Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 892,441 | 0 | G | A | 5.3% | 243.7 / 3.1 | 75 | A159T (GCG→ACG) ‡ | rimK | ribosomal protein S6 modification protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (28/43); new base A (2/2); total (30/45) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.13e-01 |
GCCATTACCTTTTATGGGACGGCGGCACTGCGCCAGTTCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGTCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCATTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCG‑TCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAACGCGCATATTCTGGTGCAGGAATATATCAAAGAGGCGCAAGGGTGCGATATCCGCTGTCT‑GGTTGTTGGCGATGAAGTGGTCGCTGCGATTGAACGGCGGGCGAAAGAGGGCGATTTTCGTTCCAATTTGCATCGTGGCGGCGCGGCAAGCGTCGCCAGTATCACACCACAGGAGCGTGAAATCGCGATAAAAGCCGCGCGAACGATGGCGCTGGACGTTGCTGGTG > NC_000913/892168‑892705 | gCCATTGCCTTTTATGGGACGGCGGCACTGGGCCAGTTCGGGATGCTGGGGGGCTATCCGCTCAATGAGTCGGTCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCATTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCG‑TCAggc < 4:493872/275‑1 (MQ=255) gccttgttagggTCGGGGGCACTGGGGCAGGTCGAGGTGCAGGGGAGCTACTCCCGCAAGGAGTCTGCGGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCATTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCG‑TCAGGCGGCGGa < 4:15534/266‑1 (MQ=255) aCCTTTTATGGGACGGCGGCACTGCGCCAGTTCGCGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGCGCCGGTCGCCCTTCCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGCCATCGACCTGCCTGTCCCCGGCATTCCGCATTCGCCGCCTGATACCCGCGCGTCAATCGACCTGCTCGCTGGTTCGCCGCTGGTGGGCACTTTGGTTGAAGTAACGCTGGGTATTAGCCTCGGGCTGGCGGGGTGGCG‑TCCGGCGGCGGa > 4:99768/1‑275 (MQ=255) ccTTTTATGGGACGGCGGCACTGCGCCAGTTCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGTCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCATTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCG‑TCAGGCGGCGGaa < 2:318538/275‑1 (MQ=255) gTTCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGTCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCATTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTTCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCCGGGAATTGGCCGCGTGCTGGCGGGGAGCCG‑CACGGGGGGGGCAAGCGCGTTTTGCGCCTTCCGCGGTCTGa > 4:54805/1‑275 (MQ=255) tcggggtggtGGGGAGCTACCCGCCCAAGTGGTCGGGCGCCCTTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCGGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCATCCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCG‑TCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGaa < 4:527895/265‑1 (MQ=255) gggaTGCTGGTGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGTCGCCATTGCCCGGGGGGGTGGCAAATGGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCATTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGGTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCG‑TCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAAcg < 2:510761/272‑1 (MQ=255) 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ttgAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCG‑TCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAACGCGCATATTGTGGTGCAGGAatat < 8:844384/110‑1 (MQ=255) ttgAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCG‑TCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAACGCGCATATTCTGGTGCAGGAatat > 7:844384/1‑110 (MQ=255) aaGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCG‑TCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAACGCGCat > 8:816066/1‑89 (MQ=255) aaGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCG‑TCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAACGCGCat < 7:816066/89‑1 (MQ=255) cGCAGGTAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCG‑TCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTTACGCTTTCCGCGGTCTGAACGCGCATATTCTGGTGCAGGAATATATCAAATTGGCGCACGAGTGCGATATCCGCTGGCT‑GGTTGTTGGCGATGAATTCGCCGCTGCTCTTGACCGGCGGGCGAATTAGGGCGATTTTGGTTCCAATTTTCCTTGTGGCGGTTCTGCTGGCGTCGCCAGTCTCACACNNNATGGCCGTGACATcgccctcaaaacct > 3:143273/1‑262 (MQ=255) cGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCG‑TCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAACGCGCATATTCTGGTGCAGGAATATATCAAAGAGGCGCAAGGGTGCGATATCCGCTGTCT‑GGTTGTTGGCGATGAAGTGGTCGCTGCGATTGACCGGCGGGCGAAAGAGGGCGATTTTCGTTCCAATTTGCATCGTGGCGGCGCGGCCAGCGTCGCCAGTATCACACCACAGGAGCGTGAAATCGCGATAAAAGcc > 2:477572/1‑272 (MQ=255) aaTTGGCGTCGGGCTGGCGGAGAAGCG‑TCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTGCCGCGGTCTGAACGCGCATATTCTGGTGCAGGAATATATCAAAGAGGCGCAAGGGTGCGATATCCGCTGTCT‑GGTTGTTGGCGATGAAGTGGTCGCTGCGATTGAACGGCGGGCGAAAGAGGGCGATTTTCGTTCCAATTTGCATCGTGGCGGCGCGGCAAGCGTCGCCAGTATCACACCACAGGAGCGTGAAATCGCGATAAAAGCCGCGCGAACGa < 2:539307/275‑1 (MQ=255) aaTTGGCGGCGTGCTGGCGGGGACGCG‑TAAGGCGGCGGAAAGCGTGATTTACGCTTTCCGCGGTCTTAACGCGCATATTCTGGTGCAGGAATATATCAAAGAGGCGCAAGGGTGCGATATCCGCTGTCT‑GGTTGTTGGCGATGAAGTGGTCGCTGCGATTGAACGGCGGGCGAAAGAGGGCGATTTTCGTTCCAATTTGCATCGTGGCGGCGCGGCAAGCGTCGCCAGTATCACACCACAGGAGCGTGAAATCGCGATAAAAGCCGCGCGAACGa < 1:151499/275‑1 (MQ=255) gCTGGCGGAGACGCG‑TCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGaatg < 6:92923/59‑3 (MQ=255) gCTGGCGGAGACGCG‑TCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAAcg > 5:92923/1‑59 (MQ=255) aggcttggggcggcGGAAAGCGTGTTTGCCGCTTTCCGGGGTATGAACGCGCATATTCTGGTGCAGGAATATAACAAAGGGGCGCAAGGGTGCGATATCCGCTGTCT‑GGTTGTTGGCGATGAAGTGGTCGCTGCGATTGAACGGCGGGCGAAAGAGGGCGATTTTCGTTCCAATTTGCATCGTGGCGGCGCGGCAAGCGTCGCCAGTATCACACCACAGGAGCGTGAAATCGCGATAAAAGCCGCGCGAACGATGGCGCTGGACGTTGCTGgtg < 4:75295/266‑1 (MQ=255) | GCCATTACCTTTTATGGGACGGCGGCACTGCGCCAGTTCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGGTCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCATTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCG‑TCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAACGCGCATATTCTGGTGCAGGAATATATCAAAGAGGCGCAAGGGTGCGATATCCGCTGTCT‑GGTTGTTGGCGATGAAGTGGTCGCTGCGATTGAACGGCGGGCGAAAGAGGGCGATTTTCGTTCCAATTTGCATCGTGGCGGCGCGGCAAGCGTCGCCAGTATCACACCACAGGAGCGTGAAATCGCGATAAAAGCCGCGCGAACGATGGCGCTGGACGTTGCTGGTG > NC_000913/892168‑892705 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |