New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 3063139 = | 159 (1.010) | 11 (0.070) | 8/252 | NT | 7.1% | coding (153/996 nt) | argK | membrane ATPase/protein kinase |
? | NC_000913 | 3063168 = | 138 (0.920) | coding (182/996 nt) | argK | membrane ATPase/protein kinase |
Only 100 of 170 total aligned reads displayed.
TCCTGCAAGAGCGCGGCGTGGCGGCGATTTATGGTCCAGGTACACCTATGCTCGACAGTGTGCGCGACGTACTGAATCTGATAAGCCAGCATCATGATTAATGAAGCCACGCTGGCAGAAAGTATTCGCCGCTTACGTCAGGGTGAGCGTGCCACACTCGCCCAGGCCATGACGCTGGTGGAAAGCCGTCACCCGCGTCATCAGGCACTAAGTACGCAGCTGCTTGATGCCATTATGCCGTACTGCGGTAACACCCTGCGACTGGGCGTTACCGGCAC‑CCCCGGCGCGGGGAAAAGTACCTTTCTTGAGGCCTTTGGCATGTTGTTGATTCGAGAGGGATTAAAGGTCGCGGTTATTGCGGTCGATCCCAGCAGCCCGGTCACTGGCGGTAGCATTCTCGGGGATAAAACCCGCATGAATGACCTGGCGCGTGCCGAAGCGGCGTTTATTCGCCCGGTACCATCCTCCGGTCATCTGGGCGGTGCCAGTCAGCGAGCGCGGGAATTAATGCTGTTATGCGAAGCAGCGGGTTATGACG > NC_000913/3062894‑3063431 | tCCTGCAAGAGCGCGGCGTGGCGGCGATTTATGGTCCAGGTACACCTATGCTCGACAGTGTGCGCGACGTACTGAATCTGATAAGCCAGCATCATGATTAATGAAGCCACGCTGGCAGAAAGTATTCGNCGCTTACGTCAGGGTGAGCGTGCCACACTCGCCCAGGCCATGACGCTGGTGGAAAGCCGTCACCCGCGCNATCAGGCCATCAGTACGCAGCTGCGTGATGCCATTCTGCCCTACCNCNGACACACCCGGCCACCGGGCGTTACCgg > 3:42108/1‑275 (MQ=255) gcgcGGCGTGGCGGGGATTTATGGTCCAGGTACACCTATGCTCGACAGTGTGCGCGACGTACTGAATCTGATAAGCCAGCATCATGATTAATGAAGCCACGCTGGCAGAAAGTATTCGCCGCTTACGTCAGGGTGAGCGTGCCACACTCGCCCAGGCCATGACGCTGGTGGAAAGCCGTCACCCGCGTCATCAGGCACTAAGTACGCAGCTGCTTGATGCCATTATGCCGTACTGCGGTAACACCCTGCGACTGGGCGTTACCGGCAC‑CCCCGgc < 2:177999/275‑1 (MQ=255) ggcggcGATTTATGGTCCAGGTACACCTATGCTCGACAGTGTGCGCGACGTACTGAATCTGATAAGCCAGCATCATGATTAATGAAGCCACGCTGGCAGAAAGTATTCGCCGCTTACGTCAGGGTGAGCGTGCCACACTCGCCCAGGCCATGACGCTGGTGGAAAGCCGTCACCCGCGTCATCAGGCACTAAGTACGCAGCTGCTTGATGCCATTATGCCGTACTGAGGTAACACCCTGCGACTGGGCGTTACCGGCAC‑CCCCGGCGCGGGGaaa > 2:462869/1‑275 (MQ=255) aGGTACACCTATGCTCGACAGTGTGCGCGACGTACTGAATCTGATAAGCCAGCATCATGATTAATGAAGCCACGCTGGCAGAAAGTATTCGCCGCTTACGTCAGGGTGAGCGTGCCACACTCGCCCAGGCCATGACGCGGGTGGAAAGCCGTCACCCGCGTCAGCAGGCACTAAGTACGCAGCTGCTTGATGCCATTCTGCCGTACCGCGGTAACACCCGGCCGCTGGGCGTTGCCGGCCC‑CCCCGGCGGGGGGAACAGTACCTGTCTTGCGGcc > 4:148385/1‑275 (MQ=255) cTCGACAGTGTGCGCGACGTACTGAATCTGATAAGCCAGCATCATGATTAATGAAGCCACGCTGGCAGAAAGTATTCGCCGCTTACGTCAGGGTGAGCGTGCCACACTCGCCCAGGCCATGACGCTGGTGGAAAGCCGTCACCCGCGTCATCAGGCACTAAGTACGCAGCTGCTTGATGCCATTATGCCGTACTGCGGTAACACCCTGCGACTGGGCGTTACCGGCAC‑CCCCGGCCCCGGGAAAAGTACCTTTCTTGAGGCCTTTGGCCtgttgt > 2:521954/1‑275 (MQ=255) cGACAGTGTGCGCGACGTACTGAATCTGATAAGCCAGCATCATGATTAATGAAGCCACGCTGGCAGAAAGTATTCGCCGCTTACGTCAGGGTGAGCGTGCCACACTCGCCCAGGCCATGACGCTGGTGGAAAGCCGTCACCCGCGTCATCAGGCACTAAGTACGCAGCTGCTTGATGCCATTATGCCGTACTGCGGTAACACCCTGCGACTGGGCGTTACCGGCAC‑CCCCGGCGCGGGGAAAAg < 1:128992/244‑1 (MQ=255) tgCGCGACGTACTGAATCTGATAAGCCAGCATCATGATTAATGAAGCCACGCTGGCAGAAAGTATTCGCCGCTTACGTCAGGGTGAGCGTTCCACACTCGCCCAGGCCATGACCCTGGTGGAAAGCCGTCACCCGCGTCATCAGGCACTAAGTCCGCCGCTGCTTGATGCCATTATGCCGTACTGCGGTAACGCCCTGAGACTTGGCGCTACCCGCAC‑CCCCGGCGCGGGGCAAAGTCCTTTTCCTGCGGCCTTTGGCCTgttgtttgtctgaga > 4:25780/1‑266 (MQ=255) 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ttACGTCAGGGTGAGCGTGCCACACTCGCCCAGGCCATGACGCTGGTGGAAAGCCGTCACCCGCGTCATCAGGCACTAAGTACGCAGCTGCTTGATGCCATTATGCCGTACTGCGGTAACACCCTGCGACTGGGCGTTACCGGCAC‑CCCCGGCGCGGGGAAAAGTACCTTTCTTGAGGCCTTTGGCATGTTGTTGATTCGAGAGGGATTAAAGGTCGCGGTTATTGCGGTCGATCCCAGCAGCCCGGTCACTGGCGGTCGCATTCTCGGGGGTaa > 2:119090/1‑275 (MQ=255) gggTGAGCGTGCCACACTCGCCCAGGCCATGACGCTGGTGGAAAGCCGTCACCCGCGTCATCAGGCACTAAGTACGCAGCTGCTTGATGCCATTATGCCGTACTGCGGTAACACCCTGCGACTGGGCGTTACCGGCAC‑CCCCGGcgcg < 8:653774/148‑1 (MQ=255) ggTGAGCGTGCCACACTCGCCCAGGCCATGACGCTGGTGGAAAGCCGTCACCCGCGTCATCAGGCACTAAGTACGCAGCTGCTTGATGCCATTATGCCGTACTGCGGTAACACCCTGCGACTGGGCGTTACCGGCAC‑CCCCGGCGCgg < 5:306571/148‑1 (MQ=255) gAGCGTGCCACACTCGCCCAGGCCATGACGCTGGTGGAAAGCCGTCACCCGCGTCATCAGGCACTAAGTACGCAGCTGCTTGATGCCATTATGCCGTACTGCGGTAACACCCTGCGACTGGGCGTTACCGGCAC‑CCCCGGcgcg < 6:968516/144‑1 (MQ=255) gAGCGTGCCACACTCGCCCAGGCCATGACGCTGGTGGAAAGCCGTCACCCGCGTCATCAGGCACTAAGTACGCAGCTGCTTGATGCCATTATGCCGTACTGCGGTAACACCCTGCGACTGGGCGTTACCGGCAC‑CCCCGGcgcg > 5:968516/1‑144 (MQ=255) 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cTCGCCCAGGCCATGACGCTGGTGGAAAGCCGTCACCCGCGTCATCAGGCACTAAGTACGCAGCTGCTTGATGCCATTATGCCGTACTGCGGTAACACCCTGCGACTGGGCGTTACCGGCAC‑CCCCGGCGCGGGGAAAAGTACCTTTCTTGAGGCCTTTGGCATGTTGTTGATTCGAGAGGGATTAAAGGTCGCGGTTATTGCGGTCGATCCCAGCAGCCCGGTCACTGGCGGTAGCATTCTCGGGGATAAAACCCGCATGAATGACCTGgc < 1:147900/272‑1 (MQ=255) cGCCCAGGCCATGACGCTGGTGGAAAGCCGTCACCCGCGTCATCAGGCACTAAGTACGCAGCTGCTTGATGCCATTATGCCGTACTGCGGTAACACCCTGCGACTGGGCGTTACCGGCAC‑CCCCGGCGCGGGGAAAAGTAc < 7:325224/141‑1 (MQ=255) cGCCCAGGCCATGACGCTGGTGGAAAGCCGTCACCCGCGTCATCAGGCACTAAGTACGCAGCTGCTTGATGCCATTATGCCGTACTGCGGTAACACCCTGCGACTGGGCGTTACCGGCAC‑CCCCGGCGCGGGGAAAAGTAc > 8:325224/1‑141 (MQ=255) cGCCCAGGCCATGACGCTGGTGGAAAGCCGTCACCCGCGTCATCAGGCACTAAGTACGCAGCTGCTTGATGCCATTATGCCGTACTGCGGTAACACCCTGCGACTGGGCGTTACCGGCAC‑CCCCGGCGCGGGGAAAAGTAc < 8:333820/141‑1 (MQ=255) gCCCAGGCCATGACGCTGGTGGAAAGCCGTCACCCGCGTCATCAGGCACTAAGTACGCAGCTGCTTGATGCCATTATGCCGTACTGCGGTAACACCCTGCGACTGGGCGTTACCGGCAC‑CCCCGGCGCGGGGAAAAGTACCTTTCTTg < 7:950972/148‑1 (MQ=255) 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tATGCCGTACTGCGGTAACACCCTGCGACTGGGCGTTACCGGCAC‑CCCCGGCGCGGGGAAAAGTACCTTTCt < 5:10176/72‑1 (MQ=255) aTGCCGGACTGCGGTAACACCCTGCGACTGGGCGTTACCGGCAC‑CCCCGGCGCGGGGAAAAGTACCTTTCTTGAGGCCTTTGGCATGTTGTTGATTCGAGAGGGATTAAAGGTCGCGGTTATTGCGGTCGATCCCAGCAGCCCGGTCACTGGCGGTAGCATTCTCGGGGATAAAACCCGCATGAATGACCTGGCGCGTGCCGAAGCGGCGTTTATTCGCCCGGTACCATCCTCCGGTCATCTGGGCGGTGCCAGTCAGCGAGCGCGGGAATTaa < 2:138962/274‑1 (MQ=255) tGCCGTACTGCGGTAACACCCTGCGACTGGGCGTTACCGGCAC‑CCCCGGCGCGGGGAAAAGTACCTTTCTTGAGGCCTTTGGCATGTTGTTGATTCGAGAGGGATTAAAGGTCGCGGTTATTGCGGTCGATCCCAGCAGCCCGGTCACTGGCGGTAGCATTCTCGGGGATAAAACCCGCATGAATGACCTGGCGCGTGCCGAAGCGGCGTTTATTCGCCCGGTACCATCCTCCGGTCATCTGGGCGGTGCCAGTCAGCGAGCGCGGGAATTAATg < 2:85313/275‑1 (MQ=255) tGCCGTACTGCGGTAACACCCTGCGACTGGGCGTTACCGGAAC‑CCCCGGCGCGGGGAAAAGTACCTTTCTTGAGGCCTTTGGCATGTTGTTGATTCGAGAGGGATTAAAGGTCGCGGTTATTGCGGTCGATCCCAGCAGCCCGGTCACTGGCGGTAGCATTCTCGGGGATAAAACCCGCATGAATGACCTGGCGCGTGCCGAAGCGGCGTTTATTCGCCCGGTACCATCCTCCGGTCATCTGGGCGGTGCCAGTCAGCGAGCGCGGGAATTAATg < 2:390579/275‑1 (MQ=255) gCCGTACTGCGGTAACACCCTGCGACTGGGCGTTACCGGCAC‑CCCCGGCGCGGGGAAAAGTACCTTTCTTGAGGCCTTTGGCATGTTGTTGATTCGAGAGGGATTAAAgg > 8:455437/1‑110 (MQ=255) gCCGTACTGCGGTAACACCCTGCGACTGGGCGTTACCGGCAC‑CCCCGGCGCGGGGAAAAGTACCTTTCTTGAGGCCTTTGGCATGTTGTTGATTCGAGAGGGATTAAAgg < 7:455437/110‑1 (MQ=255) gTACTGCGGTACCACCCTGCGACTGGG‑GTTTCCCGCGCGCCCCGGCGCGGGGAAAAGTACATTTCTTGAGCCCTTTGGCATGTTGTTGAGTCGAGAGTGATTAAAGGTCGCGGTTATTGCGGTCGATCCCAGCAGCCCGGTCACTGGCGGTAGCATTCGCGGGGATAAAACCCGCATGAATGACCTGGGGCGTGCCGAAGCGGCGTTTATTCGCCCGGTACCATCCTCCGGTCATCTGGGCGGTGCCAGTCAGCGAGCGCGGGAATTAATGCTg < 4:59874/274‑1 (MQ=255) tACTGCGGTAACACCCTGCGACTGGGCGTTACCGGCAC‑CCCCGGCGCGGGGAAAAGTACCTTTCTTGAGGCCTTTGGCATGTTGTTGATTCGAGAGGGATTAAAGGTCGCGGTTATTGCGGTCGATCCCAGCAGCCCGNTCACTGGCGGTAGCATTCTCGGTGATAAAACCCGCATGAATGACCTGGCGCGTGCCGAAGCGGCGTCTATTCGCCCGGTCNCATCCTCCGGCCCTCTGGGGGGGGTNAGTCACAGAGCGCGGTGATCAATGcgttg > 3:97399/1‑271 (MQ=255) tACTGCGGTAACACCCTGCGACTGGGCGTTACCGGCAC‑CCCCGGCGCGGGGAAAAGTACCTTTCTTGAGGCCTTTGGCATGTTGTTGATTCGAGAGGGATTAAAGGTCGCGGTTATTGCGGTCGATCCCAGCAGCCCGGTCACTGGCGGTAGCATTCTCGGGGATAACACCCGCATGAAGGACCTGGCGCGTGCCGAAGCGGCGTTTATGCGCCCGGTACTCGCCTCCGGTCATCTGGGCGGGTCCAGTCCACGAGCGCGGGCATTAATGCTGtt > 4:305830/1‑275 (MQ=255) tACTGCGGTAACACCCTGCGACTGGGCGTTACCGGCAC‑CCCCGGCGCGGGGAAAAGTACCTTTCTTGAGGCATTTGGCATGTTGTTGATTCGAGCGGGATTAAAGGTCGCGGTTATTGAGGTCGATCCCAGCAGCCCGGTCACTGGCGGTAGCATTCTCGGGGATAAAAACAGCATGAATGACCTGGCGCGTTCCGAGGCGGCGTTTCTTCGCCGGTTACCACTCCCCGGTGCACTGGGCGGTGGCATGGCGCGAGCGCGGGAAGTaaatccggt > 4:524429/1‑268 (MQ=255) tgccggtaacgcccagtcgcagggtgttaccGCAC‑CCCCGGCGCGGGGAAAAGTACCTTTCTTGAGGCCTTTGGCAtgttg < 5:951064‑M2/50‑1 (MQ=255) taacgcccagtcgcagggtgttaccgGCAC‑CCCCGGCGCGGGGAAAAGTACCTTTCt < 7:594650‑M2/31‑1 (MQ=255) taacgcccagtcgcagggtgttaccgGCAC‑CCCCGGCGCGGGGAAAAGTACCTTTCt > 8:594650‑M2/27‑57 (MQ=255) taacgcccagtcgcagggtgttaccgGCAC‑CCCCGGCGCGGGGAAAAGTACCTTTCTTGAGGCCTTTGGCATGTTGTTGATTCGAGAGGGATTaa > 5:348416‑M2/27‑95 (MQ=255) taacgcccagtcgcagggtgttaccgGCAC‑CCCCGGCGCGGGGAAAAGTACCTTTCTTGAGGCCTTTGGCATGTTGTTGATTCGAGAGGGATTAAAGGTCGCGGTTATTGCGGTCGATCCCAGCAGCCCGGTCACTGGCGGTAGCAtt > 5:870376‑M2/27‑148 (MQ=255) AACACCCTGCGACTGGGCGTTACCGGCAC‑CCCCGGCGCGGGGAAAAGTACCTTTCTTGAGGCCTTTGGCATGTTGTTGATTCGAGAGGGATTAAAGGTCGCGGTTATTGCGGTCGATCCCAGCAGCCCGGTCACTGGCGGTAGCATTCTCGGGGATAAAACCCGCATGAATGACCTGGCGCGTGCCGAAGCGGCGTTTATTCGCCCGGTa > 2:253646‑M1/1‑210 (MQ=255) ACACCCTGCGACTGGGCGTTACCGGCAC‑CCCCGGCGCGGGGAAAAGTACCTTTCTTGAGGCCTTTGGCATGTTGTTGATTCGAGAGGGATTAAAGGTCGCGGTTAtt < 7:457482‑M1/107‑1 (MQ=255) acCCTGCGACTGGGCGTTACCGGCAC‑CCCCGGCGCGGGGAAAAGTACCTTTCTTGAGGCCTTTGGCATGTTGTTGATTCGAGAGGGATTAAAGGTCGCGGTTATTGCGGTCGATCCCAGCAGCCCGGTCACTGGCGGTAGCATTCTCGGGGATAAAACCCGCATGAATGACCTGGCGCGTGCCGAAGCGGCGTTTATTCGCCCGGTACCATCCTCCGGTCATCTGGGCGGTGCCAGTCAGCGAGCGCGGGAATTAATGCTGTTATGCGAagcag < 2:81940/274‑1 (MQ=255) cccTGCGACTGGGCGTTACCGGCAC‑CCCCGGCGCGGGGAAAAGTACCTTTCTTGAGGCCTTTGGCAtgttg > 8:781107/1‑71 (MQ=255) cccTGCGACTGGGCGTTACCGGCAC‑CCCCGGCGCGGGGAAAAGTACCTTTCTTGAGGCCTTTGGCATGTTGTTGATTCGAGAGGGATTAAAGGTCGCGGTTATTGCGGTCGATCCCAGCAGCCCGGTCACTGGCgg < 5:1053273/136‑1 (MQ=255) cagtcgcagggtgttaccgGCAC‑CCCCGGCGCGGGGAAAAGTACCTTTCTTGAGGCCTTTGGCATGTTGTTGAt > 7:74051‑M2/20‑74 (MQ=255) cagtcgcagggtgttaccgGCAC‑CCCCGGCGCGGGGAAAAGTACCTTTCTTGAGGCCTTTGGCATGTTGTTGATTCGagag < 8:628004‑M2/62‑1 (MQ=255) cagtcgcagggtgttaccgGCAC‑CCCCGGCGCGGGGAAAAGTACCTTTCTTGAGGCCTTTGGCATGTTGTTGATTCGagag > 7:628004‑M2/20‑81 (MQ=255) cTGCGACTTGGCGTTACCGGCAC‑CCCCGGCGCGGGGAAAAGTACCTTTCTTGAGGCCTTTGGCATGTTGTTGATTCGAGAGGGATTAAAGGTCGCGGTTATTGCGGTCGATCCCAGCAGCCCGGTCACTGGCGGTAGCATTCTCGGGGATAAAACCCGCATGAATGACCTGGCGCGTGCCGAAGCGGCGTTTATTCGCCCGGTACCATCCTCCGGTCATCTGGGCGGTGCCAGTCAGCGAGCGCGGGAATTAATGCTGTTATGCGAAGCAGCggg < 2:364159/275‑1 (MQ=255) cTGCGACTGGGCGTTACCGGCAC‑CCCCGGCGCGGGGAAAAGTACCTTTCTTGAGGCCTTTGGCAtgttg > 7:682172/1‑69 (MQ=255) gggCGTTACCGGCAC‑CCCCGGCGCGGGGAAAAGTACCTTTCTTGAGGCCTTTGGCATGTTGTTGATTCGAGAGGGATTAAAGGTCGCGGTTATTGCGGTCGATCCCAGCAGCCCGGTCACTGGCGGTAGCATTCTCGGGGATAAAACCCGCATGAATGACCTGGCGCGTGCCGAAGCGGCGTTTATTCGCCCGGTACCATCCTCCGGTCATCTGGGCGGTGCCAGTCAGCGAGCGCGGGAATTAATGCTGTTATGCGAAGCAGCGGGTTATGACg < 4:40627/275‑1 (MQ=255) ggCGTTACCGGCAC‑CCCCGGCGCGGGGAAAAGTACCTTTCTTGAGGCCTTTGGCATGTTGTTGATTCGAGAGGGATTAAAGGTCGCGGTTATTGCGGTCGa > 5:372381/1‑101 (MQ=255) ggCGTTACCGGCAC‑CCCCGGCGCGGGGAAAAGTACCTTTCTTGAGGCCTTTGGCATGTTGTTGATTCGAGAGGGATTAAAGGTCGCGGTTATTGCGGTCGa < 6:372381/101‑1 (MQ=255) ttaccgGCAC‑CCCCGGCGCGGGGAAAAGTACCTTTCTTGAGGCCTTTGGCAtgttgt < 6:1027933‑M2/51‑1 (MQ=255) ccgGCAC‑CCCCGGCGCGGGGAAAAGTACCTTTCTTGAGGCCTTTGGCATGTTGTTGATTCGAGAGGGATTAAAGGTCGCGGTTATTGCGGTCGATCCCAGCAGCCCGGTCACTGGCGGTAGCATTCTCGGGGATAAAACCCGCatgaa < 6:870376‑M2/145‑1 (MQ=255) cgGCAC‑CCCCGGCGCGGGGAAAAGTACCTTTCTTGAGGCCTATGGCATGTTGTTGATTCGAGAGGGATTAAAGGTCGCGGTTATTGCGGTCGATCCCAGCAGCTCGGTCACTGGCGGTAGCATTCTCGGGGATAAAAcc < 6:681417‑M2/137‑1 (MQ=255) | TCCTGCAAGAGCGCGGCGTGGCGGCGATTTATGGTCCAGGTACACCTATGCTCGACAGTGTGCGCGACGTACTGAATCTGATAAGCCAGCATCATGATTAATGAAGCCACGCTGGCAGAAAGTATTCGCCGCTTACGTCAGGGTGAGCGTGCCACACTCGCCCAGGCCATGACGCTGGTGGAAAGCCGTCACCCGCGTCATCAGGCACTAAGTACGCAGCTGCTTGATGCCATTATGCCGTACTGCGGTAACACCCTGCGACTGGGCGTTACCGGCAC‑CCCCGGCGCGGGGAAAAGTACCTTTCTTGAGGCCTTTGGCATGTTGTTGATTCGAGAGGGATTAAAGGTCGCGGTTATTGCGGTCGATCCCAGCAGCCCGGTCACTGGCGGTAGCATTCTCGGGGATAAAACCCGCATGAATGACCTGGCGCGTGCCGAAGCGGCGTTTATTCGCCCGGTACCATCCTCCGGTCATCTGGGCGGTGCCAGTCAGCGAGCGCGGGAATTAATGCTGTTATGCGAAGCAGCGGGTTATGACG > NC_000913/3062894‑3063431 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |