New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 4392514 | 103 (0.540) | 3 (0.020) | 3/496 | 16.8 | 3.4% | noncoding (43/76 nt) | glyX | tRNA‑Gly |
? | NC_000913 | = 4392608 | 72 (0.390) | noncoding (26/76 nt) | glyY | tRNA‑Gly | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
ATTACGAAAGCAAAATTAAGTAGT‑ACGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAAGTGCTGCAAAGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTC‑GTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAGTGCTGTAAGGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTCTCTCAATAAAATATCCACAGCGACGCGATGCGTTATTGCTGGTTTTTGTTGTCTCTGACAAACTCTTGTAAACAGAGTTATCCACAGCCTCAGGCTGTAATCTTAATTTCAAAGAAACTTCGCACGGTGAATAGTATTTTTTTAACCTATTGATAGATAAGTTAAAAATTAAGATTCCGTTTTGTCGAGTCGATCACTTGACGATTTTATTCGTCTT > NC_000913/4392334‑4392883 | aTTACGAAAGCAAATATACGTAGT‑ACGCGGGAATATCTCAGTTGGAAGAGCACACCCTGGCCAAGGTCGGGGTCGCGGATTCGAGTCTCGTTTCCCGCGCAAAAATTTGAAAAGTGCTGCAAAGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTC‑GTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAGTGCTGTAAGGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCa < 1:750738/275‑1 (MQ=21) aTTACGAAAGCAAAATTACAGAGTGATGC‑GGAATAGCTTGGTTTGTAGGGGCGGACCTTTCCAAAGTCTGGGTCTGGAGTTCAAGTCTCGGTTCCCGATCCAAAATTTGAAAAATGCTGCAAAGCCCAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCATTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTC‑GTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAGTGCTGTAAGGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCa < 3:556560/275‑1 (MQ=18) gaaagaaaAATTAAGGAGT‑ACGCGGGAATAGCTCAGTTGTTAGAGCACGGCGTTGCCAAGGTCGGGGTCGGGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTGGAAAAGTGCTGAAAAGCACAGACCGCCAAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTC‑GTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAGTGCTGTAAGGCACAGACCACACAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGAcc < 1:230931/275‑1 (MQ=18) tAAGTAGT‑ACGCGGGAAGAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAAGTGGAAAAGTGCTGCAAAGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTC‑GTTTCCCGCTCCAAAATTGGAAAGTGCTGTAAGGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTc < 1:658204/275‑1 (MQ=255) cgcgGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAAGTGCTGCAAAGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTAGCGAGTTCGAGTCTC‑GTTTCCCGCTCCAAAATTTGACAGTGCTGTAAGGCCCAGACCACCCAAGCGCGACTAGCTCAGTTGGTCTAGCACGAACTTGCCAAGGGCGGGGtggggt > 2:517493/1‑271 (MQ=18) aTAGCTCAGTGGGTAGGACACGACCTTGCCAAGGTAGGGGTCGCAAGTTCCAGTCTCTTTTCCCTCTACAAAATTGGAAAAGTGCTGCAAAGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTC‑GTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAGTGCTGTAAGGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGa < 1:264336/275‑1 (MQ=21) gCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAAGTGCTGCAAAGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTC‑GTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAGTGCTGTAAGGCACCGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGTTCGGTGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCa > 2:810526/1‑276 (MQ=255) tGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAAGTGTTGCAAAGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGTTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGGCGCGAGTTCGAGTCTC‑GTTTCCCGCTCCAAAACTTGTAAGTCGCGTAAGGCACAGACCCCCCCATCGGTTATAGCTCAGGTGGTAGAGCACGAACTAGCAACTGTCGGGGTCGCGAGTCCACGGCTCGTGTCCCGCCCCCAAttcttc > 3:179208/1‑275 (MQ=17) tGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAAGTGCTGCAAAGCACAAACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGAGAGTTCGAGTCTC‑GTTCCCCGCTCCAAAATTTGAAAGTACTTTAAGGCACAGACCACCCCAGAGGTAATAACCCAGTTGGTTGAGCAGCACCATGACAATGTAGGGTTCGTGAGTTAGAGCTCCGTTTACCGCACCcaacttttat > 4:440797/1‑269 (MQ=17) ccAAGGTCCGGGTAGCTAGTTGGAGATTCGTTTCCCGCACAAAAATTTGAAAAGTGCAGCAAAGCACAGCACACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGGCCTTGCCAAGGTCGGGGTGGCGAGTTCGAGTCTC‑GTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAGTGCTGGAAGGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTtctc < 1:632300/275‑1 (MQ=17) 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ccaccCAAGAGGGAAGATCTCAGTTGGTAGCGCAGGCCCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGATTTCGAGTCCC‑GTTCCCCGCTCCAAAATTGGAAAGTGCTGTAAGGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGCCCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTCTCTCAATAAAATATCCACAGCGACGCGATGCGTTATTGCTGGTTTTTGTTGTCTCTGACAAACTCTTGTaaa < 2:730037/275‑1 (MQ=21) ccAGGCGCGAATAGCTCATGTCGTAGACCACGACCGTCCCAAGGTCGGGGTCCAGAGTTCGAGTCTC‑GTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAGGGCTTTAAGGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTCTCTCAATAAAATATCCACAGCGACGCGATGCGTTATTGCTGGTTTTTGTTGTCTCTGACAAACTCTTGTAAACagag < 2:442465/276‑1 (MQ=21) ccAAGCGGGAATAGTTTAGTTGGTAGGGCACGCCCTTGCAAAGGGGGGGGTAGAGAGTTCGAGTCTC‑GTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAGGGCTGGAAGGCACAGACCACCCAAGCTGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTCTCTCAATAAAATATCCACAGCGACGCGATGCGTTATTGCTGGTTTTTGTTGTCTCTGACAAACTCTTGTAAACagag < 2:533432/276‑1 (MQ=21) 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gAATAGCTGAGTTGGTAGAGGAGGCCCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGATTTCGGGTATC‑GTTTCCCGCACCAAAATTTGAGAGTGCTGTAAGGCACAGACCACCCAAGGTGGAATAGCGCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTCTCTCAATAAAATATCCACAGCGACGCGATGCGTTATTGCTGGTTTTTGTTGTCTCTGACAAACTCTTGTAAACAGAGTTATCca < 2:253284/275‑1 (MQ=21) aTAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTC‑GTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAGTGCTGTAAGGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTCTCTCAATAAAATATCCACAGCGACGCGATGCGTTATTGCTGGTTTTTGTTGTCTCTGACAAACTCTTGTAAACAGAGTTATCca < 1:179208/273‑1 (MQ=255) cTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTC‑GTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAGTGCTGTAAGGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCCCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCCCGTTTCCCGCTCCAAATTTTTCTCTAAATAACATATCTACAGCGACGCGATGCGTTATTGCTGGTTTTTGTTGTCTCTGACAACCCTTTTTAAACAAGGTTTTCCCAAGCCt > 3:449706/1‑275 (MQ=18) cTCAGTTGGTAGAGCACGACCTGGCAAAGGTCGGGGTGGCGAGTTCGAGTCTC‑GTTTCCCGGTCCAAAATTTGAAAGTGCTGTAAGGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTCTCTCAATAAAATATCCACAGCGACGCGATGCGTTATTGCTGGTTTTTGTTGTCTCTGACAAACTCTTGTAAACAGAGTTATCCACAGCCTc < 2:828993/276‑1 (MQ=255) ttGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTC‑GTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAGTGCTGTAAGGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTCTCTCa > 3:195001/1‑185 (MQ=255) tAGGGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTAGCGAGTTCGAGTCTC‑GTTTCCCGCTCCAAAAGTTGAAAGTGCTGTAAGGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTCTCTCAATAAAATATCCACAGCGACGCGATGCGTTATTGCTGGTTTTTGTTGTCTCTGACAAACTCTTGTAAACAGAGTTATCCACAGCCTCAGGCTGt < 1:843527/274‑1 (MQ=255) tAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTC‑GTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAGTGCTGTAAGGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTCTCTCAATaa < 1:195001/185‑1 (MQ=255) ccAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTC‑GTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAGTGCTGTAAGGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTAGCGAGTTCGAGTCCCGTTTCCCGCTCCACATTCTTATATCAATAAAATATCCACAACGACGCGAAGCGTACATTTTGGTTTTTGTTGTCTCTAACAAAATCTGTGAAACGTAGTTATCCACAGCCTCAGGCTGTAATCTTAATTTCaagc > 3:70449/1‑273 (MQ=18) ccAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTC‑GTTTCCCGCTCCAAAATGTGAAAGTGCTGGAAGGCACAGACCACCCACGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTCTCTCAATAAAATATCCACAGCGACGCGATGCGTTATTGCTGGTTTTTGTTGTCTCTGACAAACTCTTGTAAACAGAGTTATCCACAGCCTCAGGCTGTAATCTTAATTTCAAAg < 1:449706/275‑1 (MQ=255) 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cTGTAAGGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTCTCTCAATAAAATATCCACAGCGACGCGATGCGTTATTGCTGGTTTTTGTTGTCTCTGACAAACTCTTGTAAAc > 3:121464/1‑179 (MQ=255) aaGGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTCTCTCAATAAAATATCCACAGCGACGCGATGCGTTATTGCTGGTTTTTGTTGTCTCTGACAAACTCTTGTAAACagag < 1:121464/179‑1 (MQ=255) aGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTCTCTCAATAAAATATCCACAGCGACGCGATGCGTTATTGCTGGTTTTTGTTGTCTCTGACAAACTCTTGTAAACAGAGTTATCCACAGCCTCAGGCTGTAATCTTAATTTCAAAGAAACTTCGCACGGTGAATAGTATTTTTTTAACTTATTTATATATAAGTTAAAAATTAAGATTCCGtt > 4:967223/1‑276 (MQ=255) accaccCAAGTGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTCTCTCAATAAAATATCCACAGCGACGCGATGCGTTATTGCTGGTTTTTGTTGTCTCTGACAAACTCTTGTAAACAGAGTTATCCACAGCCTCAGGCTGTAATCTTAATTTCAAAGAAACTTCGCACGGTGAATAGTATTTTTTTAACCTATTGATAGATAAGTTAAAAATTAAGATTCCGtt > 1:764161/1‑274 (MQ=255) accaccCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTCTCTCAATAAAATATCCACAGCGACGCGATGCGTTATTGCTGGTTTTTGTTGTCTCTGACAAACTCTTGTAAACAGAGTTATCCACAGCCTCAGGCTGTAATCTTAATTTCAAAGAAACTTCg > 1:126794/1‑215 (MQ=255) accaccCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTCTCTCAATAAAATATCCACAGCGACGCGATGCGTTATTGCTGGTTTTTGTTGTCTCTGACAAACTCTTGTAAACAGAGTTATCCACAGCCTCAGGCTGTAATCTTAATTTCAAAGAAACTTCGCACGGTGAATAGTATTTTTTTAACCt > 2:256853/1‑241 (MQ=255) accaccCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTCTCTCAATAAAATATCCACAGCGACGCGATGCGTTATTGCTGGTTTTTGTTGTCTCTGACAAACTCTTGTAAACAGAGTTATCCACAGCCTCAGGCTGTAATCTTAATTTCAAAGAAACTTCGCACGGTGAATAGTATTTTTTTAACCTATTGATAGATAAGTTAAAAATTAAGATTCCGtt > 3:694973/1‑274 (MQ=255) 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aCGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTCTCTCAATAAAATATCCACAGCGACGCGATGCGTTATTGCTGGTTTTTGTTGTCTCTGACAAACTCTTGTAAACAGAGTTATCCACAGCCTCAGGCTGTAATCTTAATTTCAAAGAAACTTCGCACGGTGAATAGTATTTTTTTAACCTATTGATAGATAAGTTAAAAATTAAGATTCCGTTTTGTCGAGTCGATCACTTTACGATTTTATTCGtttt > 2:567564/1‑276 (MQ=255) | ATTACGAAAGCAAAATTAAGTAGT‑ACGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAAGTGCTGCAAAGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTC‑GTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAGTGCTGTAAGGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTCTCTCAATAAAATATCCACAGCGACGCGATGCGTTATTGCTGGTTTTTGTTGTCTCTGACAAACTCTTGTAAACAGAGTTATCCACAGCCTCAGGCTGTAATCTTAATTTCAAAGAAACTTCGCACGGTGAATAGTATTTTTTTAACCTATTGATAGATAAGTTAAAAATTAAGATTCCGTTTTGTCGAGTCGATCACTTGACGATTTTATTCGTCTT > NC_000913/4392334‑4392883 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |