Missing coverage evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
* | * | ÷ | NC_000913 | 583427 | 583846 | 420 | 48 [46] | [46] 50 | [appY] | [appY] |
GTTGGTTTTTTGTTAATTGAATGGTTCTAATAATGTTTTTTTACTGTTGTTGAATGTGACTTGATAAGAAATGCAAGTAAAAATGATACTCTTTTTATTTTAAATTCAAACGGTTGACATATATATAGCAAGAGGTTTCAGGTGCGTTGTAGTGAGTTTATGTTAATAAAAAGCATAGTAAGCGTTGAAAAATGTAACTTTGAAATAAGTTAGAATAAAAAACA > NC_000913/583294‑583517 | gTTGGTTTTTTGTTAATTGAATGGTTCTAATAATGTTTTTTTACTGTTGTTGAATGTGACTTGATAAGAAATGCAAGTAAAAATGATACTCTTTTTATTTTAAATTCAAACGGTTGACATATATATAGCAAGAGGTTTCAgg < 6:950606/142‑1 (MQ=255) gTTGGTTTTTTGTTAATTGAATGGTTCTAATAATGTTTTTTTACTGTTGTTGAATGTGACTTGATAAGAAATGCAAGTAAAAATGATACTCTTTTTATTTTAAATTCAAACGGTTGACATATATATAGCAAGAGGTTTCAgg > 5:950606/1‑142 (MQ=255) tGAATGGTTCTAATAATGTTTTTTTACTGTTGTTGAATGTGACTTGATAAGAAATGCAAGTAAAAATGATACTCTTTTTATTTTAAATTCAAACGGTTGACATATATATAGCAAGAGGTTTCAGGTGCGTTGTAGTGAGTTTATGTta > 7:551984/1‑148 (MQ=255) tgttgtTGAATGTGACTTGATAAGAAATGCAAGTAAAAATGATACTCTTTTTATTTTAAATTCAAACGGTTGACATATATATAGCAAGAGGTTTCAGGTGCGTTGTAGTGAGTTTATGTTAATAAAAAGCATAGTAAGCGTTGaaaaa < 8:551984/148‑1 (MQ=255) gttgttGAATGTGACTTGATAAGAAATGCAAGTAAATATGATACTCTTTTTATTTTAAATTCAAACGGTTGACATATATATAGCAAGAGGTTTCAg < 7:662954/96‑1 (MQ=255) gttgttGAATGTGACTTGATAAGAAATGCAAGTAAAAATGATACTCTTTTTATTTTAAATTCAAACGGTTGACATATATATAGCAAGAGGtt < 7:993586/92‑1 (MQ=255) gttgttGAATGTGACTTGATAAGAAATGCAAGTAAAAATGATACTCTTTTTATTTTAAATTCAAACGGTTGACATATATATAGCAAGAGGtt > 8:993586/1‑92 (MQ=255) gttgttGAATGTGACTTGATAAGAAATGCAAGTAAAAATGATACTCTTTTTATTTTAAATTCAAACGGTTGACATATATATAGCAAGAGGTTTCAGGTGCGTTGTAg > 5:504826/1‑107 (MQ=255) gttgttGAATGTGACTTGATAAGAAATGCAAGTAAAAATGATACTCTTTTTATTTTAAATTCAAACGGTTGACATATATATAGCAAGAGGTTTCAGGTGCGTTGTAg < 6:504826/107‑1 (MQ=255) gttgttGAATGTGACTTGATAAGAAATGCAAGTAAAAATAATACTCTTTTTATTTTAAATTCAAACGGTTGACATATATATAGCAAGAGGTTTCAg > 8:662954/1‑96 (MQ=255) tgttgAATGTGACTTGATAAGAAATGCAAGTAAAAATGATACTCTTTTTATTTTAAATTCAAACGGTTGACATATATATAGCAAGAGGTTTCAGGTGCGTTGTAGt < 8:402125/106‑1 (MQ=255) tgttgAATGTGACTTGATAAGAAATGCAAGTAAAAATGATACTCTTTTTATTTTAAATTCAAACGGTTGACATATATATAGCAAGAGGTTTCAGGTGCGTTGTAGt > 7:402125/1‑106 (MQ=255) tgAATGTGACTTGATAAGAAATGCAAGTAAAAATGATACTCTTTTTATTTTAAATTCAAACGGTTGACATATATATAGCAAGAGGTTTCAGGTGCGt > 7:884000/1‑97 (MQ=255) tgAATGTGACTTGATAAGAAATGCAAGTAAAAATGATACTCTTTTTATTTTAAATTCAAACGGTTGACATATATATAGCAAGAGGTTTCAGGTGCGt < 8:884000/97‑1 (MQ=255) aaTGTGACTTGATAAGAAATGCAAGTAAAAATGATACTCTTTTTATTTTAAATTCAAACGGTTGACATATATATAGCAaga < 8:122684/81‑1 (MQ=255) aaTGTGACTTGATAAGAAATGCAAGTAAAAATGATACTCTTTTTATTTTAAATTCAAACGGTTGACATATATATAGCAaga > 7:122684/1‑81 (MQ=255) tGATAAGAAATGCAAGTAAAAATGATACTCTTTTTATTTTAAATTCAAACGGTTGACATATATATAGCAAGAGGTTTCAGGTGCGt < 5:314662/86‑1 (MQ=255) tGATAAGAAATGCAAGTAAAAATGATACTCTTTTTATTTTAAATTCAAACGGTTGACATATATATAGCAAGAGGTTTCAGGTGCGt > 6:314662/1‑86 (MQ=255) tAAGAAATGCAAGTAAAAATGATACTCTTTTTATTTTAAATTCAAACGGTTGACATATATATAGCAAGAgg < 5:517825/71‑1 (MQ=255) tAAGAAATGCAAGTAAAAATGATACTCTTTTTATTTTAAATTCAAACGGTTGACATATATATAGCAAGAgg > 6:517825/1‑71 (MQ=255) gAAATGCAAGTAAAAATGATACTCTTTTTATTTTAAATTCAAACGGTTGACATATATATAGCAAGAGGTTTCAGGTGCGTTGTAGTGAGTTTATGTTAATAAAAAGCATAGTAAGCGTTGAAAAATGTa < 8:1059081/129‑1 (MQ=255) gAAATGCAAGTAAAAATGATACTCTTTTTATTTTAAATTCAAACGGTTGACATATATATAGCAAGAGGTTTCAGGTGCGTTGTAGTGAGTTTATGTTAATAAAAAGCATAGTAAGCGTTGAAAAATGTa > 7:1059081/1‑129 (MQ=255) ctTTTTATTTTAAATTCAAACGGTTGACATATATATAGCAAGAGGTTTCAGGTGCGTTGTAGTGAGttt > 5:54149/1‑69 (MQ=255) ctTTTTATTTTAAATTCAAACGGTTGACATATATATAGCAAGAGGTTTCAGGTGCGTTGTAGTGAGttt < 6:54149/69‑1 (MQ=255) tttaAATTCAAACGGTTGACATATATATAGCAAGAGGTTTCAGGTGCGTTGTAGTGAGTTTATGTTAATAAAAAGCATAGTAAGCGTTGAAAAATGTa > 6:631955/1‑98 (MQ=255) tttaAATTCAAACGGTTGACATATATATAGCAAGAGGTTTCAGGTGCGTTGTAGTGAGTTTATGTTAATAAAAAGCATAGTAAGCGTTGAAAAATGTa < 8:757868/98‑1 (MQ=255) tttaAATTCAAACGGTTGACATATATATAGCAAGAGGTTTCAGGTGCGTTGTAGTGAGTTTATGTTAATAAAAAGCATAGTAAGCGTTGAAAAATGTa < 5:631955/98‑1 (MQ=255) tttaAATTCAAACGGTTGACATATATATAGCAAGAGGTTTCAGGTGCGTTGTAGTGAGTTTATGTTAATAAAAAGCATAGTAAGCGTTGAAAAATGTa > 7:757868/1‑98 (MQ=255) ttaAATTCAAACGGTTGACATATATATAGCAAGAGGTTTCAGGTGCGTTGTAGTGAGTTTATGTtaat > 3:4856/1‑68 (MQ=255) aTTCAAACGGTTGACATATATATAGCAAGAGGTTTCAGGTGCGTTGTAGTGAGTTTATGTTAATaaaa < 1:4856/68‑1 (MQ=255) aCGGTTGACATATATATAGCAAGAGGTTTCAGGTGCGTTGTAGTGAGtt < 5:782519/49‑1 (MQ=255) aCGGTTGACATATATATAGCAAGAGGTTTCAGGTGCGTTGTAGCGAGtt > 6:782519/1‑49 (MQ=255) ttGACATATATATAGCAAGAGGTTTCAGGTGCGTTGTAGTGAGTTTATGTTAATAAAAAGCATAGTAAGCGt < 6:287728/72‑1 (MQ=255) ttGACATATATATAGCAAGAGGTTTCAGGTGCGTTGTAGTGAGTTTATGTTAATAAAAAGCATAGTAAGCGt > 5:287728/1‑72 (MQ=255) tGACATATATATAGCAAGAGGTTTCAGGTGCGTTGTAGTGAGTTTATGTTAATAAAAAGCATAGTAAGCGTTGAAAAATGTAACTTTGaa > 6:270339/1‑90 (MQ=255) tGACATATATATAGCAAGAGGTTTCAGGTGCGTTGTAGTGAGTTTATGTTAATAAAAAGCATAGTAAGCGTTGAAAAATGTAACTTTGaa < 5:270339/90‑1 (MQ=255) tatatataGCAAGAGGTTTCAGGTGCGTTGTAGTGAGTTTATGTTAATAAAAAGCATAGTAAGCGTTGAAAAATg < 5:465703/75‑1 (MQ=255) tatatataGCAAGAGGTTTCAGGTGCGTTGTAGTGAGTTTATGTTAATAAAAAGCATAGTAAGCGTTGAAAAATg > 6:465703/1‑75 (MQ=255) tatatataGCAAGAGGTTTCAGGTGCGTTGTAGTGAGTTTATGTTAATAAAAAGCATAGTAAGCGTTGAAAAATGTAACTTTGAAATAAGTTAGAATAAAAaaca < 7:324372/105‑1 (MQ=255) tatatataGCAAGAGGTTTCAGGTGCGTTGTAGTGAGTTTATGTTAATAAAAAGCATAGTAAGCGTTGAAAAATGTAACTTTGAAATAAGTTAGAATAAAAaaca > 8:324372/1‑105 (MQ=255) atataGCAAGAGGTTTCAGGTGCGTTGTAGTGAGTTTATGTTAATAAAAAGCATAGTAAGCg > 7:649565/1‑62 (MQ=255) atataGCAAGAGGTTTCAGGTGCGTTGTAGTGAGTTTATGTTAATAAAAAGCATAGTAAGCg < 8:649565/62‑1 (MQ=255) aGCAAGAGGTTTCAGGTGCGTTGTAGTGAGTTTATGTTAATAAAAAGCATAGTAAGc > 1:142613/1‑57 (MQ=255) gCAAGAGGTTTCAGGTGCGTTGTAGTGAGTTTATGTTAATAAAAAGCATAGTAAGCGTTGAAAAATGTAACTTTGAAATAAGTTAGaa < 8:243415/88‑1 (MQ=255) gCAAGAGGTTTCAGGTGCGTTGTAGTGAGTTTATGTTAATAAAAAGCATAGTAAGCGTTGAAAAATGTAACTTTGAAATAAGTTAGaa > 7:243415/1‑88 (MQ=255) agagGTTTCAGGTGCGTTGTAGTGAGTTTATGTTAATAAAAAGCATAGTAAGCGTTg < 3:142613/57‑1 (MQ=255) gagGTTTCAGGTGCGTTGTAGTGAGTTTATGTTAATAAAAAGCATAGTAAGCGTTGAAAAATGTAACTTTGAAATAAGTTAGa > 8:543668/1‑83 (MQ=255) gagGTTTCAGGTGCGTTGTAGTGAGTTTATGTTAATAAAAAGCATAGTAAGCGTTGAAAAATGTAACTTTGAAATAAGTTAGa < 7:543668/83‑1 (MQ=255) | GTTGGTTTTTTGTTAATTGAATGGTTCTAATAATGTTTTTTTACTGTTGTTGAATGTGACTTGATAAGAAATGCAAGTAAAAATGATACTCTTTTTATTTTAAATTCAAACGGTTGACATATATATAGCAAGAGGTTTCAGGTGCGTTGTAGTGAGTTTATGTTAATAAAAAGCATAGTAAGCGTTGAAAAATGTAACTTTGAAATAAGTTAGAATAAAAAACA > NC_000913/583294‑583517 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |