Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 1,501,769 | C→T | 6.5% | R70C (CGC→TGC) | tehB → | tellurite, selenium methyltransferase, SAM‑dependent; tellurite, selenium resistance protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 1,501,769 | 0 | C | T | 6.5% | 192.5 / 3.1 | 61 | R70C (CGC→TGC) | tehB | tellurite, selenium methyltransferase, SAM‑dependent; tellurite, selenium resistance protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (29/28); new base T (2/2); total (31/30) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.63e-01 |
TGGAAGCGGTGAAAGTGGTTAAACCGGGTAAAACGCTGGATCTGGGCTGTGGCAATGGTCGTAACAGTCTTTACCTGGCAGCCAATGGTTATGATGTTGACGCATGGGATAAAAATGCCATGAGTATCGCCAACGTCGAGCGCATTAAATCCATTGAAAATCTGGATAATTTACACACCCGAGTCGTTGATCTGAATAACCTCACATTTGATAGACAGTACGATTTTATTCTTTCGACTGTGGTGCTGATGTTCCTTGAGGCTAAAACCATCCCCGGGTTGATT > NC_000913/1501629‑1501912 | tGGAAGCGGTGAAAGTGGTTAAACCGGGTAAAACGCTGGATCTGGGCTGTGGCAATGGTCGTAACAGTCTTTACCTGGCAGCCAATGGTTATGATGTTGACGCATGGGATAAAAATGCCATGAGTATCGCCAACGTCGAGCGCATTaaa < 4:410423/149‑1 (MQ=255) tGGAAGCGGTGAAAGTGGTTAAACCGGGTAAAACGCTGGATCTGGGCTGTGGCAATGGTCGTAACAGTCTTTACCTGGCAGCCAATGGTTATGATGTTGACGCATGGGATAAAAATGCCATGAGTATCGCCAACGTCGAGCGCATTaaa > 2:207203/1‑149 (MQ=255) tGGAAGCGGTGAAAGTGGTTAAACCGGGTAAAACGCTGGATCTGGGCTGTGGCAATGGTCGTAACAGTCTTTACCTGGCAGCCAATGGTTATGATGTTGACGCATGGGATAAAAATGCCATGAGTATCGCCAACGTCGAGCGCATTaaa < 2:175499/149‑1 (MQ=255) ggAAGCGGTGAAAGTGGTTAAACCGGGTAAAACGCTGGATCTGGGCTGTGGCAATGGTCGTAACAGTCTTTACCTGGCAGCCAATGGTTATGATGTTGACGCATGGGATAAAAATGCCATGAGTATCGCCAACGTCGAGCGCATTAAAt > 3:466595/1‑149 (MQ=255) gAAGCGGTGAAAGTGGTTAAACCGGGTAAAACGCTGGATCTGGGCTGTGGCAATGGTCGTAACAGTCTTTACCTGGCAGCCAATGGTTATGATGTTGACGCATGGGATAAAAATGCCATGAGTATCGCCAACGTCGAGCGCATTAAATc > 4:410854/1‑149 (MQ=255) gCGGTGAAAGTGGTTAAACCGGGTAAAACGCTGGATCTGGGCTGTGGCAATGGTCGTAACAGTCTTTACCTGGCAGCCAATGGTTATGATGTTGACGCATGGGATAAAAATGCCATGAGTATCGCCAACGTCGAGCGCATTAAATCCAt > 2:161721/1‑149 (MQ=255) cGGTGAAAGTGGTTAAACCGGGTAAAACGCTGGATCTGGGCTGTGGCAATGGTCGTAACAGTCTTTACCTGGCAGCCAATGGTTATGATGTTGACGCATGGGATAAAAATGCCATGAGTATCGCCAACGTCGAGCGCATTAAATCCAtt < 2:451508/149‑1 (MQ=255) gTTAAACCGGGTAAAACGCTGGATCTGGGCTGTGGCAATGGTCGTAACAGTCTTTACCTGGCAGCCAATGGTTATGATGTTGACGCATGGGATAAAAATGCCATGAGTATCGCCAACGTCGAGCGCATTAAATCCATTGAAAATCTGGa > 3:443654/1‑149 (MQ=255) aaCCGGGTAAAACGCTGGATCTGGGCTGTGGCAATGGTCGTAACAGTCTTTACCTGGCAGCCAATGGTTATGATGTTGACGCATGGGATAAAAATGCCATGAGTATCGCCAACGTCGAGCGCATTAAATCCATTGAAAATCTGGATAAt > 3:221206/1‑149 (MQ=255) aaCCGGGTAAAACGCTGGATCTGGGCTGTGGCAATGGTCGTAACAGTCTTTACCTGGCAGCCAATGGTTATGATGTTGACGCATGGGATAAAAATGCCATGAGTATCGCCAACGTCGAGCGCATTAAATCCATTGAAAATCTGGATAAt > 1:558631/1‑149 (MQ=255) aCCGGGTAAAACGCTGGATCTGGGCTGTGGCAATGGTCGTAACAGTCTTTACCTGGCAGCCAATGGTTATGATGTTGACGCATGGGATAAAAATGCCATGAGTATCGCCAACGTCGAGCGCATTAAATCCATTGAAAATCTGGATAAtt < 3:420159/149‑1 (MQ=255) tAAAACGCTGGATCTGGGCTGTGGCAATGGTCGTAACAGTCTTTACCTGGCAGCCAATGGTTATGATGTTGACGCATGGGATAAAAATGCCATGAGTATCGCCAACGTCGAGCGCATTAAATCCATTGAAAATCTGGATAATTTacaca > 3:166994/1‑149 (MQ=255) aaCGCTGGATCTGGGCTGTGGCAATGGTCGTAACAGTCTTTACCTGGCAGCCAATGGTTATGATGTTGACGCATGGGATAAAAATGCCATGAGTATCGCCAACGTCGAGCGCATTAAATCCATTGAAAATCTGGATAATTTACACAccc > 2:137019/1‑149 (MQ=255) cTGGATCTGGGCTGTGGCAATGGTCGTAACAGTCTTTACCTGGCAGCCAATGGTTATGATGTTGACGCATGGGATAAAAATGCCATGAGTATCGCCAACGTCGAGCGCATTAAATCCATTGAAAATCTGGATAATTTACACACCCGAGt > 3:45956/1‑149 (MQ=255) tGGATCTGGGCTGTGGCAATGGTCGTAACAGTCTTTACCTGGCAGCCAATGGTTATGATGTTGACGCATGGGATAAAAATGCCATGAGTATCGCCAACGTCGAGCGCATTAAATCCATTGAAAATCTGGATAATTTACACACCCGAGTc < 3:521647/149‑1 (MQ=255) aTCTGGGCTGTGGCAATGGTCGTAACAGTCTTTACCTGGCAGCCAATGGTTATGATGTTGACGCATGGGATAAAAATGCCATGAGTATCGCCAACGTCGAGCGCATTAAATCCATTGAAAATCTGGATAATTTACACACCCGAGTCGtt > 2:238472/1‑149 (MQ=255) cTGGGCTGTGGCAATGGTCGTAACAGTCTTTACCTGGCAGCCAATGGTTATGATGTTGACGCATGGGATAAAAATGCCATGAGTATCGCCAACGTCGAGCGCATTAAATCCATTGAAAATCTGGATAATTTACACACCCGAGTCGTTGa < 1:455980/149‑1 (MQ=255) gggCTGTGGCAATGGTCGTAACAGTCTTTACCTGGCAGCCAATGGTTATGATGTTGACGCATGGGATAAAAATGCCATGAGTATCGCCAACGTCGAGCGCATTAAATCCATTGAAAATCTGGATAATTTACACACCCGAGTCGTTGATc < 4:46862/149‑1 (MQ=255) tgtgGCAATGGTCGTAACAGTCTTTACCTGGCAGCCAATGGTTATGATGTTGACGCATGGGATAAAAATGCCATGAGTATCGCCAACGTCGAGCGCATTAAATCCATTGAAAATCTGGATAATTTACACACCCGAGTCGTTGATCTGaa < 4:162834/149‑1 (MQ=255) 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tCTTTACCTGGCAGCCAATGGTTATGATGTTGACGCATGGGATAAAAATGCCATGAGTATCGCCAACGTCGAGCGCATTAAATCCATTGAAAATCTGGATAATTTACACACCCGAGTCGTTGATCTGAATAACCTCACATTTGATAGAc > 2:448999/1‑149 (MQ=255) tCTTTACCTGGCAGCCAATGGTTATGATGTTGACGCATGGGATAAAAATGCCATGAGTATCGCCAACGTCGAGCGCATTAAATCCATTGAAAATCTGGATAATTTACACACCCGAGTCGTTGATCTGAATAACCTCACATTTGATAGAc > 2:75893/1‑149 (MQ=255) tttACCTGGCAGCCAATGGTTATGATGTTGACGCATGGGATAAAAATGCCATGAGTATCGCCAACGTCGAGTGCATTAAATCCATTGAAAATCTGGATAATTTACACACCCGAGTCGTTGATCTGAATAACCTCACATTTGATAGACAg > 4:503353/1‑149 (MQ=255) tttACCTGGCAGCCAATGGTTATGATGTTGACGCATGGGATAAAAATGCCATGAGTATCGCCAACGTCGAGTGCATTAAATCCATTGAAAATCTGGATAATTTACACACCCGAGTCGTTGATCTGAATAACCTCACATTTGATAGACAg > 4:516259/1‑149 (MQ=255) ttACCTGGCAGCCAATGGTTATGATGTTGACGCATGGGATAAAAATGCCATGAGTATCGCCAACGTCGAGCGCATTAAATCCATTGAAAATCTGGATAATTTACACACCCGAGTCGTTGATCTGAATAACCTCACATTTGATAGACAGt < 4:559839/149‑1 (MQ=255) cTGGCAGCCAATGGTTATGATGTTGACGCATGGGATAAAAATGCCATGAGTATCGCCAACGTCGAGCGCATTAAATCCATTGAAAATCTGGATAATTTACACACCCGAGTCGTTGATCTGAATAACCTCACATTTGATAGACAGTACGa > 2:574539/1‑149 (MQ=255) cTGGCAGCCAATGGTTATGATGTTGACGCATGGGATAAAAATGCCATGAGTATCGCCAACGTCGAGCGCATTAAATCCATTGAAAATCTGGATAATTTACACACCCGAGTCGTTGATCTGAATAACCTCACATTTGATAGACAGTACGa > 4:188387/1‑149 (MQ=255) tGGCAGCCAATGGTTATGATGTTGACGCATGGGATAAAAATGCCATGAGTATCGCCAACGTCGAGCGCATTAAATCCATTGAAAATCTGGATAATTTACACACCCGAGTCGTTGATCTGAATAACCTCACATTTGATAGACAGTACGAt > 4:270399/1‑149 (MQ=255) tGGCAGCCAATGGTTATGATGTTGACGCATGGGATAAAAATGCCATGAGTATCGCCAACGTCGAGCGCATTAAATCCATTGAAAATCTGGATAATTTACACACCCGAGTCGTTGATCTGAATAACCTCACATTTGATAGACAGTACGAt < 2:515353/149‑1 (MQ=255) tGGCAGCCAATGGTTATGATGTTGACGCATGGGATAAAAATGCCATGAGTATCGCCAACGTCGAGCGCATTAAATCCATTGAAAATCTGGATAATTTACACACCCGAGTCGTTGATCTGAATAACCTCACATTTGATAGACAGTACGAt > 1:44042/1‑149 (MQ=255) gCAGCCAATGGTTATGATGTTGACGCATGGGATAAAAATGCCATGAGTATCGCCAACGTCGAGCGCATTAAATCCATTGAAAATCTGGATAATTTACACACCCGAGTCGTTGATCTGAATAACCTCACATTTGATAGACAGTACGAttt > 2:248665/1‑149 (MQ=255) aGCCAATGGTTATGATGTTGACGCATGGGATAAAAATGCCATGAGTATCGCCAACGTCGAGCGCATTAAATCCATTGAAAATCTGGATAATTTACACACCCGAGTCGTTGATCTGAATAACCTCACATTTGATAGACAGTACGATTTTa < 3:472984/149‑1 (MQ=255) aGCCAATGGTTATGATGTTGACGCATGGGATAAAAATGCCATGAGTATCGCCAACGTCGAGCGCATTAAATCCATTGAAAATCTGGATAATTTACACACCCGAGTCGTTGATCTGAATAACCTCACATTTGATAGACAGTACGATTTTa > 1:480721/1‑149 (MQ=255) gCCAATGGTTATGATGTTGACGCATGGGATAAAAATGCCATGAGTATCGCCAACGTCGAGCGCATTAAATCCATTGAAAATCTGGATAATTTACACACCCGAGTCGTTGATCTGAATAACCTCACATTTGATAGACAGTACGATTTTAt < 1:383999/149‑1 (MQ=255) cAATGGTTATGATGTTGACGCATGGGATAAAAATGCCATGAGTATCGCCAACGTCGAGCGCATTAAATCCATTGAAAATCTGGATAATTTACACACCCGAGTCGTTGATCTGAATAACCTCACATTTGATAGACAGTACGATTTTATTc > 4:241116/1‑149 (MQ=255) aaTGGTTATGATGTTGACGCATGGGATAAAAATGCCATGAGTATCGCCAACGTCGAGCGCATTAAATCCATTGAAAATCTGGATAATTTACACACCCGAGTCGTTGATCTGAATAACCTCACATTTGATAGACAGTACGATTTTATTCt > 2:94986/1‑149 (MQ=255) ttATGATGTTGACGCATGGGATAAAAATGCCATGAGTATCGCCAACGTCGAGCGCATTAAATCCATTGAAAATCTGGATAATTTACACACCCGAGTCGTTGATCTGAATAACCTCACATTTGATAGACAGTACGATTTTATTCTTTCGa < 4:29437/149‑1 (MQ=255) tATGATGTTGACGCATGGGATAAAAATGCCATGAGTATCGCCAACGTCGAGCGCATTAAATCCATTGAAAATCTGGATAATTTACACACCCGAGTCGTTGATCTGAATAACCTCACATTTGATAGACAGTACGATTTTATTCTTTCGAc > 3:335569/1‑149 (MQ=255) atgTTGACGCATGGGATAAAAATGCCATGAGTATCGCCAACGTCGAGCGCATTAAATCCATTGAAAATCTGGATAATTTACACACCCGAGTCGTTGATCTGAATAACCTCACATTTGATAGACAGTACGATTTTATTCTTTCGACtgtg < 3:448042/149‑1 (MQ=255) cGCATGGGATAAAAATGCCATGAGTATCGCCAACGTCGAGCGCATTAAATCCATTGAAAATCTGGATAATTTACACACCCGAGTCGTTGATCTGAATAACCTCACATTTGATAGACAGTACGATTTTATTCTTTCGACTGTGGTGCTGa < 4:170563/149‑1 (MQ=255) aTGGGATAAAAATGCCATGAGTATCGCCAACGTCGAGCGCATTAAATCCATTGAAAATCTGGATAATTTACACACCCGAGTCGTTGATCTGAATAACCTCACATTTGATAGACAGTACGATTTTATTCTTTCGACTGTGGTGCTGATGt > 4:92868/1‑149 (MQ=255) ggATAAAAATGCCATGAGTATCGCCAACGTCGAGCGCATTAAATCCATTGAAAATCTGGATAATTTACACACCCGAGTCGTTGATCTGAATAACCTCACATTTGATAGACAGTACGATTTTATTCTTTCGACTGTGGTGCTGATGTTcc < 1:207203/149‑1 (MQ=255) aaaaaTGCCATGAGTATCGCCAACGTCGAGCGCATTAAATCCATTGAAAATCTGGATAATTTACACACCCGAGTCGTTGATCTGAATAACCTCACATTTGATAGACAGTACGATTTTATTCTTTCGACTGTGGTGCTGATGTTCCTTGa < 3:252486/149‑1 (MQ=255) aaaaaTGCCATGAGTATCGCCAACGTCGAGCGCATTAAATCCATTGAAAATCTGGATAATTTACACACCCGAGTCGTTGATCTGAATAACCTCACATTTGATAGACAGTACGATTTTATTCTTTCGACTGTGGTCCTGATGTTCCTTGa < 3:43477/149‑1 (MQ=255) aaaaaTGCCATGAATATCGCCAACGTCGAGCGCATTAAATCCATTGAAAATCTGGATAATTTACACACCCGAGTCGTTGATCTGAATAACCTCACATTTGATAGACAGTACGATTTTATTCTTTCGCCTGTGGTGCTGATGTTCCTTGa < 2:275864/149‑1 (MQ=255) aaaaTGCCATGAGTATCGCCAACGTCGAGCGCATTAAATCCATTGAAAATCTGGATAATTTACACACCCGAGTCGTTGATCTGAATAACCTCACATTTGATAGACAGTACGATTTTATTCTTTCGACTGTGGTGCTGATGTTCCTTGAg < 4:45956/149‑1 (MQ=255) aaaaTGCCATGAGTATCGCCAACGTCGAGCGCATTAAATCCATTGAAAATCTGGATAATTTACACACCCGAGTCGTTGATCTGAATAACCTCACATTTGATAGACAGTACGATTTTATTCTTTCGACTGTGGTGCTGATGTTCCTTGAg < 1:53663/149‑1 (MQ=255) aaTGCCATGAGTATCGCCAACGTCGAGCGCATTAAATCCATTGAAAATCTGGATAATTTACACACCCGAGTCGTTGATCTGAATAACCTCACATTTGATAGACAGTACGATTTTATTCTTTCGACTGTGGTGCTGATGTTCCTTGAGGc < 4:166994/149‑1 (MQ=255) gTATCGCCAACGTCGAGCGCATTAAATCCATTGAAAATCTGGATAATTTACACACCCGAGTCGTTGATCTGAATAACCTCACATTTGATAGACAGTACGATTTTATTCTTTCGACTGTGGTGCTGATGTTCCTTGa < 2:111503/136‑1 (MQ=255) gTATCGCCAACGTCGAGCGCATTAAATCCATTGAAAATCTGGATAATTTACACACCCGAGTCGTTGATCTGAATAACCTCACATTTGATAGACAGTACGATTTTATTCTTTCGACTGTGGTGCTGATGTTCCTTGa > 1:111503/1‑136 (MQ=255) cAACGTCGAGTGCATTAAATCCATTGAAAATCTGGATAATTTACACACCCGAGTCGTTGATCTGAATAACCTCACATTTGATAGACAGTACGATTTTATTCTTTCGACTGTGGTGCTGATGTTCCTTGAGGCTAAAACCATCCCCGGGt < 3:516259/149‑1 (MQ=255) cAACGTCGAGTGCATTAAATCCATTGAAAATCTGGATAATTTACACACCCGAGTCGTTGATCTGAATAACCTCACATTTGATAGACAGTACGATTTTATTCTTTCGACTGTGGTGCTGATGTTCCTTGAGGCTAAAACCATCCCCGGGt < 3:503353/149‑1 (MQ=255) cAACGTCGAGCGCATTAAATCCATTGAAAATCTGGATAATTTACACACCCGAGTCGTTGATCTGAATAACCTCACATTTGATAGACAGTACGATTTTATTCTTTCGTCTGTGGTGCTGATGTTCCTTGAGGCTAAAACCATCCCCGGGt > 1:477896/1‑149 (MQ=255) cGTCGAGCGCATTAAATCCATTGAAAATCTGGATAATTTACACACCCGAGTCGTTGATCTGAATAACCTCACATTTGATAGACAGTACGATTTTATTCTTTCGACTGTGGTGCTGATGTTCCTTGAGGCTAAAACCATCCCCGGGTTGa < 2:44042/149‑1 (MQ=255) cGTCGAGCGCATTAAATCCATTGAAAATCTGGATAATTTACACACCCGAGTCGTTGATCTGAATAACCTCACATTTGATAGACAGTACGATTTTATTCCTTCGACTGTGGTGCTGATGTTCCTTGAGGCTAAAACCATCCCCGGGTTGa < 3:92868/149‑1 (MQ=255) gTCGAGCGCATTAAATCCATTGAAAATCTGGATAATTTACACACCCGAGTCGTTGATCTGAATAACCTCACATTTGATAGACAGTACGATTTTATTCTTTCGACTGTGGTGCTGATGTTCCTTGAGGCTAAAACCATCCCCGGGTTGAt < 1:75893/149‑1 (MQ=255) tCGAGCGCATTAAATCCATTGAAAATCTGGATAATTTACACACCCGAGTCGTTGATCTGAATAACCTCACATTTGATAGACAGTACGATTTTATTCTTTCGACTGTGGTGCTGATGTTCCTTGAGGCTAAAACCATCCCCGGGTTGAtt < 1:343315/149‑1 (MQ=255) | TGGAAGCGGTGAAAGTGGTTAAACCGGGTAAAACGCTGGATCTGGGCTGTGGCAATGGTCGTAACAGTCTTTACCTGGCAGCCAATGGTTATGATGTTGACGCATGGGATAAAAATGCCATGAGTATCGCCAACGTCGAGCGCATTAAATCCATTGAAAATCTGGATAATTTACACACCCGAGTCGTTGATCTGAATAACCTCACATTTGATAGACAGTACGATTTTATTCTTTCGACTGTGGTGCTGATGTTCCTTGAGGCTAAAACCATCCCCGGGTTGATT > NC_000913/1501629‑1501912 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |