New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 4546905 = | 217 (1.370) | 6 (0.040) | 6/252 | NT | 2.6% | coding (1810/2637 nt) | fimD | fimbrial usher outer membrane porin protein; FimCD chaperone‑usher |
? | NC_000913 | 4546951 = | 237 (1.580) | coding (1856/2637 nt) | fimD | fimbrial usher outer membrane porin protein; FimCD chaperone‑usher | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 248 total aligned reads displayed.
AATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGTTACTCAGCAACTCGGGCGCACATCAACACTGTATTTGAGTGGTAGCCATCAAACTTATTGGGGAACGAGTAATGTCGATGAGCAATTCCAGGCTGGATTAAATACTGCGTTCGAAGATATCAACTGGACGCTCAGCTATAGCCTGACGAAAAACGCCTGGCAAAAAGGACGGGATCAGATGTTAGCGCTTAACGTCAATATTCCTTTCAGCCACTGGCTGCGTTCTGACAGTAAATCTCAGTGGCGACATGCCAGTGCCAGCTACAGCATGTCACACGATCTCAACGGTCGGATGACCAATCTGGCTGGTGTATACGGTACGTTGCTGGAAGACAACAACCTCAGCTATAGCGTGCAAACCGGCTATGCCGGGGGAGGCGATGGAAATAGCGGAAGTACAGGCTACGCCACGCTGAATTATCGCGGTGGTTACGGCAATGCCAATATCGGTTACAGCCATAGCGATGATATTAAGCAGCTC > NC_000913/4546636‑4547174 | tacccctgtggcatgagccggtaccccgccgttgactccgtaatagagccgcttaatatcatcgctatggctgtacccgatattggcattgccgtaacccccgcgataattcagcgtggcgtagcctgtacttccgctatttccatcgcctcccccggcatagccggtttgcacgctatagctgaggttgttgtcttccagcaacgtaccgtatacaccagccagattggtcatccgaccgttgagatcgtgtgacatgctgtagctggCACTgg > 4:56631‑M1/270‑275 (MQ=255) tATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGTTACTCAGCAACTCGGGCGCACATCAACACTGTATTTGAGTGGTAGCCATCAAACTTATTGGGGAACGAGTAATGTCGATGAGCAATTCCAGGCTGGATTAAATACTGCGTTCGAAGATATCAACTGGACGCTCAGCTATAGCCTGACGAAAAACGCCTGGCAAAAAGGACGGGATCAGATGTTAGCGCTTAACGTCAATATTCCTTTCAGCCACTGGCTGCGTTCTGa < 2:211619/275‑1 (MQ=255) tCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGTTACTCAGCAACTCGGGCGCACATCAACACTGTATTTGAGTGGTAGCCATCAAACTTATTGGGGAACGAGTAATGTCGATGAGCAATTCCAGGCTGGATTAAATACTGCGTTCGAAGATATCAACTGGACGCTCAGCTATAGCCTGACGAAAAACGCCTGGCAAAAAGGCCGGGATCAGATGTTAGCGCTTAACGTCAAATTTCCTTTCAGCCCCTGGCTGGGTTCTgcacggaaaat > 4:517978/1‑264 (MQ=255) tCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGTTACTCAGCAACTCGGGCGCACATCAACACTGTATTTGAGTGGTAGCCATCAAACTTATTGGGGAACGAGTAATGTCGATGAGCAATTCCAGGCTGGATTAAATACTGCGTTCGAAGATATCAACTGGACGCTCAGCTATAGCCTGACGAAAAACGCCTGGCAAAAAGGACGGGATCAGATGTTAGCGCTTAACGTCAATATTCCTTTCAGCCACTGGCTGCGTTCTGACAGTAAAtc > 1:12050/1‑274 (MQ=255) gCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGTTACTCAGCAACTCGGGAGCACATCAACACTGTATTTGAGTGGTAGCCATCAAACTTATTGGGGAAGGAGTAATGTCGATGAGCAATTCCAGGCTGGATTAAATACTGCGTTCGAAGATATCAACTGGACGCTCAGCTATAGCCTGACGAAAAACGCCTGGCACAAAGAACGGGATCAGATGTTAGCGCTTAACGTCAATATTACTTTCATCCACTGTCTGCGTTCTTACTGTCAATCTCa > 1:131711/1‑275 (MQ=255) ggAAATTACAACTCACCGTTACTCAGCAACTCGGGCGCACATCAACACTGTATTTGAGTGGTAGCCATCAAACTTATTGGGGAACGAGTAATGTCGATGAGCAATTCCAGGCTGGATTAAATACTGCGTTCGACGATATCAACTGGACGCTCAGCTATAGCCTGACGAAAAACGCCGGGAAAAAAGGCAGGAATCCGNAGTACGAGCTTAACGTCAGGATTCCATTAAACCACTGGCCGCGCTCTGACAGTAAACCCCAGGTGCGACCtgaaagc > 3:128767/1‑270 (MQ=255) aatgtACAAGTCACCGTAATTCAGTAGCTCGGACAAACATCAAAAAAGTAGTTGAGTGGTATCGATCATACTACTTGGGGAACGAGTAATGTGGATGAGCAATTCCAGGCTGTATTAAATACTGCGTTCGAAGGTATCAACTGGACGCTCAGCTATAGCCTGACGAAAAACGCCTGGCAAAAAAGCCGTGATCAGATGTTAGCGCTTAACGTCAATATTCCTTTCGGCCACTGGCTGCGTTCTGACAGTAAATCTCAGTAGCGACAtgccagtgc < 4:11578/271‑1 (MQ=255) aCCGTTACTCAGCAACTCGGGCGCACATCAACACTGTATTTGAGTGGTAGCCATCAAACTTATTGGGGAACGAGTAATGTCGATGAGCAATTCCAGGCTGGATTAAATACTGCGTTCGAAGATATCAANTGGACGCTCAGCTATAGCCTGACGAAAAACGCCTGGCAAAAAGGACGGGATCAGATGTTAGCGCTTAACNTCACAATTCCTTTCAGCAACTGGCTGAGTTCTTAAAGTAAATCCCNGNGNCAAAATGCCAGTGCCAGCTAccacat > 3:54582/1‑270 (MQ=255) acaaaCAATGGATTTGAGTGGTAGCCATCAAAATTATTGGGGAACGAGTAATGTCGATGAGCAATTCCAGGCTGGATTAAATACTGCGTGCGAAGACATCAACTGGACGCGCAGCTAGAGACTGACGAAAAACGCCTGGCAAAAAGGACGGGATCAGATGTTAGCGCTTAACGTCAATATTCCGTTCAGCCACTGGCTGCGTTCTGACAGTAAATCTCAGTGGCGACATGCCAGTGCCAGCTACAGCATGTCACACGATCTCAACGGTCGGATGa < 4:401057/272‑1 (MQ=255) tGTATTTGAGTGGTAGCCATCAAACTTATTGGGGAACGAGTAATGTCGATGAGCAATTCCAGGCTGGATTAAATACTGCGTTCGAAGATATCAACTGGACGCTCAGCTATAGCCTGACGAAAAACGCCTGGCAAAAAGGACGGGATCAGATGTTAGCGCTTAACGTCAATATTCCTTTCAGCCACTGGCTGCGTTCTGACAGTAAATCTCAGTGGCGACATGCCAGTGCCAGCTACAGCATGTCACACGATCCCAACGGGCGGATGCCCAATctg > 4:245163/1‑275 (MQ=255) tATTTGAGTGGTAGCCATCAAACTTATTGGGGAACGAGTAATGTCGATGAGCAATTCCAGGCTGGATTAAATACTGCGTTCGAAGATATCAACTGGACGCTCAGCTATAGCCTGACGAAAAACGCCTGGCAAAAAGGACGGGATCAGATGTTAGCGCTTAACGTCAATATTCCTTTCAGCCACTGGCTGCGTTCTGACAGTAAATCTCAGTGGCGACATGCCAGTGCCAGCTACAGCATGTCACACGATCTCAACGGTCGGATGACCAATctgg < 2:123339/274‑1 (MQ=255) gagatGGTAGCCATAAAACTTAATGGGGANNNAGTAAGGTCGAGGAGAAATTCCAGGCTGGATTAAAAACTGCGTTCGAAGAGATAAACTGGACGCTCAGCTATAGCCTGACGAAAAACGCCTGGCAAAAAGGACGGGATAAGATGTTAGCGCTTAACGTCAATATTCCTTTCAGCCACTGGCTGCGTTCGGACAGTAAATCTCAGTGGCGACATGCCAGTGCCAGCTACAGCATGTCACACGATCTCAACGGTCGGATGACCAATCTGGCTGgt < 3:161043/271‑1 (MQ=255) gTAGCCATCAAACTTATTGGGGAACGAGTAATGTCGATGAGCAATTCCAGGCTGGATTAAATACTGCGTTCGAAGATATCAACTGGACGCTCAGCTATAGCCTGACGAAAAACGCCTGGCAAAAAGGACGGGATCAGATGTTAGCGCTTAACGTCAATATTCCTTTCAGCCACTGGCTGCGTTCTGACAGTAAATCTCAGTGGCGACATGCCAGTGCCAGCTACAGCATGTCACACGATCTCAACGGTCGGATGACCAATCTGGCTGGTGTATAc > 4:157276/1‑275 (MQ=255) gTAGCCATCAAACTTATTGGGGAACGAGTAATGTCGATGAGCAATTCCAGGCTGGATTAAATACTGCGTTCGAAGATATCAACTGGACGCTCAGCTATAGCCTGACGAAAAACGCCTGGCAAAAAGGACGGGATCAGATGTTAGCGCTTAACGTCAATATTCCTTTCAGCCACTGGCTGCGTTCTGACAGTAAATCTCAGTGGCGACATGCCAGTGCCAGCTACAGCATGTCACACGATCTCAACGGTCGGATGACCAATCTGGCTGGTGTATAc > 2:69956/1‑275 (MQ=255) tCAAACTTATTGGGGAACGAGTAATGTCGATGAGCAATTCCAGGCTGGATTAAATACTGCGTTCGAAGATATCAACTGGACGCTCAGCTATAGCCTGACGAAAAACGCCTGGCAAAAAGGACGGGATCAGATGTTAGCGCTTAACGTCAATATTCCTTTCAGCCACTGGCTGCg > 4:142268/1‑174 (MQ=255) tGGGGAACGAGTAATGTCGATGAGCAATTCCAGGCTGGATTAAATACTGCGTTCGAAGATATCAACTGGACGCTCAGCTATAGCCTGACGAAAAACGCCTGGCAAAAAGGACGGGATCAGATGTTAGCGCTTAACGTCAATATTCCTTTCCGACACTGGCTGCGTTCTGACAGTAAATCTCAGTGGCGACATGCCAGTGCCCGCTACAGCATGTCACAAGATCTAAACGGTCGGATGACCAATCTGTCTGGTGTATACGGTACGTTGCTGGTAGa > 2:353449/1‑275 (MQ=255) ctgtacttccgctatttccatcgcctcccccggcatagccggtttgcacgctatagctgaggttgttgtcttccagcaacgtaccgtatacaccagccagattggtcatccgaccgttgagatcgtgtgacatgctgtagctggCACt < 5:412957‑M1/4‑1 (MQ=255) aGTAATGTCGATGAGCAATTCCAGGCTGGATTAAATACTGCGTTCGAAGATATCAACTGGACGCTCAGCTATAGCCTGACGAAAAACGCCTGGCAAAAAGGACGGGATCAGATGTTAGCGCTTAACGTCAATATTCCTTTCAGCCACTGGCTGCGTTCTGACAGTAAATCTCAGTGGCGACATGCCAGTGCCAGCTACAGCATGTCACACGATCTCAACGGTCGGATGACCAATCTGGCTGGTGTATACGGTACGTTGCTGGAAGACAACAACCt > 1:94631/1‑275 (MQ=255) aaTGTCGATGAGCAATTCCAGGCTGGATTAAATACTGCGTTCGAAGATATCAACTGGACGCTCAGCTATAGCCTGACGAAAAACGCCTGGCAAAAAGGACGGGATCAGATGTTAGCGCTTAACGTCAATATTCCTTTCAGCCACTGGCTGCGTTCTGACAGTAAATCTCAGTGGCGACATGCCAGTGCCAGCTACAGCATGTCACACGATCTCAACGGTCGGATGACCAATCTGGCTGGTGTATACGGTACGTTGCTGGAAGACAACAACCTCAg < 4:86937/275‑1 (MQ=255) tGTCGATGAGCAATTCCAGGCTGGATTAAATACTGCGTTCGAAGATATCAACTGGACGCTCAGCTATAGCCTGACGAAAAACGCCTGGCAAAAAGGACGGGATCAGATGTTAGCGCTTAACGTCAATATTCCTTTCAGCCACt < 6:672652/143‑1 (MQ=255) gATGAGCAATTCCAGGCTGGATTAAATACTGCGTTCGAAGATATCAACTGGACGCTCAGCTATAGCCTGACGAAAAACGCCTGGCAAAAAGGACGGGATCAGATGTTAGCGCTTAACGTCAATATTCCTTTCAGCCACTGGCTGCGtt < 6:1107737/148‑1 (MQ=255) gATGAGCAATTCCAGGCTGGATTAAATACTGCGTTCGAAGATATCAACTGGACGCTCAGCTATAGCCTGACGAAAAACGCCTGGCAAAAAGGACGGGATCAGATGTTAGCGCTTAACGTCAATATTCCTTTCAGCCACTGGCTGCGTTCTGACAGTAAATCTCAGTGGCGACATGCCAGTGCCAGCTACAGCATGTCACACGATCTCAACGGTCGGATGACCAATCTGGCTGGTGTATACGGTACGTTGCTGGAAGACAACAACCTCAGCtata < 2:245164/274‑1 (MQ=255) aTGAGCAATTCCAGGCTGGATTAAATACTGCGTTCGAAGATATCAACTGGACGCTCAGCTATAGCCTGACGAAAAACGCCTGGCAAAAAGGACGGGATCAGATGTTAGCGCTTAACGTCAATATTCCTTTCAGCCACTGGCTGCGTTCTGACAGTAAATCTCAGTGGCGACATGCCAGTGCCAGCTACAGCATGTCACACGATCTCAACGGTCGGATGACCAATCTGGCTGGTGTATACGGTACGTTGCTGGAAGGCAACAACCTCAGCTATAGc > 2:165250/1‑275 (MQ=255) tCCAGGCTGGATTAAATACTGCGTTCGAAGATATCAACTGGACGCTCAGCTATAGCCTGACGAAAAACGCCTGGCAAAAAGGACGGGATCAGATGTTAGCGCTTAACGTCAATATTCCTTTCAGCCACTGGCTGCGTTCTGACAGTAAATCTCAGTGGCGACATGCCAGTGCCAGCTACAGCATGTCACACGATCTCAACGGTCGGATGACCAATctgg < 2:397961/219‑1 (MQ=255) tACTGCGTTCGAAGATATCAACTGGACGCTCAGCTATAGCCTGACGAAAAACGCCTGGCAAAAAGGACGGGATCAGATGTTAGCGCTTAACGTCAATATTCCTTTCAGCCACTGGCTGCGTTCTGACAGTAAATCTCAGTGGCGACATGCCAGTGCCAGCTACAGCATGTCACACGATCTCAACGGTCGGATGACCAATCTGGCTGGTGTATACGGTACGTTGCTGGAAGACAACAACCTCAGCTATAGCGTGCAAACCGGCTATGCCGGGGGAg < 2:481823/275‑1 (MQ=255) tGCGTTCGAAGATATCAACTGGACGCTCAGCTATAGCCTGACGAAAAACGCCTGGCAAAAAGGACGGGATCAGATGTTAGCGCTTAACGTCAATATTCCTTTCAGCCACTGGCTGCGTTCTGACAGTAAATCTCAGTGGCGACATGCCAGTGCCAGCTACAGCATGTCACACGATCTCAACGGTCGGATGACCAATct > 2:142318/1‑198 (MQ=255) tGCGTTCGAAGATATCAACTGGACGCTCAGCTATAGCCTGACGAAAAACGCCTGGCAAAAAGGACGGGATCAGATGTTAGCGCTTAACGTCAATATTCCTTTCAGCCACTGGCTGCGTTCTGACAGTAAATCACAGTGGCGAc > 1:157981/1‑143 (MQ=255) gCGTTCGAAGATATCAACTGGACGCTCAGCTATAGCCTGACGAAAAACGCCTGGCAAAAAGGACGGGATCAGATGTTAGCGCTTAACGTCAATATTCCTTTCAGCCACTGGCTGCGTTCTGACAGTAAATCTCAGTGGCGACATGCCAGTGCCAGCTACAGCATGTCACACGATCTCAACGGTCGGATGACCAATctggc > 4:440130/1‑200 (MQ=255) tCGAAGATATCAACTGGACGCTCAGCTATAGCCTGACGAAAAACGCCTGGCAAAAAGGACGGGATCAGATGTTAGCGCTTAACGTCAATATTCCTTTCAGCCACTGGCTGCGTTCTGACAGTAAATCTCAGTgg < 7:725426/134‑1 (MQ=255) tCGAAGATATCAACTGGACGCTCAGCTATAGCCTGACGAAAAACGCCTGGCAAAAAGGACGGGATCAGATGTTAGCGCTTAACGTCAATATTCCTTTCAGCCACTGGCTGCGTTCTGACAGTAAATCTCAGTgg > 8:725426/1‑134 (MQ=255) tCGAAGATATCAACTGGACGCTCAGCTATAGCCTGACGAAAAACGCCTGGCAAAAAGGACGGGATCAGATGTTAGCGCTTAACGTCAATATTCCTTTCAGCCACTGGCTGCGTTCTGACAGTAAATCTCAGTGGCGACAtgccagtgc < 5:477671/148‑1 (MQ=255) tCGAAGATATCAACTGGACGCTCAGCTATAGCCTGACGAAAAACGCCTGGCAAAAAGGACGGGATCAGATGTTAGCGCTTAACGTCAATATTCCTTTCAGCCACTGGCTGCGTTCTGACAGTAAATCTCAGTGGCGACATGCCAGTGCCAGCTACAGCATGTCACACGATCTCAACGGTCGGATGACCAATCTGGCTGgt < 2:440131/200‑1 (MQ=255) cGAAGATATCAACTGGACGCTCAGCTATAGCCTGACGAAAAACGCCTGGCAAAAAGGACGGGATCAGATGTTAGCGCTTAACGTCAATATTCCTTTCAGCCACTGGCt > 6:341988/1‑108 (MQ=255) gAAGATATCAACTGGACGCTCAGCTATAGCCTGACGAAAAACGCCTGGCAAAAAGGACGGGATCAGATGTTAGCGCTTAACGTCAATATTCCTTTCAGCCACTGGCTGCGTTCTGACAGTAAATCTCAGTGGCGACATGCCAGTGCCAGCTACAGCATGTCACACGATCTCAACGGTCGGATGACCAATCTGGCTGGTGTATACGGTACGTTGCTGGAAGAAAACAACCTCCGCTATAGCGTGAAAAACGGCGATGCCGGGGGAGGCGATGGaaa > 4:501735/1‑275 (MQ=255) aaaataacgaCTGGACGCTCAGCTATAGCCTGACGAAAAACGCCTGTCAAAAAGGACGGGATCAGATGTTAGCGCTTAACGTCAATATTCCTTTCAGCCACTGGCTGCGTTCTGACAGTAAATCTCAGTGGCGACATGCCAGTGCCAGCTACAGCATGTCACACGATCTCAACGGTCGGATGACCAATCTGGCTTGTGTATACGGTACGTTGCTGGAAGACAACAACCTCAGCTATAGCGTGCAAACCGGCTATGCCGGGGGAGGCGATGGAAAt < 1:54582/266‑1 (MQ=255) aaGATATCAACTGGACGCTCAGCTATAGCCTGACGAAAAACGCCTGGCAAAAAGGACGGGATCAGATGTTAGCGCTTAACGTCAATATTCCTTTCAGCCACTGGCTGCGTTCTGAc < 6:581575/116‑1 (MQ=255) aCTGGACGCTCAGCTATAGCCTGACGAAAAACGCCTGGCAAAAAGGACGGGATCAGATGTTAGCGCTTAACGTCAATATTCCTTTCAGCCACTGGCTGCGTTCTGACAGTAAAtctc < 5:432479/117‑1 (MQ=255) aCTGGACGCTCAGCTATAGCCTGACGAAAAACGCCTGGCAAAAAGGACGGGATCAGATGTTAGCGCTTAACGTCAATATTCCTTTCAGCCACTGGCTGCGTTCTGACAGTAAAtctc > 6:432479/1‑117 (MQ=255) cTGGACGCTCAGCTATAGCCTGACGAAAAACGCCTGGCAAAAAGGACGGGATCAGATGTTAGCGCTTAACGTCAATATTCCTTTCAGCCACTGGCTGCGTTc < 7:177588/102‑1 (MQ=255) cTGGACGCTCAGCTATAGCCTGACGAAAAACGCCTGGCAAAAAGGACGGGATCAGATGTTAGCGCTTAACGTCAATATTCCTTTCAGCCACTGGCTGCGTTc > 8:177588/1‑102 (MQ=255) gaggttgttgtcttccagcaacgtaccgtatacaccagccagattggtcatccgaccgttgagatcgtgtgacatgctgtagctggCACTGGCTGCGTTCTGACAGTAAATCTCAGTGGCGACAtgcca > 7:319846‑M1/87‑129 (MQ=255) tgttgtcttccagcaacgtaccgtatacaccagccagattggtcatccgaccgttgagatcgtgtgacatgctgtagctggCACTg > 5:1108184‑M1/82‑86 (MQ=255) cAGCTATAGCCTGACGAAAAACGCCTGGCAAAAAGGACGGGATCAGATGTTAGCGCTTAACGTCAATATTCCTTTCAGCCACTGGCTGCGTTCTGACAGTAAATCTCAGTGGCGACAtg > 6:404434/1‑119 (MQ=255) aggtataGCCTGACGAAAAACGCCTGGCAAAAAGGACGGGATCAGATGTTAGCGCTTAACGTCAATATTCCTTTCAGCCACTGGCTGCGTTCTGACAGTAAATCTCAGTGGCGACATGCCAGTGCCAGCTACAGCATGTCACACGATCTCAACGGTCGGACGACCAATCTGGCTGGTGTATACGGTACGTTGCTGGAAGACAACAACCTCAGCTATAGCGTGCAAACCGGCTATGCCGGGGGAGGCGATGGAAATAGCGGAAGTACAGGCTACGc < 4:196190/272‑1 (MQ=255) aGCTATAGCCTGACGAAAAACGCCTGGCAAAAAGGACGGGATCAGATGTTAGCGCTTAACGTCAATATTCCTTTCAGCCACTGGCTGCGTTCTGACAGTAAATCTCAGTGGCGACATGCCAGTGCCAGCTACAGCAt < 5:291357/137‑1 (MQ=255) cTATAGCCTGACGAAAAACGCCTGGCAAAAAGGACGGGATCAGATGTTAGCGCTTAACGTCAATATTCCTTTCAGCCACTGGCTGCGTTCTGACAGTAAATCTCAGTGGCGACATGCCAGTGCCAGCTACAGCATGTCACACGAtctc > 8:659318/1‑148 (MQ=255) tataGCCTGACGAAAAACGCCTGGCAAAAAGGACGGGATCAGATGTTAGCGCTTAACGTCAATATTCCTTTCAGCCACTGGCTGCGTTCTGACAGTAAATCTCAGTGGCGACAtgcc > 7:510082/1‑117 (MQ=255) cTGACGAAAAACGCCTGGCAAAAAGGACGGGATCAGATGTTAGCGCTTAACGTCAATATTCCTTTCAGCCACTGGCTg < 6:871651/78‑1 (MQ=255) cTGACGAAAAACGCCTGGCAAAAAGGACGGGATCAGATGTTAGCGCTTAACGTCAATATTCCTTTCAGCCACTGGCTGCGTTCTGACAGTAAATCTCAGTGGCGACa > 5:72016/1‑107 (MQ=255) tGACGAAAAACGCCTGGCAAAAAGGACGGGATCAGATGTTAGCGCTTAACGTCAATATTCCTTTCAGCCACTGGCTGCGTTCTGACAGTAAATCTCAGTGGCGACATGCCAGTGCCAGCTACAGCATGTCACACGa < 7:898311/136‑1 (MQ=255) tGACGAAAAACGCCTGGCAAAAAGGACGGGATCAGATGTTAGCGCTTAACGTCAATATTCCTTTCAGCCACTGGCTGCGTTCTGACAGTAAATCTCAGTGGCGACATGCCAGTGCCAGCTACAGCATGTCACACGa > 8:898311/1‑136 (MQ=255) aCGAAAAACGCCTGGCAAAAAGGACGGGATCAGATGTTAGCGCTTAACGTCAATATTCCTTTCAGCCACTGGCTGCGTTCTGACAGTAAATCTCAGTGGCGACATGCCAGTGCCAGCTACAGCATGTCACACGATCTCAACGGTCGGATGACCAATCTGGCTGGTGTATACGGTACGTTGCTGGAAg > 3:119484/1‑187 (MQ=255) aaaaaCGCCTGGCAAAAAGGACGGGATCAGATGTTAGCGCTTAACGTCAATATTCCTTTCAGCCACTGGCTGCGtt < 8:524497/76‑1 (MQ=255) aaaaaCGCCTGGCAAAAAGGACGGGATCAGATGTTAGCGCTTAACGTCAATATTCCTTTCAGCCACTGGCTGCGtt > 5:1123317/1‑76 (MQ=255) aaaaaCGCCTGGCAAAAAGGACGGGATCAGATGTTAGCGCTTAACGTCAATATTCCTTTCAGCCACTGGCTGCGTTCTGACAGTAAATCTCAg < 5:758802/93‑1 (MQ=255) aaaaaCGCCTGGCAAAAAGGACGGGATCAGATGTTAGCGCTTAACGTCAATATTCCTTTCAGCCACTGGCTGCGTTCTGACAGTAAATCTCAGTGGCGACATGCCAGTGCCAGCTACAGCATGTCACACGATCTCaa > 5:353870/1‑137 (MQ=255) aCGCCTGGCAAAAAGGACGGGATCAGATGTTAGCGCTTAACGTCAATATTCCTTTCAGCCACTGGCTGCGTTCTGACAGTAAATCTCAGTGGCGACATGCCAGTGCCAGCTACAGCATGTCACACGATCTCAACGGTCGGATGACCaa < 7:363228/148‑1 (MQ=255) ggCAAAAAGGACGGGATCAGATGTTAGCGCTTAACGTCAATATTCCTTTCAGCCACTGGCTGCGTTCTGACAGTAAATCTCAGTGGCGACATGCCAGTGCCAGCTACAGCATGTCACACGATCTCAACGGTCGGAt < 7:1018384/136‑1 (MQ=255) ggCAAAAAGGACGGGATCAGATGTTAGCGCTTAACGTCAATATTCCTTTCAGCCACTGGCTGCGTTCTGACAGTAAATCTCAGTGGCGACATGCCAGTGCCAGCTACAGCATGTCACACGATCTCAACGGTCGGAt > 8:1018384/1‑136 (MQ=255) aaaaGGACGGGATCAGATGTTAGCGCTTAACGTCAATATTCCTTTCAGCCACTGGCTGCGTTCTGACAGTAAATCTCAGTGGCGACATGCCAGTGCCAGCTACAGCATGTCACACGATCTCAACGGTCGGa > 6:539567/1‑131 (MQ=255) aaaGGACGGGATCAGATGTTAGCGCTTAACGTCAATATTCCTTTCAGCCACTGGCTGCGTTCTGACAGTAAATCTCAGTGGCGACATGCCAGTGCCAGCTACGGCATGTCACACGATCTCAACGGTCGGATAACCAATCTGGCTGGTGTATACGGTACGTTGCTGGAAGACAACAACCTCAGCTATAGCGTGCAAACCGGCTATGCCGGGGGAGGCGATGGAAATAGCGGAAGTACAGGCTACGCCACGCTGAATTATCGCGGTGGTTACGGc < 2:346188/273‑1 (MQ=255) aaaGGACGGGATCAGATGTTAGCGCTTAACGTCAATATTCCTTTCAGCCACTGGCTGCGTTCTGACAGTAAATCTCAGTGGCGACATGCCAGTGCCAGCTACAGCATGTCACACGATCTCa < 8:371194/121‑1 (MQ=255) tCAGATGTTAGCGCTTAACGTCAATATTCCTTTCAGCCACTGGCTGCGTTCTGACAGTAAATCTCAGTGGCGACATGCCAGTGCCAGCTACAGCATGTCACACGATCTCAACGGTCGGATGACCAATCTGGCTGGTGTATACGGTACg > 6:1002927/1‑148 (MQ=255) cAGATGTTAGCGCTTAACGTCAATATTCCTTTCAGCCACTGGCTGCGTTCTGACAGTAAATCTCAGTGGCGACATGCCAGTGCCAGCTACAGCATGTCACACGATCTCaa < 6:112001/110‑1 (MQ=255) ccgaccgttgagatcgtgtgacatgctgtagctgcCACTGGCTGCGTTCTGACAGTAAATCTCAGTGGCGa > 5:231625‑M1/36‑71 (MQ=255) aTGTTAGCGCTTAACGTCAATATTCCTTTCAGCCACTGGCTGCGTTCTGACAGTAAATCTCAGTGGCGACATGCCAGTGCCAGCTACAGCATGTCACACGATCTCAACGGTCGGATGa < 5:560861/118‑1 (MQ=255) aTGTTAGCGCTTAACGTCAATATTCCTTTCAGCCACTGGCTGCGTTCTGACAGTAAATCTCAGTGGCGACATGCCAGTGCCAGCTACAGCATGTCACACGATCTCAACGGTCGGATGACCAATCTGGCTGGTGTATACGGTACGTTGc < 7:659318/148‑1 (MQ=255) aTGTTAGCGCTTAACGTCAATATTCCTTTCAGCAACTGGTGGCGTTCTGACAGTAAATCTCAGTGGCGACATGCCAGTGCCAGCTACAGCATGTCACACGATCTCAACGGTCGGATGACCAATCTGGCTGGTGTATACGGTACGTTGCTGGAAGACAACAACCTCAGCTATAGCGTGCAAACCGGCTATGCCGGGGGAGGCGATGGAAATAGCGGAAGTACAGGCTACGCCACGCTGAATTATCGCGGTGGTTACGGCAATGCCAATATCGGTTa < 2:501736/275‑1 (MQ=255) tGTTAGCGCTTAACGTCAATATTCCTTTCAGCCACTGGCTGCGTTCTGACAGTAAATCTCAGTGGCGACATGCCAGTGCCAGCTACAGCATGTCACACGATCTCAACGGTCGGATGACCAATctggct > 7:580208/1‑128 (MQ=255) tGTTAGCGCTTAACGTCAATATTCCTTTCAGCCACTGGCTGCGTTCTGACAGTAAATCTCAGTGGCGACATGCCAGTGCCAGCTACAGCATGTCACACGATCTCAACGGTCGGATGACCAATCTGGCTGGTGTATACg > 8:870795/1‑138 (MQ=255) tGTTAGCGCTTAACGTCAATATTCCTTTCAGCCACTGGCTGCGTTCTGACAGTAAATCTCAGTGGCGACATGCCAGTGCCAGCTACAGCATGTCACACGATCTCAACGGTCGGATGACCAATCTGGCTGGTGTATACg < 7:870795/138‑1 (MQ=255) tAGCGCTTAACGTCAATATTCCTTTCAGCCACTGGCTGCGTTCTGACAGTAAATCTCAGTGGCGACATGCCAGTGCCAGCTACAGCATGTCACACGATCTCAACGGTCGGATGACCAATCTGGCTGTTGTATACGGTACGTTGCTGGa > 8:264612/1‑148 (MQ=255) cgcTTAACGTCAATATTCCTTTCAGCCACTGGCTGCGTTCTGACAGTAAATCTCAGTGGCGACATGCCAGTGCCAGCTACAGCATGTCACACGATCTCAACGGTCgg < 8:606974/107‑1 (MQ=255) cTTAACGTCAATATTCCTTTCAGCCACTGGCTGCGTTCTGACAGTAAATCTCAGTGGCGACATGCCAGTGCCAGCTACAGCATGTCACACGATCTCAACGGTCGGATGa > 6:7601/1‑109 (MQ=255) tAACGTCAATATTCCTTTCAGCCACTGGCTGCGTTCTGACAGTAAATCTCAGTGGCGACATGCCAGTGCCAGCTACAGCATGTCACACGATCTCAACGGTCGGATGACCAAt < 5:813203/112‑1 (MQ=255) aaCGTCAATATTCCTTTCAGCCACTGGCTGCGTTCTGACAGTAAATCTCAGTGGCGACATGCCAGTGCCAGCTACAGCATGTCACACGATCTCAACGGTCGGATGACCAATCTGGCTGGTGTATACGGTACGTTGCTGGAAGacaaca > 1:115534/1‑148 (MQ=255) aaCGTCAATATTCCTTTCAGCCACTGGCTGCGTTCTGACAGTAAATCTCAGTGGCGACATGCCAGTGCCAGCTACAGCATGTCACACGATCTCAACGGTCGGATGACCAATCTGGCTGGTGTATACGGTACGTTGCTGGAAGACAACAACCTCAGCTATAGCGTGCAAACCGGCTATGCCGGGGGAGGCGATGGAAATAGCGGAAGTACAGGCTACGCCACGCTGAATTATCGCGGTGGTTACGGCAATGCCAATATCGGTTACAGCCATAGCga < 2:188926/275‑1 (MQ=255) aaCGTCAAATATCCTTTCAGCCACTGGATGCGATCTGACAGTAAAGTTCAGTTGGGACATGCCAGGGCCAGATACAGCATGTCACACGATCTCAACGGTCGGATGACCAATCTGGCTGGTGTATACGGTACGTTGCTGGAAGACAACAACCTAAGCGATAGCGTGCAAACCGGCTATGCCGGGGGAGGCGATGGAAATAGCGGAAGTACAGGCTACGCCACGCTGAATTATCGCGGTGGTTACGGCAATGCCAATATCGGTTACAGCCATAGCga < 4:384607/275‑1 (MQ=255) cGTCAATATTCCTTTCAGCCACTGGCTGCGTTCTGACAGTAAATCTCAGTGGCGACATGCCAGTGCCAGCTACAGCATGTCACACGATCTCAACGGTCGGATGACCAATCTGGCTGGTGTATACGGTACGTTGCTGGAAGaca > 6:165248/1‑143 (MQ=255) cGTCAATATTCCTTTCAGCCACTGGCTGCGTTCTGACAGTAAATCTCAGTGGCGACATGCCAGTGCCAGCTACAGCATGTCACACGATCTCAACGGTCGGATGACCAATCTGGCTGGTGTATACGGTACGTTGCTGGAAGaca < 5:647584/143‑1 (MQ=255) tCAATATTCCTTTCAGCCACTGGCTGCGTTCTGACAGTAAATCTCAGTGGCGACATGCCAGTGCCAGCTACAGCATGTCACACGATCTCAACGGTCGGATGACCAATCTGGCTGGTGTATACGGTACGTTGCt < 8:1097320/133‑1 (MQ=255) cAATATTCCTTTCAGCCACTGGCTGCGTTCTGACAGTAAATCTCAGTGGCGACATGCCAGTGCCAGCTACAGCATGTCACACGATCTCAACGGTCGGATGACCAATCTGGCTGGTGTATACGGTACGTTGCTGGAAGACAACAACCTc < 5:908776/148‑1 (MQ=255) atatTCCTTTCACCCACTGGCTGCGTTCTGGCAGTAAATCTCAGTGGCGACATGCCAGTGCCAGCTACAGCATGTCACACGATCTCAACGGTCGGATGACCAATCTGGCTGGTGTATACGGTACGTTGCTGGAAGACAACAACCTc < 5:160425/146‑1 (MQ=255) tgctgtagctggCACTGGCTGCGTTCTGACAGTAAATCTCAGTGGCGACAtgcc > 5:721584‑M1/13‑54 (MQ=255) atTCCTTTCAGCCACTGGCTGCGTTCTGACAGTAAATCTCAGTGGCGACATGCCAGTGCCAGCTACAGCATGTCACACGATCTCa < 7:789056/85‑1 (MQ=255) atTCCTTTCAGCCACTGGCTGCGTTCTGACAGTAAATCTCAGTGGCGACATGCCAGTGCCAGCTACAGCATGTCACACGATCTCa > 8:789056/1‑85 (MQ=255) tCCTTTCAGCCACTGGCTGCGTTCTGACAGTAAATCTCAGTGGCGACATGCCAGTGCCAGCTACAGCATGTCACACGATCTCAACGGTCGGATGACCAATc > 8:560694/1‑101 (MQ=255) tCCTTTCAGCCACTGGCTGCGTTCTGACAGTAAATCTCAGTGGCGACATGCCAGTGCCAGCTACAGCATGTCACACGATCTCAACGGTCGGATGACCAATc < 6:156737/101‑1 (MQ=255) atttCGGCCACTGGCTGCGTTCGGACAGTAAATCTACGTGGGGACATGCACGTGCCAGGGACATGATGTCAAACGATCGCAACGGTCGGATGACCAATCTGGCTGGTGGATACGGTACGTTGCTGGAAGACAACAACCTCAGCTATAGCGTGCAAACCGGCTATGCCGGGGGAGGCGATGGAAATAGCGGAAGTACAGGCTACGCCACGCTGAATTATCGCGGTGGTTACGGCAATGCCAATATCGGTTACAGCCATAGCGATGATATTAagcag < 4:376441/274‑1 (MQ=255) ttCAGCCACTGGCTGCGTTCTGACAGTAAATCTCAGTGGCGACATGCCAGTGCCAGCTACAGCATGTCACACGATCTCAACGGTCGGa > 7:1100850/1‑88 (MQ=255) ttCAGCCACTGGCTGCGTTCTGACAGTAAATCTCAGTGGCGACATGCCAGTGCCAGCTACAGCATGTCACACGATCTCAACGGTCGGATGACCAATCTGGCTGGTGtat < 7:555457/109‑1 (MQ=255) ttCAGCCACTGGCTGCGTTCTGACAGTAAATCTCAGTGGCGACATGCCAGTGCCAGCTACAGCATGTCACACGATCTCAACGGTCGGATGACCAATCTGGCTGGTGTATCCGGTACGTTGCTGGAAGAcaacaa > 7:689723/1‑134 (MQ=255) ttCAGCCACTGGCTGCGTTCTGACAGTAAATCTCAGTGGCGACATGCCAGTGCCAGCTACAGCATGTCACACGATCTCAACGGTCGGATGACCAATCTGGCTGGTGTATACGGTACGTTGCTGGAAGaca < 6:721142/130‑1 (MQ=255) ttCAGCCACTGGCTGCGTTCTGACAGTAAATCTCAGTGGCGACATGCCAGTGCCAGCTACAGCATGTCACACGATCTCAACGGTCGGATGACCAATCTGGCTGGTGTATACGGTACGTTGCTGGAAGAcaacaa < 8:689723/134‑1 (MQ=255) ttCAGCCACTGGCTGCGTTCTGACAGTAAATCTCAGTGGCGACATGCCAGTGCCAGCTACAGCATGTCACACGATCTCAACGGTCGGATGACCAATCTGGCTGGTGTATACGGTACGTTGCTGGAAGACAACAACCTCAGCTATAGCg < 5:1002927/148‑1 (MQ=255) ttCAGCCACTGGCTGCGTTCTGACAGTAAATCTCAGTGGCGACATGCCAGTGCCAGCTACAGCATGTCACACGATCTCAACGGTCGGATGACCAATCTGGCTGGTGTATACGGTACGTTGCTGGAAGACAACAACCTCAGCTATAGCGTGCAAACCGGCTATGCCGGGGGAGGCGATGGAAATAGCGGAAGTACAGGCTACGCCACGCTGAATTATCGCGGTGGGTACGGAAAAGCCAAAATCGGTTACAGCAATAGCGATGATAATAAGCAGct > 4:474979/1‑275 (MQ=255) tCAGCCACTGGCTGCGTTCTGACAGTAAATCTCAGTGGCGACATGCCAGTGCCAGCTACAGCATGTCACACGATCTCAACGGTCGGATGACCAATCTGGCTGGTGTATACGGTACGTTGCTGGAAGACAACAACCTCAGCTATAGCGTGCAAACCGGCTATGCCGGGGGAGGCGATGGAAATAGCGGAAGTACAGGCTACGCCACGCTGAATTATCGCGGTGGTTACGGCAATGCCAATATCGGTTACAGCCATAGCGAGGATATTAagcagcct > 2:8634/1‑273 (MQ=255) aGCCACTGGCTGCGTTCTGACAGTAAATCTCAGTGGCGACATGCCAGTGCCAGCTACAGCATGTCACACGATCTCAACGGTCGGATGACCAATCTGGCTGGTGTATACGGTACGTTGCTGGAAGACAACAACCTCAGCTATAGCGTGCAAACCGGCTATGCCGGGGGAGGCGATGGAAATAGCGGAAGTACAGGCTACGCCACGCTGAATTAt > 2:307991/1‑213 (MQ=255) gCCACTGGCTGCGTTCTGACAGTAAATCTCAGTGGCGACATGCCAGTGCCAGCTACAGCATGTCACACGATCTCAACGGTCGGATGa < 6:747470/87‑1 (MQ=255) gCCACTGGCTGCGTTCTGACAGTAAATCTCAGTGGCGACATGCCAGTGCCAGCTACAGCATGTCACACGATCTCAACGGTCGGATGACCAATCTGGCTGGTGTATACGGTACGTTGCTGGAAGACAACAAcc < 6:288942/132‑1 (MQ=255) | AATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGTTACTCAGCAACTCGGGCGCACATCAACACTGTATTTGAGTGGTAGCCATCAAACTTATTGGGGAACGAGTAATGTCGATGAGCAATTCCAGGCTGGATTAAATACTGCGTTCGAAGATATCAACTGGACGCTCAGCTATAGCCTGACGAAAAACGCCTGGCAAAAAGGACGGGATCAGATGTTAGCGCTTAACGTCAATATTCCTTTCAGCCACTGGCTGCGTTCTGACAGTAAATCTCAGTGGCGACATGCCAGTGCCAGCTACAGCATGTCACACGATCTCAACGGTCGGATGACCAATCTGGCTGGTGTATACGGTACGTTGCTGGAAGACAACAACCTCAGCTATAGCGTGCAAACCGGCTATGCCGGGGGAGGCGATGGAAATAGCGGAAGTACAGGCTACGCCACGCTGAATTATCGCGGTGGTTACGGCAATGCCAATATCGGTTACAGCCATAGCGATGATATTAAGCAGCTC > NC_000913/4546636‑4547174 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |