New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_000913 | 3811039 = | 1116 (3.980) | 5 (0.020) | 5/254 | NT | 0.49% | coding (114/810 nt) | mutM | formamidopyrimidine/5‑formyluracil/ 5‑hydroxymethyluracil DNA glycosylase |
? | NC_000913 | 3811133 = | 962 (3.620) | coding (20/810 nt) | mutM | formamidopyrimidine/5‑formyluracil/ 5‑hydroxymethyluracil DNA glycosylase | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 1274 total aligned reads displayed.
CAGGGGGAAGTTCTTCTGGAAGGATGCGCAGGCTGCCAGACATCCCTAAATGAATGATAATCCAGCCCTCAGGCAGCTCCAGCAGCAGATATTTAGCCCGCCGCTGCACGCTAAGCACTGGTTGGTCGCTTAAACGGTAGATCTCTTCTGAAACCGGCCAGCGCAAGCGTCCGTTGCGCACCACTGCATGAAGAATGGTTGCACCAACGAGATGCGGTTCTATGCCGCGGCGGCTGGTTTCAACTTCGGGTAATTCAGGCATAGCATCTCCAGGAATGAACAGATGCAGTCAATATG > NC_000913/3810891‑3811187 | cgtgatctacaaagaagcgaaaatcaaataattctcgctttgatgtaacaaaaaacctcgctccggcggggttttttgttatctgcttgcccccatattgactgcatctgttcattcctggagatgctatgcctgaattacccgaagtt > 1:2010176‑M1/149‑149 (MQ=255) cgtgatctacaaagaagcgaaaatcaaataattctcgctttgatgtaacaaaaaacctcgctccggcggggttttttgttatctgcttgcccccatattgactgcatctgttcattcctggagatgctatgcctgaattacccgaagtt < 3:2373593‑M1/1‑1 (MQ=255) gtgatctacaaagaagcgaaaatcaaataattctcgctttgatgtaacaaaaaacctcgctccggcggggttttttgttatctgcttgcccccatattgactgcatctgttcattcctggagatgctatgcctgaattacccgaagtTg < 4:553494‑M1/2‑1 (MQ=255) ggggAAGTTCTTCTGGAAGGATGCGCAGGCTGCCAGACATCCCTAAATGAATGATAATCCAGCCCTCAGGCAGCTCCAGCAGCAGATATTTAGCCCGCCGCTGCACGCTAAGCACTGGTTGGTCGCTTAAACGGTAGATCTCTTCTGaa > 2:259112/1‑149 (MQ=255) tctacaaagaagcgaaaatcaaataattctcgctttgatgtaacaaaaaacctcgctccggcggggttttttgttatctgcttgcccccatattgactgcatctgttcattcctggagatgctatgcctgaattacccgaagtt > 2:33622‑M1/144‑144 (MQ=255) ggAAGTTCTTCTGGAAGGATGCGCAGGCTGCCAGACATCCCTAAATGAATGATAATCCAGCCCTCAGGCAGCTCCAGCAGCAGATATTTAGCCCGCCGCTGCACGCTAAGCACTGGTTGGTCGCTTAAACGGTAGATCTCTTCTGAAAc > 2:395686/1‑149 (MQ=255) ggAAGTTCTTCTGGAAGGATGCGCAGGCTGCCAGACATCCCTAAATGAATGATAATCCAGCCCTCAGGCAGCTCCAGCAGCAGATATTTAGCCCGCCGCTGCACGCTAAGCACTGGTTGGTCGCTTAAACGGTAGATCTCTTCTGAAAc > 4:1252427/1‑149 (MQ=255) tcttctGGAAGGATGCGCAGGCTGCCAGACATCCCTAAATGAATGATAATCCAGCCCTCAGGCAGCTCCAGCAGCAGATATTTAGCCCGCCGCTGCACGCTAAGCACTGGTTGGTCGCTTAAACGGTAGATCTCTTCTGAAACCGGCCa < 4:1549521/149‑1 (MQ=255) cttctGGAAGGATGCGCAGGCTGCCAGACATCCCTAAATGAATGATAATCCAGCCCTCAGGCAGCTCCAGCAGCAGATATTTAGCCCGCCGCTGCACGCTAAGCACTGGTTGGTCGCTTAAACGGTAGATCTCTTCTGAAACCGGCCAg > 3:488998/1‑149 (MQ=255) ggAAGGATGCGCAGGCTGCCAGACATCCCTAAATGAATGATAATCCAGCCCTCAGGCAGCTCCAGCAGCAGATATTTAGCCCGCCGCTGCACGCTAAGCACTGCTTGGTCGCTTAAACGGTAGATCTCTTCTGAAACCGGCCAGCGCaa > 2:768733/1‑149 (MQ=255) gAAGGATGCGCAGGCTGCCAGACATCCCTAAATGAATGATAATCCAGCCCTCAGGCAGCTCCAGCAGCAGATATTTAGCCCGCCGCTGCACGCTAAGCACTGGTTGGTCGCTTAAACGGTAGATCTCTTCTGAAACCGGCCAGCGCAAg > 3:1542962/1‑149 (MQ=255) gAAGGATGCGCAGGCTGCCAGACATCCCTAAATGAATGATAATCCAGCCCTCAGGCAGCTCCAGCAGCAGATATTTAGCCCGACGCTGCACGCTAAGCACTGGTTGGTCGCTTAAACGGTAGCTCTCTTCTGAAACCGGCCAGCGCAAg < 3:2055926/149‑1 (MQ=255) aGGATGCGCAGGCTGCCAGACATCCCTAAATGAATGATAATCCAGCCCTCAGGCAGCTCCAGCAGCAGATATTTAGCCCGCCGCTGCACGCTAAGCACTGGTTGGTCGCTTAAACGGTAGATCTCTTCTGAAACCGGCCAGCGCAAGCg > 1:1724561/1‑149 (MQ=255) 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< 4:2005879/149‑1 (MQ=255) gtCGCTTAAACGGTAGATCTCTTCTGAAACCGGCCAGCGCAAGCGTCCGTTGCGCACCACTGCATGAAGAATGTTTGCACCAACGAGATGCGGTTCTATGCCGCGGCGGCTGGTTTCAACTTCGGGTAATTCAGGCATAGCATCTCCAg > 1:1311948/1‑149 (MQ=255) gtCGCTTAAACGGTAGATCTCTTCTGAAACCGGCCAGCGCAAGCGTCCGTTGCGCACCACTGCATGAAGAATGGTTGCACCAACGAGATGCGGTTCTATGCCGCGGCGGCTGGTTTCAACTTCGGGTAATTCAGGCATAGCATCTCCAg < 4:391954/149‑1 (MQ=255) tCGCTTAAACGGTAGATCTCTTCTGAAACCGGCCAGCGCAAGCGTCCGTTGCGCACCACTGCATGAAGAATGGTTGCACCAACGAGATGCGGTTCTATGCCGCGGCGGCTGGTTTCAACTTCGGGTAATTCAGGCATAGCATCTCCAgg > 1:1011013/1‑149 (MQ=255) tCGCTTAAACGGTAGATCTCTTCTGAAACCGGCCAGCGCAAGCGTCCGTTGCGCACCACTGCATGAAGAATGGTTGCACCAACGAGATGCGGTTCTATGCCGCGGCGGCTGGTTTCAACTTCGGGTAATTCAGGCATAGCATCTCCAgg > 3:1069729/1‑149 (MQ=255) gCTTAAACGGTAGATCTCTTCTGAAACCGGCCAGCGCAAGCGTCCGTTGCGCACCACTGCATGAAGAATGGTTGCACCAACGAGATGCGGTTCTATGCCGCGGCGGCTGGTTTCAACTTCGGGTAATTCAGGCATAGCATCTCCAGGaa > 4:2372889/1‑149 (MQ=255) 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ggTAGATCTCTTCTGAAACCGGCCAGCGCAAGCGTCCGTTGCGCACCACTGCATGAAGAATGGTTGCACCAACGAGATGCGGTTCTATGCCGCGGCGGCTGGTTTCAACTTCGGGTAATTCAGGCATAGCATCTCCAGGAATGAACAGa > 3:1859268/1‑149 (MQ=255) ggTAGATCTCTTCTGAAACCGGCCAGCGCAAGCGTCCGTTGCGCACCACTGCATGAAGAATGGTTGCACCAACGAGATGCGGTTCTATGCCGCGGCGGCTGGTTTCAACTTCGGGTAATTCAGGCATAGCATCTCCAGGAATGAACAGa < 3:2170892/149‑1 (MQ=255) aTCTCTTCTGAAACCGGCCAGCGCAAGCGTCCGTTGCGCACCACTGCATGAAGAATGGTTGCACCAACGAGATGCGGTTCTATGCCGCGGCGGCTGGTTTCAACTTCGGGTAATTCAGGCATAGCATCTCCAGGAATGAACAGATGCAg < 3:1622619/149‑1 (MQ=255) aTCTCTTCTGAAACCGGCCAGCGCAAGCGTCCGTTGCGCACCACTGCATGAAGAATGGTTGCACCAACAAGATGCGGTTCTATGCCGCGGCGGCTGGTTTCAACTTCGGGTAATTCAGGCATAGCATCTCCAGGAATGAACAGATGCAg > 2:2320272/1‑149 (MQ=255) tctcTTCTGAAACCGGCCAGCGCAAGCGTCCGTTGCGCACCACTGCATGAAGAATGGTTGCACCAACGAGATGCGGTTCTATGCCGCGGCGGCTGGTTTCAACTTCGGGTAATTCAGGCATAGCATCTCCAGGAATGAACAGATGCAGt > 2:848969/1‑149 (MQ=255) ctctTCTGAAACCGGCCAGCGCAAGCGTCCGTTGCGCACCACTGCATGAAGAATGGTTGCACCAACGAGATGCGGTTCTATGCCGCGGCGGCTGGTTTCAACTTCGGGTAATTCAGGCATAGCATCTCCAGGAATGAACAGATg < 3:1148863/144‑1 (MQ=255) ttctGAAACCGGCCAGCGCAAGCGTCCGTTGCGCACCACTGCATGAAGAATGGTTGCACCAACGAGATGCGGTTCTATGCCGCGGCGGCTGGTTTCAACTTCGGGTAATTGAGGCATAGCATCTCCAGGAATGAACAGATGCAGTCAat > 4:194399/1‑149 (MQ=255) ttctGAAACCGGCCAGCGCAAGCGTCCGTTGCGCACCACTGCATGAAGAATGGTTGCACCAACGAGATGCGGTTCTATGCCGCGGCGGCTGGTTTCAACTTCGGGTAATTCa < 2:1663372/112‑1 (MQ=255) ttctGAAACCGGCCAGCGCAAGCGTCCGTTGCGCACCACTGCATGAAGAATGGTTGCACCAACGAGATGCGGTTCTATGCCGCGGCGGCTGGTTTCAACTTCGGGTAATTCAGGCATAGCATCTCCAGGAATGAACAGATGCAGTCAat > 1:882376/1‑149 (MQ=255) ttctGAAACCGGCCAGCGCAAGCGTCCGTTGCGCACCACTGCATGAAGAATGGTTGCACCAACGAGATGCGGTTCTATGCCGCGGCGGCTGGTTTCAACTTCGGGTAATTCAGGCATAGCATCTCCAGGAATGAACAGATGCAGTCAat > 1:1211637/1‑149 (MQ=255) tctGAAACCGGCCAGCGCAAGCGTCCGTTGCGCACCACTGCATGAAGAATGGTTGCACCAACGAGATGCGGTTCTATGCCGCGGCGGCTGGTTTCAACTTCGGGTAATTCAGGCATa > 4:1030438/1‑117 (MQ=255) ctGAAACCGGCCAGCGCAAGCGTCCGTTGCGCACCACTGCATGAAGAATGGTTGCACCAACGAGATGCGGTTCTATGCCGCGGCGGCTGGTTTCAACTTCGGGTAATTCAGGCATAGCATCTCCAGGAATGAACAGATGCAGTCAatat < 4:1876236/149‑1 (MQ=255) ctGAAACCGGCCAGCGCAAGCGTCCGTTGCGCACCACTGCATGAAGAATGGTTGCACCAACGAGATGCGGTTCTATGCCGCGGCGGCTGGTTTCAACTTCGGGTAATTCAGGCATAGCATCTCCAGGAATGAACAGATGCAGTCAatat > 3:1751952/1‑149 (MQ=255) TGAAACCGGCCAGCGCAAGCGTCCGTTGCGCACCACTGCATGAAGAATGGTTGCACCAACGAGATGCGGTTCTATGCCGCGGCGGCTGGTTTCAACTTCg > 1:1547402‑M1/1‑100 (MQ=255) TGAAACCGGCCAGCGCAAGCGTCCGTTGCGCACCACTGCATGAAGAATGGTTGCACCAACGAGATGCGGTTCTATGCCGCGGCGGCTGGTTTCAACTTCGGGTAATTCAGGCATAGCATCTCCAGGAATGAACAGATGCAGTCAATATg < 4:735015‑M1/149‑1 (MQ=255) | CAGGGGGAAGTTCTTCTGGAAGGATGCGCAGGCTGCCAGACATCCCTAAATGAATGATAATCCAGCCCTCAGGCAGCTCCAGCAGCAGATATTTAGCCCGCCGCTGCACGCTAAGCACTGGTTGGTCGCTTAAACGGTAGATCTCTTCTGAAACCGGCCAGCGCAAGCGTCCGTTGCGCACCACTGCATGAAGAATGGTTGCACCAACGAGATGCGGTTCTATGCCGCGGCGGCTGGTTTCAACTTCGGGTAATTCAGGCATAGCATCTCCAGGAATGAACAGATGCAGTCAATATG > NC_000913/3810891‑3811187 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |