New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 4621981 | 171 (1.080) | 4 (0.030) | 4/254 | NT | 2.3% | coding (213/1332 nt) | yjjJ | putative protein kinase |
? | NC_000913 | = 4622003 | 171 (1.130) | coding (235/1332 nt) | yjjJ | putative protein kinase | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 187 total aligned reads displayed.
GTATCTATTCACGAATCTATTCATTAATGAGCGAGCTGACTGATCTTTTACTGCAAGGGCCGCGTTCTGCCCCGGAATTGCGCCAGCGTCTGGCAATCAGTCAGGCGACGTTCTCACGCCTTGTTGCCAGAGAAGATCGGGTGATTCGCTTTGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCACTGCTGCGTCCTTATCGCGGAATTGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTGGTAACAGGCGCAGATGGCGACGAACAGTGGTTTGATGGTTTGCCCTGGTATTTGACCGATCTCCGACCGCAGGGCTTTTTAGGGCGCGCGTGGGGCAGGAAGTTAGCCGCGCAACTGAATCTGACTGATGATATACGTCTCTGGCAGGAAGAAGATGTGCTCTACGCCCTGACCGTATTTAACGGTGAATATACTGGCGGTTGGTTGGTCGGGGAGGGGAATTATCAGCGATGGATTA > NC_000913/4621743‑4622273 | gTATCTATTCACGAATCTATTCATTAATGAGCGAGCTGACTGATCTTTTACTGCAAGGGCCGCGTTCTGCCCCGGAATTGCGCCAGCGTCTGGCAATCAGTCAGGCGACGTTCTCACGCCTTGTTGCCAGAGAAGATCGGGTGATTCGCTTTGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCACTGCTGCGTCCTTATCGCGGAATTGAGCGTGTTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTgg > 4:232614/1‑275 (MQ=255) tATTCATTAATGAGCGAGCTGACTGATCTTTTACTGCAAGGGCCGCGTTCTGCCCCGGAATTGCGCCAGCGTCTGGCAATCAGTCAGGCGACGTTCTCACGCCTTGTTGCCAGAGAAGATCGGGTGATTCGCTTTGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCACTGCTGCGTCCTTATCGCGGAATTGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCAACATCCGGTTGTGCTTGCCGCAGGGAAGTTGTCt > 1:50748/1‑275 (MQ=255) agcgagcTGACTGATCTTTTACTGCAAGGGCCGCGTTCTGCCCCGGAATTGCGCCAGCGTCTGGTAATCAGTCAGGCGACGTTCTCACGCCTTGTTGCCAGAGAAGATCGGGTGATTCGCTTTGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCACTGCTGCGTCCTTATCGCGGAATTGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCGGGTAACAGgcgg > 1:76805/1‑274 (MQ=255) cAAGGGCCGCGTTCTGCCCCGGAATTGCGCCAGCGTCTGGCAATCAGTCAGGCGACGTTCTCACGCCTTGTTGCCAGAGAAGATCGGGTGATTCGCTTTGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCACTGCTGCGTCCTTATCGCGGAATTGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTGGTAACAGGCGCAGATGGCGACGAACAGTGGTTGGa > 2:345863/1‑275 (MQ=255) ccccGGAATTGCGCCAGCGTCTGGCAATCAGTCAGGCGACGTTCTCACGCCTTGTTGCCAGAGAAGACCGGGTGATTCGCTTTGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCACTGCTGCGTCCTTATCGCGGAATTGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAACGGCGCATAAATTCGCCGCCATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTGGTAACAGGCGCAGATGGCGACGAACAGTGGTTTGATGGTTTGCCCTGGTa > 2:251308/1‑274 (MQ=255) cGGAATTGCGCCAGCGTCTGGCAATCAGTCAGGCGACGTTCTCACGCCTTGTTGCCAGAGAAGATCGGGTGATTCGCTTTGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCACTGCTGCGTCCTTATCGCGGAATTGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCCCAGGGAAGTTGTCTGGTCACCGGCGCAGATGGCGCCGAACAGTGGTTTGATGTTTTTCCCTGGTAttt > 4:13473/1‑274 (MQ=255) gAATTGCGCCAGCGTCTGGCAATCAGTCAGGCGACGTTCTCACGCCTTGTTGCCAGAGAAGATCGGGTGATTCGCTTTGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCACTGCTGCGTCCTTATCGCGGAATTGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTGGTAACAGGCCCCATTGGCCACGAACAGTGGTTTGATGGTTTGCCTCGGGAtttta > 4:361019/1‑272 (MQ=255) aaTTGCGCCAGCGTCTGGCAATCAGTCAGGCGACGTTCTAACGCCTTGTTGCCAGAGAAGATCGGGTGATTCGCTTTGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCACTGCTGCGTCCTTATCGCGGAATTGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTGGTAACAGGCGCAGATGGCGACGAACAGTGGTTTGATGGTTTGCCCTGGTATTTGAc < 2:13473/274‑1 (MQ=255) gcgcCAGCGTCTGGCAATCAGTCAGGCGACGTTCTCACGCCTTGTTGCCAGAGAAGATCGGGTGATTCGCTTTGGTACAGCACGGGCAACGCGATATGCACTGCTGCGTCCTTATCGCGGAATTGAGCGAATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCCCCGACACCCGGTTGGGCTGGCCCCCGGGAAGTTGTCTGGCAACAGGCGCAGATGGCGGCGCAAAGTGNNNTGACGGTTTGGCCTGGTAGTTGagctggc > 3:158151/1‑269 (MQ=255) tGGCAATCAGTCAGGCGACGTTCTCACGCCTTGTTGCCAGAGAAGATCGGGTGATTCGCTTTGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCACTGCTGCGTCCTTATCGCGGAATTGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTGGTAACAGGCGCAGCTGGCGACGAAAAGTGGTTTGATGGTTTGCCCTGGTATTTGACCGATCTACGGACGCAg > 1:118441/1‑275 (MQ=255) cACGCCTTGTTGCCAGAGAAGATCGGGTGATTCGCTTTGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCACTGCTGCGTCCTTATCGCGGAATTGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTGGTAACa > 2:68470/1‑185 (MQ=255) cGCCTTGTTGCCAGAGAAGATCGGGTGATTCGCTTTGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCACTGCTGCGTCCTTATCGCGGAATTGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACAtcc < 8:44784‑M2/148‑4 (MQ=255) gCCTTGTTGCCAGAGAAGATCGGGTGATTCGCTTTGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCACTGCTGCGTCCTTATCGCGGAATTGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACAtccg < 7:1128095‑M2/148‑5 (MQ=255) ccTTGTTGCCAGAGAAGATCGGGTGATTCGCTTTGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCACTGCTGCGTCCTTATCGCGGAATTGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACAtccgg < 5:438540‑M2/148‑6 (MQ=255) agagAAGATCGGGTGATTCGCTTTGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCACTGCTGCGTCCTTATCGCGGAATTGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGc > 8:713183/1‑148 (MQ=255) agaagaTCGGGTGATTCGCTTTGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCACTGCTGCGTCCTTATCGCGGAATTGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTtgt < 8:922368/140‑1 (MQ=255) agaagaTCGGGTGATTCGCTTTGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCACTGCTGCGTCCTTATCGCGGAATTGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTtgt > 7:922368/1‑140 (MQ=255) gaagaTCGGGTGATTCGCTTTGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCACTGCTGCGTCCTTATCGCGGAATTGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGc < 5:1009270/148‑1 (MQ=255) aagaTCGGGTGATTCGCTTTGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCACTGCTGCGTCCTTATCGCGGAATTGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCa < 6:1082707/148‑1 (MQ=255) tCGGGTGATTCGCTTTGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCACTGCTGCGTCCTTATCGCGGAATTGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGa < 8:182338/148‑1 (MQ=255) ggTGATTCGCTTTGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCACTGCTGCGTCCTTATCGCGGAATTGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGt > 8:107554/1‑148 (MQ=255) ggTGATTCGCTTTGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCACTGCTGCGTCCTTATCGCGGAATTGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGt < 8:428157/148‑1 (MQ=255) gTGATTCGCTTTGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCACTGCTGCGTCCTTATCGCGGAATTGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAg < 6:569841/141‑1 (MQ=255) aTTCGCTTTGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCACTGCTGCGTCCTTATCGCGGAATTGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTc < 6:438540/148‑1 (MQ=255) ttCGCTTTGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCACTGCTGCGTCCTTATCGCGGAATTGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGc > 5:949637/1‑135 (MQ=255) tCGCTTTGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCACTGCTGCGTCCTTATCGCGGAATTGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGa < 6:843560/139‑1 (MQ=255) tCGCTTTGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCACTGCTGCGTCCTTATCGCGGAATTGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGa > 5:843560/1‑139 (MQ=255) cggtttGGTAAATGACGGGCAACGCGATATGCACTGCTGCGTCCTTATCGCGGAATTGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTGGTAACAGGCGCAGATGGCGACGAACAGTGGTTTGATGGTTTGCCCTGGTATTTGACCGATCTCCGACCGCAGGGCTTTTTAGGGCGCGCGTGGGGCAGGAAGTTAGCCGCGCAACTGAATctgactga < 1:145486/272‑1 (MQ=255) gCTTTGGTAAAGCACGTGCAACGCGATGTGTGCTGCTGCGTCCGTATCGCGGAATTGGGCGATTTCCCGTCTGGCGTGTGGACGATACCGGAAAGGCGAATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTGGTAACAGGCGCAGATGGCGACGAACAGTGGTTTGATGGTTTGCCCTGGTATTTGACCGATCTCCGACCGCAGGGCTTTTTAGGGCGCGCGTGGGGCAGGAAGTTAGCCGCGCAACTGAATctgactga < 4:283352/274‑1 (MQ=255) gCTTTGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCACTGCTGCGTCCTTATCGCGGAATTGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTGGTAACAGGCGCAGATGGCGACGAACAGTGGTTTGATGGTTTGCTCTGGTATTTGACCGATCTCCGACCGCAGGGCTTTTTAGGGCGCGCGTGGGGCAGGAAGTTAGCCGCGCAACTGAATctgactga < 1:37555/274‑1 (MQ=255) cTTTGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCACTGCTGCGTCCTTATCGCGGAATTGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGt < 7:906064/142‑1 (MQ=255) cTTTGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCACTGCTGCGTCCTTATCGCGGAATTGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGt > 8:906064/1‑142 (MQ=255) tttGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCACTGCTGCGTCCTTATCGCGGAAATGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTGGTaa < 7:107554/148‑1 (MQ=255) ggTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCACTGCTGCGTCCTTATCGCGGAATTGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTc > 7:829275/1‑139 (MQ=255) 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cACTGCTGCGTCCTTATCGCGGAATTGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTc > 5:1051836/1‑114 (MQ=255) cACTGCTGCGTCCTTATCGCGGAATTGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTc < 6:1051836/114‑1 (MQ=255) gctgcGTCCTTATCGCGGAATTGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTGGTAACAGGCGCAGATGGCCACCAACTGTGGTTTGATGGTTTGCCCTGGTATTTGACCGATCGCCGACCGCAGGGCTTTTTCGGGCCTGCCTGGGGCAGGAAGTTAGCCGCGCAACCGAATCTGCCTGGATATATACGTCTCCTGCCGGAAGAAGAtagcccct > 4:173346/1‑268 (MQ=255) gctgcGTCCTTATCGCGGAATTGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAACGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGACCGCAGGGAAGTTGTCTGGTAACAGGCGCAGATGGCGACGAACAGTGGTTTGAt > 8:838783/1‑148 (MQ=255) 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tCCTTATCGCGGAATTGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCCGGTAACAGGCGCAGATGGCGACGNACAGTGGTTTGATGGTTTGCCCTGGTATTTGACCGATCTCCGACCGCAGGGCTTTTTAGGGCGCGCGTGNGGCAGGAAGTTCGCCGCGCACCTGAATCTCACTGATTATCTATTTNTNTTGCAGGAAAACGCTGTGCCCTcccccc > 3:40470/1‑275 (MQ=255) ttATCGCGGAATTGAGCGTGTTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTGGTAACAGGCGCAGATGGCGACGAACAGTGGTTTGATGGTTTGCCCTGGTATTTGACCGATCTCCGACCGCAGGGCTTTTTAGGGCGCGCGTGGGGCAGGAAGTTAGCCGCGCAACTGAATCTGACTGATGATATACGTCTCTGGCAGGAAGAAGATGTGCTCTACGCCCTGa < 2:232615/275‑1 (MQ=255) tCGCGGAATTGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTtgtg < 7:324684/78‑1 (MQ=255) aaTTGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTGGTAACAGGCGCAGATGGCGACGAACAGTGGTTTGATGGTTTGCCCTGGTATTTg < 8:563757/148‑1 (MQ=255) atggAGCGGTTTCCCGGCTGGTGGGTGGAGGAGACCGGAAAGGGGTATAAATTGGCCGACGGCGGGTGTGGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTGGTAACAGGGGCAGATGGCGACGAACAGTGGTTTGATGGTTTGCCCTGGTATTTGACCGATCTCCGACCGCAGGGCTTTTTAGGGCGCGCGTGGGGCAGGAAGTTAGCCGCGCAACTGAATCTGACTGATGATATACGTCTCTGGCAGGAAGAAGATGTGCTCTACGCCCTGACCGTATTTa < 4:251307/271‑1 (MQ=255) ttGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGt > 5:580267/1‑86 (MQ=255) tGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTGGTAACAGGCGCAGATGGCGACGAACAGTGGTTTGATGGTTTGCCCTGGTAtt < 5:642914/143‑1 (MQ=255) tGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTGGTAACAGGCGCAGATGGCGACGAACAGTGGTTTGATGGTTTGCCCTGGTAtt > 6:642914/1‑143 (MQ=255) aTTCCCTTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTgg > 6:607429/1‑85 (MQ=255) aTTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTgg > 8:96000/1‑85 (MQ=255) aTTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTgg < 7:96000/85‑1 (MQ=255) aTTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTgg < 5:607429/85‑1 (MQ=255) cccGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTGGTAACAGGCGCAGATGGCGACGAACAGTGGTTTGATGGTTTGCCCTGGTATTTGa > 5:281116/1‑136 (MQ=255) cccGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTGGTAACAGGCGCAGATGGCGACGAACAGTGGTTTGATGGTTTGCCCTGGTATTTGa < 6:281116/136‑1 (MQ=255) cGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTGGTAACAGGCGCAGATGGCGACGAACAGTGGTTTGATGGTTTGcc > 8:790672/1‑123 (MQ=255) cGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTGGTAACAGGCGCAGATGGCGACGAACAGTGGTTTGATGGTTTGCCCTGGTATTTGa < 5:1096097/134‑1 (MQ=255) cGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTGGTAACAGGCGCAGATGGCGACGAACAGTGGTTTGATGGTTTGCCCTGGTATTTGACCGAtc < 8:793936/140‑1 (MQ=255) cGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTGGTAACAGGCGCAGATGGCGACGAACAGTGGTTTGATGGTTTGCCCTGGTATTTGACCGATCTCCGACCg < 6:977860/148‑1 (MQ=255) cGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTGGTAACAGGCGCAGATGGcg < 7:260694/91‑1 (MQ=255) cGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTGGTAACAGGCGCAGATGGCGACGAACAGTGGTTTGATGGTTTGCCCTGGTATTTGACCGATCTCCGACCGCAGGGCTTTTTAGGGCGCGCGGGGGGCAGGAAGTTAGCCGCGCAACGGAATCTGACTGATGATATACGTCGCTGGCAGGAAGAGGGAGTGCCTTACGCCCTGACCGTATTTAACGGTAAAAATAAGGGGggttg > 4:428704/1‑275 (MQ=255) gTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTGGTAACAGGCGCAGATGGCGACGAACAGTGGTTTGATGGTTTGCCCTGGTATTTGACCGATCTCCGACCGCAGGGCtttt < 7:792780/148‑1 (MQ=255) tGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTGGTAACAGGCGCAGATGGCGACGAACAGTGGTTTGATGGTTTGCCCTGGTATTTGACCGATCTCCGACCGCAGGGCttttt < 6:935132/148‑1 (MQ=255) aCGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTGGTAACAGGCGCAGATGGCGACGAACAGTGGTTTGATGGtt < 6:359680/105‑1 (MQ=255) aCGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTGGTAACAGGCGCAGATGGCGACGAACAGTGGTTTGATGGtt > 5:359680/1‑105 (MQ=255) tACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTGGTAACAGGCGCAGATGGCGACGAACAGTGGTTTGATGGTTTGCCCTGGTATTTGACCGATCTCCGACCGCAGGGCTTTTTa < 8:24832/142‑1 (MQ=255) aacGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTGGTAACAGGCGCAGATGGCGACGAACAGCGGTTTGATGGTTTGCCCTGGTATTTGACCGATCTCCg > 7:755907/3‑125 (MQ=255) aCCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACAtccggtatcgtccacccgccagacgggaatacgctcaattccgcgataaggacgcagcagtgcatatcgcgttgcccgtgctttac > 7:373413‑M2/1‑28 (MQ=255) aCCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTGGTAACAGGCGCAGATGGCGACGAACAGCGGTTTGATGGTTTGCCCTGGTATTTGACCGATCTCCg < 8:755907/125‑1 (MQ=255) 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aaaGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTGGTAACAGGCGCAGATGGCGACGAACAGTGGTTTGATGGTTTGCCCTGGTATTTGACCGa < 6:1101075/114‑1 (MQ=255) aaaGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTGGTAACAGGCGCAGATGGCGACGAACAGTGGTTTGATGGTTTGCCCTGGTATTTGACCGa > 5:1101075/1‑114 (MQ=255) ggCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTGGTAACAGGCGCAGATGGCGACGAACAGTGGTTTGATGGTTTGCCCTGGTATTTGACCGATCTCCGACCGCAGGGc < 5:472661/127‑1 (MQ=255) ggCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTGGTAACAGGCGCAGATGGCGACGAACAGTGGTTTGATGGTTTGCCCTGGTATTTGACCGATCTCCGACCGCAGGGc > 6:472661/1‑127 (MQ=255) cATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTGGTAACAGGCGCAGATGGCGACGAACAGTGGTTTGATGGTTTGCCCTGGTATTTGACCGa > 7:874500/1‑107 (MQ=255) cATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTGGTAACAGGCGCAGATGGCGACGAACAGTGGTTTGATGGTTTGCCCTGGTATTTGACCGa < 8:874500/107‑1 (MQ=255) cATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTGGTAACAGGCGCAGATGGCGACGAACAGTGGTTTGATGGTTTGCCCTGGTATTTGACCGATCTCCGa < 7:172835/114‑1 (MQ=255) aTAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTGGTAACAGGCGCAGATGGCGACGAACAGTGGTTTGATGGTTTGCCCTGGTATTTGACCGATCTCCGACCGCAGGGCTTTTTAGGGCGCGCGTGGGGCAGGAAGTTAGCCGCGCaa < 4:537651/161‑1 (MQ=255) tAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTGGTAACAGGCGCAGATGGCGACGAACAGTGGTTTGATGGTTTGCCCTGGTATTTGACCGATCTCCg < 5:182512/111‑1 (MQ=255) tAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTGGTAACAGGCGCAGATGGCGACGAACAGTGGTTTGATGGTTTGCCCTGGTATTTGACCGATCTCCg > 6:182512/1‑111 (MQ=255) cGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTGGTAACAGGCGCAGATGGCGACGAACAGTGGTTTGATGGTTTGCCCTGGTATTTGACCGATCTGCGACCGCAGGGCTTTTTAGGGCGCGCGTGGGGCAGGAAGTTAGcc > 7:983006/1‑148 (MQ=255) gaaaTCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTGGTAACAGGCGCAGATGGCGACGAACAGTGGTTTGATGGTTTGCCCTGGTATTTGACCGATCTCCGACCGCAGGGCTTTTTAGGGCGCGCGTGGGGCAGGAAGTTAGCCGCGCAACTGAATCTGACTGATGATATACGTCTCTGGCAGGAAGAAGATGTGCTCTACGCCCTGACCGTATTTAACGGTGAATATACTGGCGGTTGGTTGGTCGGGGAGGGGAATTATCAGCGATGGATTa < 2:428705/271‑1 (MQ=255) | GTATCTATTCACGAATCTATTCATTAATGAGCGAGCTGACTGATCTTTTACTGCAAGGGCCGCGTTCTGCCCCGGAATTGCGCCAGCGTCTGGCAATCAGTCAGGCGACGTTCTCACGCCTTGTTGCCAGAGAAGATCGGGTGATTCGCTTTGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCACTGCTGCGTCCTTATCGCGGAATTGAGCGTATTCCCGTCTGGCGGGTGGACGATACCGGAAAGGCGCATAAATTCGCCGACATCCGGTTGTGCTGGCCGCAGGGAAGTTGTCTGGTAACAGGCGCAGATGGCGACGAACAGTGGTTTGATGGTTTGCCCTGGTATTTGACCGATCTCCGACCGCAGGGCTTTTTAGGGCGCGCGTGGGGCAGGAAGTTAGCCGCGCAACTGAATCTGACTGATGATATACGTCTCTGGCAGGAAGAAGATGTGCTCTACGCCCTGACCGTATTTAACGGTGAATATACTGGCGGTTGGTTGGTCGGGGAGGGGAATTATCAGCGATGGATTA > NC_000913/4621743‑4622273 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |