| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 3,739,717 | 0 | C | T | 7.0% | 3092.8 / 53.4 | 1063 | L5F (CTT→TTT) | avtA | valine‑pyruvate aminotransferase; transaminase C; alanine‑valine transaminase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (563/416); new base T (2/79); total (565/498) | |||||||||||
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Only 100 of 1102 total aligned reads displayed.
AACCAGGATAAAATGTCAGCCCTAATCAGCGTTGCAGGATAAAGCACCGCTCACTCTTCAACAGACCGATTTGCACCCCAGCAAATGTAGCGTTATTGTTACCTTCCTTGCTACAGAGTTCGACAGATATCCCGCTATGACATTCTCCCTTTTTGGTGACAAATTTACCCGCCACTCCGGCATTACGCTGTTGATGGAAGATCTGAACGACGGTTTACGCACGCCTGGCGCGATTATGCTCGGCGGCGGTAATCCGGCGCAGATCCCGGAAATGCAGGACTACTTCCAGACGCTACT > NC_000913/3739569‑3739865 | aaCCAGGATAAAATGTCAGCCCTAATCAGCGTTGCAGGATAAAGCACCGCTCACTCTTCAACAGACCGATTTGCACCCCAGCAAATGTAGCGTTATTGTTACCTTCCTTGCTACAGAGTTCGAGAGATATCCCGCTATGACATTCTccc < 3:251265/149‑1 (MQ=255)aaCCAGGATAAAATGTCAGCCCTAATCAGCGTTGCAGGATAAAGCACCGCTCACTCTTCAACAGACCGATTTGCACCCCAGCAAATGTAGCGTTATTGTTACCTTCCTTGCTACAGAGTTCGACAGATATCCCGCTATGACATTCTccc > 1:1699797/1‑149 (MQ=255) cAGGATAAAATGTCAGCCCTAATCAGCGTTGCAGGATAAAGCACCGCTCACTCTTCAACAGACCGATTTGCACCCCCGCAAATGTAGCGTTATTGTTACCTTCCTTGCTACAGAGTTCGACAGATATCCCGCTATGACATTCTCCCttt > 1:1975478/1‑149 (MQ=255) 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cccGCTATGACATTCTCCTTTTTTGGTGAAAAATTTACCCGCCACTCCGGCATTACGCTGTTGATGGAAGATCTGAACGACGGTTTACGCACGCCTGGCGCGATTATGCTCGGCGGCGGTAATCCGGCGCAGATCCCGGAAATGCAGGa < 2:313922/149‑1 (MQ=255) cccGCTATGACATTCTCCCTTTTTGGTGACAAATTTACCCGCCACTCCGGCATTACGCTGTTGATGGAAGATCTGAACGACGGTTTACGCACGCCTGGCGCGATTATGCTCGGCGGCGGTAATCCGGCGCAGATCCCGGAAATGCAGGa < 4:2129714/149‑1 (MQ=255) cccGCTATGACATCCCCCTTTTTTGGTGACAACTTTCCCCGCCACTCCGGCATTACGCTGTTGATGGAAGATCTGAACGACGGTTTACGCACGCCTGGCGCGATTATGCTCGGCGGCGGTAATCCGGCGCAGATCCCGTAAATGCAGGa < 2:2126959/149‑1 (MQ=255) ccGTTATGACTTTCTCCCTTTTTGGTGACAAATTTACCCGCCACTCCGGCATTACGCTGTTGATGGAAGATCTGAACGACGGTTTACGCACGCCTGGCGCGATTATGCTCGGCGGCGGTAATCCGGCGCAGATCCCGGAAATGCAGGac < 3:1541677/149‑1 (MQ=255) ccGCTATGACATTCTCCCTTTTTGGTGACAAATTTACCCGCCACTCCGGCATTACGCTGTTGATGGAAGATCTGAACGACGGTTTACGCACGCCTGGCGCGATTATGCTCGGCGGCGGTAATCCGGCGCAGATCCCGGAAATGCAGGac > 2:1056812/1‑149 (MQ=255) cTATGACATTCTCCCTTTTGGGTGACAAATTTACCCGCCACTCCGGCATTACGCTGTTGATGGAAGATCTGAACGACGGTTTACGCACGCCTGGCGCGATTATGCTCGGCGGCGGTAATCCGGCGCAGATCCCGGAAATGCAGGactac < 4:2289690/149‑1 (MQ=255) tATGACATTCTCCCTTTTTGGTGACAAATTTACCCGCCACTCCGGCATTACGCTGTTGATGGAAGATCTGAACGACGGTTTACGCACGCCTGGCGCGATTATGCTCGGCGGCGGTAATCCGGCGCAGATCCCGGAAATGCAGGactact > 3:944667/1‑149 (MQ=255) tGACATCCTCCCTTTTTGGTGACAAATTTACCCGCCACTCCGGCATTACGCTGTTGATGGAAGATCTGAACGACGGTTTACGCACGCCTGGCGCGATTATGCTCGGCGGCGGTAATCCGGCGCAGATCCCGGAAATGCAGGACTACTTc < 1:955823/149‑1 (MQ=255) cctttttcCTTTTTTGGTAACAATTTTAGCCGCCACTCCGGCATTACGCTGTTGATGGAAGATCTGAACGACGGTTTACGCACGCCTGGCGCGATTATGCTCGGCGGCGGTAATCCGGCGCAGATCCCGGAAATGCAGGACTACTTCCa < 1:2479689/143‑1 (MQ=255) aTTCTCCCTTTTTGGTGACAAATTTACCCGCCACTCCGGCATTACGCTGTTGATGGAAGATCTGAACGACGGTTTACGCACGCCTGGCGCGATTATGCTCGGCGGCGGTAATCCGGCGCAGATCCCGGAAATGCAGGACTACTTCCa > 4:809634/1‑147 (MQ=255) aTTCTCCCTTTTTGGTGACAAATTTACCCGCCACTCCGGCATTACGCTGTTGATGGAAGATCAGAACGACGGTTTACGCACGCCTGGTGCGATTATGCTCGGCGGCGGTAATCCGGCACAGATACCGGACATGCAGGACTACTTGCAGa > 4:1306836/1‑149 (MQ=255) ctcCCTTTTTGGTGAAAATTTTCCCCGCCACTCCGGCATTACGCTGTTGATGGAAGATCTGAACGACGGTTTACGCACGCCTGGCGCGATTATGCTCGGCGGCGGTAATCCGGCGCAGATCCCGGAAATGCAGGACTACTTCCAGACGc < 2:897345/149‑1 (MQ=255) tcCCTTTTTGGTGACAAATTTACCCGCCACTCCGGCATTACGCTGTTGATGGAAGATCTGAACGACGGTTTACGCACGCCTGGCGCGATTATGCTCGGCGGCGGTAATCCGGCGCAGATCCCGGAAATGCAGGACTACTTCCAGACGCt > 1:299566/1‑149 (MQ=255) tcCCTTTTTGGTGACAAATTTACCCGCCACTCCGGCATTACGCTGTTGATGGAAGATCTGAACGACGGTTTACGCACGCCTGGCGCGATTATGCTCGGCGGCGGTAATCCGGCGCAGATCCCGGAAATGCAGGACTACTTCCAGACGCt > 1:1439459/1‑149 (MQ=255) ccTTTTTGGTGACAAATTTACCCGCCACTCCGGCATTACGCTGTTGATGGAAGATCTGAACGACGGTTTACGCACGCCTGGCGCGATTATGCTCGGCGGCGGTAATCCGGCGCAGATCCCGGAAATGCAGGACTACTTCCAGACGCTAc > 3:1102821/1‑149 (MQ=255) | AACCAGGATAAAATGTCAGCCCTAATCAGCGTTGCAGGATAAAGCACCGCTCACTCTTCAACAGACCGATTTGCACCCCAGCAAATGTAGCGTTATTGTTACCTTCCTTGCTACAGAGTTCGACAGATATCCCGCTATGACATTCTCCCTTTTTGGTGACAAATTTACCCGCCACTCCGGCATTACGCTGTTGATGGAAGATCTGAACGACGGTTTACGCACGCCTGGCGCGATTATGCTCGGCGGCGGTAATCCGGCGCAGATCCCGGAAATGCAGGACTACTTCCAGACGCTACT > NC_000913/3739569‑3739865 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |