Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 1,572,928 | 0 | C | G | 5.9% | 602.0 / 20.2 | 173 | A759P (GCA→CCA) | pqqL | putative periplasmic M16 family zinc metalloendopeptidase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (86/75); new base G (5/5); total (92/81) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.92e-01 |
Only 100 of 173 total aligned reads displayed.
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(MQ=255) | TTTAGCCAGACGCTTAACCATCACTTCATTCGCTAACGTTAACAGTTCATCATGTCGTTCTGGTTGACAAGTAAAAGCCAGCAAATGACTGATATCTTTGGCCTGAGGATCAACCGAGAGGCGAGAAGAAACGCTGTATGCTCCAGATGCCTGTTCACGAATATTAACACGTAGATCTTTTGCCAGTGCGACGTTAAAAGCATCGAGCGCCATACGCGTCGGCAGATTAACAGGTGTCCGGGAATCATAACGCTTCCACTGTGAAACCTGTGCCACAGGTTCATTTTGTTCTTTTACAGTAACCGATGCGTTGTCCGTCGCGCGAGTTAATGGTTTACCTGCGGCTAATGGCGAATCAGAGTGTTTGATTGATCCTAAGTAACGCGTAATTAACGCCACGAGTTTGTCTTCTGCGACATTACCGACAATGACAAACGTGATATCCGCTGGAGATGAAAACAATTGGCGATCGGCAGCCAGCGCATCTGCGGCAGTAAACTGTGCAATCTGATTTTCTTGCAGTAATTTCGTGCGGTCATCAGCAT > NC_000913/1572656‑1573200 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |