Predicted mutation | ||||||
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RA | NC_000913 | 1,685,527 | A→G | G354G (GGT→GGC) | fumC ← | fumarate hydratase (fumarase C),aerobic Class II |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 1,685,527 | 0 | A | G | 97.1% | 721.6 / ‑5.6 | 211 | G354G (GGT→GGC) | fumC | fumarate hydratase (fumarase C),aerobic Class II |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/0); major base G (116/87); minor base T (3/3); total (121/90) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.90e-01 |
Only 100 of 211 total aligned reads displayed.
ATACCCCAGCGCAAGGGCCGCAGCTTTTAAGGTCAGCCCTTCTTTA‑TGCGCTTTTTTGGCGATCTCGGCGGCTTTGTCATAACCAATGTGGGTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTACCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTTGGGTTCACTTTCCCCGGCATGATTGAGCTGCCCGGCTCATTTTCCGGGATTGAGATTTCACCAATTCCGCAGCGCGGGCCAGAGGCCAGCCAGCGGACATCATTGGCGA‑TTTTCATCAGTGACGCAGCCAACCCTTTCAACGCGCCGTGCGCCTGAACCAGGGCATCACAGGTCGCCAGCGCTTCAAA > NC_000913/1685257‑1685796 | cccAGCGCAAGGGCCGCAGCTTTTAAGGTCAGCCCTTCTTTA‑TGCGCTTTTTTGGCGATCTCGGCGGCTTTGTCATAACCAATGTGGGTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACAATTGGACGGCAGACGTTCAGTTCAAAGTTGCGGGagtc > 1:374382/1‑272 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |