New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_000913 | 2327300 = | 84 (0.530) | 10 (0.070) | 7/240 | NT | 12.3% | intergenic (+7/+67) | atoB/yfaP | acetyl‑CoA acetyltransferase/DUF2135 family protein, putative host defense protein |
? | NC_000913 | 2327334 = | 67 (0.470) | intergenic (+41/+33) | atoB/yfaP | acetyl‑CoA acetyltransferase/DUF2135 family protein, putative host defense protein |
Only 100 of 119 total aligned reads displayed.
TATTGATCTCATTGAGGCTAATGAAGCATTTGCTGCACAGTTCCTTGCCGTTGGGAAAAACCTGGGCTTTGATTCTGAGAAAGTGAATGTCAACGGCGGGGCCATCGCGCTCGGGCATCCTATCGGTGCCAGTGGTGCTCGTATTCTGGTCACACTATTACATGCCATGCAGGCACGCGATAAAACGCTGGGGCTGGCAACACTGTGCATTGGCGGCGGTCAGGGAATTGCGATGGTGATTGAACGGTTGAATTAATCAATAAAAACACCCGATAGCGAAAGTTATCGGGTGTTTTCTTGAACATCGACGGCGAAGGTAACCCCATTAATCACCAGTCAAAACTTTTCACCAGCGTCAGCTCGCCAGCATTACGCATCGGTACAATAAATGTTTCCTGTTTCTCATTGACCGATCCTTCATCGGTGATCAGCGTCAGTTGGGCGGTGGTTAATTCCGTTTCGCTGCGCCCACCATAGTAGTTGATATACACCTGATAGCGCCCGTGAATTGGCGCGGGCATGGCGAAAA > NC_000913/2327038‑2327566 | ggatgtcacgacggggtacggacccgagattttcgccatgcccgcgccaattcacgggcgctatcaggtgtatatcaactactatggtgggcgcagcgaaacggaattaaccaccgcccaactgacgctgatcaccgatgaaggatcggtcaatgagaaacaggaaacatttattgtaccgatgcgtaatgctggcgagctgacgctggtgaaaagttttgactggtgattaatggggttaccttcgccgtcgatgttcaagAAAACACCCGATa < 4:313229‑M1/13‑1 (MQ=255) aTTGAGGCTAATGAAGCATTTGCTGCACAGTTCCTTGCCGTTGGGAAAAACCTGGGCTTTGATTCTGAGCAAGTGAATGTCAACGGCGGGGCCATCGCGCTCGGGCATCCTATCGGTGCCAGTGGTGCTCGTATTCTGGTCACACTATTACATGCCATGCAGGCACGCGATAAAACGCTGGGGCTGGCAACACTGTGCATTGGCGGCGGTCAGGGAATTGCGATGGTGATTGAACGGTTGAATTAATCAATAAAAACACCCGATAGCGAAAGTTa > 2:104287/1‑275 (MQ=255) aTTGAGGCTAATGAAGCATTTGCTGCACAGTTCCTTGCCGTTGGGAAAAACCTGGGCTTTGATTCTGAGAAAGTGAATGTCAACGGCGGGGCCATCGCGCTCGGGCATCCTATCGGTGCCAGTGGTGCTCGTATTCTGGTCACACTATTACATGCCATGCAGGCACGCGATAAAACGCTGGGGCTGGCAACACTGTGCATTGGCGGCGGTCAGGGAATTGCGATGGTGATTGAACGGTTGAATTAATCAATAAAAACACCCGATAGCGAAAGTTa > 1:130572/1‑275 (MQ=255) aTGAATCATTTGCTGCACAGTTCCTTGCCGTTGGGAAAAACCTGGGCTTTGATTCTGAGAAAGTGAATGTCAACGGCGGGGCCATCGCGCTCGGGCATCCTATCGGTGCCAGTGGTGCTCGTCTTCTGGTCACACTATTACATGCCATGCAGGCACGCGATAAAACGCTTGGGCTGGCCACACTTTGCATTGGCGGCGGTCAGGGAATTTCGATGGTTATTTAACGGTTGAATTAATCCATAAAAACACGCGATAGCGAAATTTATCTGGTGttt > 4:113492/1‑275 (MQ=255) tgctgcACAGTTCCTTGCCGTTGGGAAAAACCTGGGCTTTGATTCTGAGAAAGTGAATGTCAACGGCGGGGCCATCGCGCTCGGGCATCCTATCGGTGCCAGTGGTGCTCGTATTCTGGTCACACTATTACATGCCATGCAGGCACGCGATAAAACGCTTGGGCTGGCAACACTGTGCATTGGCGGCGGTCCTGGAATTGCGATGGTGATTGAACTGTTGACTTAATCAATAAAAACACCCGATGGTGAAAGTTAACGGGGGTTTTCTTGAACAt > 4:308499/1‑275 (MQ=255) aggtgcTTGCCGTTGGGGAAACCCCGGGTTTTGATTCTGAGAAAGTGGATGTCAACGGCGGGGCCATCGCCCTCGGGCATCCTATCGTGGCCAGTGTTGCTCGTATTCTGGTCACACTATTACATGCCATGCAGGCACGCGATAAAACGCTGTGGCTGGCAACAGTGGGCATTGAGGGCGGTCAGGGAATTGCGATGGTGATTGAACGGTTGAATTAAACAATAAAAACTCCCGATAGCGAAAGTTATCGGGTATTTGCTAGAACAACGAAGGca < 4:347131/270‑2 (MQ=255) cTTGCCGTTGGGAAAAACCTGGGCTTTGATTCTGAGAAAGTGAATGTCAACGGCGGGGCCATCGCGCTCGGGCATCCTATCGGTGCCAGTGGTGCTCGTATTCTGGTCACACTATTACATGCCATGCAGGCACGCGATAAAACGCTGGGGCTGGCAACACTGTGCATTGGCGGCGGTCAGGGAATTGCGATGGTGATTGAACGGTGGAATTAATCAATAAAAACACCCGATAGCGAAAGTTATCGGGTGTTTTCTTGAACATCGACGGCGAAGGt < 2:113493/275‑1 (MQ=255) tGCCGTTGGGAAAAACCTGGGCTTTGATTCTGAGAAAGTGAATGTCAACGGCGGGGCCATCGCGCTCGGGCATCCTATCGGTGCCAGTGTTGCCTGTATTCTGGTCACACTATTACATGCCATGCAGGCACGCGACAAAACGCCGGGGCTGGCAACACTGTGCATTGGCGGCGGTTAGGGAATTGCGATGGTGATTGAACGGTTGAATTAATCAATAAATACACCCGATAGCGAAAGTTACCGGGTGGTTTCTTGAAAATCCACGACGAAGGTa > 2:182220/1‑274 (MQ=255) gCTTTGATTCTGAGAAAGTGAATGTCAACGGCGGGGCCATCGCGCTCGGTCTTCCTATCGGTGCCAGTGGTGCTCTTATTCTGGTCACACTATTACATGCCATGCAGGCACGCGATAAAACGCTGGGGCTGGCAACACTGTGCATTGGCGGCGGTCAGGGAATTGCGATGGTGATTGAACGGTTGAATTAATCAATAAAAACACCCGATAGCGAAAGTTATCGGGTGTTTTCTTGAACATCGACGGCGAAGGTAACCCCATTAATCACCAGTCaa < 1:33476/275‑1 (MQ=255) tCAACGGCGGGGCCATCGCGCTCGGGCATCCTATCGGTGCCAGTGGTGCTCGTATTCTGGTCACCCTATTACATGCCATGCAGGCACGCGATAAAACGCTGGGGCTGGCAACACTGTGCATTGGCGGCGGTCAGGGAATTGCGATGGTGATTGAACGGTTGAATTAATCAATAAAAACACCCGATAGCGGAAGTTATCGGGTGTTTTCTTGAACATCGACGGCGAAGGTAACCGCATTAATCACCAGTCAAAACTTTTCACCAGCGTCAGCTCGc > 2:499438/1‑275 (MQ=255) 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tCTGGTCACACTATTACATGCCATGCAGGCACGCGATAAAACGCTGGGGCTGGCAACACTGTGCATTGGCGGCGGTCAGGGAATTGCGATGGTGATTGAACGGTTGAATTAATCAATaaa < 8:920972/120‑1 (MQ=255) gTCACACTATTACATGCCATGCAGGCACGCGATAAAACGCTGGGGCTGGCAACACTGTGCATTGGCGGCGGTCAGGGAATTGCGATGGTGATTGAACGGTTGAATTAATCAATAAAAACACACGATAGCGAAAGTTATCGGGTGTTTTCTTGAACATAGACGGCGAAGGTAACCCCATTAATCACCAGTCAAAACTTTTCACCAGCGTCAGCTCGCCAGCATTACGCATCGGTAAAATAAATGTTTCCTGTTTCTCATTGACCGATACttacgcg > 4:425785/1‑270 (MQ=255) tCACACTATTACATGCCATGCAGGCACGCGATAAAACGCTGGGGCTGGCAACACTGTGCATTGGCGGCGGTCAGGGAATTGCGATGGTGATTGAACGGTTGAATTAATCAATaaaaa > 7:1039023/1‑117 (MQ=255) tCACACTATTACATGCCATGCAGGCACGCGATAAAACGCTGGGGCTGGCAACACTGTGCATTGGCGGCGGTCAGGGAATTGCGATGGTGATTGAACGGTTGAATTAATCAATaaaaa < 8:1039023/117‑1 (MQ=255) cacaCTATTACATGCCATGCAGGCACGCGATAAAACGCTGGGGCTGGCAACACTGTGCATTGGCGGCGGTCAGGGAATTGCGATGGTGATTGAACGGTTGAATTAATCAATAAAAACACCCGATAACTTTCGCTATCGGGTGttttta < 7:1131647/148‑3 (MQ=38) 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(MQ=255) tttgactggtgattaatggggttaccttcgccgtcgatgttcaagAAAACACCCGATAGCGAAAGTTATCggg < 6:347618‑M1/28‑1 (MQ=255) gTCAGGGAATTGCGATGGTGATTGAACGGTTGAATTAATCAATAAAAACACCCGATAGCGAAAGTTa > 7:114988/1‑67 (MQ=255) gTCAGGGAATTGCGATGGTGATTGAACGGTTGAATTAATCAATAAAAACACCCGATAGCGAAAGTTa < 8:114988/67‑1 (MQ=255) gTCAGGGAATTGCGATGGTGATTGAACGGTTGAATTAATCAATAAAAACACCCGATAGCGAAAGTTATCGGGTGTTTTCTTGAACATCGACGGCGAAGGTAAc < 5:181034/103‑1 (MQ=255) gTCAGGGAATTGCGATGGTGATTGAACGGTTGAATTAATCAATAAAAACACCCGATAGCGAAAGTTATCGGGTGTTTTCTTGAACATCGACGGCGAAGGTAAc > 6:181034/1‑103 (MQ=255) ggAATTGCGATGGTGATTGAACGGTTGAATTAATCAATAAAAACACCCGATAGCGAAAGTTATCGGGTGTTTTCTTGAACATCGACGGCGAAGGTAACCCCATTAATCACCAGTCAAAACTTTTCACCAGCGTCAGCTCGCCAGCATTACGCATCGGTACAATAAATGTTTCCTGTTTCTCATTGACCGATCCTTCATCGGTGATCAGCGTCAGTTGGGCGGTGGTTAATTCCGTTTCGCTGCGCCCACCATAGTAGTTGATATACACCTGATa > 2:29631/1‑274 (MQ=255) gAATTGCGATGGTGATTGAACGGTTGAATTAATCAATAAAAACACCCGATAGCGAAAGTTATCggg < 6:317161/66‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) ttGAACGGTTGAATTAATCAATAAAAACACCCGATAGCGAAAGTTATCGGGTGTTTTCTTGAACATCGACGGCGAAGGTAACCCCATTAATCACCAGTCAAAACt > 8:460546/1‑105 (MQ=255) taccttcgccgtcgatgttcaagAAAACACCCGATAGCGAAAGTTATCggg > 8:426238‑M1/24‑51 (MQ=255) taccttcgccgtcgatgttcaagAAAACACCCGATAGCGAAAGTTATCggg < 7:426238‑M1/28‑1 (MQ=255) gTTGAATTAATCAATAAAAACACCCGATAGCGAAAGTTATCGGGTGTTTTCTTGAACATCGACGGCGAAGGTAACCCCATTAATCACCAGTCAAAACTTTTCACCAGCGTCAGCTCGCCAGCATTACGc > 5:708946/1‑129 (MQ=255) gTTGAATTAATCAATAAAAACACCCGATAGCGAAAGTTATCGGGTGTTTTCTTGAACATCGACGGCGAAGGTAACCCCATTAATCACCAGTCAAAACTTTTCACCAGCGTCAGCTCGCCAGCATTACGc < 6:708946/129‑1 (MQ=255) ttGAATTAATCAATAAAAACACCCGATAGCGAAAGTTATCGGGTGTTTTCTTGAACATCGACGGCGa > 6:156266/1‑67 (MQ=255) ttGAATTAATCAATAAAAACACCCGATAGCGAAAGTTATCGGGTGTTTTCTTGAACATCGACGGCGa < 5:156266/67‑1 (MQ=255) 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6:777834‑M1/91‑1 (MQ=255) AAAACACCCGATAGCGAAAGTTATCGGGTGTTTTCTTGAACATCGACGGCGAAGGTAACCCCATTAATCACCAGTCAAAACTTTTCACCAg > 5:777834‑M1/1‑91 (MQ=255) | TATTGATCTCATTGAGGCTAATGAAGCATTTGCTGCACAGTTCCTTGCCGTTGGGAAAAACCTGGGCTTTGATTCTGAGAAAGTGAATGTCAACGGCGGGGCCATCGCGCTCGGGCATCCTATCGGTGCCAGTGGTGCTCGTATTCTGGTCACACTATTACATGCCATGCAGGCACGCGATAAAACGCTGGGGCTGGCAACACTGTGCATTGGCGGCGGTCAGGGAATTGCGATGGTGATTGAACGGTTGAATTAATCAATAAAAACACCCGATAGCGAAAGTTATCGGGTGTTTTCTTGAACATCGACGGCGAAGGTAACCCCATTAATCACCAGTCAAAACTTTTCACCAGCGTCAGCTCGCCAGCATTACGCATCGGTACAATAAATGTTTCCTGTTTCTCATTGACCGATCCTTCATCGGTGATCAGCGTCAGTTGGGCGGTGGTTAATTCCGTTTCGCTGCGCCCACCATAGTAGTTGATATACACCTGATAGCGCCCGTGAATTGGCGCGGGCATGGCGAAAA > NC_000913/2327038‑2327566 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |