| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,987,105 | A→G | 5.1% | intergenic (+29/‑431) | yqeG → / → yqeH | putative transporter/putative LuxR family transcriptional regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,987,105 | 0 | A | G | 5.1% | 322.4 / 5.3 | 97 | intergenic (+29/‑431) | yqeG/yqeH | putative transporter/putative LuxR family transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (48/44); new base G (3/2); total (51/46) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.13e-01 | |||||||||||
TTCATCATGCCTACGCTGTCAACGTATCTCATCCCGGCGCTTAAACCCTGGCGTTCCATCGGAAATCTGATTACGCTGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGG‑ATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCAGTTAGTTAAACACACAAAGAGATCTGAACATCTTAAATAAGACTATTTAAGATGCATAACTTA > NC_000913/2986957‑2987253 | ttCATCATGCCTACGCTGTCAACGTATCTCATCCCGGCGCTTAAACCCTGGCGTTCCATCGGAAATCTGATTACGCTGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGG‑ATGGTTCAAAATTGCTa > 2:563020/1‑149 (MQ=255) atcatGCCTACGCTGTCAACGTATCTCATCCCGGCGCTTAAACCCTGGCGTTCCATCGGAAATCTGATTACGCTGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGG‑ATGGTTCAAAATTGCTA‑Caa > 3:89203/1‑149 (MQ=255) atcatGCCTACGCTGTCAACGTATCTCATCCCGGCGCTTAAACCCTGGCGTTCCATCGGAAATCTGATTACGCTGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGG‑ATGGTTCAAAATTGCTA‑Caa > 4:176682/1‑149 (MQ=255) atcatGCCTACGCTGTCAACGTATCTCATCCCGGCGCTTAAACCCTGGCGTTCCATCGGAAATCTGATTACGCTGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGG‑ATGGTTCAAAATTGCTA‑Caa > 3:187722/1‑149 (MQ=255) tcatGCCTACGCTGTCAACGTATCTCATCCCGGCGCTTAAACCCTGGCGTTCCATCGGAAATCTGATTACGCTGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGG‑ATGGTTCAAAATTGCTA‑CAAt < 1:399122/149‑1 (MQ=255) tGCCTACGCTGTCAACGTATCTCATCCTGGCGCTTAAACCCTGGCGTTCCATCGGAAATCTGATTACGCTGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGG‑ATGGTTCAAAATTGCTA‑CAAtttt < 1:681496/149‑1 (MQ=255) aCGCTGTCAACGTATCTCATCCCGGCGCTTAAACCCTGGCGTTCCATCGGAAATCTGATTACGCTGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGGAATGGTTCAAAATTG‑TAGCAATTTTGAAc < 2:630962/149‑1 (MQ=255) aCGCTGTCAACGTATCTCATCCCGGCGCTTAAACCCTGGCGTTCCATCGGAAATCTGATTACGCTGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGG‑ATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAAcc < 3:343445/149‑1 (MQ=255) cTGTCAACGTATCTCATCCCGGCGCTTAAACCCTGGCGTTCCATCGGAAATCTGATTACGCTGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGG‑ATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAAccatt < 2:61485/149‑1 (MQ=255) tCAACGTATCTCATCCCGGCGCTTAAACCCTGGCGTTCCATCGGAAATCTGATTACGCTGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGG‑ATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAAccattcca < 4:353975/149‑1 (MQ=255) tATCTCATCCCGGCGCTTAAACCCTGGCGTTCCATCGGAAATCTGATTACGCTGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGG‑ATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTc < 3:372351/149‑1 (MQ=255) aTCTCATCCCGGCGCTTAAACCCTGGCGTTCCATCGGAAATCTGATTACGCTGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGG‑ATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCa < 3:248777/149‑1 (MQ=255) aTCTCATCCCGGCGCTTAAACCCTGGCGTTCCATCGGAAATCTGATTACGCTGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGG‑ATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCa < 1:61762/149‑1 (MQ=255) tctcATCCCGGCGCTTAAACCCTGGCGTTCCATCGGAAATCTGATTACGCTGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGG‑ATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCat > 1:136/1‑149 (MQ=255) tcATCCCGGCGCTTAAACCCTGGCGTTCCATCGGAAATCTGATTACGCTGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGG‑ATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCataa > 1:469112/1‑149 (MQ=255) cccGGCGCTTAAACCCTGGCGTTCCATCGGAAATCTGATTACGCTGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGG‑ATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATAtt > 3:74723/1‑149 (MQ=255) cGGCGCTTAAACCCTGGCGTTCCATCGGAAATCTGATTACGCTGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGG‑ATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCa > 1:99895/1‑149 (MQ=255) cgcTTAAACCCTGGCGTTCCATCGGAAATCTGATTACGCTGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGG‑ATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCAttt < 2:243750/149‑1 (MQ=255) cgcTTAAACCCTGGCGTTCCATCGGAAATCTGATTACGCTGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGG‑ATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCAttt < 2:157766/149‑1 (MQ=255) ttAAACCCTGGCGTTCCATCGGAAATCTGATTACGCTGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGG‑ATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGtt > 2:141809/1‑149 (MQ=255) tAAACCCTGGCGTTCCATCGGAAATCTGATTACGCTGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGG‑ATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGtta < 3:432122/149‑1 (MQ=255) aCCCTGGCGTTCCATCGGAAATCTGATTACGCTGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGG‑ATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGttatta < 1:344001/149‑1 (MQ=255) ccTGGCGTTCCATCGGAAATCTGATTACGCTGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGG‑ATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTattatt > 3:338397/1‑149 (MQ=255) cTGGCGTTCCATCGGAAATCTGATTACGCTGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGG‑ATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTc < 1:82752/149‑1 (MQ=255) tGGCGTTCCATCGGAAATCTGATTACGCTGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGG‑ATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGa < 2:536444/110‑1 (MQ=255) tGGCGTTCCATCGGAAATCTGATTACGCTGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGG‑ATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGa > 1:536444/1‑110 (MQ=255) tGGCGATCCATCGGAAATCTGATTACGCTGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGG‑ATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTcc > 2:464635/1‑149 (MQ=255) cATCGGAAATCTGATTACGCTGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGG‑ATGGTTCAAAATTGTAG‑CAATTTTGaa > 1:494749/1‑103 (MQ=255) cATCGGAAATCTGATTACGCTGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGG‑ATGGTTCAAAATTGTAG‑CAATTTTGaa < 2:494749/103‑1 (MQ=255) aTCGGAAATCTGATTACGCTGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGG‑ATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCa > 4:629199/1‑149 (MQ=255) ggAAATCTGATTACGCTGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGG‑ATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACtt > 2:579176/1‑149 (MQ=255) gAAATCTGATTACGCTGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGG‑ATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTtc < 1:346118/149‑1 (MQ=255) gAAATCTGATTACGCTGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGG‑ATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTtc > 4:580218/1‑149 (MQ=255) aTCTGATTACGCTGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGG‑ATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGtta > 4:373546/1‑126 (MQ=255) aTCTGATTACGCTGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGG‑ATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGtta < 3:373546/126‑1 (MQ=255) tCTGATTACGCTGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGG‑ATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTtctctc > 3:165427/1‑149 (MQ=255) gATTACGCTGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGG‑ATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTc > 2:335911/1‑149 (MQ=255) gATTACGCTGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGG‑ATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTc > 2:379088/1‑149 (MQ=255) ttACGCTGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGG‑ATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCat < 1:289482/149‑1 (MQ=255) tGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGG‑ATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTa > 1:463063/1‑149 (MQ=255) tGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGG‑ATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTa < 2:516617/149‑1 (MQ=255) gTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGG‑ATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGtatt > 4:478945/1‑149 (MQ=255) tGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGG‑ATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGtatta < 1:66752/149‑1 (MQ=255) gggTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGG‑ATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGtattat < 1:531651/149‑1 (MQ=255) gggTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGG‑ATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGtattat < 2:136/149‑1 (MQ=255) gggTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGG‑ATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGtattat > 4:425839/1‑149 (MQ=255) ggTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGG‑ATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATc > 2:337295/1‑149 (MQ=255) gTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGG‑ATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCa < 1:318432/149‑1 (MQ=255) aTCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCGGTTGTGG‑AGGTTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTGATAATATTCATTTGTTATTATTCCACCTTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCagt > 2:697580/1‑149 (MQ=255) tCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGG‑ATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCagtt < 1:37972/149‑1 (MQ=255) tCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGG‑ATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCagtt < 4:134603/149‑1 (MQ=255) cTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGG‑ATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCGCTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCagttag > 3:620006/1‑149 (MQ=255) cTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGG‑ATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCagttag > 3:130071/1‑149 (MQ=255) cTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGG‑ATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCagttag > 3:187212/1‑149 (MQ=255) tgtgCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGG‑ATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCagttagt > 4:9315/1‑149 (MQ=255) tgtgCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGG‑ATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCagttagc < 1:335911/149‑2 (MQ=255) tgtgCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGG‑ATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATACTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCagttagt > 4:282707/1‑149 (MQ=255) gtgCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGG‑ATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCagttagtt > 1:166602/1‑149 (MQ=255) tgCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGG‑ATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCAgttagtta < 3:580218/149‑1 (MQ=255) cGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGG‑ATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCAGTTAGTTaaa < 2:463063/149‑1 (MQ=255) cGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGG‑ATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCAGTTAGTTaaa < 3:122550/149‑1 (MQ=255) gTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGG‑GTGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCAGTTAGTTAAac > 2:631970/1‑149 (MQ=255) gTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGG‑ATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGCCATATCCTAGTATTATCAGTTAGTTAAac > 4:534495/1‑149 (MQ=255) gTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGG‑ATGGTACAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCAGTTAGTTAAac > 4:233159/1‑149 (MQ=255) aTCGGAAATGTGCCTTAGCTGATATCAGTTGTGG‑ATGGGTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCAGTTAGTTAAacac > 2:41441/1‑149 (MQ=255) aTGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGG‑ATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCAGTTAGTTAAACACACAAaga > 4:252190/1‑149 (MQ=255) aTGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGG‑ATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCAGTTAGTTAAACACACAAaga > 1:233165/1‑149 (MQ=255) tGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGG‑ATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCAGTTAGTTAAACACACAAagag < 3:138921/149‑1 (MQ=255) gTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGG‑ATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCAGTTAGTTAAACACACAAAgaga < 1:563020/149‑1 (MQ=255) ttCTTTAGCTAATATCAGTTGTGG‑ATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCAGTTAGTTAAACACACAAAGAGAt < 3:176682/149‑1 (MQ=255) ttCTTTAGCTAATATCAGTTGTGG‑ATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCAGTTAGTTAAACACACAAAGAGAt < 1:579176/149‑1 (MQ=255) ttCTTTAGCTAATATCAGTTGTGG‑ATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCAGTTAGTTAAACACACAAAGAGAt < 4:130071/149‑1 (MQ=255) tCTTTAGCTAATATCAGTTGTGG‑ATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCAGTTAGTTAAACACACAAAGAGATc < 4:421808/149‑1 (MQ=255) tCTTTAGCTAATATCAGTTGTGG‑ATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCAGTTAGTTAAACACACAAAGAGATc < 3:478945/149‑1 (MQ=255) ttAGCTAATATCAGTTGTGG‑ATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCAGTTAGTTAAACACACAAAGAGATCTGa > 4:98477/1‑149 (MQ=255) ttAGCTAATATCAGTTGTGG‑ATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCAGTTAGTTAAACACACAAAGAGATCTGa < 1:352171/149‑1 (MQ=255) tAGCTAATATCAGTTGTGG‑ATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCAGTTAGTTAAACACACAAAGAGATCTGaa < 2:469112/149‑1 (MQ=255) tAATATCAATTGTGG‑ATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCACCCTACCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCAGTTAGTTAAACACACAAAGAGATCTGAACATc < 2:574330/149‑1 (MQ=255) aaTATCAGTTGTGG‑ATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCAGTTAGTTaaa > 4:113589/1‑126 (MQ=255) aaTATCAGTTGTGG‑ATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCAGTTAGTTaaa < 3:113589/126‑1 (MQ=255) aaTATCAGTTGTGG‑ATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCAGTTAGTTAAACACACAAAGAGATCTGAACATCt > 2:58683/1‑149 (MQ=255) atCAGTTGTGG‑ATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCAGTTAGTTAAACACACAAAGAGATCTGAACATCTTaa > 4:226604/1‑149 (MQ=255) g‑ATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCAGTTAGTTAAACACACAAAGAGATCTGAACATCTTAAATAAGACTAt > 2:24628/1‑149 (MQ=255) tGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCAGTTAGTTAAACACACAAAGAGATCTGAACATCTTAAATAAGACTAttt > 3:258066/1‑149 (MQ=255) tGGTTCAAAATTG‑TAGCAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCAGTTAGTTAAACACACAAAGAGATCTGAACATCTTAAATAAGACTAttt > 4:111666/1‑149 (MQ=255) ggTTCAAAATTGTAG‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCAGTTAGTTAAACACACAAAGAGATCTGAACATCTTAAATAAGACTATTTa > 1:502784/1‑149 (MQ=255) gTTCAAAATTGTAG‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCAGTTAGTTAAACACACAAAGAGATCTGAACATCTTAAATaa < 4:454997/139‑1 (MQ=255) gTTCAAAATTGTAG‑CAATTTTGAACCATTCCATTCTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCAGTTAGTTAAACACACAAAGAGATCTGAACATCTTAAATaa > 3:454997/1‑139 (MQ=255) gTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCAGTTAGTTAAACACACAAAGAGATCTGAACATCTTAAATAAGACTATTTaa > 1:417089/1‑149 (MQ=255) tCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCAGTTAGTTAAACACACAAAGAGATCTGAACATCTTAAATAAGACTATTTAAGa < 4:605660/149‑1 (MQ=255) ccaaaTTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTGATAATATTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCAGTTAGTTAAACACACAAAGAGATCTGAACATCTTAAATAAGACTATTTAAGAt < 3:556193/147‑1 (MQ=255) aaaaTTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCAGTTAGTTAAACACACAAAGAGATCTGAACATCTTAAATAAGa > 2:255684/1‑137 (MQ=255) aaaaTTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCAGTTAGTTAAACACACAAAGAGATCTGAACATCTTAAATAAGa < 1:255684/137‑1 (MQ=255) aaTTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCAGTTAGTTAAACACACAAAGAGATCTGAACATCTTAAATAAGACTATTTAAGATGCa > 3:627/1‑149 (MQ=255) aTTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCAGTTAGTTAAACACACAAAGAGATCTGAACATCTTAAATAAGACTATTTAAGATGCAt < 3:252190/149‑1 (MQ=255) tA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCAGTTAGTTAAACACACAAAGAGATCTGAACATCTTAAATAAGACTATTTAAGATGCATAACtt > 2:66914/1‑149 (MQ=255) tA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCAGTTAGTTAAACACACAAAGAGATCTGAACATCTTAAATAAGACTATTTAAGATGCATAACtt > 4:197133/1‑149 (MQ=255) tA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCAGTTAGTTAAACACACAAAGAGATCTGAACATCTTAAATAAGACTATTTAAGATGCATAACtt > 4:643023/1‑149 (MQ=255) a‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCAGTTAGTTAAACACACAAAGAGATCTGAACATCTTAAATAAGACTATTTAAGATGCATAACTTa < 3:9315/149‑1 (MQ=255) | TTCATCATGCCTACGCTGTCAACGTATCTCATCCCGGCGCTTAAACCCTGGCGTTCCATCGGAAATCTGATTACGCTGATCGTGGGTATCCTGTGCGTATCGGTAATGTTCTTTAGCTAATATCAGTTGTGG‑ATGGTTCAAAATTGCTA‑CAATTTTGAACCATTCCATTTTTCATAATATTCATTTGTTATTATTCCACCCTATCACTTCTCTCGTCATATCCTAGTATTATCAGTTAGTTAAACACACAAAGAGATCTGAACATCTTAAATAAGACTATTTAAGATGCATAACTTA > NC_000913/2986957‑2987253 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |