| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 3787895 = | 506 (2.430) | 4 (0.020) | 4/502 | 17.2 | 0.82% | coding (1058/1260 nt) | envC | activator of AmiB,C murein hydrolases, septal ring factor |
| ? | NC_000913 | = 3787891 | 486 (2.430) | coding (1054/1260 nt) | envC | activator of AmiB,C murein hydrolases, septal ring factor | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 512 total aligned reads displayed.
CAGGCGGTTCGCGACCGCCAGAAAGAAGCGACGCGCAAAGGCACCACCTACAAACCGACCGAAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACGCTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGATTGCCGACGGTCGGGTGATTCTGGCTGACTGGCTGCAAGGCTACGGTCTGGTGGTGGTGGTTGAGCATGGTAAAGGCGACATGAGTCTTTACGGCTATAATCAGAGCGCACTGGTGAGCGTTGGTTCGCAGGTTCGCGCGGGCCAGCCGATTGCACTGGTGGGCAGCAGTGGCGGTCAGGGTCGGCCTTCACTCTATTTCGAAATTCGCCGCCAGGGTCAGGCGGTCAATCCACAGCCGTGGTTGGGAAGATAAGTTTTGTTTCCATTTCGTCGTAACGTTCTTGCATTTGCCGCTCTGTTGGCGCTCTCCTCCCCCGTACTT > NC_000913/3787612‑3788166 | cggggcggcaccgACCACCAAAACGAACCGACGGCCCAAGGCACCCCCTACAAACCGACCGAAAGGGAAGAATCGCGGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGGGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACGCTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGATTGCCGACGGTCGGGTGATTCTGGCTGACTGGCTGCAAGGCTACGGTc < 4:37222/269‑1 (MQ=255) gggtggaggccGGCAGAAAGACCCGCGGCGCAAATGAACCAATGACAGACAAACGCAAGGCTAACACTCGCTGATGCCGCGTAGCGGTGGACTGGGCGCGCCGCGTAGTCAGGGATGGTGACCGGTAGGGGGGCGGAGGCGTGATGGCTATGGCGAACAGCGACAGGGTCAATTACGCGGGAAAGGGATAGTGATCGGCGCTTGTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGATTGCCGACTGTCGGGTGATTCTGGCTGACTGGCTGCAAGGCTACGGTc < 3:40418/266‑1 (MQ=255) ggTACGCGACCGACAGAAACGAGCGACGCGGAAATGCACCACCTACAAACCCACCGCAAGCGACAAAGCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACGCTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGGACTGAAGTTAAAGCGATTGCCGACGGTCGGGTGATTCTGGCTGACTGGCTGCAAGGCTACGGTc < 1:51501/275‑1 (MQ=255) ttCGCGACCGCCAGAAAGAAGCGACGCGCAAAGGCACCACCTACAAACCGACCGAAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACGCTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTAATGAAGTTAAAGGGATTGCCGACGGGCGGTTGATTCGGGCTGACCGGCTGCAAGGCTAGGGTCtg > 3:453276/1‑275 (MQ=255) cgACCGCCAGAAAGAAGCGACGCGCAAAGGCACCACCTACAAACCGACCGAAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACGCTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGATTGCCGACGGTCGGGTGATTCTGGCTGACTGGCTGCAAGGCTTAGGTCtggtggtggtg > 2:31423/1‑280 (MQ=255) aagaagCAACGCGGAAGGGCACCCCCTACGAACCGACCGAAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGGGCGCGGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACGCTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGATTGCCGACGGTCGGGTGATTCTGGCTGACTGGCTGCAAGGCTACGGTCTGGTGGTGGTGGTTGAg < 3:151256/275‑1 (MQ=255) gaagGGACGCGCAAAGGCACCACCTACAAACCGGACGAAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGGGCGCCGCGTGGGCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGAGGCTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGATTGCCGACGGTCGGGTGATTCTGGCTGACTGGCTGCAAGGCTACGGTCTGGTGGTGGTGGTTGAGCATGGTa < 2:588750/280‑1 (MQ=255) gaagCGACGCGCAAAGGCACAACCTACAAACCGACCGAAAGCGAAAGAGCGCTGATGGCCCGTACCGGTGGTCTGGGGGCGCCGCGTGGGCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACGCTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGATTGCCGACGGTCGGGTGATTCTGGCTGACTGGCTGCAAGGCTACGGTCTGGTGGTGGTGGTTGAGCa < 3:794226/275‑1 (MQ=255) aaaggccgcggcaaGGCACCTCCTACAAAGCGGCGGAAGGCGAGAATGCGCTGAGGCTCCGTAGCGGTGGGCTGGGGGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGGGGGCCGTAGCTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGATTGCCGACGGTCGGGTGATTCTGGCTGACTGGCTGCAAGGCTACGGTCTGGTGGTGGTGGTTGAGCATGGTa < 4:243630/267‑1 (MQ=255) cGACGCGCAAAGGCACCACCTACAAACCGACCGAAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACGCTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGATTGCCGACGGTCGGGTGATTCTGGCTGACTGGCTGCAAGGCTACGGTCTggtggtggtggt > 1:151256/1‑265 (MQ=255) 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ccaccGACAAATCGGCCGAAAGCGAAAAGTCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTAGCGGGCCGACGCTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGATTGCCGACGGTCGGGTGATTCTGGCTGACTGGCTGCAAGGCTACGGTCTGGTGGTGGTGGTTGAGCATGGTAAAGGCGACATGAGTCTTTa < 2:755256/280‑1 (MQ=255) acaccGAAAAAACGCCCGAAGGGGAAAAATCGCGGATGTCCCGTGCCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACGCTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGATTGCCGACGGTCGGGTGATTCTGGCTGACTGGCTGCAAGGCTACGGTCTGGTGGTGGTGGTTGAGCATGGTAAAGGCGACATGAGTCTTTa < 2:366739/279‑1 (MQ=255) ccTACAAACCGACCGAAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACGCTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGATTGTCGACGGTCGGGTGATTCTGGCTGACTGGCTGTAAGGCTACGGTCTGGTTGTGGTGGTTGAGCATGGTAAAGGCGACATTAGtttt > 1:49728/1‑275 (MQ=255) ccTACAAACCGACCGAAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACGCTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGATTGCCGACGGTCGGGTGATTCTGGCTGACTGGCTGCAAGGCTACGGTCTGGTGGTGGTGGTTGAGCATGGTAACGGCGACATGGGTCTTTACgg > 2:242226/1‑280 (MQ=255) aCAAACCGACCGAAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACGCTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGATTGCCGACGGTCGGGTGATTCTGGCTGACTGGCTGCAAGGCTACGGTCTGGTGGTGGTGGTTGAGCATGGTAAAGGCGACATGAGTCTTTa < 3:464116/274‑1 (MQ=255) cAAACCGACCGAAAGCGAAAAATCGCTGCTGTCCCGTACCGGTGGTCTGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACGCTGCATCGCGATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTAGGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGATTGCCGACGGCCGGGTTATTCTGGCTGACTGGCTGCAAGGCTACGGTCTGGTGGTGGTGGTTGAGCATGGTCAAGGCGACATGAGTACTTACg > 1:44917/1‑275 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |