| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 696506 | 165 (0.760) | 3 (0.020) | 3/362 | 15.5 | 2.4% | intergenic (‑2/+36) | glnX/glnV | tRNA‑Gln/tRNA‑Gln |
| ? | NC_000913 | 696619 = | 131 (0.870) | intergenic (‑3/+45) | glnV/metU | tRNA‑Gln/tRNA‑Met | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 165 total aligned reads displayed.
GAAGGATAAGACGTGTCAACATCGCATTCGACATTGAATGAACGCAGAAAAGCAAAAAGCTCGCCGAAGCGAGC‑TTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAAT‑CAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACTGGGTGCACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTACGACGGGATTCGAACCTGTGACCCCATCATTATGAGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAAT > NC_000913/696346‑696896 | gATAAGACGTGTCAACATAGCATTCGACATTGAATGAACGCAGAAAAGCAAAAAGCTCGCCGAAGCGAGC‑TTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAAT‑CAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACTGGGTGCACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAAt < 1:1165939/273‑1 (MQ=255) tAAGACGTGTCAACATCGCATTCGACATTGAATGAACGCAGAAAAGCAAAAAGCTCGCCGAAGCGAGC‑TTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAAT‑CAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACTGCGTGCATTTACAAGGTAAGATTATTTAATGAATTGGCTGGGGTACTAGGATTCCATCCTCGGACAGCCGGAATAGCAATCCGGTCCCTTACCGCTTGCCTGTACCCACACAAAGTGGt > 3:391681/1‑275 (MQ=37) aaGACGTGTCAACATCGCATTCGACATTGAATGAACGCAGAAAAGCAAAAAGCTCGCCGAAGCGAGC‑TTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAAT‑CAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACTGGGTGCACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGTTACGAGGATTCGACACTAGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTTCCTTACCGCTTGGGCATACCCCAACAAAGTGGTTTTGaa > 4:274381/1‑280 (MQ=255) gtCAACATCGCATTCGACATTGAATGAACGCAGAAAAGCAAAAAGCTCGCCGAAGCGAGC‑TTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAAT‑CAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACTGGGTGCACTTCCAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGACCCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCAGGTGCCTTACCGCTTGGAGATACACCAACAAATTGGTTTTGAAtt > 1:438545/1‑275 (MQ=255) gtCAACATCGCATTCGACATTGAATGAACGCAGAAAAGCAAAAAGCTCGCCGAAGCGAGC‑TTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAAT‑CAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACTGGGTGCACTTACAATGTAAGAGTCTTTAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACGTAGGAATGACGGAATCAGAATCCGTTGCCTTACCGTCTGACTACACCCCAACAACTTGTCTTTTAAATTGca > 4:632697/1‑278 (MQ=37) gtCAACATCGCATTCGACATTGAATGAACGCAGAAAAGCAAAAAGCTCGCCGAAGCGAGC‑TTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAAT‑CAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACTGGGTGCACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAAACTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGTTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATGGGTTTTGAAtt > 1:995484/1‑275 (MQ=255) tCAACAGCGCATTCGACATTGAATGAACGGAGAAAAGCAAAAAGCGCTCCGAAGCGAGC‑TTTTTTAAGGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAAT‑CAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACTGGGTGCACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCg < 2:420634/279‑1 (MQ=255) cAACATCGCATTCGACATTGAATGAACGCAGAAAAGCAAAAAGCTCGCCGAAGCGAGC‑TTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAAT‑CAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACTGGGTGCACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTg < 1:489850/275‑1 (MQ=255) aaaCATCGCATTCGACATTGAATGAACGCAGAAAAGCAAAAAGCTCGCCGAATCGAGCTTTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACATCGGAATGCCGGAAT‑CAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACTGGGTGCACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGa < 2:287927/279‑1 (MQ=255) tgcgatggtatttGAAAGAACGCAGAAAAGCAGAAAGGTCGACGATTAGAGC‑TTGATTATGTTGGGCGAGGGACGGAGGTGCGAACCTCTGAATGACGGGAC‑CAGCAGACAGGGCCTTACCCCTTGGCTATACCCCGAATGGGTGCACTTACCACGTAAGCGTTTAGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGACGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAAc < 3:655768/264‑1 (MQ=16) cATTCGACATTGAATGAACGCAGAAAAGCAAAAAGCTCGCCGAAGCGAGC‑TTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAAT‑CAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACTGGGTGCACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTTCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCg > 2:384122/1‑280 (MQ=255) cATTCGACATTGAATGAACGCAGAAAAGCAAAAAGCTCGCCGAAGCGAGC‑TTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAAT‑CAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACTGGGTGCACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACat > 1:936562/1‑275 (MQ=255) aCATTGAATGAACGCAGAAAAGCAAAAAGCTCGCCGAAGCGAGC‑TTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAAT‑CAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACTGGGTGCACTTACAAGGTAAGCGCCTTGAATAAATTGTCTGGGGTACGAGGATTCGACCCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCAGGTGCCTTACCGCTTGGCCATACCCCAACAAATTGGTTTTGACTGTGTCGacacatgtcga > 1:415684/1‑265 (MQ=38) aCGCAGAAAAGCAAAAAGCTCGCCGAAGCGAGC‑TTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAAT‑CAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACTGGGTGCACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTCCCGCTTGGCGATAACCAAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAAtgtg > 2:838517/1‑279 (MQ=255) aCGCAGAAAAGCAAAAAGCTCGCCGAAGCGAGC‑TTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAAT‑CAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACTGGGTGCACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTtg > 2:345544/1‑279 (MQ=255) aggtCGCCGAAGCGAGC‑TTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAAT‑CAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACTGGGTGCACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTacgacg < 1:1033421/272‑1 (MQ=255) aGCTCGCCGAAGCGAGC‑TTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAAT‑CAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACTGGGTGCACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTCTTGAATTTTCCGAACATATTCGATACATTCTGATTTTGGTGGCTacgacc > 1:382232/1‑274 (MQ=255) gCTGGCCGGAGGGGGC‑TGTTTTAATTGGGCTGGGGTACGAGGATTCCAACCTCGGAAAGCCAGAAA‑CAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGACGATACCCCAACTGGGTGCACGTACAACGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTacgacg < 3:129374/274‑1 (MQ=38) gCCGAAGCGAGC‑TTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAAT‑CAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACTGGGTGCACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATACATTGGCTGGGGTACGAGGATTCCAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACTCCAACAAATTGGTTTTGAATTTgtc > 1:36658/1‑229 (MQ=255) aaGCGAGC‑TTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGGATGCCGGAAT‑CAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACTGGGTGCACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAAGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTACGACGGGATTCGAACCtgt < 2:146683/280‑1 (MQ=255) gCGAGC‑TTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTAGAACCTCGGAATGCCGGAAT‑CAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACTGGGTGCACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTACGACGGGATTCGAACCTGTGa < 2:495764/280‑1 (MQ=255) cGAGC‑TTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAAT‑CAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACTGGGTGCACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTACGACGGGATTCGAACCTGTGAc < 2:274381/280‑1 (MQ=255) taggttttttAAACGGGCTGGAGTAGTGGGATGCGAACATGGGCATACCAGACT‑CAGGAACCGGGGCCTTAGCGCTTGGAGGTACCCCAAATGGGTGAACTTACAAGGTAAGCGGCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTACGACGGGATTCGAACCTGTGAc < 4:384122/275‑1 (MQ=25) c‑TTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGTATTCGAATCTAGGAATGCCGGAAT‑CAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACTGGGTGCACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTACGACGGGATTCGAACCTGTGAcccc < 2:608533/279‑1 (MQ=255) tttttGATGTGTCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCCGACTGCCTGACA‑CAAGATCCGGCGCCTTCCCGCTTGGCGATACCGCAACAGGGTGCAAGTACAAGGTAAGCGTCTTTGATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTACGACGGGATTCGAACCTGTGAcc < 3:1094025/275‑1 (MQ=37) tttaacggtgCTTGGGGACGAGGAGTCGAACCTCGTAAAGACCGAAT‑CAGAATCCGGTGCCTTAACGATTGGCGATACGCCGAAAGGGTGCACATACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTACGACGGGATTCGAACCTGTGACCCcatcat < 4:345544/271‑1 (MQ=37) tttAATGTGGCTTGGGTACGAGGATTCGAACCTCGTAATGGCGGAAT‑CAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACTGGGTACACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTACGACGGGATTCGAACCTGTGAcccc < 1:829210/275‑1 (MQ=255) ttgattgggatGGGGTAAGAGGAGTCGAACCGCGGAATGCCGGAAT‑CAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACTGGGTGCACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTACGACGGGATTCGAACCTGTGAcccc < 1:333027/264‑1 (MQ=255) ttAATGTGGCTGGGGTACGAGTATTCGAACGTCGGAATGCCGGAAT‑CAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACTGGGTACACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTACGACGGGATTCGAACCTGTGAcccc < 1:53579/274‑1 (MQ=255) ttAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAAT‑CAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACTGGGTGCACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTACGACGGGATTCGAACCTGTGAcccc < 1:182786/274‑1 (MQ=255) ttAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAAT‑CAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACTGGGTGCACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTACGACGGAATTCGAACCTGTGACCCca < 1:755344/275‑1 (MQ=255) taaagtgggcggtggTACGAAGTGTCGAACCTCGGAATGCAGGAAT‑CAGAATCCAGCTCCTTACAGCTTGACGATACCCCAAATGGGTACACTTGCAAGGTAAGCGTCTTGATTAAATTGGCTGGCGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTACGACGGGATTCGAACCTGTGACCCcatcat < 4:1945/266‑1 (MQ=37) aggtgGCGGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAAT‑CAGAATCCGGGGCCGTACCGCTTGGCGATACCCCAACTGGGTGCACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTACGACGGGATTCGAACCTGTGACCCcatc < 1:663692/272‑1 (MQ=255) aTGTGGCGGGGGGAGTGGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAAT‑CAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACTGGGTGCACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTACGACGGGATTCGAACCTGTGACCCCATCATTAt < 2:256076/279‑1 (MQ=255) ggggCTGGGGGACGGGGGTACGAACGTCGCAATG‑CGGAATACAGGACCCGAGGCCTTTCCGCTTTGCCATACCCCAACTTGGTGCACCTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGGTGGGATACGAGGATTCGAAGCTCGGAATGCCGGAAGCAGAATCCGGTGCATTCCCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTACGACGGGATTCGAACCTGTGACCCcatcat < 3:1197765/272‑1 (MQ=255) gCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAAT‑CAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACTGGGTGCACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAACTGGTCTTGAATTTGCCGAACATAGTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCGACGCCGGGATTCGAACCTGGGACCCCACCATTATg > 1:715821/1‑275 (MQ=255) gggTACGAGGAATCGAACCTCGGAATGCCGGAAG‑CAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACTGGGTGCACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTACGACGGGATTCGAACCTGTGACCCCATCATTATGAGTGAtgtg < 2:84857/280‑1 (MQ=255) gTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAAT‑CAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACTGGGTGCACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTACGACGGGATTCGAACCTGTGACCCCATCATTATGAGTGAt < 1:814894/275‑1 (MQ=255) aCGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAAT‑CAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACTGGGTGCACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTGGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATAGTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTACGACGGGATTCGAACCTGTGACCCCATCATTATGAGTGAtgt > 1:50001/1‑275 (MQ=255) gAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAAT‑CAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACTGGGTGCACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTACGACGGGATTCGAACCTGTGACCCCATCATTATGAGTGATGTGCTCTa < 2:632697/279‑1 (MQ=255) aGGGTTCCAACCTCGGAATGCCGGAAA‑CGGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGGTACCCCAACTGGGTGCACTTACAAGGAAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTACGACGGGATTCGAACCTGTGACCCCATCATTATGAGTGATGTGct < 3:696927/275‑1 (MQ=255) ttCGAACCTCGGAAGGCCGGAAT‑CAGAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACTGGGTGCACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTACGACGGGATTCGAACCTGTGACCCCATCATTATGAGTGATGTGCTCTAACCaa < 2:915152/279‑1 (MQ=255) ttCGAACCTAAGAATGCCGGAAT‑CAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACTGGGTGCACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTACCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTACGACGGGATTCGAACCTGTGACCCCATCATTATGAGTGATGTGCTCTAACCaa < 4:405154/279‑1 (MQ=255) 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t‑CAGATTCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGGTACGCCAACTGGGTGCACGTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTACGACGGGATTCGAACCTGTGACCCCATCATTATGAGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGa < 1:8625/275‑1 (MQ=255) cGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACTGGGTGCACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTACGACGGGATTCGAACCTGTGACCCCATCATTATGAGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGa < 2:537566/279‑1 (MQ=255) ggTTCCTTACCGCTTGTCGATACCCCAACTGGGTGCACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAATTTGGCTGGGGTACGAGGTTTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTACGACGGGATTCGAACCTGTGACCCcatcat < 2:691475/225‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |