| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 820612 | 71 (0.450) | 12 (0.080) | 9/254 | NT | 14.6% | intergenic (+24/‑181) | ybhL/ybhM | putative acetate transporter; BAX Inhibitor‑1 family inner membrane protein/BAX Inhibitor‑1 family inner membrane protein |
| ? | NC_000913 | = 820621 | 73 (0.480) | intergenic (+33/‑172) | ybhL/ybhM | putative acetate transporter; BAX Inhibitor‑1 family inner membrane protein/BAX Inhibitor‑1 family inner membrane protein | |||||
Only 100 of 110 total aligned reads displayed.
TGGCATCGCTGGTCAACTTCTGGTTGAAAAGCGAAGCATTGATGTGGGCAGTTACCTACATCGGCGTGATTGTCTTTGTCGGATTGACGGCGTATGACACGCAGAAACTGAAAAATATGGGTGAGCAGATTGATACCCGCGACACGTCGAACCTGCGCAAATATTCCATTCTTGGCGCGTTAACCTTGTATCTGGACTTCATCAACCTGTTCCTGATGTTGTTGCGGATCTTCGGCAACCGCCGTTAATTCTTTTTCACCATCACTATCCCGGCCATGTGTCGGGATTTTTTTCTTACTAAAAACGACACTTAACAAGTACCAGGTATAAAATATGCCTTATGGACGAGCGGAAGCGTTTTCTGTATCCATAAATGCAAAAGTATTTTGTATGCGTGGTTTTAAATTTATTGATGGTGAATATTAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGGATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGG > NC_000913/820341‑820886 | tGGCATCGCTGGTAAACTTCTGGTTGAAAAGCGAAGCATTGATGTGGGCAGTTACCTACATCGGCGTGATTGTCTTTGTCGGATTGACGGCGTATGACACGCAGAAACTGAAAAATATGGGTGAGCAGATTGATACCCGCGACACGTCGAACCTGCGCAAATATTCCATTCTTGGCGCGTTAACCTTGTATCTGGACTTCATCAACCTGTTCCTGATGTTGTTGCGGATCTTCGGCAACCGCCGTTAATTCTTTTTCACCATCACTATCCCGGcc < 2:373897/275‑1 (MQ=255) gCTGGTCAACTTCTGGTTGAAAAGCGAAGCATTGATGTGGGCAGTTACCTACATCGGCGTGATTGTCTTTGTCGGATTGACGGCGTATGACACGCAGAAACTGAAAAATATGGGTGAGCAGATTGATACCCGCGACACNTCGAACCTGCGCAAATATTCCATTCTTGGCGCGTTAACCTTGTAACTGGACTTCATCAACCTGTTCCTGATGTTGTGTCGNTCCTTCGGCAACCACCGTTAATCCTNTTTCGCCACCACTATCCCGGCCATGTTTc > 3:94887/1‑275 (MQ=255) gCTGGTCAACTTCTGGTTGAAAAGCGAAGCATTGATGTGGGCAGTTACCTACATCGGCGTGATTGTCTTTGTCGGATTGACGGCGTATGACACGCAGAAACTGAAAAATATGGGTGAGCAGATTGATACCCGCGACACGTCGAACCTGCGCAAATATTCCATTCTTGGCGCGTTAACCTTGTATCTGGACTTCATCAACCTGTTCCTGATGTTGTTGCGGATCTTCGGCAACCGCCGTTAATTCTTTTTCACCATCACTATCCCGGCCATGTGTc < 2:11656‑M2/275‑2 (MQ=255) ggTTGAAAAGCGAAGCATTGATGTGGGCAGTTACCTACATCGGCGTGATTGTCTTTGTCGGATTGACGGCGTATGACACGCAGAAACTGAAAAATATGGGTGAGCAGATTGATACCCGCGACACGTCGAACCTGCGCAAATATTCCATTCTTGGCGCGTTAACCTTGTATCTGGACTTCATCAACCTGTTCCTGATGTTGTTGCGGATCTTCGGCAACCGCCGTTAATTCTTTTTCACCATCACTATCCCGGCCATGTGTCGGGATTTTTTTc > 2:60916/1‑273 (MQ=255) gaggCATTGATGTGGGCAGTTACCTACATCGGCGTGATTGTCTTTGTCGGATTGACGGCGTATGACACGCAGAAACTGAAAAATATGGGTGAGCAGATTGATACCCGCGACACGTCGAACCTGCGCAAATATTCCATTCTTGGCGCGTTAACCTTGTATCTGGACTTCATCAACCTGTTCCTGATGTTGTTGCGGATCTTCGGCAACCGCCGTTAATTCTTTTTCACCATCACTATCCCGGCCATGTGTCGGGATTTTTTTCTTACTAAAAACGa < 2:155813/272‑1 (MQ=255) ggCAGTTACCTACATCGGCGTGATTGTCTTTGTCGGATTGACGGCGTATGACACGCAGAAACTGAAAAATATGGGTGAGCAGATTGATACCCGCGACACGTCGAACCTGCGCAAATATTCCATTCTTGGCGCGTTAACCTTGTATCTGGACTTCATCAACCTGTTCCTGATGTTGTTGCGGATCTTCGGCAACCGCCGTTAATTCTTTTTCACCATCACTATCCCGGCCATGTGTCGGGATTTTTTTCTTACTAAAAACGACACTTAACAAGTa < 2:150251/274‑1 (MQ=255) gaGTGACCTACATGGGCGTGATGGTATTTTTCGGATGGCTGGCGTTTGAAACGCAAAAACGGAAAAATATGGTGTAGCAGATTGTTACCCGGGAAACGTCAAACGTGTACAAAAATTCCAATCTAGGAATGTTAACATTGTATCTGGAGTTCATGAACTTGTTCCTGGTGTTGTGGCAGATATTCGGAAGCCGCCGTTAATTCTTTTTCACCATCACTATACCGGCCATGTGTCGGGATTTTTTTCTTACTAAAAGCGACACTTAACAAGTAcc < 4:487772/273‑1 (MQ=255) cAGTTACCTACATTGGAGTACTTGTTTTGGTCGAATTGACGGCAAATGAAACGCAAAAAATGAAAAATATGGGTGAGCAGATTGATACCCGCGACACGTCGAACCTGCGCAAATATTCCATTCTTGGCGCGTTAACCTTGTATCTGGACTTCATCAACCTGTTCCTAATGTTGTTGCGGATCTTCGGCAACCGCCGTTAATTCTTTTTCACCATCACTATCCCGGCCATGTGTCGGGATTTTTTTCTTACTAAAAACGACACTTAACAAGTAcc < 4:160763/274‑1 (MQ=255) cGGCGTGATTGTCTTTGTCGGATTGACGGCGTATGACACGCAGAAACTGAAAAATATGGGTGAGCAGATTGATACCCGCGACACGTCGAACCTGCGCAAATATTCCATTCTTGGCGCGTTAACCTTGTATCTGGACTTCATCAACCTGTTCCTGATGTTGTTGCGGATCTTCGGCAACCGCCGTTAATTCTTTTTCACCATCACTATCCCGGCCATGTGTCGGGATTTTTTTCTTACTAAAAACGACACTTAACAAGTACCAGGTATAAAATATg > 1:90623/1‑275 (MQ=255) gCGTGATTGTCTTTGTCGGATTGACGGCGTATGACACGCAGAAACTGAAAAATATGGGTGAGCAGATTGATACCCGCGACACGTCGAACCTGCGCAAATATTCCATTCTTGGCGCGTTAACCTTGTATCTGGACTTCATCAACCTGTTCCTGATGTTGTTGCGGATCTTCGGCAACCGCCGTTAATTCTTTTTCACCATCACTATCCCGGCCATGTGTCGGGATTTTTTTCTTACTAAAAACGACACTTAACAAGTACCAGGTATAAAATATGcc > 2:300296/1‑275 (MQ=255) 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ttGTTTTTGTGGGATTGAGGGCGTATGACNCGCAAAACCTGAAAAATATGGGTGGNCAAATTTATACCCGCGACACGTCGAACCTGCCCAAATATTCCATTCTTGGCGCGTTAACCTTGTATCTGGACTTCATCAANCTGTTCCTGATGTTGTTGCGGATCTTCGGCAACCGCCGTTAATTCTTTTTCACCATCACTATCCCGGCCATGTGTCGGGATTTTTTTCTTACTAAAAACGACACTTAACAAGTACCAGGTATAAAATATGCCTTATgg < 3:90623/275‑1 (MQ=255) tttttttTCGGATGTCCGGCGTAGTGCACGCGGAAACGGATAAATATGGGTGGCCAAGTTGATACCCGCGACACGTCGAACCTGGGCAAAAATTCCATTCTTGGCGCGTTAACCTTGTATCTGGACTTCATCAACCTGTTCCTGATGTTGTTGCGGATCTTCGGCAACCGCCGTTAATTCTTTTTCACCATCACTATCCCGGCCATGTGTCGGGATTTTTTTCTTACTAAAAACGACACTTAACAAGTACCAGGTATAAAATATGCCTTATGGAc < 4:262739/272‑1 (MQ=255) ttGACGGCGTATGACACGCAGAAACTGAAAAATATGGGTGAGCAGATTGATACCCGCGACACGTCGAACCTGCGCAAATATTCCATTCTTGGCGCGTTAACCTTGTATCTGGACTTCATCAACCTGTTCCTGCGGTTGNTGCGGATCTTCGGCAACCGCCGTTAATTCTTTTTACCCATCACTATCCCGGCCATGTGTCGGGATTTTTTTATTNTTAAAAACGACCTTTAAAAATTACCAGCTTNNAAATATGCCTTATGGACGAGAGGAAACGt > 3:73386/1‑275 (MQ=255) 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gggggCAGATTGATACCCGCGACACGTCGAACCTGCGCAAATATTCCATTCTTGGCGCGTTAACCTTGTATCTGGACTTCATCAACCTGTTCCTGATGTTGTTGCGGATCTTCGGCAACCGCCGTTAATTCTTTTTCACCATCACTAGCCCGGCCATGTGTCGGGATTTTTTTCTTACTAAAAACGACACTTAACAAGTACCAGGTATAAAATATGCCTTATGGACGAGCGGAAGCGTTTTCTGTATCCATAAATGCAAAAGTATTTTGTATGCg < 1:154148/271‑1 (MQ=255) gTGAGCAGATTGCTACCCGCGACACGTCGAACCTTCCCCAATATTCCCTTCTTGGGTCGTTAACCTTGTATCTGGACTTCATCAACCGGTTCCTGATGTTGTTGCGGATCTTCGGCAACCGCCGTTAATTCTTTTTCACCATCACTATCCCGGCCATGTGTCGGGATTTTTTTCTTACTAAAAACGACACTTAACAAGTACCAGGTATAAAATATGCCTTATGGACGAGCGGAAGCGTTTTCTGTATCCATAAATGCAAAAGTATTTTGTATGCg < 4:11656/275‑1 (MQ=255) aGCAGATTGATACCCGCGACACGTCGAACCTGCGCAAATATTCCATTCTTGGCGCGTTAACCTTGTATCTGGACTTCATCAACCTGTTCCTGATGTTGTTGCGGATCTTCGGCAACCGCCGTTAATTCTTTTTCACCATCACTATCCCGGCCATGTGTCGGGATTTTTTTCTTACTAAAAACGACACTTAACAAGTACCAGGTATAAAATATGCCTTATGGACGAGCGGAAGCGTTTTCTGTATCCATAAATg > 4:334400/1‑253 (MQ=255) 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(MQ=255) gTTAATTCTTTTTCACCATCACTATCCCGGCCATGTGTCGGGATTTTTTTCTTACTAAAAACGACACTTAACAAGTACCAGGTATAAAATATGCCTTATGGACGAGCGGAAGCGTTTTCTGTATCCATAAATGCAAAAGTATTTTGTa < 6:811211/148‑1 (MQ=255) tCTTTTTCACCATCACTATCCCGGCCATGTGTCGGGATTTTTTTCTTACTAAAAACGACACTTAACAAGTACCAGGTATAAAATATGCCTTATGGACGAGCGGAAGCGtt > 7:398385/1‑110 (MQ=255) ttttCACCATCACTATCCCGGCCATGTGTCGGGATTTTTTTCTTACTAAAAACGACACTTAACAAGTACCAGGTATAAAATATGCCTTATGGACGAg < 8:158490/97‑1 (MQ=255) ttttCACCATCACTATCCCGGCCATGTGTCGGGATTTTTTTCTTACTAAAAACGACACTTAACAAGTACCAGGTATAAAATATGCCTTATGGACGAg > 7:158490/1‑97 (MQ=255) cACCATCACTATCCCGGCCATGTGTCGGGATTTTTTTCTTACTAAAAACGACACTTAACAAGTACCAGGTATAAAATATGCCTTATgg > 7:28949/1‑88 (MQ=255) cACCATCACTATCCCGGCCATGTGTCGGGATTTTTTTCTTACTAAAAACGACACTTAACAAGTACCAGGTATAAAATATGCCTTATgg < 8:28949/88‑1 (MQ=255) aTCACTATCCCGGCCATGTGTCGGGATTTTTTTCTTACTAAAAACGACACTTAACACGTACCAGGTATAAAATATGCCTTATGGACGAGCGGAAGCGTTTTc > 6:916265/1‑102 (MQ=255) tCACTATCCCGGCCATGTGTCGGGATTTTTTTCTTACTAAAAACGACACTTAACAAGTACCAGGTATAAAATATGCCTTATGGACGAGCGGa > 7:487069/1‑92 (MQ=255) tCACTATCCCGGCCATGTGTCGGGATTTTTTTCTTACTAAAAACGACACTTAACAAGTACCAGGTATAAAATATGCCTTATGGACGAGCGGa < 8:487069/92‑1 (MQ=255) cTATCCCGGCCATGTGTcgggatagtgatggtgaaaaagaattaacggcggttgccgaagatccgcaaca < 6:198836‑M2/70‑54 (MQ=255) cTATCCCGGCCATGTGTcgggatagtgatggtgaaaaagaattaacggcggttgccgaagatccgcaaca > 5:198836‑M2/1‑17 (MQ=255) tATCCCGGCCATGTGTcgggatagtgatggtgaaaaagaattaacggcggttgccgaagatccgcaacaacatcaggaacaggttgatgaagtccagatacaaggttaacgcgccaagaatggaatatttgcgca > 7:94136‑M2/1‑16 (MQ=255) tATCCCGGCCATGTGTcgggatagtgatggtgaaaaagaattaacggcggttgccgaagatccgcaacaacatcaggaacaggttgatgaagtccagatacaaggttaacgcgccaagaatggaatatttgcgca < 8:94136‑M2/135‑120 (MQ=255) tATCCCGGCCATGTGTcgggatagtgatggtgaaaaagaattaacggcggttgccgaagatccgcaacaacatca < 5:260619‑M2/75‑60 (MQ=255) tATCCCGGCCATGTGTCGGGATTTTTTTCTTACTAAAAACGACACTTAACAAGTACCAGGTATAAAATATGCCTTATGGACGAGCGGAAGCGtttt < 8:228682/96‑1 (MQ=255) tATCCCGGCCATGTGTCGGGATTTTTTTCTTACTAAAAACGACACTTAACAAGTACCAGGTATAAAATATGCCTTATGGACGAGCGGAAGCGtttt > 7:228682/1‑96 (MQ=255) aTCCCGGCCATGTGTcgggatagtgatggtgaaaaagaattaacggcggttgccgaagatccgcaacaacatcaggaacaggttgatgaagtccagatacaaggttaacgcgccaagaatggaatatttgcgcaggtt < 5:215384‑M2/138‑124 (MQ=255) aTCCCGGCCATGTGTcgggatagtgatggtgaaaaagaattaacggcggttgccgaagatccgcaacaacatcaggaacaggttgatgaagtccagatacaaggttaacgcgccaagaatggaatatttgcgcaggtt > 6:215384‑M2/1‑15 (MQ=255) cccGGCCATGTGTcgggatagtgatggtgaaaaagaattaacggcggttgccgaagatccgcaacaacatca < 8:669414‑M2/72‑60 (MQ=255) cccGGCCATGTGTcgggatagtgatggtgaaaaagaattaacggcggttgccgaagatccgcaacaacatc < 6:865616‑M2/71‑59 (MQ=255) cccGGCCATGTGTcgggatagtgatggtgaaaaagaattaacggcggttgccgaagatccgcaacaacatc > 5:865616‑M2/1‑13 (MQ=255) cccGGCCATGTGTCGGGATTTTTTTCTTACTAAAAACg < 7:761214/38‑1 (MQ=255) cccGGCCATGTGTCGGGATTTTTTTCTTACTAAAAACg > 8:761214/1‑38 (MQ=255) cccGGCCATGTGTCGGGATTTTTTTCTTACTAAAAACGACACTTAACAAGTACCAGGTATAAAATATGCCTTa < 7:634331/73‑1 (MQ=255) cccGGCCATGTGTCGGGATTTTTTTCTTACTAAAAACGACACTTAACAAGTACCAGGTATAAAATATGCCTTa > 8:634331/1‑73 (MQ=255) gacacatggccgggatagtgatggtgaaaaagaattaacggcggttgccgaagatccgcaacaacatcaggaacaggttgatgaagtccagatacaaggttaacgcgccaagaatggaatatttgcgcaggttcgacgtgtcgcgggtatcaatctgctcacccatatttttcagtttctgcgtgtcatacgccgtcaatccgacaaagacaatcacgccgatgtaggtaactgcccacatcaatgcttcgcttttcaaccagaagttgaccagc < 2:11656‑M1/275‑275 (MQ=255) | TGGCATCGCTGGTCAACTTCTGGTTGAAAAGCGAAGCATTGATGTGGGCAGTTACCTACATCGGCGTGATTGTCTTTGTCGGATTGACGGCGTATGACACGCAGAAACTGAAAAATATGGGTGAGCAGATTGATACCCGCGACACGTCGAACCTGCGCAAATATTCCATTCTTGGCGCGTTAACCTTGTATCTGGACTTCATCAACCTGTTCCTGATGTTGTTGCGGATCTTCGGCAACCGCCGTTAATTCTTTTTCACCATCACTATCCCGGCCATGTGTCGGGATTTTTTTCTTACTAAAAACGACACTTAACAAGTACCAGGTATAAAATATGCCTTATGGACGAGCGGAAGCGTTTTCTGTATCCATAAATGCAAAAGTATTTTGTATGCGTGGTTTTAAATTTATTGATGGTGAATATTAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAGGATATTAAACGGTATATGGCTCATTACCGCTTTAGGTTTGG > NC_000913/820341‑820886 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |