New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_000913 | 1096961 = | 119 (0.570) | 16 (0.110) | 3/362 | 14.9 | 17.4% | intergenic (+132/+604) | ycdU/serX | putative inner membrane protein/tRNA‑Ser |
? | NC_000913 | = 1097503 | 70 (0.490) | intergenic (+674/+62) | ycdU/serX | putative inner membrane protein/tRNA‑Ser | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 119 total aligned reads displayed.
TGGCGGATTTGGTTTGAAGCCTATTTTTTACTCTGCTATGTACCGTGCTTAATTTACTATTTTTTCTATTGTCGATTCCTCTGGCATAACGATTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGT‑‑GTGTGCAATATACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAGCCCGCTCACTGCGTTCACGGT‑CTGTCCAACTGGCTGTCGCCAGTTGTCGACCCCCGGTCGGGGCTTCTCATCCCCCCGGTGTGTGCAATACACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGT‑GAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTC > NC_000913/1096686‑1097235 | tGGCGGATTTGGTTTGAAGCCTATTTTTTACTCTGCTATGTACCGTGCTTAATTTACTATTTTTTCTATTGTCGTTTCCTCTGGCATAACGATTTTATGATGGCATGTGACGTGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGCAGTGATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTACCCAGACAGTTGATGTGCACAATTTCCCATCGCCCTAAGAGCCGTGGGCGGCGGCACCCgg > 2:426213/1‑280 (MQ=255) cGGATTTGGTTTGAAGCCTATTTTTTACTCTGCTATGTACCGTGCTTAATTTACTATTTTTTCTATTGTCGATTCCTCTGGCATAACGATTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCAccc < 1:870864/275‑1 (MQ=255) ccTATTTTTTACTCTGCTATGTACCGTGCTTAATTTACTATTTTTTCTGTTGTCGATTCCTCGGGCATAACGATTTTATGATGGCATGTAACATGTATTTCCGTTGGGGGAATTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGG‑AGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCACCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGT‑‑GTGTGCAATATACGaaaaa < 2:36022/280‑1 (MQ=255) tATTTTTTACTCTGCTATGTACCGTGCTTAATTTACTATTTTTTCTATTGTCGATTCCTCTGGCATAACGATTTTATGATGGCCTGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCCTTTTAATAAGGGAGGAAGTGATAGGAAGTGACCAGATAATAAATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGCGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAAACGTGGGCGCGGGCACCCGGT‑‑GTGTGCAATATAcc > 1:701500/1‑273 (MQ=255) aTTTTTTACTCTGCTATGTACCGTGCTTAATTTACTATTTTTTCTATTGTCGATTCCTCTGGCATAACGATTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTTTCTTGCGCATTTTGATTGTTGATTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCTCCCTAACAGCCGTGGTCGGGGGGACACGGG‑‑GTGTGCCGTATAcc > 1:50793/1‑272 (MQ=255) tGCTATGTACCGTGCTTAATTTACTATTTTTTCTATTGTCGATTCCTCTGGCATAACGATTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTACCCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGT‑‑GTGTGAACTATACGAAAAAAAAGCCCGTACt > 2:919832/1‑279 (MQ=255) ctgttcTTAATTTTCTTTTTTTTCTGTTGGCGAGTCCTTTGGCATAACGATTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCTTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGT‑‑GTGTGCAATATACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAg < 2:953979/275‑1 (MQ=255) cGTGCTTAATTTACTATTTTTTCTATTGTCGATTCCTCTGGCATAACGATTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGT‑‑GTGTGCAATATACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTa > 1:892425/1‑275 (MQ=255) ttgtttAATTTATTTTTTTTTCTATTGTTGTATCCTCTTGCATAAAGATTTTTTGATGGCATGTGACATGTTTTTCCGTTGGGGGTATTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGAAGTGATCAGATAATACATTTATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGGGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGT‑‑GTGTGCAATATACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGct < 4:603606/276‑1 (MQ=255) gttcTTTATTTTCTCTTTTTTCTTTTTTTGTTTTCTCTGGCATAATGATTTTTTGATGGAATGTGACATGTATTGCCGTTTGGTGCTTTTTAATAAGGAAGGAAGGGATAGGAAGTGACCAGATAATCCATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGT‑‑GTGTGCAATATACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGct < 4:192555/277‑1 (MQ=255) 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tGCTTAATTTACTATTTTTTCTATTGTCGATTCCTCTGGCATAACGATTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGT‑‑GTGTGCAATATACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGctc > 2:692952/1‑280 (MQ=255) tGCTTAATTTACTATTTTTTCTATTGTCGATTCCTCTGGCATAACGATTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCCCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGT‑‑GTGTGCAATATACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACg > 1:551166/1‑275 (MQ=255) aaTTTACTATTTTTTCTATTGTCGATTCCTCTGGCATAACGATTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGG‑‑GTGTGCAATATACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGcgc > 1:801392/1‑273 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |