| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 261 total aligned reads displayed.
GATAAGCGATGGCAGAGAATCAACAATGTAATCGCCATTAAGCGTGAACGGTTCAAGTCCCGGTTCAAAATAGCTGATTTCATTGCCGCGCTGTACCACTTCCCGGCGCGGGCCATCCATTTGCAACAATTGTGCAAGAGGACGGTTATCGAGGCGTGCATGTCGATAACGCAGAGACTCAACACCCTGTTTATTGATGCTGATGAATGACAGCTCGTAATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGGCTACCTGTCACTAATGACATGGCAAACCAAAGTTGCTTCATTACTGCGATTGCGTTCCTAAAGTTTGAATTCCTGGCACCTGTACAGCGGCTTGCTGGGTTTGCGCCTGCTCAAACTGAAGCTGTTCAGAGTGGAGTCGGCGTTGCAGTTCGTAATCCTGCAACATTGCATTAATGCGACGACGCTGCTCCTGTACCTGCTGCTGTTGACCATTGTTTGCGGTCGCTTCAG > NC_000913/2708410‑2708944 | cGATGGCCGAGAATCACCAATGTAATCGCCATTAAGCGTGAACGGTTCAAGTCCCGGTTCAAAATAGCTGATTTCATTGCCGCGCTGTACCACTTCCCGGCGCGGGCCATCCATTTGCAACAATTGTCCCAGAGGACGNTTACAGAGGCGTGCATGTCCATAACGCAGATACTCAACATCCTGTTTCTTGATGCTGATGCATCACACCCCGTAATTCCANGACTGACAGGCAACGTCAATCCCCCNTAACAACCACCCGGACGCGGCCGAGGCCg > 3:101839/1‑275 (MQ=255) ggCAGAGAATCAACAATGTAATCGCCATTAAGCGTGAACGGTTCAAGTCCCGGTTCAAAATAGCTGATTTCATTGCCGCGCTGTACCACTTCCCGGCGCGGGCCATCCATTTGCAACAATTGTGCAAGAGGACGGTTATCGAGGCGTGCATGTCGATAACGCAGAGACTCAACACCCTTTTTATTGATGCTGATGAATGACAGCTCGTAATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCAAggc < 1:145467‑M2/275‑4 (MQ=255) gAACGGTTCAAGTCCCGGTTCAAAATAGCTGATTTCATTGCCGCGCTGTACCACTTCCCGGCGCGGGCCATCCATTTGCAACAATTTTGCAAGAGGACGGTTATCGAGGCGTGCATGTCGATAACGCAGAGACTCAACACCCTGTTTATTGATGCTGATGAATGACAGCTCGTAATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGTGGCGTTAGCATAGAATAACAGGCTAccgttccattatg > 2:417040/1‑264 (MQ=255) gAACGGTTCAAGTCCCGGTTCAAAATAGCTGATTTCATTGCCGCGCTGTACCACTTCCCGGCGCGGGCCATCCATTTGCAACAATTGTGCAAGAGGACGGTTATCGAGGCGTGCATGTCGATAACGCAGAGACTCAACACCCTGTTTATTGATGCTGATGAATGACAGCTCGTAATTCATTGACTGCCTGGCCAGGTTCATCTGCTGCAATAACGCCCCGGCCGCGGGAGTGGCCCAGGCGTAAGCAGAGAATAACAGGCTACCGGTCACAAAta > 4:516091/1‑274 (MQ=255) ttCAAGTCCCGGTTCAAAATAGCTGATTTCATTGCCGCGCTGTACCACTTCCCGGCGCGGGCCATCCATTTGCAACAATTGTGCAAGAGGACGGTTATCGAGGCGTGCATGTCGATAACGCAGAGACTCAACACCCTGTTTATTGATGCTGATGAATGACAGCTCGTAATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCTTTAGCAGGGAATAACAGGCTAACTGTCACTAATGACATga > 4:495855/1‑274 (MQ=255) ttCAAGTCCCGGTTCAAAATAGCTGATTTCATTGCCGCGCTGTACCACTTCCCGGCGCGGGCCATCCATTTGCAACAATTGTGCAAGAGGACGGTTATCGAGGCGTGCATGTCGATAACGCAGAGACTCAACACCCTGTTTATTGATGCTGATGAATGACAGCTCGTAATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCACGGACGCGGAGGTGGCCGGGGCGTTAGCAGAGAATAAAAGGCACCCTGTCACTAAGGACAtt > 4:57218/1‑273 (MQ=255) cccGGTTCAAAATAGCTGATTTCATTGCCGCGCTGTACCACTTCCCGGCGCGGGCCATCCATTTGCAACAATTGTGCAAGAGGACGGTTATCGAGGCGTGCATGTCGATAACGCAGAGACTCAACACCCTGTTTATTGATGCTGATGAATGACAGCTCGTAATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGGCTACCTGTCACTAATGACATGGCAAAcc < 2:51417/274‑1 (MQ=255) 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cAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGGCTACCTGTCACTAATGACATGGCAAACCAAAGTTGCTTCATTACTGCGATTGCGTTCCTAAAGTTTg < 7:369085/134‑1 (MQ=255) ggTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGGCTACCTGTCACTAATGACATGGCAAACCAAAGTTGCTTc < 5:342464/104‑1 (MQ=255) ggTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGGCTACCTGTCACTAATGACATGGCAAACCAAAGTTGCTTc > 6:342464/1‑104 (MQ=255) ggTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGGCTACCTGTCACTAATGACATGGCAAACCAAAGTTGCTTCATTACTGCGATTGCGTTCCTAAAGTTTGAATTCCTGGCACCTGTACAGCGGCTTGCTGGGTTTGCGCCTGCTCAAACTGAAGCTGTTCAGAGTGGAGTCGGCGTTGCAGTTCGTAATCCTGCAACa < 2:375288/230‑1 (MQ=255) gTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGGCTACCTGTCACTAATGACATGGCAAACCAAAGTTGCTTCATTACTGCGATTGCGTTCCTAAAGtt > 8:25525/1‑129 (MQ=255) gTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGGCTACCTGTCACTAATGACATGGCAAACCAAAGTTGCTTCATTACTGCGATTGCGTTCCTAAAGtt < 7:25525/129‑1 (MQ=255) gctgTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGGCTACCTGTCACTAATGACATGGCAAACCAAAGTTGCTTCATTACTGCGATTGCGTTCCTAAAGTTTGAATTCCTGGCACCTGTACAGCGGCt > 8:124222/1‑148 (MQ=255) tgTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGGCTACCTGTCACTAATGACATGGCAAACCAAAGTTGCTTCATTACTGCGATTGCGTTCCTAAAGTTTGAATTCCTGGCACCTGTACAGCGGCTTGCTGGGTTTGCGCCTGCTCAAACTGAAGCTGTTCAGAGTGGAGTCGGCGTTGCAGTTCGTAATCCTGCACCATTGCATTAATGCGACGACGCTGCCCCTGTACCTGCTGCTTTTTACCCTTGTTTGCg > 4:448968/1‑275 (MQ=255) gTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCag > 8:659012/1‑42 (MQ=255) ataaCGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGGCTACCTGTCACTAATGACATGGCAAACCAAAGTTGCTTCATTACTGCGATTGCGTTCCTAAAGTTTGAATTCCt < 1:28270/124‑1 (MQ=255) taaCGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGGCTACCTGTCACTAATGACATGGCAAACCAAAGTTGCTTCATTACTGCGATTGCGTTCCTAAAGTTTg > 6:571069/1‑116 (MQ=255) taaCGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGGCTACCTGTCACTAATGACATGGCAAACCAAAGTTGCTTCATTACTGCGATTGCGTTCCTAAAGTTTg < 5:571069/116‑1 (MQ=255) aaCGCCtcggccactcccgcgtccggggcgttattacagcagatgaacctggccagtcagtcactgaattacga < 6:239992‑M1/74‑69 (MQ=255) aaCGCCtcggccactcccgcgtccggggcgttattacagcagatgaacctggccagtcagtcactgaattacga > 5:239992‑M1/1‑6 (MQ=255) aCGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAggcgttattacagcagatgaacctggccagtcagtcactgaattacgagctgtcattcatcagcatcaataaacagggtgttg > 7:744080‑M2/1‑25 (MQ=255) aCGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGGCTACCTGTCACTAATGACATGGCAAACCAAAGTTGCTTCATTACTGCGATTGCGTTCCTAAAGttt < 7:1078234/113‑1 (MQ=255) aCGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGGCTACCTGTCACTAATGACATGGCAAACCAAAGTTGCTTCATTACTGCGATTGCGTTCCTAAAGttt > 6:1089049/1‑113 (MQ=255) aCGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGGCTACCTGTCACTAATGACATGGCAAACCAAAGTTGCTTCATTACTGCGATTGCGTTCCTAAAGttt < 5:1089049/113‑1 (MQ=255) cGCCtcggccactcccgcgtccggggcgttattacagcagatgaacctggccagtcagtcactgaattacgagctgtcattcatcagcatcaataaacagggtgttg < 5:886891‑M1/107‑104 (MQ=255) cGCCtcggccactcccgcgtccggggcgttattacagcagatgaacctggccagacagtcactgaattacgagctgtcattcatcagcatcaa > 6:966735‑M1/1‑4 (MQ=255) cGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGGCTACCTGTCACTAATGACATGGCAAACCAAAGTTGCTTCATTACTGCGATTGCGTTCCTaa < 8:394739/107‑1 (MQ=255) ccccGGACGCGGGAGTGGCCGAggcgttattacagcagatgaacctggccagtcagtcactgaattacgagctgtcattcatcagcatcaataaacagggtgttgagtctctgcgttat > 7:78489‑M2/1‑22 (MQ=255) ccccGGACGCGGGAGTGGCCGAggcgttattacagcagatgaacctggccagtcagtcactgaattacgagctgtcattcatcagcatcaataaacagggtgttgagtctctgcgttat < 8:78489‑M2/119‑98 (MQ=255) cccGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGGCTACCTGTCACTAATGACATGGCAAACCAAAGTTGCTTCATTACTGCGATTGCGTTCCTAAAGTTTGAATTCCTGGCACCTGTACAGc < 8:533617/131‑1 (MQ=255) | GATAAGCGATGGCAGAGAATCAACAATGTAATCGCCATTAAGCGTGAACGGTTCAAGTCCCGGTTCAAAATAGCTGATTTCATTGCCGCGCTGTACCACTTCCCGGCGCGGGCCATCCATTTGCAACAATTGTGCAAGAGGACGGTTATCGAGGCGTGCATGTCGATAACGCAGAGACTCAACACCCTGTTTATTGATGCTGATGAATGACAGCTCGTAATTCAGTGACTGACTGGCCAGGTTCATCTGCTGTAATAACGCCCCGGACGCGGGAGTGGCCGAGGCGTTAGCAGAGAATAACAGGCTACCTGTCACTAATGACATGGCAAACCAAAGTTGCTTCATTACTGCGATTGCGTTCCTAAAGTTTGAATTCCTGGCACCTGTACAGCGGCTTGCTGGGTTTGCGCCTGCTCAAACTGAAGCTGTTCAGAGTGGAGTCGGCGTTGCAGTTCGTAATCCTGCAACATTGCATTAATGCGACGACGCTGCTCCTGTACCTGCTGCTGTTGACCATTGTTTGCGGTCGCTTCAG > NC_000913/2708410‑2708944 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |