| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 127761 | 59 (0.670) | 4 (0.050) | 4/242 | NT | 6.9% | intergenic (+174/‑151) | aceF/lpd | pyruvate dehydrogenase, dihydrolipoyltransacetylase component E2/dihydrolipoyl dehydrogenase; E3 component of pyruvate and 2‑oxoglutarate dehydrogenases complexes; glycine cleavage system L protein; dihydrolipoamide dehydrogenase |
| ? | NC_000913 | = 127874 | 53 (0.640) | intergenic (+287/‑38) | aceF/lpd | pyruvate dehydrogenase, dihydrolipoyltransacetylase component E2/dihydrolipoyl dehydrogenase; E3 component of pyruvate and 2‑oxoglutarate dehydrogenases complexes; glycine cleavage system L protein; dihydrolipoamide dehydrogenase | |||||
TTTCTGGTAATCTCATGAATGTATTGAGGTTATTAGCGAATAGACAAATCGGTTGCCGTTTGTTGTTTAAAAATTGTTAACAATTTTGTAAAATACCGACGGATAGAACGACCCGGTGGTGGTTAGGGTATTACTTCACATACCCTATGGATTTCTGGGTGCAGCAAGGTAGCAAGCGCCAGAATCCCCAGGAGCTTACATAAGTAAGTGACTGGGGTGAGGGCGTGAAGCTAACGCCGCTGCGGCCTGAAAGACGACGGGTATGACCGCCGGAGATAAATATATAGAGGTCA > NC_000913/127617‑127909 | tttCTGGTAATCTCATGAATGTATTGAGGTTATTAGCGAATAGACAAATCGGTTGCCGTTTGTTGTTTAAAAATTGTTAACAATTTTGTAAAATACCGACGGATAGAACGACCCGGTGGTGGTTAGGGTATTACTTCACATACCCTATg > 4:155888/1‑149 (MQ=255)tttCTGGTAATCTCATGAATGTATTGAGGTTATTAGCGAATAGACAAATCGGTTGCCGTTTGTTGTTTAAAAATTGTTAACAATTTTGTAAAATACCGACGGATAGAACGACCCGGTGGTGGTTAGGGTATTACTTCACATACCCTATg < 1:343769/149‑1 (MQ=255)tttCTGGTAATCTCATGAATGTATTGAGGTTATTAGCGAATAGACAAATCGGTTGCCGTTTGTTGTTTAAAAATTGTTAACAATTTTGTAAAATACCGACGGATAGAACGACCCGGTGGTGGTTAGGGTATTACTTCACATACCCTATg < 1:824/149‑1 (MQ=255) gTAATCTCATGAATGTATTGAGGTTATTAGCGAATAGACAAATCGGTTGCCGTTTGTTGTTTAAAAATTGTTAACAATTTTGTAAAATACCGACGGATAGAACGACCCGGTGGTGGTTAGGGTATTACTTCACATACCCTATGGATTTc > 4:482419/1‑149 (MQ=255) aTCTCATGAATGTATTGAGGTTATTAGCGAATAGACAAATCGGTTGCCGTTTGTTGTTTAAAAATTGTTAACAATTTTGTAAAATACCGACGGATAGAACGACCCGGTGGTGGTTAGGGTATTACTTCACATACCCTATGGATTTCTgg < 4:694840/149‑1 (MQ=255) tcATGAATGTATTGAGGTTATTAGCGAATAGACAAATCGGTTGCCGTTTGTTGTTTAAAAATTGTTAACAATTTTGTAAAATACCGACGGATAGAACGACCCGGTGGTGGTTAGGGTATTACTTCACATACCCTATGGATTTCTGGGTg > 3:604864/1‑149 (MQ=255) gAGGTTATTAGCGAATAGACAAATCGGTTGCAGTTTGTTGTTTAAAAATTGTTAACAATTTTGTAAAATACCGACGGATAGAACGACCCGGTGGTGGTTAGGGTATTACTTCACATACCCTATGGATTTCTGGGTGCAGCAAGGTAGCa > 2:37595/1‑149 (MQ=255) tattaGCGAATAGACAAATCGGTTGCAGTTTGTTGTTTGAAAATTGTTAACAATTTCGTAAAATACCGACGGATAGAACGACCCGGTGGTGGTTAGGGTATTACTTCACATACCATATGGATTTCTGTGTGCAGCAAGGTCGCAAgcgc > 3:496715/1‑149 (MQ=255) ttaGCGAATAGACAAATCGGTTGCCGTTTGTTGTTTAAAAATTGTTAACAATTTTGTAAAATACCGACGGATAGAACGACCCGGTGGTGGTTAGGGTATTACTTCACATACCCTATGGATTTCTGGGTGCAGCAAGGTAGCAAgcgc < 3:53805/147‑1 (MQ=255) 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TTTCTGGTAATCTCATGAATGTATTGAGGTTATTAGCGAATAGACAAATCGGTTGCCGTTTGTTGTTTAAAAATTGTTAACAATTTTGTAAAATACCGACGGATAGAACGACCCGGTGGTGGTTAGGGTATTACTTCACATACCCTATGGATTTCTGGGTGCAGCAAGGTAGCAAGCGCCAGAATCCCCAGGAGCTTACATAAGTAAGTGACTGGGGTGAGGGCGTGAAGCTAACGCCGCTGCGGCCTGAAAGACGACGGGTATGACCGCCGGAGATAAATATATAGAGGTCA > NC_000913/127617‑127909 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |