| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_000913 | 3787895 = | 808 (2.880) | 4 (0.020) | 4/248 | NT | 0.53% | coding (1058/1260 nt) | envC | activator of AmiB,C murein hydrolases, septal ring factor |
| ? | NC_000913 | = 3787891 | 763 (2.940) | coding (1054/1260 nt) | envC | activator of AmiB,C murein hydrolases, septal ring factor | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 922 total aligned reads displayed.
CGCTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGATTGCCGACGGTCGGGTGATTCTGGCTGACTGGCTGCAAGGCTACGGTC‑‑‑TGGTGGTGGTGGTTGAGCATGGTAAAGGCGACATGAGTCTTTACGGCTATAATCAGAGCGCACTGGTGAGCGTTGGTTCGCAGGTTCGCGCGGGCCAGCCGATTGCACTGGTGGGCAGCAGTGGCGGTCAGGGTCGGCCTTCACTCTATTTC > NC_000913/3787754‑3788043 | ggccgacgctgcatcgctatggcgaacagctacagggtgaattacgctggaaaggtatggttatcggtgcttctgaaggtactgaagttaaagcgattgccgacggtcgggtgattctggctgactggctgcaaggctacggtctggtg < 3:1654676‑M1/5‑1 (MQ=255) gCTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGATTGCCGACGGTCGGGTGATTCTGGCTGACTGGCTGCAAGGCTACGGTC‑‑‑tggtggtggtgg < 1:1390496/149‑1 (MQ=255) gCTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGATTGCCGACGGTCGGGTGATTCTGGCTGACTGGCTGCAAGGCTACGGTC‑‑‑tggtggtggtgg < 1:2166122/149‑1 (MQ=255) tGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGATTGCCGACGGTCGGGTGATTCTGGCTGACTGGCTGCAAGGCTACGGTC‑‑‑TGGTGGTGGTGGtt < 3:1780056/149‑1 (MQ=255) gacgctgcatcgctatggcgaacagctacagggtgaattacgctggaaaggtatggttatcggtgcttctgaaggtactgaagttaaagcgattgccgacggtcgggtgattctggctgactggctgcaaggctacggtctggtggtgg > 4:1856263‑M1/141‑149 (MQ=255) cATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGATTGCCGACGGTCGGGTGATTCTGGCTGACTGGCTGCAAGGCTACGGTC‑‑‑TGGTGGTGGTGGTTGa < 3:2438520/149‑1 (MQ=255) cATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGATTGCCGACGGTCGGGTGATTCTGGCTGACTGGCTGCAAGGCTACGGTC‑‑‑TGGTGGTGGTGGTTGa < 4:287942/149‑1 (MQ=255) aTCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGATTGCCGACGGTCGGGTGATTCTGGCTGACTGGCTGCAAGGCTACGGTC‑‑‑TGGTGGTGGTGGTTGAg > 2:906545/1‑149 (MQ=255) gCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGATTGCCGACGGTCGGGTGATTCTGGCTGACTGGCTGCAAGGCTACGGTC‑‑‑TGGTGGTGGTGGTTGAGCAt > 4:864685/1‑149 (MQ=255) cTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGATGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGATTGCCGACGGTCGGGTGATTCTGGCTGACTGGCTGCAAGGCTACGGTC‑‑‑TGGTGGTGGTGGTTGAGCATg < 3:1991464/149‑1 (MQ=255) gCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGATTGCCGACGGTCGGGTGATTCTGGCTGACTGGCTGCAAGGCTACGGTC‑‑‑TGGTGGTGGTGGTTGAGCATGGTaaa < 1:662155/149‑1 (MQ=255) cGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGATTGCCGACGGTCGGGTGATTCTGGCTGACTGGCTGCAAGGCTACGGTC‑‑‑TGGTGGTGGTGGTTGAGCATGGTAAAg < 1:1207889/149‑1 (MQ=255) gAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGATTGCCGACGGTCGGGTGATTCTGGCTGACTGGCTGCAAGGCTACGGTC‑‑‑TGGTGGTGGTGGTTGAGCATGGTAAAgg < 2:457062/149‑1 (MQ=255) aaCAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGATTGCCGACGGTCGGGTGATTCTGGCTGACTGGCTGCAAGGCTACGGTC‑‑‑TGGTGGTGGTGGTTGAGCATGGTAAAGGc > 3:1907934/1‑149 (MQ=255) cAGCTATAGGGTGAATTACGCTGTAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAATGTACTGAAGTGAAAGCGATTGCCGACGGTCGGGTGATTCTGGCTGACTGGCTGCAAGGCTACGGTC‑‑‑TGGTGGTGGTGGTTGAGCATTGTAAAGGCGa < 2:1593204/149‑1 (MQ=255) cAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGATTGCCGACGGTCGGGTGATTCTGGCTGACTGGCTGCAAGGCTACGGTC‑‑‑TGGTGGTGGTGGTTGAGCATGGTAAAGGCGa < 1:954108/149‑1 (MQ=255) cAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGATTGCCGACGGTCGGGTGATTCTGGCTGACTGGCTGCAAGGCTACGGTC‑‑‑TGGTGGTGGTGGTTGAGCATGGTAAAGGCGa < 2:814533/149‑1 (MQ=255) cTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGATTGCCGACGGTCGGGTGATTCTGGCTGACTGGCTGCAAGGCTACGGTC‑‑‑TGGTGGTGGTGGTTGAGCATGGTAAAGGCGACAt < 1:815720/149‑1 (MQ=255) 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2:2312629/1‑149 (MQ=255) ttCTGGCTGACTGGCTGCAAGGCTACGGTC‑‑‑TGGTGGTGGTGGTTGAGCATGGTAAAGGCGACATGAGTCTTTACGGCTATAATCAGAGCGCa < 2:197557/92‑1 (MQ=255) ttCTGGCTGACTGGCTGCAAGGCTACGGTC‑‑‑TGGTGGTGGTGGTTGAGCATGGTAAAGGCGACATGAGTCTTTACGGCTATAATCAGAGCGCACTGGTGAGCGTTGGTTCGCAGGTTCGCGCGGGCCAGCCGATTGCACTGGTGGgcagc > 4:1237885/1‑149 (MQ=255) ttCTGGCTGACTGGCTGCAAGGCTACGGTC‑‑‑TGGTGGTGGTGGTTGAGCATGGTAAAGGCGACATGAGTCTTTACGGCTATAATCAGAGCGCACTGGTGAGCGTTGGTTCGCAGGTTCGCGCGGGCCAGCCGATTGCACTGGTGGgcagc > 3:20954/1‑149 (MQ=255) tGGCTGACTGGCTGCAAGGCTACGGTC‑‑‑TGGTGGTGGTGGTTGAGCATGGTAAAGGCGACATGAGTCTTTACGGCTATAATCAGAGCGCACTGGTGAGCGTTGGTTCGCAGGTTCGCGCGGGCCAGCCGATTGCACTGGTGGGCAGCAGt < 3:2174839/149‑1 (MQ=255) tGACTGGCTGCAAGGCTACGGTC‑‑‑TGGTGGTGGTGGTTGAGCATGGTAAAGGCGACATGAGTCTTTACGGCTATAATCAGAGCGCACTGGTGAGCGTTGGTTCGCAGGTTCGCGCGGGCCAGCCGATTGCACTGGTGGGCAGCAGTGGCg < 1:331703/149‑1 (MQ=255) tGGCTGCAAGGCTACGGTC‑‑‑TGGTGGTGGTGGTTGAGCATGGTAAAGGCGACATGAGTCTTTACGGCTATAATCAGAGCGCACTGGTGAGCGTTGGTTCGCAGGTTCGCGCGGGCCAGCCGATTGCACTGGTGGGCAGCAGTGGCGGTCa > 1:1593840/1‑149 (MQ=255) gCTGCAAGGCTACGGTC‑‑‑TGGTGGTGGTGGTTGAGCATGGTAAAGGCGACATGAGTCTTTACGGCTATAATCAGAGCGCACTGGt > 2:6714/1‑84 (MQ=255) gCTGCAAGGCTACGGTC‑‑‑TGGTGGTGGTGGTTGAGCATGGTAAAGGCGACATGAGTCTTTACGGCTATAATCAGAGCGCACTGGTGAGCGTTGGTTCGCAGGTTCGCGCGGGCCAGc < 4:1971501/116‑1 (MQ=255) tGCAAGGCTACGGTC‑‑‑TGGTGGTGGTGGTTGAGCATGGTAAAGGCGACATGAGTCTTTACGGCTATAATCAGAGCGCACTGGTGAGCGTTGGTTCGCAGGTTCGCGCGGGCCAGCCGATTGCACtggt > 2:622992/1‑127 (MQ=255) tGCAAGGCTACGGTC‑‑‑TGGTGGTGGTGGTTGAGCATGGTAAAGGCGACATGAGTCTTTACGGCTATAATCAGAGCGCACTGGTGAGCGTTGGTTCGCAGGTTCGCGCGGGCCAGCCGATTGCACTGGTGGGCAGCAGTGGCGGTCAGGGt > 3:979760/1‑149 (MQ=255) gCAAGGCTACGGTC‑‑‑TGGTGGTGGTGGTTGAGCATGGTAAAGGCGACATGAGTCTTTACGGCTATAATCAGAGCGCACTGGTGAGCGTTGGTTCGCAGGTTCGCGCGGGCCAGCCGATTGCACTGGTGGGCAGCAGTGGCGGTCAGGGTc < 1:890287/149‑1 (MQ=255) cAAGGCTACGGTC‑‑‑TGGTGGTGGTGGTTGAGCATGGTAAAGGCGACATGAGTCTTTACGGCTATAATCAGAGCGCACTGGTGAGCGTTGGTTCGCAGGTTCGCGCGGGCCAGCCGATTGCACTGGTGGGCAGCAGTGGCGGTCAGGGTCg < 4:1795746/149‑1 (MQ=255) aGGCTACGGTC‑‑‑TGGTGGTGGTGGTTGAGCATGGTAAAGGCGACATGAGTCTTTACGGCTATAATCAGAGCGCACTGGTGAGCGTTGGTTCGCAGGTTCGCGCGGGCCAGCCGATTGCACTGGTGGGCAGCAGTGGCGGTCAGGGTCGGc < 1:2329993/149‑1 (MQ=255) aGGCTACGGTC‑‑‑TGGTGGTGGTGGTTGAGCATGGTAAAGGCGACATGAGTCTTTACGGCTATAATCAGAGCGCACTGGTGAGCGTTGGTTCGCAGGTTCGCGCGGGCCAGCCGATTGCACTGGTGGGCAGCAGTGGCGGTCAGGGTCGGc < 1:2031115/149‑1 (MQ=255) gCTACGGTC‑‑‑TGGTGGTGGTGGTTGAGCATGGTAAAGGCGACATGAGTCTTTACGGCTATAATCAGAGCGCACTGGTGAGCGTTGGTTCGCAGGTTCGCGCGGGCCAGCCGATTGCACTGGTGGGCAGCAGTGGCGGTCAgg < 3:2296292/141‑1 (MQ=255) gCTACGGTC‑‑‑TGGTGGTGGTGGTTGAGCATGGTAAAGGCGACATGAGTCTTTACGGCTATAATCAGAGCGCACTGGTGAGCGTTGGTTCGCAGGTTCGCGCGGGCCAGCCGATTGCACTGGTGGGCAGCAGTGGCGGTCAGGGTCGGCCt < 3:2349161/149‑1 (MQ=255) tACGGTC‑‑‑TGGTGGTGGTGGTTGAGCATGGTAAAGGCGACATGAGTCTTTACGGCTATAATCAGAGCGCACTGGTGAGCGTTGGTTCGCAGGTTCGCGCGGGCCAGCCGATTGCACTGGTGGGCAGCAGTGGCGGTCAGGGTCGGCCTTc > 2:1515646/1‑149 (MQ=255) tACGGTC‑‑‑TGGTGGTGGTGGTTGAGCATGGTAAAGGCGACATGAGTCTTTACGGCTATAATCAGAGCGCACTGGTGAGCGTTGGTTCGCAGGTTCGCGCGGGCCAGCCGATTGCACTGGTGGGCAGCAGTGGCGGTCAGGGTCGGCCTTc < 2:1247886/149‑1 (MQ=255) cGGTC‑‑‑TGGTGGTGGTGGTTGAGCATGGTAAAGGCGACATGAGTCTTTACGGCTATAAACAGAGCGCACTGGTAAGCGTTGGTTCGCAGGTTCGCGCGGGCCAGCCGATTGCACTGGTGGGCAGCAGTGGCGGTCACGGTCGGCCTTCat < 4:2123420/149‑2 (MQ=255) tC‑‑‑TGGTGGTGGTGGTTGAGCATGGTAAAGGCGACATGAGTCTTTACGGCTATAATCAGAGCGCACTGGTGAGCGTTGGTTCGCAGGTTCGCGCGGGCCAGCCGAt < 3:466145/105‑1 (MQ=255) tttggtggtggtggTTGAGCATGGTAAAGGCGACATGAGTCTTTACGGCTATAATCAGAGCGCACTGGTGAGCGTTGGTTCGCAGGTTCGCGCGGGCCAGCCGATTGCACTGGTGGGCAGCAGTGGCGGTCAGGGTCGGCCTTCActct > 1:2255775/3‑149 (MQ=255) tggtggtggtggTTGAGCATGGTAAAGGCGACATGAGTCTTTACGGCTATAATCAGAGCGCACTGGTGAGCGTTGGTTCGCAGGTTCGCGCGGGCCAGCCGATTGCACTGGTGGGCAGCAGTGGCGGTCAGGGTCGGCCTTCACTCTAt < 1:488440/149‑1 (MQ=255) gtggtggtggtTGAGCATGGTAAAGGCGACATGAGTCTTTACGGCTATAATCAGAGCGCACTGGTGAGCGTTGGTTCGCAGGTTCGCGCGGGCCAGCCGATTGCACTGGTGGGCAGCAGTGGCGGTCAGGGTCGGCCTTCACTCTAttt < 3:1356028/149‑1 (MQ=255) | CGCTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGATTGCCGACGGTCGGGTGATTCTGGCTGACTGGCTGCAAGGCTACGGTC‑‑‑TGGTGGTGGTGGTTGAGCATGGTAAAGGCGACATGAGTCTTTACGGCTATAATCAGAGCGCACTGGTGAGCGTTGGTTCGCAGGTTCGCGCGGGCCAGCCGATTGCACTGGTGGGCAGCAGTGGCGGTCAGGGTCGGCCTTCACTCTATTTC > NC_000913/3787754‑3788043 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |