| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 138 total aligned reads displayed.
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ccgccAGCGT‑ATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTTGCCGGACGCGCATGTACGCCGTTAgg < 6:44324/148‑1 (MQ=255) cGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTTGCCGGACGCGCATGTACGCCGTTAGGTAGCTCACaaat > 5:1067918/1‑148 (MQ=255) cGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTTGCCGGACGCGCATGTACGCCGTTAGGTAGCTCACaaat > 6:1014916/1‑148 (MQ=255) tGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGc > 8:182514/1‑92 (MQ=255) tGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGc < 7:182514/92‑1 (MQ=255) cAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTTGCCGGACGCGCATGTACGCCGTTAGGTAGCTCACaaataaa < 5:126156/145‑1 (MQ=255) cAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTAt > 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CAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTTGCCGGACGCGCATGTACGCCGTTAGGTAGCTCACAAATAAATTCCACAATCAg > 6:1067918‑M1/1‑148 (MQ=255) aagggcaacgccaaaagcgcccttgcgGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTTGCCGGACGCGCATGTACGCCGtt > 8:364837‑M2/28‑117 (MQ=255) aagggcaacgccaaaagcgcccttgcgGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTTGCCGGACGCGCATGTACGCCGtt < 7:364837‑M2/90‑1 (MQ=255) agggcaacgccaaaagcgcccttgcgGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTtgtg < 7:522824‑M2/32‑1 (MQ=255) AGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTTGCCGGACGCGCATGTACGCCGTTAGGTAGCTCACaa < 7:784810‑M1/129‑1 (MQ=255) AGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTTGCCGGACGCGCATGTACGCCGTTAGGTAGCTCACAAATAAATTCCACAATCAggg > 5:245154‑M1/1‑148 (MQ=255) AGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTTGCCGGACGCGCATGTACGCCGTTAGGTAGCTCACAAATAAATTCCACAATCAGGGCCATTGCCTCTCTCCCGGTACGGTTTTCTGTTTACAGGATAAGAGCGCACGGCAACGGCCTGCCATGTGACAAATCTGCCAAAAGCTGGACAAATGTAATGTAACCGTCAATTTGCGACGCGTCTca < 1:2443‑M1/275‑1 (MQ=255) AGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTAAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTTGCCGGACGCGCATGTACGCCGTTAGGTAGCTCACAAATAAATTCCACAATCAGGGCCATTGCCTCTCTCCCGGTACGGTTTTCTGTTTACAGGATAAGAGCGCACGGCAACGGCCTGCCATGTGACAAATCTGCCAAAAGCTGGACAaatgta > 4:512468‑M1/1‑246 (MQ=255) gggcaacgccaaaagcgcccttgcgGTCAGTGCGCAGGTTATGcc > 8:122233‑M2/26‑45 (MQ=255) GGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTTGCCGGACGCGCATGTACGCCGTTAGGTAGCTCACAAATAAATTCCACAATCAGGGCCATTGCCTCTCTCCCGGTACGGTTTTCTGTTTACAGGATAAGAGCGCACGGCAACGGCCTGCCATGTGACAAATCTGCCAAAAGCTGGACAAATGTAATGTAACAGTCAATTTGCGACGcgtctccc < 1:161018‑M1/275‑3 (MQ=255) ggcaacgccaaaagcgcccttgcgGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGt < 5:69103‑M2/62‑1 (MQ=255) ggcaacgccaaaagcgcccttgcgGTCAGTGCGCAGGTTAGGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGt > 6:69103‑M2/25‑86 (MQ=255) CGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTTGCCGGACGCGCATGTACGCCGTTAGGTAGCTCACaaataaat < 5:796400‑M1/131‑1 (MQ=255) CGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTTGCCGGACGCGCATGTACGCCGTTAGGTAGCTCACaaataaat > 6:796400‑M1/1‑131 (MQ=255) gcTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTTGCCGGACGCGCATGTACGCCGTTAGGTAGCTCACaaataa > 8:73837/1‑128 (MQ=255) gcTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTTGCCGGACGCGCATGTACGCCGTTAGGTAGCTCACaaataa < 7:73837/128‑1 (MQ=255) tttGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTTGCCGGACGCGCATGTACGCCGTTAGGTAGCTCACAAATAAATTCCACAATCAg < 7:1026807/138‑1 (MQ=255) tttGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTTGCCGGACGCGCATGTACGCCGTTAGGTAGCTCACAAATAAATTCCACAATCAGGGCCATTg < 8:1137235/146‑1 (MQ=255) tttGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTTGCCGGACGCGCATGTACGCCGTTAGGTAGCTCACAAATAAATTCCACAATCAGGGCCATTg > 7:1137235/1‑146 (MQ=255) tGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTTGCCGGACGCGCATGTACGCCGTTAGGTa < 5:876923/111‑1 (MQ=255) ttGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTTGCCGGACGCGCATGTACGCCGTTAGGTAGCTCACaaataaat > 6:841835/1‑120 (MQ=255) ccttgcgGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTTGCCGGACGCGCATGTACGCCGTTAGGTAGCTCACAAATAAATTCCACAATCAGGGCCATTGCCTCTCTCCCGGt < 8:1089131‑M2/141‑1 (MQ=255) cttgcgGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTTGCCGGACGCGCATGTACGCCGTTAGGTAGCTCACAAATAAAtt > 8:553725‑M2/7‑116 (MQ=255) cttgcgGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTTGCCGGACGCGCATGTACGCCGTTAGGTAGCTCACAAATAAAtt < 7:553725‑M2/110‑1 (MQ=255) cttgcgGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTTGCCGGACGCGCATGTACGCCGTTAGGTAGCTCACAAATAAATTCCACAATCAGGGCCATTGCCTCTCTCCCGGTa > 6:6078‑M2/7‑148 (MQ=255) ttgcgGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTTGCCGGACGCGCATGTACGCCGTTAg < 6:726249‑M2/92‑1 (MQ=255) ttgcgGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTTGCCGGACGCGCATGTACGCCGTTAg > 5:726249‑M2/6‑97 (MQ=255) | CGTCAGAATGCCGCCTGCACTACCGCTGCACACGGTGCGGGCGCGGATAATTTGCGGATTCAGATTGGTCAGTGAAACCGGCAGTGGTTCCAGTTCGTCAGATTTAACTTCCGCCAGCGGCGCATCGCAGTGGGGGAATTCATCGCGCAGCCATTGGCTTAAACGCTGGTGCGCTTCCTGTTCGTCGGCCCCGGAAATCAGTAACTGGCAGTTATCGCCCGCCAGCGT‑ATCGGTGCCAATCAGCGCAAGGGCGCTTTTGGCGTTGCCCTTGCGGTCAGTGCGCAGGTTATGCCACTCAATTTGTGATGAAAAAGTATTACACAGCGTTTCAACGTGGCTTGCCGGACGCGCATGTACGCCGTTAGGTAGCTCACAAATAAATTCCACAATCAGGGCCATTGCCTCTCTCCCGGTACGGTTTTCTGTTTACAGGATAAGAGCGCACGGCAACGGCCTGCCATGTGACAAATCTGCCAAAAGCTGGACAAATGTAATGTAACCGTCAATTTGCGACGCGTCTCACAAGACGCTGTTTTGCGGCA > NC_000913/4141823‑4142364 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |