| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,448,274 | G→A | 5.6% | intergenic (+39/‑173) | ytfP → / → chpS | GGCT‑like protein/antitoxin of the ChpBS toxin‑antitoxin system |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,448,274 | 0 | G | A | 5.6% | 236.8 / 3.3 | 71 | intergenic (+39/‑173) | ytfP/chpS | GGCT‑like protein/antitoxin of the ChpBS toxin‑antitoxin system |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (30/37); new base A (2/2); total (32/39) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.85e-01 | |||||||||||
CCAGTTGATTCAGACGCCGTACGGGAGTGCATGGATGTACGTTTATCAACGACCCGTCGATGGATTAAAGCTAATTGAAAGCGGCGACTGGTTAGACAGGGATAAGTAACCATATGCATACGCCACCTTCGGGTGGCGTTGTTTTTTGCGAGACGACTCGCATTCTGTTTTGTAATTCCCTCACCTTTTGCTTTTCTCTCCGAGCCGCTTTCCATATCTATTAACGCATAAAAAACTCTGCTGGCATTCACAAATGCGCAGGGGTAAAACGTTTCCTGTAGCACCGTGAGTTATAC > NC_000913/4448127‑4448422 | ccAGTTGATTCAGACGCCGTACGGGAGTGCATGGATGTACGTTTATCAACGACCCGTCGATGGATTAAAGCTAATTGAAAGCGGCGACTGGTTAGACAGGGATAAGTAACCATATGCATACGCCACCTTCGGGTGGCGTTGTTTTTTGc < 2:726918/149‑1 (MQ=255) aTTCAGACGCCGTACGGGAGTGCATGGATGTACGTTTATCAACGACCCGTCGATGGATTAAAGCTAATTGAAAGCGGCGACTGGTTAGACAGGGATAAGTAACCATATGCATACGCCACCTTCGGGTGGCGTTGTTTTTTGCGAgacga > 4:581090/1‑149 (MQ=255) cGTACGGGAGTGCATGGATGTACGTTTATCAACGACCCGTCGATGGATTAAAGCTAATTGAAAGCGGCGACTGGTTAGACAGGGATAAGTAACCATATGCATACGCCACCTTCGGGTGGCGTTGTTTTTTGCGAGACGACTCGCATTCt < 2:753082/149‑1 (MQ=255) gTACGGGAGTGCATGGATGTACGTTTATCAACGACCCGTCGATGGATTAAAGCTAATTGAAAGCGGCGACTGGTTAGACAGGGATAAGTAACCATATGCATACGCCACCTTCGGGTGGCGTTGTTTTTTGCGAGACGACTCGCATTCTg > 4:66344/1‑149 (MQ=255) tACGGGAGTGCATGGATGTACGTTTATCAACGACCCGTCGATGGATTAAAGCTAATTGAAAGCGGCGACTGGTTAGACAGGGATAAGTAACCATATGCATACGCCACCTTCGGGTGGCGTTGTTTTTTGCGAGACGACTCGCATTCTGt < 1:253659/149‑1 (MQ=255) cGGGAGTGCATGGATGTACGTTTATCAACGACCCGTCGATGGATTAAAGCTAATTGAAAGCGGCGACTGGTTAGACAGGGATAAGTAACCATATGCATACGCCACCTTCGGGTGGCGTTGTTTTTTGCGAGACGACTCGCATTCTGttt < 4:198349/149‑1 (MQ=255) gCATGGATGTACGTTTATCAACGACCCGTCGATGGATTAAAGCTAATTGAAAGCGGCGACTGGTTAGACAGGGATAAGTAACCATATGCATACGCCACCTTCGGGTGGCGTTGTTTTTTGCGAGACGACTCGCATTCTGTTTTGTAAtt > 1:673200/1‑149 (MQ=255) gCATGGATGTACGTTTATCAACGACCCGTCGATGGATTAAAGCTAATTGAAAGCGGCGACTGGTTAGACAGGGATAAGTAACCATATGCATACGCCACCTTCGGGTGGCGTTGTTTTTTGCGAGACGACTCGCATTCTGTTTTGTAAtt > 3:444811/1‑149 (MQ=255) cATGGATGTACGTTTATCAACGACCCGTCGATGGATTAAAGCTAATTGAAAGCGGCGACTGGTTAGACAGGGATAAGTAACCATATGCATACGCCACCTTCGGGTGGCGTTGTTTTTTACGAGACGACTCGCATTCTGTTTTGTAATTc > 2:130178/1‑149 (MQ=255) cATGGATGTACGTTTATCAACGACCCGTCGATGGATTAAAGCTAATTGAAAGCGGCGACTGGTTAGACAGGGATAAGTAACCATATGCATACGCCACCTTCGGGTGGCGTTGTTTTTTACGAGACGACTCGCATTCTGTTTTGTAATTc > 2:2424/1‑149 (MQ=255) aTGGATGTACGTTTATCAACGACCCGTCGATGGATTAAAGCTAATTGAAAGCGGCGACTGGTTAGACAGGGATAAGTAACCATATGCATACGCCACCTTCGGGTGGCGTTGTTTTTTGCGAGACGACTCGCATTCTGTTTTGTAATTcc > 3:729942/1‑149 (MQ=255) ggATGTACGTTTATCAACGACCCGTCGATGGATTAAAGCTAATTGAAAGCGGCGACTGGTTAGACAGGGATAAGTAACCATATGCATACGCCACCTTCGGGTGGCGTTGTTTTTTGCGAGACGACTCGCATTCTGTTTTGTAATTCCCt > 4:107520/1‑149 (MQ=255) gTACGTTTATCAACGACCCGTCGATGGATTAAAGCTAATTGAAAGCGGCGACTGGTTAGACAGGGATAAGTAACCATATGCATACGCCACCTTCGGGTGGCGTTGTTTTTTGCGAGACGACTCGCATTCTGTTTTGTAATTCCCTc > 3:464456/1‑146 (MQ=255) gTACGTTTATCAACGACCCGTCGATGGATTAAAGCTAATTGAAAGCGGCGACTGGTTAGACAGGGATAAGTAACCATATGCATACGCCACCTTCGGGTGGCGTTGTTTTTTGCGAGACGACTCGCATTCTGTTTTGTAATTCCCTc < 4:464456/146‑1 (MQ=255) tACGTTTATCAACGACCCGTCGATGGATTAAAGCTAATTGAAAGCGGCGACTGGTTAGACAGGGATAAGTAACCATATGCATACGCCACCTTCGGGTGGCGTTGTTTTTTGCGAGACGACTCGCATTCTGTTTTGTaa < 2:772206/138‑1 (MQ=255) tACGTTTATCAACGACCCGTCGATGGATTAAAGCTAATTGAAAGCGGCGACTGGTTAGACAGGGATAAGTAACCATATGCATACGCCACCTTCGGGTGGCGTTGTTTTTTGCGAGACGACTCGCATTCTGTTTTGTaa > 1:772206/1‑138 (MQ=255) aCGTTTATCAACGACCCGTCGATGGATTAAAGCTAATTGAAAGCGGCGACTGGTTAGACAGGGATAAGTAACCATATGCATACGCCACCTTCGGGTGGCGTTGTTTTTTGCGAGACGACTCGCATTCTGTTTTGTAATTCCCTCACCtt > 4:131686/1‑149 (MQ=255) gTTTATCAACGACCCGTCGATGGATTAAAGCTAATTGAAAGCGGCGACTGGTTAGACAGGGATAAGTAACCATATGCATACGCCACCTTCGGGTGGCGTTGTTTTTTGCGAGACGACTCGCATTCTGTTTTGTAATTcc < 3:605957/139‑1 (MQ=255) gTTTATCAACGACCCGTCGATGGATTAAAGCTAATTGAAAGCGGCGACTGGTTAGACAGGGATAAGTAACCATATGCATACGCCACCTTCGGGTGGCGTTGTTTTTTGCGAGACGACTCGCATTCTGTTTTGTAATTcc > 4:605957/1‑139 (MQ=255) gTTTATCAACGACCCGTCGATGGATTAAAGCTAATTGAAAGCGGCGACTGGTTAGACAGGGATAAGTAACCATATGCATACGCCACCTTCGGGTGGCGTTGTTTTTTACGAGACGACTCGCATTCTGTTTTGTAATTCCCTCACCtttt < 1:130178/149‑1 (MQ=255) gTTTATCAACGACCCGTCGATGGATTAAAGCTAATTGAAAGCGGCGACTGGTTAGACAGGGATAAGTAACCATATGCATACGCCACCTTCGGGTGGCGTTGTTTTTTACGAGACGACTCGCATTCTGTTTTGTAATTCCCTCACCtttt < 1:2424/149‑1 (MQ=255) tATCAACGACCCGTCGATGGATTAAAGCTAATTGAAAGCGGCGACTGGTTAGACAGGGATAAGTAACCATATGCATACGCCACCTTCGGGTGGCGTTGTTTTTTGCGAGACGACTCGCATTCTGTTTTGTAATTCCCTCACCTTTTGCt < 4:291845/149‑1 (MQ=255) tATCAACGACCCGTCGATGGATTAAAGCTAATTGAAAGCGGCGACTGGTTAGACAGGGATAAGTAACCATATGCATACGCCACCTTCGGGTGGCGTTGTTTTTTGCGAGACGACTCGCATTCTGTTTTGTAATTCCCTCACCTTTTGCt < 4:669182/149‑1 (MQ=255) cAACGACCCGTCGATGGATTAAAGCTAATTGAAAGCGGCGACTGGTTAGACAGGGATAAGTAACCATATGCATACGCCACCTTCGGGTGGCGTTGTTTTTTGCGAGACGACTCGCATTCTGTTTTGTAATTCCCTCACCTTTTGCtttt < 4:706349/149‑1 (MQ=255) cAACGACCCGTCGATGGATTAAAGCTAATTGAAAGCGGCGACTGGTTAGACAGGGATAAGTAACCATATGCATACGCCACCTTCGGGTGGCGTTGTTTTTTGCGAGACGACTCGCATTCTGTTTTGTAATTCCCTCACCTTTTGCtttt < 2:458695/149‑1 (MQ=255) cAACGACCCGTCGATGGATTAAAGCTAATTGAAAGCGGCGACTGGTTAGACAGGGATAAGTAACCATATGCATACGCCACCTTCGGGTGGCGTTGTTTTTTGCGAGACGACTCGCATTCTGTTTTGTAATTCCCTCACCTTTTGCtttt < 4:612953/149‑1 (MQ=255) aCGACCCGTCGATGGATTAAAGCTAATTGAAAGCGGCGACTGGTTAGACAGGGATAAGTAACCATATGCATACGCCACCTTCGGGTGGCGTTGTTTTTTGCGAGACGACTCGCATTCt < 2:648118/118‑1 (MQ=255) aCGACCCGTCGATGGATTAAAGCTAATTGAAAGCGGCGACTGGTTAGACAGGGATAAGTAACCATATGCATACGCCACCTTCGGGTGGCGTTGTTTTTTGCGAGACGACTCGCATTCt > 1:648118/1‑118 (MQ=255) cccGTCGATGGATTAAAGCTAATTGAAAGCGGCGACTGGTTAGACAGGGATAAGTAACCATATGCATACGCCACCTTCGGGTGGCGTTGTTTTTTGCGAGACGACTCGCATTCTGTTTTGTAATTCCCTCACCTTTTGCTTTTCTCTcc < 2:279932/149‑1 (MQ=255) ccGTCGATGGATTAAAGCTAATTGAAAGCGGCGACTGGTTAGACAGGGATAAGTAACCATATGCATACGCCACCTTCGGGTGGCGTTGTTTTTTGCGAGACGACTCGCATTCTGTTTTGTAATTCCCTCACCTTTTGCTTTTCTCTCCg > 2:556743/1‑149 (MQ=255) aTGGATTAAAGCTAATTGAAAGCGGCGACTGGTTAGACAGGGATAAGTAACCATATGCATACGCCACCTTCGGGTGGCGTTGTTTTTTGCGAGACGACTCGCATTCTGTTTTGTAATTCCCTCACCTTTTGCTTTTCTCTCCGAGCCGc < 1:725678/149‑1 (MQ=255) aTGGATTAAAGCTAATTGAAAGCGGCGACTGGTTAGACAGGGATAAGTAACCATATGCATACGCCACCTTCGGGTGGCGTTGTTTTTTGCGAGACGACTCGCATTCTGTTTTGTAATTCCCTCACCTTTTGCTTTTCTCTCCGAGCCGc < 3:109909/149‑1 (MQ=255) gATTAAAGCTAATTGAAAGCGGCGACTGGTTAGACAGGGATAAGTAACCATATGCATACGCCACCTTCGGGTGGCGTTGTTTTTTGCGAGACGACTCGCATTCTGtttt < 2:244377/109‑1 (MQ=255) gATTAAAGCTAATTGAAAGCGGCGACTGGTTAGACAGGGATAAGTAACCATATGCATACGCCACCTTCGGGTGGCGTTGTTTTTTGCGAGACGACTCGCATTCTGtttt > 1:244377/1‑109 (MQ=255) aTTAAAGCTAATTGAAAGCGGCGACTGGTTAGACAGGGATAAGTAACCATATGCATACGCCACCTTCGGGTGGCGTTGTTTTTTGCGAGACGACTCGCATTCTGTTTTGTAATTCCCTCACCTTTTGCTTTTCTCTCCGAGCCGCTTTc > 2:288050/1‑149 (MQ=255) aTTAAAGCTAATTGAAAGCGGCGACTGGTTAGACAGGGATAAGTAACCATATGCATACGCCACCTTCGGGTGGCGTTGTTTTTTGCGAGACGACTCGCATTCTGTTTTGTAATTCCCTCACCTTTTGCTTTTCTCTCCGAGCCGCTTTc < 3:581090/149‑1 (MQ=255) aTTAAAGCTAATTGAAAGCGGCGACTGGTTAGACAGGGATAAGTAACCATATGCATACGCCACCTTCGGGTGGCGTTGTTTTTTGCGAGACGACTCGCATTCTGTTTTGTAATTCCCTCACCTTTTGCTTTTCTCTCCGAGCCGCTTTc > 3:518257/1‑149 (MQ=255) aaaGCTAATTGAAAGCGGCGACTGGTTAGACAGGGATAAGTAACCATATGCATACGCCACCTTCGGGTGGCGTTGTTTTTTGCGAGACGACTCGCATTCTGTTTTGTAATTCCCTCACCTTTTGCTTTTCTCTCCGAGCCGCTTTCCat < 4:729942/149‑1 (MQ=255) aaGCTAATTGAAAGCGGCGACTGGTTAGACAGGGATAAGTAACCATATGCATACGCCACCTTCGGGTGGCGTTGTTTTTTGCGAGACGACTCGCATTCTGTTTTGTAATTCCCTCACCTTTTGCTTTTCTCTCCGAGCCGCTTTCCata < 3:66344/149‑1 (MQ=255) tAATTGAAAGCGGCGACTGGTTAGACAGGGATAAGTAACCATATGCATACGCCACCTTCGGGTGGCGTTGTTTTTTGCGAGACGACTCGCATTCTGTTTTGTAATTCCCTCACCTTTTGCTTTTCTCTCCGAGCCGCTTTCCATATCTa > 1:447304/1‑149 (MQ=255) tAATTGAAAGCGGCGACTGGTTAGACAGGGATAAGTAACCATATGCATACGCCACCTTCGGGTGGCGTTGTTTTTTGCGAGACGACTCGCATTCTGTTTTGTAATTCCCTCACCTTTTGCTTTTCTCTCCGAGCCGCTTTCCATATCTa > 3:652540/1‑149 (MQ=255) aaGCGGCGACTGGTTAGACAGGGATAAGTAACCATATGCATACGCCACCTTCGGGTGGCGTTGTTTTTTGCGAGACGACTCGCATTCTGTTTTGTAATTCCCTCACCTTTTGCTTCTCTCTCCGAGCCGCTTTCCATATCTATTAACGc > 2:430231/1‑149 (MQ=255) aCTGGTTAGACAGGGATAAGTAACCATATGCATACGCCACCTTCGGGTGGCGTTGTTTTTTGCGAGACGACTCGCATTCTGTTTTGTAATTCCCTCACCTTTTGCTTTTCTCTCCGAGCCGCTTTCCATATCTATTAACGCATaaaaaa < 3:107520/149‑1 (MQ=255) aCTGGTTAGACAGGGATAAGTAACCATATGCATACGCCACCTTCGGGTGGCGTTGTTTTTTGCGAGACGACTCGCATTCTGTTTTGTAATTCCCTCACCTTTTGCTTTTCTCTCCGAGCCGCTTTCCATATCTATTAACGCATaaaaaa < 1:43907/149‑1 (MQ=255) tGGTTAGACAGGGATAAGTAACCATATGCATACGCCACCTTCGGGTGGCGTTGTTTTTTGCGAGACGACTCGCATTCTGTTTTGTAATTCCCTCACCTTTTGCTTTTCTCTCCGAGCCGCTTTCCATATCTATTAACGCATAAAAAAct < 4:639989/149‑1 (MQ=255) tAGACAGGGATAAGTAACCATATGCATACGCCACCTTCGGGTGGCGTTGTTTTTTGCGAGACGACTCGCATTCTGTTTTGTAATTCCCTCACCTTTTGCTTTTCTCTCCGAGCCGCTTTCCATATCTATTAACGCATAAAAAACTctgc < 4:444811/149‑1 (MQ=255) tAGACAGGGATAAGCAAACATATGCATACGCCACCTTCGGGTGGCGTTGTTTTTTGCGAGACGACTCGCATTCTGTTTTGTAATTCCCTCACCTTTTGCTTTTCTCTCCGAGCCGCTTTCCATATCTATTAACGCATAAAAAACTctgc < 2:673200/149‑1 (MQ=255) aGACAGGGATAAGTAACCATATGCATACGCCACCTTCGGGTGGCGTTGTTTTTTGCGAGACGACTCGCATTCTGTTTTGTAATTCCCTCACCTTTTGCTTTTCTCTCCGAGCCGCTTTCCATATCTATTAACGCATAAAAAACTctgct < 1:556743/149‑1 (MQ=255) aCAGGGATAAGTAACCATATGCATACGCCACCTTCGGGTGGCGTTGTTTTTTGCGAGACGACTCGCATTCTGTTTTGTAATTCCCTCACCTTTTGCTTTTCTCTCCGAGCCGCTTTCCATATCTATTAACGCATAAAAAACTCTGCTgg > 2:590729/1‑149 (MQ=255) aGGGATAAGTAACCATATGCATACGCCACCTTCGGGTGGCGTTGTTTTTTGCGAGACGACTCGCATTCTGTTTTGTAATTCCCTCACCTTTTGCTTTTCTCTCCGAGCCGCTTTCCATATCTATTAACGCATAAAAAACTCTGCTGGCa < 3:209927/149‑1 (MQ=255) aGGGATAAGTAACCATATGCATACGCCACCTTCGGGTGGCGTTGTTTTTTGCGAGACGACTCGCATTCTGTTTTGTAATTCCCTCACCTTTTGCTTTTCTCTCCGAGCCGCTTTCCATATCTATTAACGCATAAAAAACTCTGCTGGCa > 4:198965/1‑149 (MQ=255) gggATAAGTAACCATATGCATACGCCACCTTCGGGTGGCGTTGTTTATTGCGAGATGACTCGCATTCTGTTTTGTAATTCCCTCACCTTTTGCTTTTCTCTCCGAGCCGCTTTCCATATCTATTAACGCATAAAAAACTCTGCTGGCAt < 4:652540/149‑1 (MQ=255) gATAAGTAACCATATGCATACGCCACCTTCGGGTGGCGTTGTTTTTTGCGAGACGACTCGCATTCTGTTTTGTAATTCCCTCACCTTTTGCTTTTCTCTCCGAGCCGCTTTCCATATCTATTAACGCATAAAAAACTCTGCTGGCATTc > 4:264565/1‑149 (MQ=255) aTAAGTAACCATATGCATACGCCACCTTCGGGTGGCGTTGTTTTTTGCGAGACGACTCGCATTCTGTTTTGTAATTCCCTCACCTTTTGCTTTTCTCTCCGAGCCGCTTTCCATATCTATTAACGCATAAAAAACTCTGCTGGCATTca < 1:430231/149‑1 (MQ=255) gTAACCATATGCATACGCCACCTTCGGGTGGCGTTGTTTTTTGCGAGACGACTCGCATTCTGTTTTGTAATTCCCTCACCTTTTGCTTTTCTCTCCGAGCCGCTTTCCATATCTATTAACGCATAAAAAACTCTGCTGGCATTCACaaa < 4:155674/149‑1 (MQ=255) tAACCATATGCATACGCCACCTTCGGGTGGCGTTGTTTTTTGCGAGACGACTCGCATTCTGTTTTGTAATTCCCTCACCTTTTGCTTTTCTCTCCGAGCCGCTTTCCATATCTATTAACGCATAAAAAACTCTGCTGGCATTCACAAAt > 2:525116/1‑149 (MQ=255) tAACCATATGCATACGCCACCTTCGGGTGGCGTTGTTTTTTGCGAGACGACTCGCATTCTGTTTTGTAATTCCCTCACCTTTTGCTTTTCTCTCCGAGCCGCTTTCCATATCTATTAACGCATAAAAAACTCTGCTGGCATTCACAAAt > 2:237635/1‑149 (MQ=255) aaCCATATGCATACGCCACCTTCGGGTGGCGTTGTTTTTTGCGAGACGACTCGCATTCTGTTTTGTAATTCCCTCACCTTTTGCTTTTCTCTCCGAGCCGCTTTCCATATCTATTAACGCATAAAAAACTCTGCTGGCATTCACAAATg > 1:117283/1‑149 (MQ=255) tatGCATACGCCACCTTCGGGTGGCGTTGTTTTTTGCGAGACGACTCGCATTCTGTTTTGTAATTCCCTCACCTTTTGCTTTTCTCTCCGAGCCGCTTTCCATATCTATTAACGCATAAAAAACTCTGCTGGCATTCACAAATGCGCAg < 3:264565/149‑1 (MQ=255) atGCATACGCCACCTTCGGGTGGCGTTGTTTTTTGCGAGACGACTCGCATTCTGTTTTGTAATTCCCTCACCTTTTGCTTTTCTCTCCGAGCCGCTTTCCATATCTATTAACGCATAAAAAACTCTGCTGGCATTCACAAATGCGCAgg < 1:525116/149‑1 (MQ=255) gCCACCTTCGGGTGGCGTTGTTTTTTGCGAGACGACTCGCATTCTGTTTTGTAATTCCCTCACCTTTTGCTTTTCTCTCCGAGCCGCTTTCCATATCTATTAACGCATAAAAAActc > 1:44815/1‑117 (MQ=255) gCCACCTTCGGGTGGCGTTGTTTTTTGCGAGACGACTCGCATTCTGTTTTGTAATTCCCTCACCTTTTGCTTTTCTCTCCGAGCCGCTTTCCATATCTATTAACGCATAAAAAActc < 2:44815/117‑1 (MQ=255) gCCACCTTCGGGTGGCGTTGTTTTTTGCGAGACGACTCGCATTCTGTTTTGTAATTCCCTCACCTTTTGCTTTTCTCTCCGAGCCGCTTTCCATATCTATTAACGCATAAAAAACTCTGCTGGCATTCACAAATGCGCAGGGGTAAAAc > 1:562759/1‑149 (MQ=255) aCCTTCGGGTGGCGTTGTTTTTTGCGAGACGACTCGCATTCTGTTTTGTAATTCCCTCACCTTTTGCTTTTCTCTCCGAGCCGCTTTCCATATCTATTAACGCATAAAAAACTCTGCTGGCATTCACAAATGCGCAGGGGTAAAACGtt < 3:198965/149‑1 (MQ=255) cTTCGGGTGGCGTTGTTTTTTGCGAGACGACTCGCATTCTGTTTTGTAATTCCCTCACCTTTTGCTTTTCTCTCCGAGCCGCTTTCCATATCTATTAACGCATAAAAAACTCTGCTGGCATTCACAAATGCGCAGGGGTAAAACGTTTc < 1:288050/149‑1 (MQ=255) ggTGGCGTTGTTTTTTGCGAGACGACTCGCATTCTGTTTTGTAATTCCCTCACCTTTTGCTTTTCTCTCCGAGCCGCTTTCCATATCTATTAACGCATAAAAAACTCTGCTGGCATTCACAAATGCGCAGGGGTAAAACGTTTc < 1:208972/144‑1 (MQ=255) ggTGGCGTTGTTTTTTGCGAGACGACTCGCATTCTGTTTTGTAATTCCCTCACCTTTTGCTTTTCTCTCCGAGCCGCTTTCCATATCTATTAACGCATAAAAAACTCTGCTGGCATTCACAAATGCGCAGGGGTAAAACGTTTc > 2:208972/1‑144 (MQ=255) cGTTGTTTTTTGCGAGACGACTCGCATTCTGTTTTGTAATTCCCTCACCTTTTGCTTTTCTCTCCGAGCCGCTTTCCATATCTATTAACGCATAAAAAACTCTGCTGGCATTCACAAATGCGCAGGGGTAAAACGTTTCCTGTAGCAcc > 2:114143/1‑149 (MQ=255) cGTTGTTTTTTGCGAGACGACTCGCATTCTGTTTTGTAATTCCCTCACCTTTTGCTTTTCTCTCCGAGCCGCTTTCCATATCTATTAACGCATAAAAAACTCTGCTGGCATTCACAAATGCGCAGGGGTAAAACGTTTCCTGTAGCAcc < 2:117283/149‑1 (MQ=255) ttgttTTTTGCGAGACGACTCGCATTCTGTTTTGTAATTCCCTCACCTTTTGCTTTTCTCTCCGAGCCGCTTTCCATATCTATTAACGCATAAAAAACTCTGCTGGCATTCACAAATGCGCAGGGGTAAAACGTTTCCTGTAGCACCGt > 4:357340/1‑149 (MQ=255) gttTTTTGCGAGACGACTCGCATTCTGTTTTGTAATTCCCTCACCTTTTGCTTTTCTCTCCGAGCCGCTTTCCATATCTATTAACGCATAAAAAACTCTGCTGGCATTCACAAATGCGCAGGGGTAAAACGTTTCCTGTAGCACCGTGa > 4:386464/1‑149 (MQ=255) gCGAGACGACTCGCATTCTGTTTTGTAATTCCCTCACCTTTTGCTTTTCTCTCCGAGCCGCTTTCCATATCTATTAACGCATAAAAAACTCTGCTGGCATTCACAAATGCGCAGGGGTAAAACGTTTCCTGTAGCACCGTGAGTTATAc < 3:357340/149‑1 (MQ=255) | CCAGTTGATTCAGACGCCGTACGGGAGTGCATGGATGTACGTTTATCAACGACCCGTCGATGGATTAAAGCTAATTGAAAGCGGCGACTGGTTAGACAGGGATAAGTAACCATATGCATACGCCACCTTCGGGTGGCGTTGTTTTTTGCGAGACGACTCGCATTCTGTTTTGTAATTCCCTCACCTTTTGCTTTTCTCTCCGAGCCGCTTTCCATATCTATTAACGCATAAAAAACTCTGCTGGCATTCACAAATGCGCAGGGGTAAAACGTTTCCTGTAGCACCGTGAGTTATAC > NC_000913/4448127‑4448422 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |