| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,419,860 | G→T | 20.9% | intergenic (‑235/‑120) | ulaG ← / → ulaA | L‑ascorbate 6‑phosphate lactonase/L‑ascorbate‑specific enzyme IIC permease component of PTS |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,419,860 | 0 | G | T | 20.9% | 254.3 / 51.2 | 91 | intergenic (‑235/‑120) | ulaG/ulaA | L‑ascorbate 6‑phosphate lactonase/L‑ascorbate‑specific enzyme IIC permease component of PTS |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (35/37); new base T (11/8); total (46/45) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.07e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.64e-01 | |||||||||||
ACCATTTTTTGACTTTTTGCCAGGGAAGTTGTTGTTGATTTTGAGTATGGAAAGATTTAATGGAATGTGTAATTCAATTAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTATCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTAGAGTGAGTGCACAACATTCCGGGTGTGTGGAATACCCGGTTACCTCTTCTTCAGGAGATCGTTATGGAGATCCTCTACAACATCTTTACCGT > NC_000913/4419713‑4420008 | aCCATTTTTTGACTTTTTGCCAGGGAAGTTGTTGTTGATTTTGAGTATGGAAAGATTTAATGGAATGTGTAATTCAATTAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTATCCATGTGGAATTATTTGc > 4:10864/1‑149 (MQ=255) ccATTTTTTGACTTTTTGCCAGGGAAGTTGTTGTTGATTTTGAGTATGGAAAGATTTAATGGAATGTGTAATTCAATTAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTATCCATGTGGAATTATTTGCg < 2:458770/149‑1 (MQ=255) cATTTTTTGACTTTTTGCCAGGGAAGTTGTTGTTGATTTTGAGTATGGAAAGATTTAATGGAATGTGTAATTCAATTAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTATCCATGTGGAATTATTTGCgg < 2:786154/149‑1 (MQ=255) aTTTTTTGACTTTTTGCCAGGGAAGTTGTTGTTGATTTTGAGTATGGAAAGATTTAATGGAATGTGTAATTCAATTAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTATCCATGTGGAATTATTTGc < 2:207735/146‑1 (MQ=255) aTTTTTTGACTTTTTGCCAGGGAAGTTGTTGTTGATTTTGAGTATGGAAAGATTTAATGGAATGTGTAATTCAATTAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTATCCATGTGGAATTATTTGc > 1:207735/1‑146 (MQ=255) tttGACTTTTTGCCAGGGAAGTTGTTGTTGATTTTGAGTATGGAAAGATTTAATGGAATGTGTAATTCAATTAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTATCCATGTGGAATTATTTGCGGGTcgc < 3:10864/149‑1 (MQ=255) tttttGCCAGGGAAGTTGTTGTTGATTTTGAGTATGGAAAGATTTAATGGAATGTGTAATTCAATTAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTATCCATGTGGAATTATTTTCGGGt > 3:60674/1‑140 (MQ=255) tttttGCCAGGGAAGTTGTTGTTGATTTTCAGTATGGAAGGATTTAATGGAATGTGTAATTCAATTAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTATCCATGTGGAATTATTTTCGGGt < 4:60674/140‑1 (MQ=255) tttGCCAGGGAAGTTGTTGTTGATTTTGAGTATGGAAAGATTTAATGGAATGTGTAATTCAATTAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTATCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACAtt < 4:375328/149‑1 (MQ=255) tGCCAGGGAAGTTGTTGTTGATTTTGAGTATGGAAAGATTTAATGGAATGTGTAATTCAATTAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTATCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTa < 1:346434/149‑1 (MQ=255) gCCAGGGAAGTTGTTGTTGATTTTGAGTATGGAAAGATTTAATGGAATGTGTAATTCAATTAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTATCCATGTGGAATTATTTTCGGGTCGCGTCACATTTaa < 3:13401/149‑1 (MQ=255) gCCAGGGAAGTTGTTGTTGATTTTGAGTATGGAAAGATTTAATGGAATGTGTAATTCAATTAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTATCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTaa > 4:552744/1‑149 (MQ=255) ccAGGGAAGTTGTTGTTGATTTTGAGTATGGAAAGATTTAATGGAATGTGTAATTCAATTAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTATCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAAt < 4:493438/149‑1 (MQ=255) ccAGGGAAGTTGTTGTTGATTTTGAGTATGGAAAGATTTAATGGAATGTGTAATTCAATTAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTATCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAAt < 1:327174/149‑1 (MQ=255) ccAGGGAAGTTGTTGTTGATTTTGAGTATGGAAAGATTTAATGGAATGTGTAATTCAATTAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTATCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAAt < 1:796428/149‑1 (MQ=255) ttgttgttgATTTTGAGTATGGAAAGATTTAATGGAATGTGTAATTCAATTAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTATCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCataaataa > 3:743538/1‑149 (MQ=255) tgttgttgATTTTGAGTATGGAAAGATTTAATGGAATGTGTAATTCAATTAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTATCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAaataat > 2:488343/1‑149 (MQ=255) ttgATTTTGAGTATGGAAAGATTTAATGGAATGTGTAATTCAATTAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTATCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCttgt > 3:595328/1‑149 (MQ=255) ttgATTTTGAGTATGGAAAGATTTAATGGAATGTGTAATTCAATTAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTATCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCttgt > 3:10288/1‑149 (MQ=255) ttttGAGTATGGAAAGATTTAATGGAATGTGTAATTCAATTAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTATCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTtgtg > 4:356893/1‑149 (MQ=255) tATGGAAAGATTTAATGGAATGTGTAATTCAATTAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTATCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACtt > 1:656219/1‑149 (MQ=255) tATGGAAAGATTTAATGGAATGTGTAATTCAATTAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTATCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACtt > 3:656858/1‑149 (MQ=255) ggAAAGATTTAATGGAATGTGTAATTCAATTAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTATCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCttgt < 2:652012/135‑1 (MQ=255) ggAAAGATTTAATGGAATGTGTAATTCAATTAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTATCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCttgt > 1:652012/1‑135 (MQ=255) ggAAAGATTTAATGGAATGTGTAATTCAATTAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTATCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTg > 1:582348/1‑149 (MQ=255) gAAAGATTTAATGGAATGTGTAATTCAATTAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTATCCATGTGGAATTATTTTCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGa < 2:285230/149‑1 (MQ=255) gAAAGATTTAATGGAATGTGTAATTCAATTAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTATCCATGTGGAATTATTTTCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGa < 3:307144/149‑1 (MQ=255) gAAAGATTTAATGGAATGTGTAATTCAATTAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTATCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGa > 3:131326/1‑149 (MQ=255) gAAAGATTTAATGGAATGTGTAATTCAATTAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTATCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGa < 1:175906/149‑1 (MQ=255) gAAAGATTTAATGGAATGTGTAATTCAATTAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTATCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGa > 3:577412/1‑149 (MQ=255) aaaGATTTAATGGAATGTGTAATTCAATTAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTATCCATGTGGAATTATTTTCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGaa > 3:608784/1‑149 (MQ=255) aaaGATTTAATGGAATGTGTAATTCAATTAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTATCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATc > 2:434047/1‑129 (MQ=255) aaaGATTTAATGGAATGTGTAATTCAATTAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTATCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATc < 1:434047/129‑1 (MQ=255) gATTTAATGGAATGTGTAATTCAATTAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTATCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAAt < 1:488343/149‑1 (MQ=255) tttAATGGAATGTGTAATTCAATTAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTATCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTa > 3:409405/1‑149 (MQ=255) tttAATGGAATGTGTAATTCAATTAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTATCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTa < 3:694693/149‑1 (MQ=255) tttAATGGAATGTGTAATTCAATTAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTATCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTa < 4:10288/149‑1 (MQ=255) tAATGGAATGTGTAATTCAATTAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTATCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTaga < 3:282658/149‑1 (MQ=255) aTGGAATGTGTAATTCAATTAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTATCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTAgagt < 4:85966/149‑1 (MQ=255) tAATTCAATTAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTATCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGa > 2:794800/1‑119 (MQ=255) tAATTCAATTAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTATCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGa < 1:794800/119‑1 (MQ=255) aTTCAATTAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTATCCATGTGGAATTATTTTCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTAGAGTGAGTGCacaaca > 4:136810/1‑149 (MQ=255) aTTCAATTAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTATCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTAGAGTGAGTGCacaaca > 3:415013/1‑149 (MQ=255) ttCAATTAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTATCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTAGAGTGAGTGCACAACAt > 2:529316/1‑149 (MQ=255) cAATTAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTATCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTAGAGTGAGTGCACAACATTc < 4:573096/149‑1 (MQ=255) aaTTAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTATCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCttg > 4:448079/1‑107 (MQ=255) aaTTAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTATCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCttg < 3:448079/107‑1 (MQ=255) aTTAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTATCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTAGAGTGAGTGCACAACATTCCg < 3:356893/149‑1 (MQ=255) aaCTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTATCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTAGAGTGAGTGCACAACATTCCGGgt < 1:529316/149‑1 (MQ=255) aaCTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTATCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTAGAGTGAGTGCACAACATTCCGGgt < 4:415013/149‑1 (MQ=255) aaTGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTATCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTAGAGTGAGTGCACAACATTCCGGGtgtgtg > 1:801479/1‑149 (MQ=255) aaTGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTATCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTAGAGTGAGTGCACAACATTCCGGGtgtgtg < 4:743538/149‑1 (MQ=255) aTGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTATCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTAGAGTGAGTGCACAACATTCCGGGTGTGTgg > 1:674141/1‑149 (MQ=255) tGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTATCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTAGAGTGAGTGCACAACATTCCGGGtgtgtg < 2:412845/147‑1 (MQ=255) tGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTATCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTAGAGTGAGTGCACAACATTCCGGGtgtgtg > 1:412845/1‑147 (MQ=255) tttAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTATCCATGTGGAATTATTTTCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTAGAGTGAGTGCACAACATTCCGGGTGTGTGGAATAc > 4:625867/1‑149 (MQ=255) tttAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTATCCATGTGGAATTATTTTCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTAGAGTGAGTGCACAACATTCCGGGTGTGTGGAATAc > 2:249545/1‑149 (MQ=255) tttAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTATCCATGTGGAATTATTTTCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTAGAGTGAGTGCACAACATTCCGGGTGTGTGGAATAc > 2:725577/1‑149 (MQ=255) ttGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTATCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTAGAGTGAGTGCACAACATTCCGGGTGTGTGGAATACCCGGTTACCtctt > 1:434328/1‑149 (MQ=255) ttGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTATCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTAGAGTGAGTGCACAACATTCCGGGTGTGTGGAATACCCGGTTACCtctt < 2:165063/149‑1 (MQ=255) ttGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTATCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTAGAGTGAGTGCACAACATTCCGGGTGTGTGGAATACCCGGTTACCtctt > 1:777518/1‑149 (MQ=255) tttCGTTGTGTGAATCCCACTCTATCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTAGAGTGAGTGCACAACATTCCGGgtgt < 4:749348/124‑1 (MQ=255) tttCGTTGTGTGAATCCCACTCTATCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTAGAGTGAGTGCACAACATTCCGGgtgt > 3:749348/1‑124 (MQ=255) tttCGTTGTGTGAATCCCACTCTATCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTAGAGTGAGTGCACAACATTCCGGGTGTGTGGAATACCCGGTTACCTcttctt > 4:523313/1‑149 (MQ=255) gTTGTGTGAATCCCACTCTATCCATGTGGAATTATTTTCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTAGAGTGAGTGCACAACATTCCGGGTGTGTGGAATACCCGGTTACCTCTTCTTCAgg > 2:648238/1‑149 (MQ=255) ttGTGTGAATCCCACTCTATCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTAGAGTGAGTGCACAACATTCCGGGTGTGTGGAATACCCGGTTACCTCTTCTTCAGga < 4:744738/149‑1 (MQ=255) tgtgAATCCCACTCTATCCATGTGGAATTATTTTCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTAGAGTGAGTGCACAACATTCCGGGTGTGTGGAATACCCGGTTACCTCTTCTTCAGGAGAt < 4:608784/149‑1 (MQ=255) gtgAATCCCACTCTATCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTAGAGTGAGTGCACAACATTCCGGGTGTGTGGAATACCCGGTTACCTCTTCTTCAGGAGATc < 4:577412/149‑1 (MQ=255) gtgAATCCCACTCTATCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTAGAGTGAGTGCACAACATTCCGGGTGTGTGGAATACCCGGTTACCTCTTCTTCAGGAGATc < 4:131326/149‑1 (MQ=255) aaTCCCACTCTATCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAAGCTTGTTGTGATGACTTTTGAAAATTAGAGTGAGTGCACAACATTCCGGGTGTGTGGAATACCCGGTTACCTCTTCTTCAGGAGATCGtt < 2:582348/149‑1 (MQ=255) cccACTCTATCCATGTGGAATTATTTTCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTAGAGTGAGTGCACAACATTCCGGGTGTGTGGAATACCCGGTTACCTCTTCTTCAGGAGATCGTTATg > 2:54898/1‑149 (MQ=255) cccACTCTATCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTAGAGTGAGTGCACAACATTCCGGGTGTGTGGAATACCCGGTTACCTCTTCTTCAGGAGATCGTTATg < 2:674141/149‑1 (MQ=255) cACTCTATCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGa < 4:159558/65‑1 (MQ=255) cACTCTATCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGa > 3:159558/1‑65 (MQ=255) cACTCTATCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTAGAGTGAGTGCACAACATTCCGGGTGTGTGGAATACCCGGTTACCTCTTCTTCAGGAGATCGTTATGga > 3:361777/1‑149 (MQ=255) cACTCTATCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTAGAGTGAGTGCACAACATTCCGGGTGTGTGGAATACCCGGTTACCTCTTCTTCAGGAGATCGTTATGga > 3:271537/1‑149 (MQ=255) ctATCCATGTGGAATTATTTTCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTAGAGTGAGTGCACAACATTCCGGGTGTGTGGAATACCCGGTTACCTCTTCTTCAGGAGATCGTTATGGAGATc < 1:648238/149‑1 (MQ=255) aTGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTAGAGTGAGTGCACAACATTCCGGGTGTGTGGAATACCCGGTTACCTCTTCTCCAGGAGATCGTTATg < 4:255557/137‑1 (MQ=255) aTGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTAGAGTGAGTGCACAACATTCCGGGTGTGTGGAATACCCGGTTACCTCTTCTCCAGGAGATCGTTATg > 3:255557/1‑137 (MQ=255) gAATTATTTTCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTaga > 1:152929/1‑68 (MQ=255) gAATTATTTTCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTaga < 2:152929/68‑1 (MQ=255) gAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTAGAGTGAGTGCACAACATTCCGGGTGTGTGGAATACCCGGTTACCTCTTCTTCAGGAGATCGTTATGGAGATCCTCTACAACAt > 4:321460/1‑149 (MQ=255) aaTTATTTTCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTAGAGTGAGTGCACAACATTCCGGGTGTGTGGAATACCCGGTTACCTCTTCTTCAGGAGATCGTTATGGAGATCCTCTACAACATc > 2:337198/1‑149 (MQ=255) aaTTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTAgagt < 4:108781/69‑1 (MQ=255) aaTTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTAgagt > 3:108781/1‑69 (MQ=255) aaTTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTAGAGTGAGTGCACAACATTCCGGGTGTGTGGAATACCCGGTTACCTCTTCTTCAGGAGATCGTTATGGAGATCCTCTACAACATc > 4:631542/1‑149 (MQ=255) attattTTCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTAGAGTGAGTGCACAACATTCCGGGTGTGTGGAATACCCGGTTACCTCTTCTTCAGGAGATCGTTATGGAGATCct < 4:263708/138‑1 (MQ=255) attattTTCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTAGAGTGAGTGCACAACATTCCGGGTGTGTGGAATACCCGGTTACCTCTTCTTCAGGAGATCGTTATGGAGATCct > 3:263708/1‑138 (MQ=255) ttattTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTAGAGTGAGTGCACAACATTCCGGGTGTGTGGAATACCCGGTTACCTCTTCTTCAGGAGATCGTTATGGAGATCCTCTACAACATCtt > 1:82022/1‑149 (MQ=255) tgattTGCGGGTCGAGTCACATTTAATTATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTAGAGTGAGTGCACAACATTCCGGGTGTGTGGAATACCCGGTTTCCTCTTCTTCAGGAGATCGTTATGGAGATCCTCTACAACATCtt < 2:223037/147‑1 (MQ=255) ttGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTAGAGTGAGTGCACAACATTCCGGGTGTGTGGAATACCCGGTTACCTCTTCTTCAGGAGATCGTTATGGAGATCCTCTACAACATCTTTAcc < 3:523313/149‑1 (MQ=255) gCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTAGAGTGAGTGCACAACATTCTGGGTGTGTGGAATACCCGGTTACCTCTTCTTCAGGAGATCGTTATGGAGATCCTCTACAACATCTTTACCgt < 4:656858/149‑1 (MQ=255) gCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTAGAGTGAGTGCACAACATTCCGGGTGTGTGGAATACCCGGTTACCTCTTCTTCAGGAGATCGTTATGGAGATCCTCTACAACATCTTTACCgt < 2:656219/149‑1 (MQ=255) | ACCATTTTTTGACTTTTTGCCAGGGAAGTTGTTGTTGATTTTGAGTATGGAAAGATTTAATGGAATGTGTAATTCAATTAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTATCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTAGAGTGAGTGCACAACATTCCGGGTGTGTGGAATACCCGGTTACCTCTTCTTCAGGAGATCGTTATGGAGATCCTCTACAACATCTTTACCGT > NC_000913/4419713‑4420008 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |