New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 4523274 = | 175 (1.110) | 4 (0.030) | 4/258 | NT | 2.4% | coding (821/1968 nt) | yjhG | putative dehydratase |
? | NC_000913 | 4523298 = | 160 (1.040) | coding (797/1968 nt) | yjhG | putative dehydratase | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 179 total aligned reads displayed.
CGTTGGATGATAAACCGGG‑CCATTAGGCAGTACGCTCACCAGTCGGGGCACGCGCTTGTTGATGCGGATCCAGTCATCAACGGTCGGGATATGGCAACCTGCCTGGTGAGCAATTGCCGGGATGTGTAACAGCAGGTTTGTTGAACCACCGAACGCGGCATGGACCGTCATCGCATTCTCTATCGCTTTATCGGTGAGAATTTCCCGGGTGGTGATGCCTTTTTGACTCAGGTTCAGCGCAGCTCGCGCGGAAGCTCTGGCGATCTCCCGCCACACAGGCTCACCGGAAGGGGCCAGGGCTGAATGTGGGATTGCCAGTCCCAATCCTTCGGCCACCACCTGAGATGTCCCGGCAGTGCCCAAAAATTGACAGCCGCCGCCGGAAGAGGCACAGGCTTTACAGCCCGCACGGCGTGCGTCCTGTAGAGATAATTCGCCATTGGCGAAGCGTGCGCCAATGGTTTGCACCTTGCCGTTGTCTTCTCCATCCTTTGCGGGCAGCGTCGCGCCGCCGG > NC_000913/4523027‑4523541 | cGTGGGATG‑TAAACCGGGTCGATAGGGCGCTACGCTGACGTGTGGGGGCACGCGCTGTTTGCTGCGGATCAAGTCAANAAAGGTCGGGAGATGGCAACCTGCCTGGTGAGGAAGTGCCGGGATGTGTAATAGCAGGTGTGTTAAAGCACCGAACGCGGCATGGACCGTCATCGCATTCTCTATCGCTTTATCGGTGAGAATTTCCCAGGTGGTGATGCCTTTTTGACTCAGGTTAAGCGCAGCTCGCGCGGAAGCTCTGGCGATCTCCCGCcaca < 3:119362/275‑1 (MQ=255) cATTAGGCAGTACGCTCACCAGTCGGGGCACGCGCTTGTTGATGCGGATCCAGTCATCAACGGTCGGGATATGGCAACCTGCCTGGTGAGCAATTGCCGGGATGTGTAACAGCAGGTTTGTTGAACCACCGAACGCGGCATGGACCGTCATCGCATTCTCTATCGCTTTATCGGTGAGAATTTCCCGGGTGGTGATGCCTTTTTGACTCAGGTTCAGCGCAGCTCGCGCGGAAGCTCTGGCGATCTCCCGCCACACAGGCTCACCGGAAGGGGcc < 4:97562/275‑1 (MQ=255) tACGCTCACCAGTCGGGGCACGCGCTTGTTGATGCGGATCCAGTCATCAACGGTCGGGATATGGCAACCTGCCTGGTGAGCAATTGCCGGGATGTGTAACAGCAGGTTTGTTGAACCACCGAACGCGGCATGGACCGTCATCGCATTCTCTATCGCTTTATCGGTGAGAATTTCCCGGGTGGTGATGCGTTTTTGACTCAGGTTCAGCGCAGCTCGCGCGGAAGCTCTGGCGATCTCCCGCCCCCCCGGCCCACCGGACGGGGGCCGGGCTGAAt > 4:426322/1‑275 (MQ=255) tACGCTCACCAGTCGGGGCACGCGCTTGTTGATGCGGATCCAGTCATCAACGGTCGGGATATGGCAACCTGCCTGGTGAGCAATTGCCGGGATGTGTAACAGCAGGTTTGTTGAACCACCGAACGCGGCATGGACCGTCATCGCATTCTCTATCGCTTTATCGGTGAGAATTTCCCGGGTGGTGATGCCTTTTTGACTCAGGTTCAGCGCAGCTCGCGCGGAAGCTCTGGCGATCTCCCGCCACACAGGCTCACCGGAAGGGGCCAGGGCTGaa > 2:284357/1‑274 (MQ=255) tACGCTCACCAGTCGGGGCACGCGCTTGTTGATGCGGATCCAGTCATCAACGGTCGGGATATGGCAACCTGCCTGGTGAGCAATTGCCGGGATGTGTAACAGCAGGTTTGTTGAACCACCGAACGCGGCATGGACCGTCATCGCATTCTCTATCGCTTTATCGGTGAGAATTTCCCGGGTGGTGATGCCTTTTTGACTCAGGTTCAGCGCAGCTCGCGCGGAAGCTCTGGCGATCTCCCGCCACACAGGCCCACCGGAAggg > 2:367180/1‑262 (MQ=255) tACGCTCACCAGTCGGGGCACGCGCTTGTTGATGCGGATCCAGTCATCAACGGTCGGGAGATGGCAACCTGCCTGGTGCGCAATTGCCGGGATGAGTAACAGCAGGTTTGTTGAACCACCGAACGCGGCATGGACAGTCATCGCATTCTCTATCGCCTTATCGGTGATAATTTCCCGGGTGGGGATGCCTTTTTTACCCCGGTTCAGCCCAGCTCCGCCGGACGCCCGGGCGATCCCCCGCCACAACGGCCCCACGGAAGGGGCCCGGGCTGAAt > 4:135422/1‑275 (MQ=255) gTCGGGGCACGCGCTTGTTGATGCGGATCCAGTCATCAACGGTCGGGATATGGCAACCTGCCTGGTGAGCAATTGCCGGGATGTGTAACAGCAGGTTTGTTGAACCACCGAACGCGGCATGGACCGTCATCGCATTCTCTATCGCTTTATCGGTGAGAATTTCCCGGGTGGTGATGCCTTTTTGACTCAGGTTCAGCGCAGCTCGCGCGGAAGCTCTGGCGATCTCCCGCCACACAGGCTCACCGGAAGGGGCCAGGGCTGAATGTGGGATTGc < 2:276226/274‑1 (MQ=255) tCGGGGCACGCGCTTGTTGATGCGGATCCAGTCATCAACGGTCGGGATATGGCAACCTGCCTGGTGAGCAATTGCCGGGATGTGTAACAGCAGGTTTGTTGAACCACCGAACGCGGCATGGACCGTCATCGCATTCTCTATCGCTTTATCGGTGAGAATTTCCCGGGTGGTGATGCCTTTTTGACTCAGGTTCAGCGCAGCTCGCGCGGAAGCTCTGGCGATCTCCCGCCACACAGGCTCACCGGAAGGGGCCAGGGCTGAATGTGGGATTGcc < 2:85037/274‑1 (MQ=255) tCGGGGCACGCGCTTGTTGATGCGGATCCAGTCATCAACGGTCGGGATATGGCAACCTGCCTGGTGAGCAATTGCCGGGATGTGTAACAGCAGGTTTGTTGAACCACCGAACGCGGCATGGACCGTCATCGCATTCTCTATCGCTTTATCGGTGAGAATTTCCCGGGTGGTGATGCCTTTTTGACTCAGGTTCAGCGCAGCTCGCGCGGAAGCTCTGGCGATCTCCCGCCACACAGGCTCACCGGAAGGGGCCAGGGCTGAATGTGGGATTGcc < 2:514349/274‑1 (MQ=255) tCGGGGCACGCGCTTGTTGATGCGGATCCAGTCATCAACGGTCGGGATATGGCAACCTGCCTGGTGAGCAATTGCCGGGATGTGTAACAGCAGGTTTGTTGAACCACCGAACGCGGCATGGACCGTCATCGCATTCTCTATCGCTTTATCGGTGAGAATTTCCCGGGTGGTGATGCCTTTTTGACTCAGGTTCAGCGCAGCTCGCGCGGAAGCTCTGGCGATCTCCCGCCACACAGGCTCACCGGAAGGGGCCAGGGCTGAATGTGGGATTGCCa > 4:133343/1‑275 (MQ=255) 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aTCCAGTCATCAACGGTCGGGATATGGCAACCTGCCTGGTGAGCAATTGCCGGGATGTGTAACAGCAGGTTTGTTGAACCACCGAACGCGGCATGGACCGTCATCGCATTCTCTATCGCTTTATCGGTGAGAATTTCCCGGGTGGTGATGCCTTTTTGACTCAGGTTCAGCGCAGCTCGCGCGGAAGCTCTGGCGATCTCCCGCCACACAGGCTCACCGGAAGGGGCCAGGGCTGAATGTGGGATTGCCAGTCCCACTCCTTCGGCCACCACCTg > 1:61089/1‑275 (MQ=255) tcaACGGTCGGGATATGGCAACCTGCCTGGTGAGCAATTGCCGGGATGGGTAACAGCAGGTTTGTTGAACCACCGAACGCGGCATGGACCGTCATCGCATTCTCTATCGCTTTATCGGTGAGAATTTCCCGGGTGGTGATGCCTTTTTGACTCAGGTTCAGCGCAGCTCGCGCGGAAGCTCTGGCGATCTCCCGCCACACAGGCTCACCGGAAGGGGCCAGGGCTGAATGTGGGATTGCCAGTCCCAATCCTTCGGCCACCACCTGAGATGTcc < 2:426323/274‑1 (MQ=255) cctgcctgGTGAGCAATTGCCGGGATGTGTAACAGCAGGTTTGTTGAACCACCGAACGCGGCATGGACCGTCATCGCATTCTCTATCGCTTTATCGGTGAGAATTTCCCGGGTGGTGATGCCTTTTTGACTCAGGTTCAGCGCAGCTCGCGCGGAAGCTCTGGCGATCTCCCGCCACACAGGCTCACCGGAAGGGGCCAGGGCTGAATGTGGGATTGCCAGTCCCAATCCTTCGGCCACCACCTGAGATGTCCCGGCAGTGCCCAAAAATTGACa > 2:223491/1‑275 (MQ=255) 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6:1044009/118‑1 (MQ=255) ttCCCGGGTGGTGATGCCTTTTTGACTCAGGTTCAGCGCAGCTCGCGCGGAAGCTCTGGCGATCTCCCGCCACACAGGCTCACCGGAAGGGGcc > 8:1082696/1‑94 (MQ=255) ttCCCGGGTGGTGATGCCTTTTTGACTCAGGTTCAGCGCAGCTCGCGCGGAAGCTCTGGCGATCTCCCGCCACACAGGCTCACCGGAAGGGGcc < 7:1082696/94‑1 (MQ=255) ttCCCGGGTGGTGATGCCTTTTTGACTCAGGTTCAGCGCAGCTCGCGCGGAAGCTCTGGCGATCTCCCGCCACACAGGCTCACCGGAAGGGGCCAGGGCTGAAtg > 8:405045/1‑105 (MQ=255) ttCCCGGGTGGTGATGCCTTTTTGACTCAGGTTCAGCGCAGCTCGCGCGGAAGCTCTGGCGATCTCCCGCCACACAGGCTCACCGGAAGGGGCCAGGGCTGAAtg < 7:405045/105‑1 (MQ=255) ccGGGTGGTGATGCCTTTTTGACTCAGGTTCAGCGCAGCTCGCGCGGAAGCTCTGGCGATCTCCCGCCACACAGGCTCACCGGAAGGGGCCAGGGCTGAATGTGGGATTGCCAGTCCCAATCCTTCGGCCACCACCTGAGATGTCCCGGCAGTGCCCAAAAATTGACAGCCGCCGCCGGAAGACGCACAGGCTTTACAGCCCGCACGGCGTGCGTCCTGTAGAGATAATTCGCCATTGGCGAAGCGTGCGCCAATGGTTTGCACCGTGCCGTTGt > 2:307155/1‑275 (MQ=255) gggTGGTGATGCCTTTTTGACTCAGGTTCAGCGCAGCTCGCGCGGAAGCTCTGGCGATCTCCCGCCACACAGGCTCACCGGAAGGGGcc > 8:915009/1‑89 (MQ=255) 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ccTTTTTGACTCAGGTTCAGCGCAGCTCGCGCGGAAGCTCTGGCGATCTCCCGCCACACAGGCTCACCGGAAGGGGCCAGGGCTGAATGTGGGATTGCCAGTCCCAATCCtt < 7:448950/112‑1 (MQ=255) ccTTTTTGACTCAGGTTCAGCGCAGCTCGCGCGGAAGCTCTGGCGATCTCCCGCCACACAGGCTCACCGGAAGGGGCCAGGGCTGAATGTGGGATTGCCAGTCCCAATCCTTCGGCCACCACCTg < 5:1007533/125‑1 (MQ=255) ccTTTTTGACTCAGGTTCAGCGCAGCTCGCGCGGAAGCTCTGGCGATCTCCCGCCACACAGGCTCACCGGAAGGGGCCAGGGCTGAATGTGGGATTGCCAGTCCCAATCCTTCGGCCACCACCTg > 6:1007533/1‑125 (MQ=255) cTTTTTGACCCAGGTGTAGCGCAGGTCGCGCGGAAGCTCTGGCGATCTCCCGCCACCCAAGCTCACCGGAAGGGGCAAGGGCTGAATGTGGGATTGCCAGTCCAAATCCTTCGGCCACCACCTGAGATGTCCCGGCAGTGCCCAAAAATTGACAGCCGCCGCCGGAAGAGGCACAGGCTTTACAGCCCGCACGGCGTGCGTCCTGTAGAGATAATTCGCCATTGGCGAAGCGTGCGCCAATGGTTTGCACCTTGCCGTTGTCTTCTCCATCCttt < 4:504797/275‑1 (MQ=255) ttttGACTCAGGTTCAGCGCAGCTCGCGCGGAAGCTCTGGCGATCTCCCGCCACACAGGCTCACCGGAAGGGGCCAGGGCTGAATGTGGGATTGCCAGTCCCAATCCTTCGGCCACCACCTGAGATGTCCCGGCAg < 8:181487/136‑1 (MQ=255) ttttGACTCAGGTTCAGCGCAGCTCGCGCGGAAGCTCTGGCGATCTCCCGCCACACAGGCTCACCGGAAGGGGCCAGGGCTGAATGTGGGATTGCCAGTCCCAATCCTTCGGCCACCACCTGAGATGTCCCGGCAg > 7:181487/1‑136 (MQ=255) cTCAGGTTCAGCGCAGCTCGCGCGGAAGCTCTGGCGATCTCCCGCCACACAGGCTCACCGGAAGGGGCCAGGGCTGAATGTGGGATTGCCAGTCCCAATCCTTc > 8:366986/1‑104 (MQ=255) cTCAGGTTCAGCGCAGCTCGCGCGGAAGCTCTGGCGATCTCCCGCCACACAGGCTCACCGGAAGGGGCCAGGGCTGAATGTGGGATTGCCAGTCCCAATCCTTCGGCCACCACCTGAGATGTCCCg < 8:244966/126‑1 (MQ=255) cAGGTTCAGCGCAGCTCGCGCGGAAGCTCTGGCGATCTCCCGCCACACAGGCTCACCGGAAGGGGCCAGGGCTGAATGTGGGATTGCCAGTCCCAATCCTTCGGCCACCACCTGAGATGTCCCGGCAGTGCCCAAAAATTg < 5:896133/141‑1 (MQ=255) cAGGTTCAGCGCAGCTCGCGCGGAAGCTCTGGCGATCTCCCGCCACACAGGCTCACCGGAAGGGGCCAGGGCTGAATGTGGGATTGCCAGTCCCAATCCTTCGGCCACCACCTGAGATGTCCCGGCAGTGCCCAAAAATTg > 6:896133/1‑141 (MQ=255) 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cgcAGCTCGCGCGGAAGCTCTGGCGATCTCCCGCCACACAGGCTCACCGGAAGGGGCCAGGGCTGAATGTGGGATTGCCAGTCCCAATCCTTCGGCCACCACCTGAGATGTCCCGGCAGTGCCCAAAAATTGACAGCCGCCGCCGGAAGAGGCACAGGCTTTACAGCCCGCACGGCGTGCGTCCTGTAGAGATAATTCGCCATTGGCGAAGCGTGCGCCAATGGTTTGCACCTTGCCGTTGTCTTCTCCATCCTTTGCGGGCAGCGTCGcgccgc > 2:349946/1‑275 (MQ=255) cAGCTCGCGCGGAAGCTCTGGCGATCTCCCGCCACACAGGCTCACCGGAAGGGGCCAGGGCTGAATGTGGGATTGCCAGTCCCAATCCTTCGGCCACCACCTGAGATGTCCCGGCAGTGCCCAAAAATTGACAGCCGCCGCCGGAaga < 7:707050/148‑1 (MQ=255) cTCGCGCGGAAGCTCTGGCGATCTCCCGCCACACAGGCTCACCGGAAGGGGcc > 2:538737/1‑53 (MQ=255) cgcgcgGAAGCTCTGGCGATCTCCCGCCACACAGGCTCACCGGAAGGGGCCAGGGCTGAAtgt > 8:220323/1‑63 (MQ=255) cgcgcgGAAGCTCTGGCGATCTCCCGCCACACAGGCTCACCGGAAGGGGCCAGGGCTGAAtgt < 7:220323/63‑1 (MQ=255) cgcgcgGAAGCTCTGGCGATCTCCCGCCACACAGGCTCACCGGAAGGGGCCAGGGCTGAATGTGGGATTGCCAGTCCCAATCCTTCGGccacc > 6:305267/1‑93 (MQ=255) ggcgggagatcgccagagcttccgcCACACAGGCTCACCGGAAGGGGCCAGGGCTGAATGTGGGATTGCCAGTCCCAATCCTTCGGCCACCACCTg > 7:955481‑M2/26‑96 (MQ=255) cgcgGAAGCTCTGGCGATCTCCCGCCACACAGGCTCACCGGAAGGGGCCAggg < 4:538736/53‑1 (MQ=255) gagatcgccagagcttccgcCACACAGGCTCACCGGAAGGGGCCAGGGCTGAATGTggg < 5:515382‑M2/39‑1 (MQ=255) ctctGGCGATCTCCCGCCACACAGGCTCACCGGAAGGGGCCAGGGCTGAATGTGGGATTGCCAGTCCCAATCCTTCGGCCACCACCTGAGATGTCCCGGCAGTGCCCAAAAAt > 7:970051/1‑113 (MQ=255) aTCTCCCGCCACACAGGCTCACCGGAAGGGGCCAGGGCTGAATGTGGGATTGCCAGTCCCAATCCTTCGGCCACCACCTGAGATGTCCCGGCAGTGCCCAAAAATTGACAGCCGCCGCCGGa < 7:160285/122‑1 (MQ=255) cgcCACACAGGCTCACCGGAAGGGGCCAGGGCTGAATGTGGGATTg > 6:721676‑M2/4‑46 (MQ=255) cgcCACACAGGCTCACCGGAAGGGGCCAGGGCTGAATGTGGGATTg < 5:721676‑M2/43‑1 (MQ=255) | CGTTGGATGATAAACCGGG‑CCATTAGGCAGTACGCTCACCAGTCGGGGCACGCGCTTGTTGATGCGGATCCAGTCATCAACGGTCGGGATATGGCAACCTGCCTGGTGAGCAATTGCCGGGATGTGTAACAGCAGGTTTGTTGAACCACCGAACGCGGCATGGACCGTCATCGCATTCTCTATCGCTTTATCGGTGAGAATTTCCCGGGTGGTGATGCCTTTTTGACTCAGGTTCAGCGCAGCTCGCGCGGAAGCTCTGGCGATCTCCCGCCACACAGGCTCACCGGAAGGGGCCAGGGCTGAATGTGGGATTGCCAGTCCCAATCCTTCGGCCACCACCTGAGATGTCCCGGCAGTGCCCAAAAATTGACAGCCGCCGCCGGAAGAGGCACAGGCTTTACAGCCCGCACGGCGTGCGTCCTGTAGAGATAATTCGCCATTGGCGAAGCGTGCGCCAATGGTTTGCACCTTGCCGTTGTCTTCTCCATCCTTTGCGGGCAGCGTCGCGCCGCCGG > NC_000913/4523027‑4523541 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |