| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_000913 | 1,327,216 | A→G | 6.0% | D122G (GAT→GGT) | rluB → | 23S rRNA pseudouridine(2605) synthase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 1,327,216 | 0 | A | G | 6.0% | 733.7 / 22.8 | 221 | D122G (GAT→GGT) | rluB | 23S rRNA pseudouridine(2605) synthase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (103/104); new base G (6/8); total (109/112) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.84e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.59e-02 | |||||||||||
Only 100 of 227 total aligned reads displayed.
GTTGATGGCAAAATTGCTAAACTCGGCGATCGTGTTGAAGTTACCCCTGGATTGAAAATCCGTATCGATGGTCACCTGATTTCGGTACGTGAGTCCGCTGAACAAATTTGTCGCGTTCTGGCCTATTACAAACCGGAAGGTGAGTTGTGTACCCGTAACGATCCGGAAGGACGTCCAACGGTGTTTGACCGTCTGCCAAAACTGCGTGGCGCACGCTGGATTGCCGTGGGTCGCTTGGACGTTAATACCTGTGGTCTGCTGCTGTTCACCACCGATGGTGAACTG‑‑GCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAACGTGAATATGCCGTGCGTGTATTTGGTCAGGTTGACGACGCGAAACTGCGTGATTTGAGTCGTGGCGTGCAGTTGGAAGATGGTCCGGCAGCTTTTAAAACCATCAAGTTCAGCGGCGGCGAAGGGATCAACCAGTGGTACAACGTGACTCTGACCGAAGGCCGTAACCGTGAAGTTCGTCGTCTGTGGGAAGCGGTTGGTGTGCAGGTGAGCCGCCTGATCCGT > NC_000913/1326942‑1327487 | aaTTGCTAAACTCGGCGATCGTGTTGAAGTTACCCCTGGATTGAAAATCCGTATCGATGGTCACCTGATTTCGGTACGTGAGTCCGCTGAACAAATTTGTCGCGTTCTGGCCTATTACAAACCGGAAGGTGAGTTGTGTACCCGTAACGATCCGGAAGGACGTCCAACGGTGTTTGACCGTCTGCCAAAACTGCGTGGCGCACGCTGGATTGCCGTGGGTCGCTTGGACGTTAATACCTGTGGTCTGCTGCTGTTCACCACCGATGGTGAACTg > 2:262531/1‑274 (MQ=255) 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caccatCGGTGGTGAACTG‑‑GCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAACGTGAATATGCCGTGCGTGTATTTGGTCAGGTTGACGACGCGAAACTGCGTGATTTGAGTCGTGGCGTGCAGTTGGAAGATGGTCCGGCAGCt < 8:299229/148‑1 (MQ=255) accaccGATGGTGAACTG‑‑GCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAACg < 5:377013/56‑1 (MQ=255) ccatcGGTGGTGAACTG‑‑GCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAACGTGAATATGCCGTGCGTGTATTTGGTCAGGTTGACGACGCGAAACTGCGTGAt < 6:437980/107‑1 (MQ=255) ccaccGATGGTGAACTG‑‑GCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAACGTGAATATGCCGTGCGTGTATTTGGTCAGGTTGACGACGCGAAACTGCGTGATTTGAGTCGTGGCGTGCAGTTGGAAGATGGTCCGGCAGCTTTTAAAACCATCAAGTTCAGCGGCGGCGAAGGGATCAACCAGTGGTACAACGTGACTCTGACCGAAGGCCGTAACCGTGAAGTTCGTCGTCTGTGGGAAGCGGTTGGTGTGCAGGTGAGCCGCCTGATc > 2:387244/1‑275 (MQ=255) accGATGGTGAACTG‑‑GCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAACGTGAATATGCCGTGCGTGTATTTGGTCAGGTTGACGACGCGAAACTGCGTGATTTg < 7:200121/108‑1 (MQ=255) 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GTTGATGGCAAAATTGCTAAACTCGGCGATCGTGTTGAAGTTACCCCTGGATTGAAAATCCGTATCGATGGTCACCTGATTTCGGTACGTGAGTCCGCTGAACAAATTTGTCGCGTTCTGGCCTATTACAAACCGGAAGGTGAGTTGTGTACCCGTAACGATCCGGAAGGACGTCCAACGGTGTTTGACCGTCTGCCAAAACTGCGTGGCGCACGCTGGATTGCCGTGGGTCGCTTGGACGTTAATACCTGTGGTCTGCTGCTGTTCACCACCGATGGTGAACTG‑‑GCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAACGTGAATATGCCGTGCGTGTATTTGGTCAGGTTGACGACGCGAAACTGCGTGATTTGAGTCGTGGCGTGCAGTTGGAAGATGGTCCGGCAGCTTTTAAAACCATCAAGTTCAGCGGCGGCGAAGGGATCAACCAGTGGTACAACGTGACTCTGACCGAAGGCCGTAACCGTGAAGTTCGTCGTCTGTGGGAAGCGGTTGGTGTGCAGGTGAGCCGCCTGATCCGT > NC_000913/1326942‑1327487 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |