New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 2174580 | 144 (0.670) | 4 (0.020) | 4/512 | 18.0 | 2.7% | intergenic (‑14/+17) | gatB/gatA | galactitol‑specific enzyme IIB component of PTS/galactitol‑specific enzyme IIA component of PTS |
? | NC_000913 | 2174584 = | 144 (0.670) | intergenic (‑18/+13) | gatB/gatA | galactitol‑specific enzyme IIB component of PTS/galactitol‑specific enzyme IIA component of PTS | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 148 total aligned reads displayed.
AGAATTTTATTTTGTAATGCTTCGATACCGATACCAGAAATAAAAGGCATGCCGTGAACTAACGGAATATCGCCAAAACTACGATCCACTTTGGCAGTGGTGCATATCAAATGCACACCATCCATATAGGTTTCTATTTCATTAACCCGACACTGGATTAATTCAACAGGAATATTATGATTCTGACACAACTCTTTAATTTCTTCCGCCGCCATCGTAGAGGTCGCAACCGCGCCTCCGCAAGCGACAATAATCTTGCGTTTCATAAATAGTCCTTTTTATTGTTACAGAGGGATTTATTCGTCTGAATCTAAAACATACTTTGTGAAGTATTCCTTTAACTGGGTTTCAGGAAGAGTGATTAGTGTCTCGACGATATCGGGCTGTTGTAACTTGCCAAATAAACAGCGTAAAAGTTTCAATTGCTGCTGCGGATTTTCCACAATCAACGCAATAACCAACGATACCGCCACGTCGTTATCATCATCCGCTTGCTGAAAATGAACTTTATTTGTTGGCCTTAACAGATAAATGGCTGACGACTTAGCATGAATCGCC > NC_000913/2174301‑2174858 | aGAATTTTATTTTGTAATGCTTCGATACCGATACCAGAAATAAAAGGCATGCCGTGAACTAACGGAATATCGCCAAAACTACGATCCACTTTGGCAGTGGTGCATATCAAATGCACACCATCCATATAGGTTTCTATTTCATTAACCCGACACTGGATTAATTCAACAGGAATATTATGATTCTGACACAACTCTTTAATTTATTCCGCCGCCATCGTCAAGGTCGCAACCGCCGATCCGCAAGCGACAACAATCTTGCGTTTCATAATAAGTCAttttt > 4:287408/1‑280 (MQ=255) ttGTAATGCTTCGATACCGATACCAGAAATAAAAGGCATGCCGTGAACTAACGGAATATCGCCAAAACTACGATCCACTTTGGCAGTGGTGCATATCAAATGCACACCATCCATATAGGTTTCTATTTCATTAACCCGACACTGGATTAATTCAACAGGAATATTATGATTCTGACACAACTCTTTAATTTCTTCCGCCGCCATCGTAGAGGTCGCAACCGCGCCTCCGCAAGCGACAATAATCTTGCGTTTCATAAATAGTCCTTTTTATTGTTACaga < 2:524179/280‑1 (MQ=255) ttgaaTGCTTCGATACCGAGACCCGAAATAAACGGCATGCCGTGAACTAACGCAATATCGCCAAAACTACGATCCACTTGGGCAGTGGTGCATATCAAATGCACACCATCCATATAGGTTTCTATTTCATTAACCCGACACTGGATTAATTCAACAGGAATATTATGATTCTGACACAACTCTTTAATTTCTTCCGCCGCCATCGTAGAGGTCGCAACCGCGCCTCCGCAAGCGACAATAATCTTGCGTTTCATAAATAGTCCTTTTTATTGTTACagag < 2:555371/277‑1 (MQ=255) tAATGCTTCGATACCGATACCAGAGATAAAAGGCATGCCGTGAACTAACGGAATATCGCCAAAACTACGATCCACTTTGGCAGTGGTGCATATCAAATGCACACCATCCATATAGGTTTCTATTTCATTAACCCGACACTGGATTAATTCAACAGGAATATTATGATTCTGACACAACTCTTTAATTTCTTCCGCCGCCATCGTAGAGGTCGCAACCGCGCCTCCGCCAGCGACCATAATCTTTCGTGTACTCAATAGTCCTTTTTTTTTGTACa > 3:424656/1‑275 (MQ=255) aaaccAGAAAAAAAAGGCAATCCGTGAACTAACGGAATATCGCCAAAACTACGCTCCACTTTGGCAGTTGTGCATATCAAATGCACACCATCCATATAGGTTTCTATTTCATTAACCCGACACTGGATTAATTCAACAGGAATATTATGATTCTGACACAACTCTTTAATTTCTTCCGCCGCCATCGTAGAGGTCGCAACCGCGCCTCCGCAAGCGACAATAATCTTGCGTTTCATAAATAGTCCTTTTTATTGTTACAGAGGGATTTATTCGTCTGAAt < 4:660505/278‑1 (MQ=255) aGAAATAAAAGGCATGCCGTGAACTAACGGAATATCGCCAAAACTACGATCCACTTTGGCAGTGGTGCATATCAAATGCACACCATCCATATAGGTTTCTATTTCATTAACCCGACACTGGATTAATTCAACAGGAATATTATGATTCTGACACAACTCTTTAATTTCTTCCGCCGCCATCGTAGAGGTCGCAACCGCGCCTCCGCAAGCGACAATAATCTTGCGTTTCATAAATAGTCCTTTTTATTGTTACAGAGGGATTTATTCGTCTGAAt < 1:710397/275‑1 (MQ=255) gaaaaGGCATGCCGTACACTAACGGAATATCGCCAAACATCCGATCCAATTTGGCAGTGGTGCATATCAAATGCACACCATCCATATAGGTTTCTATTTCATTAACCCGACACTGGATTAATTCAACAGGAATATTATGATTCTGACACAACTCTTTAATTTCTTCCGCCGCCATCGTAGAGGTCGCAACCGCGCCTCCGCAAGCGACAATAATCTTGCGTTTCATAAATAGTCCTTTTTATTGTTACAGAGGGATTTATTCGTCTGAATCTAAAACATa < 2:75753/279‑1 (MQ=255) aaaGGCATGCCGTGAACTAACGGAATATCGCCAAAACTACGATCCACTTTGGCAGTGGTGCATATCAAATGCACACCATCCATATAGGTTTCTATTTCATTAACCCGACACTGGATTAATTCAACAGGAATATTATGATTCTGACACAACTCTTTAATTTCTTCCGCCGCCATCGTAGAGGTCGCAACCGCGCCTCCGCAAGCGACAATAATCTTGCGTTTCATAAATAGTCCTTTTTATTGTTACAGAGGGATTTATTCGTCTGAATCTAAAAc < 1:150419/275‑1 (MQ=255) agCATGCCGTGAACTAAACGAATATCGCCAAAACTACGATCCACTTTTGCATTGGTGCATATCAAATGCACACCATCCATATAGGTTTCTATTTCATTAACCCGACACTGGATTAATTCAACAGGAATATTATGATTCTAACACAACTCTTTAATTTCTTCCGCCGCCATCGTAGAGGTCGCAACCGCGCCTCCGCAAGCGACAATAATCTTGCGTTTCATAAATAGTCCTTTTTATTGTTACAGAGGGATTTATTCGTCTGAATCTAAAACAt < 3:1169463/273‑1 (MQ=255) tGCCGTGAACTAACGGAATATCGCCAAAACTACGATCCACTTTGGCAGTGGTGCATATCAAATGCACACCATCCATATAGGTTTCTATTTCATTAACCCGACACTGGATTAATTCAACAGGAATATTATGATTCTGACACAACTCTTTAATTTCTTCCGCCGCCATCGTAGAGGTCGCAACCGCGCCTCCGCAAGCGGCAATATTCTTGCGTTTCATAAATAGTCCTTTTTATTGTTACAGAGGGCTCTATTCGTCTGACTCTAAAACATACttt > 1:1176147/1‑275 (MQ=255) tGCCGTGAACTAACGGAATATCGCCAAAACTACGATCCACTTTGGCAGTGGTGCATATCAAATGCACACCATCCATATAGGTTTCTATTTCATTAACCCGACACTGGATTAATTCAACAGGAATATTATGATTCTGACACAACTCTTTAATTTCTTCCGCCGCCATCGTAGAGGTCGCAACCGCGCCTCCGCAAGCGACAATAATCTTGCGCTTCATAACTAGTCCTTTTTCTTGTTACAGTGGGATTTATTCGTTTGAATCTAAAACATACttt > 3:101052/1‑275 (MQ=255) cGTGAACTAACGGAATATCGCCAAAACTACGATCCACTTTGGCAGTGGTGCATATCAAATGCACACCATCCATATAGGTTTCTATTTCATTAACCCGACACTGGATTAATTCAACAGGAATATTATGATTCTGACACAACTCTTTAATTTCTTCCGCCGCCATCGTAGAGGTCGCAACCGCGCCTCCGCAAGCGACAATAATCTTGCGTTTCATAAATAGTCCTTTTTATTGTTACAGAGGGATTTATTCGTCTGAATCTAAAACATACTTtgtg < 1:311088/275‑1 (MQ=255) aCGGAATATCGCCAAAACTACGATCCACTTTGGCAGTGGTGCATATCAAATGCACACCATCCATATAGGTTTCTATTTCATTAACCCGACACTGGATTAATTCAACAGGAATATTATGATTCTGACACAACTCTTTAATTTCTTCCGCCGCCATCGTAGAGGTCGCAACCGCGCCTCCGCAAGCGACAATAATCTTGCGTTTCATAAATAGTCCTTTTTATTGTTACAGAGGGATTTATTCGTCTGAATC‑AAAACATACTTTGTGAAGTATTCCt > 1:827585/1‑275 (MQ=255) cGGAATATCGCCAAAACTACGATCCACTTTGGCAGTGGTGCATATCAAATGCACACCCTCCATATAGGTTTCTATTTCATTAACCCGACACTGGATTAATTCAACAGGAATATTATGATTCTGACACAACTCTTTAATTTCTTCCGCCGCCATCGTAGAGGTCGCAACCGCGCCTCCGCACGCGACAATAATCTTGCGTTTCATAAATAGTCCTTTTTATTGTTACAGAGGGATTTATTCGTCTGAATCTAAAACATACTTTGTGAAGTCTTCCTTTaat > 2:675478/1‑279 (MQ=255) cGGAATATCGCCAAAACTACGATCCACTTTGGCAGTGGTGCATATCAAATGCACACCATCCATATAGGTTTCTATTTCATTAACCCGACACTGGATTAATTCAACAGGAATATTATGATTCTGACACAACTCTTTAATTTCTTCCGCCGCCATCGTAGAGGTCGCAACCGCGCCTCCGCAAGCGACAATAATCTTGCGTTTCATAAATAGTCCTTTTTATTGTTACAGAGGGAGTTATTCGTCTGAATCTAAAACATACTTTGTGAAGTATTCCt > 1:1078714/1‑275 (MQ=255) atCGACAAAACTGCGTTACAATTTGGCAATGGCTCATATCAAATGCACACCATCCATATAGGTTTCTATTTCATTAAACCGACACTGGATTAATTCAACAGGAATATTATGATTCTGACACAACTCTTTAACTTCTTCCGCCGCCATCGTAGAGGTCGCAACCGCGCCTCCGCAAGCGACAATAATCTTGCGTTTCATAAATAGTCCTTTTTATTGTTACAGAGGGATTTATTCGTCTGAATCTAAAACATACTTTGTGAAGTATTCCTTTAAc < 3:374893/274‑1 (MQ=255) tCGCCAAAACTACGATCCACTTTGGCAGTGGTGCATATCAAATGCACACCATCCATATAGGTTTCTATTTCATTAACCCGACACTGGATTAATTCAACAGGAATATTATGATTCTGACACAACTCTTTAATTTCTTCCGCCGCCATCGTAGAGGTCGCAACCGCGCCTCCGCAAGCGACAATAATCTTGCGTTTCATAAATAGTCCTTTTTATTGTTACAGAGGGATTTATTCGTCTGAATCTAAAACATACTTTGTGAAGTATTCCTTTAACTGGGttt > 2:510209/1‑280 (MQ=255) cGCCAAAACTACGATCCACTTTGGCAGTGGTGCATATCAAATGCACACCATCCATATAGGTTTCTATTTCATTAACCCGACACTGGATTAATTCAACAGGAATATTATGATTCTGACACAACTCTTTAATTTCTTCCGCCGCCATCGTAGAGGTCGCAACCGCGCCTCCGCAAGCGACAATAATCTTGCGTTTCATAAATAGTCCTTTTTATTGTTACAGAGGGATTTATTCGTCTGAATCTAAAACATACTTTGTGAAGTATTCCTTTAACTGGGTTTc > 2:906955/1‑280 (MQ=255) aaaCTACGATCCACTTTGGCAGTGGTGCATATCAAATGCACACCATCCATATAGGTTTCTATTTCATTAACCCGACACTGGATTAATTCAACAGGAATATTATGATTCTGACACAACTCTTTAATTTCTTCCGCCGCCATCGTAGAGGTCGCAACCGCGCCTCCGCAAGCGACAATAATCTTGCGTTTCATAAATAGTCCTTTTTATTGTTACAGAGGGATTTATTCGTCTGAATCTAAAACATACTTTGTGAAGTATTCCTTTAACTGGGTTTc > 1:245616/1‑275 (MQ=255) tccGATCCACTTTGGCAGTGGTGCATATCAAATGCACAACATCCATATAGGTTTCTATTTCATTAACCCGACACTGGATTAATTCAACAGGAATATTATGATTCTGACACAACTCTTTAATTTCTTCCGCCGCCATCGTAGAGGTCGCAACCGCGCCTCCGCAAGCGACAATAATCTTGCGTTTCATAAATAGTCCTTTTTATTGTTACAGAGGGATTTATTCGTCTGAATCTAAAACATACTTTGTGAAGTATTTCTTTAACTGGGTTTCAGGa < 1:167804/273‑1 (MQ=255) aCGATCCATTTTGGCAGTGGTGCATATCAAATGCACACCATCCATATAGGTTTCTATTTCATTAACCCGACACTGGATTAATTCAACAGGAATATTATGATTCTGACACAACTCTTTAATTTCTTCCGCCGCCATCGTAGAGGTCGCAACCGCGCCTCCGCAAGCGACAATAATCTTGCGTTTCATAAATAGTCCTTTTTATTGTTACAGAGGGATTTATTCGTCTGAATCTAAAACATACTTTGTGAAGTATTCCTTTAACTGGGTTTCAGGa < 1:101052/274‑1 (MQ=255) gATCCACTTTGGCAGTGGTGCATATCAAATGCACACCATCCATATAGGTTTCTATTTCATTAACCCGACACTGGATTAATTCAACAGGAATATTATGATTCTGACACAACTCTTTAATTTCTTCCGCCGCCATCGTAGAGGTCGCAACCGCGCCTCCGCAAGCGACAATAATCTTGCGTTTCATAAATAGTCCTTTTTATTGTTACAGAGGGATTTATTCGTCTGAATCTAAAACATACTTTGTGAAGTATTCCTTTAACTGGGTTTCAGGAaga > 1:412342/1‑275 (MQ=255) aCTTTGGCAGTGGTGCATATCAAATGCACACCATCCATATAGGTTTCTATTTCATTAACCCGACACTGGATTAATTCAACAGGAATATTATGATTCTGACACAACTCTTTAATTTCTTCCGCCGCCATCGTAGAGGTCGCAACCGCGCCTCCGCAAGCGACAATAATCTTGCGTTTCATAAATAGTCCTTTTTATTGTTACAGAGGGATTTATTCGTCTGAATCTAAAACATACTTTGTGAAGTATTCCTTTAACTGGGTTTCAGGAAGAGTGAt < 1:931681/275‑1 (MQ=255) tttGGCAGGGGTGCATATCAAATGAACACCATCCAAATAGGTTTCTATTTCATTAACCCGACACTTGATTAATTCAACAGGAATATTATGATTCTGACACAACTCTTTAATTTCTTCCGCCGCCATCGTAGAGGTCGCAACCGCGCCTCCGCAAGCGACAATAATCTTGCGTTTCATAAATAGTCCTTTTTATTGTTACAGAGGGATTTATTCGTCTGAATCTAAAACATACTTTGTGAAGTATTCCTTTAACTGGGTTTCAGGAAGAGTGATTa < 3:378106/275‑1 (MQ=255) tGGCAGTGGTGCATATCAAATGCACACCATCCATATAGGTTTCTATTTCATTAACCCGACACTGGATTAATTCAACAGGAATATTATGATTCTGACACAACTCTTTAATTTCTTCCGCCGCCATCGTAGAGGTCGCAACCGCGCCTCCGCAAGCGACAATAATCTTGCGTTTCATAAATAGTCCTTTTTATTGTTACAGAGGGATTTATTCGTCTGAATCTAAAACATACTTTGTGAAGTATTCCTTTAACTGGGTTTCAGGAAGAGTGATTAgt < 3:412342/275‑1 (MQ=255) 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atatCAAATGCAAACCATCCATTTAGGTTGCTATTTCATTAACCCGACCATTTATTAATTCAAAAGGAATATTATGATTCTGACACAACTCTTTAATTTCTTCCGCCGCCATCGTAGAGGTCGCAACCGCGCCTCCGCAAGCGACAATAATCTTGCGTTTCATAAATAGTCCTTTTTATTGTTACAGAGGGATTTATTCGTCTGAATCTAAAACATACTTTGTGAAGTATTCCTTTAACTGGGTTTCAGGAAGAGTGATTAGTGTCTCGACGATATCgg < 2:480523/279‑1 (MQ=255) tatCAAATGCACACCATCCATATAGGTTTCTATTTCATTAACCCGACACTGGATTAATTCAACAGGAATATTATGATTCTGACACAACTCTTTAATTTCTTCCGCCGCCATCGTAGAGGTCGCAACCGCGCCTCCGCAAGCGACAATAATCTTGCGTTTCATAAATAGTCCTTTTTATTGTTACAGAGGGATTTATTCGTCTGAATCTAAAACATACTTTGTGAAGTATTCCTTTAACTGGGTTTCAGGAAGAGTGATTAGTGTCTCGACGATATCggg < 2:287408/279‑1 (MQ=255) tatCAAATGCAAACCATCCATATAGGTTTCTATTTCAGTAACCCGACACTGGATTAATTCAACAGGAATATTAGGATTCTGACACAACTCTTTAATTTCTTCCGCCGCCATCGTAGAGGTCGCAACCGCGCCTCCGCAAGCGACAATAATCTTGCGTTTCATAAATAGTCCTTTTTATTGTTACAGAGGGATTTAGTCGTCTGAATCTAAAACATACTTTGTGAAGTATTCCTTTAACTGGGTTTCAGGAAGAGTGATTAGTGTCTAGACGATATCggg < 2:34953/279‑1 (MQ=255) 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1:882513/178‑1 (MQ=255) tccatATAGGTTTCTATTTCATTAACCCGACACTGGATTAATTCAACAGGAATATTATGATTCTGACACAACTCTTTAATTTCTTCCGCCGCCATCGTAGAGGTCGCAACCGCGCCTCCGCAAGCGACAATAATCTTGCGTTTCATAAACAGTCCTTTTGATTGTTACAGAGGGATCTATTCGTCTGAATCTAAAACATACTTTGTGAAGTATTCCTTTAACTGGGTTTCAGGAAGAGTGATTAGTGTATTGACGAGACCGGTCTGTTGTAACtt > 1:868468/1‑275 (MQ=255) taGGTTTCTATTTCATTAACCCGACACTGGATTAATTCAACAGGAATATTATGATTCTGACACAACTCTTTAATTTCTTCCGCCGCCATCGTAGAGGTCGCAACCGCGCCTCCGCAAGCGACAATAATCTTGCGTTTCATAAATAGTCCTTTTTATTGTTACAGAGGGATTTATTCGTCTGAATCTAAAACATACTTTGTGAAGTATTCCTTTAACTGGGTTTCAGGAAGAGTGATTAGTGTCTCGACGATATCGGGCTGTTGTAACTTGCCAAATAAAc > 2:867858/1‑280 (MQ=255) aGGTTTCAATTTCTATAACCAGACATCTGATTAATTCAACAGGAATATTATGATTCTGACACAACTCTTTAATTTCTTCCGCCGCCATCGTAGAGGTCGCAACCGCGCCTCCGCAAGCGACAATAATCTTGCGTTTCATAAATAGTCCTTTTTATTGTTACAGAGGGATTTATTCGTCTGAATCTAAAACATACTTTGTGAAGTATTCCTTTAACTGGGTTTCAGGAAGAGTGATTAGTGTCTCGACGATATCGGGCTGTTGTAACtt < 4:151738/268‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |