| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,891,842 | C→T | 8.9% | G465D (GGT→GAT) ‡ | yoaA ← | putative ATP‑dependent helicase, DinG family |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,891,842 | 0 | C | T | 8.9% | 533.4 / 34.4 | 179 | G465D (GGT→GAT) ‡ | yoaA | putative ATP‑dependent helicase, DinG family |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (87/76); new base T (9/7); total (96/83) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.38e-03 | |||||||||||
Only 100 of 182 total aligned reads displayed.
GTGGATCATCCGGCGAGGTAAACGGCAATTTGTCGATAATTACCAATGACAATGTATCGCCACGCACGTCCACCCCTTCCCAGAAACTGCTGGTTGCCACAAGAAGCGCATTACCGGCGCTGACAAATTGCTGCAACAGTTGCCCTTTGCTGGTTTCCCCCTGCAACAATACAGGAAGCGTCATGGTAGCGCGGAACTGCTCGGCCAGATCGCGCATCATGGCGTGCGAGGTACAAAGCATAAAACAACGACCGTTGTTAGCTTCGATGATCGGTCGCAGCATTGCCGCTAACTGGCGAGCAGAACCTGGCTGGTTGGTTTGCGGCAGATTGCGCAGCACACA‑GAGTAACGCCTGGCGGCTGTAATCAAATGGGCTGGGCAACAGCAACGACTCGGCCTGTTCGATGCCAAGCCGCGAGGTGAAATGATGCAGATCGTCGTTCACCGACAGCGTTGCTGAGGTGAAGATCCAGCTACCGGGTTTTTGCGCCATTAACTCTTTGAATTTATCCGCCACGCTGAGCG > NC_000913/1891591‑1892115 | ggCGAGGTAAACGGCAATTTGTCGATAATTACCAATGACAATGTATCGCCACGCACGTCCACCCCTTCCCAGAAACTGCTGGTTGCCACAAGAAGCGCATTACCGGCGCTGACAAATTGCTGCAACAGTTGCCCTTTGCTGGTTTCCCCCTGCAACAATACAGGAAGCGTCATGGTAGCGCGGAACTGCTCGGCCAGATCTCGCATCATGGCGTGCGAGGTACAAAGCATAAAACAACGACCGTTGTTAGCTTCGATGATCGGTCGCAGCATTg > 2:336628/1‑274 (MQ=255) cAATTTGTCGAGAATTCCCAATGACAAATGATCGCCCCGCACGACCGCCCCTTCCCAGAATCTGTTGGTTGCCACACGAAGTGCATTACCGGCGGTGACAACTTGCTGCAACAGTTGCCGTTTGCTGGTTTCCCCATGCAACAATATAGGAAGGGTAATGGTAGCGGGGAACTGCGCGGCCGGATCGGGCATCATGGCGTGCGAGGTACAAAGCATAGAACAACGACCGTTGTTAGCTTCGATGTTCGGTCGCAGCATTGCCGCTAACTGGCGAg < 4:164329/275‑1 (MQ=255) aTTTCTAGATAAATACCAATTACAATGNNCCGCCCCTACCGTCCACCCCTTCCCAGAAANTGCCGGTTGCCACAAGAAGCGCATTACCCTCGCTGACAAATTGCTGCAACAGTTGCCCTTTGCTGGTTTCCCCCNGCAACAATACAGGAAGCGTCATGGTAGCGCGGAACTGCTCGGCCAGATCGCGCATCATGGCGTGCGAGGTACAAAGCATAAAACAACGACCGTTGTTAGCTTCGATGATCGGTCGCAGCATTGCCGCTAACTGGCGAg < 3:76834/273‑1 (MQ=255) aaTGTATCGCCACGCACGTCCACCCCTTCCCAGAAACTGCTGGTTGCCACAAGAAGCGCATTACCGGCGCTGACAAATTGCTGCAACAGTTGCCCTTTGCTGGTTTCCCCCTGCAACAATACAGGAAGCGTCATGGTAGTGCGGAACTGCTCGGCCAGATCGCGCATCATGGCGTGCGAGGTACAAAGCATAAAACAACGACCGTTGCTAGCTTCGATGAACGGTCGCAGCATTGCCGCTAACTGGCGAGCAGAACCTGGCTGGTTGGTTTGCg > 2:455091/1‑274 (MQ=255) cGCCACGCACGTCCACCCCTTCCCAGAAACTGCTGGTTGCCACAAGAAGCGCATTACCGGCGCTGACAAATTGCTGCAACAGTTGCCCTTTGCTGGTTTCCCCCTGCAACAATACAGGAAGCGTCATGGTAGCGCGGAACTGCTCGGCCAGATCGCGCATCATGGCGTGCGAGGTACAAAGCATAAAACAACGACCGTTGTTAGCTTCGATGATCGGTCGCAGCATTGCCGCTAACTGGCGAGCAGAACCTGGCTGGTTGGTTTGCGGCAGATTg > 2:48539/1‑275 (MQ=255) cacgTCCACCCCTTCCCAGAAACTGCTGGTTGCCACAAGAAGCGCATTACCGGCGCTGACAAATTGCTGCAACAGTTGCCCTTTGCTGGTTTCCCCCTGCAACAATCCAGGAAGCGTCATGGTAGCGCGGAACTGCTCGGCCAGATCGCGCATCATGGCGTGCGAGGTACAAAGCATAAAACAACGACCGTTGTTAGCTTCGATGATCGGTCGCAGCATTGCCGCTAACTGGCGAGCAGAACCTGGCTGGTTGGTTTTCGGCAGATTGCgtagc > 2:362880/1‑274 (MQ=255) cgTCCACCCCTTCCCAGAACCTGCTGTGTGCCACAAGATGCGCATTTCCGGCGCTGACAAATTGCTGCAACAGTTGCCCGTTTCTGTTTTCCCCCTGCAACAATACAGGAAGCGTCATGGTAGCGCGGAACTGCTCTGCCAGATCGCGCATTATGGCGTGCGAGGTACAAAGCATAAAACAACGACCGTTGTTAGCTTCGATGATCGGTCGCAGCATTGCCGCTAACTGGCGAGCAGAACCTGGCTGGTTGGTTTGCGGCAGATTGCGCAGcaca < 1:77055/275‑1 (MQ=255) aCCCCTTCCCAGAAACTGCTGGTTGCCACAAGAAGCGCATTACCGGCGCTGACAAATTGCTGCAACAGTTGCCCTTTGCTGGTTTCCCCCTGCAACAATACAGGAAGCGTCATGGTAGCGCGGAACTGCTCGGCCAGATCGCGCATCATGGCGTGCGAGGTACAAAGCATAAAACAACGACCGTTGTTAGCTTCGATGATCGGTCGCAGCATTGCCGCTAACTGGCGAGCAGAACCTGGCTGGTTGGTTTGCGGCAGATTGCGCAGCACACa‑gag < 2:200187/275‑1 (MQ=255) cTTCCCAGAAACTGCTGGTTGCCACAAGAAGCGCATTACCGGCGCTGACAAATTGCTGCAACAGTTGCCCTTTGCTGGTTTCCCCCTGCAACAATACAGGAAGCGTCATGGTAGCGCGGAACTGCTCGGCCAGATCGCGCATCATGGCGTGCGAGGTACAAAGCATAAAACAACGACCGTTGTTAGCTTCGATGATCGGTCGCAGCATTGCCGCTAACTGGCGAGCAGAACCTGGCTGGTTGGTTTGCGGCAGATTGCGCAGCACACA‑CAGTAAc > 2:171536/1‑275 (MQ=255) tCCCAGAAACTGCTGGTTGCCACAAGAAGCGCATTACCGGCGCTGACAAATTGCTGCAACAGTTGCCCTTTGCTGGTTTCCCCCTGCAACAATACAGGAAGCGTCATGGTAGCGCGGAACTGCTCGGCCAGATCGCGCATCATGGCGTGCGAGGTACAAAGCATAAAACAACGACCGTTGTTAGCTTCGATGATCGGTCGCAGCATTGCCGCTAACTGGCGAGCAGACCCTGGCGGGTTGGTTTTCGGCAGATTGCGCACCACACA‑GAGTAAcc > 4:168116/1‑273 (MQ=255) ctgGTTGCCACAAGAAGAGCATTACCGGCGCTGACAAATTGCTGCAACAGTTGCCCTTTGCTGGTTTCCCCCTGCAACAATACAGGAAGCGTCATGGTAGCGCGGAACTGCTCGGCCAGATCGCGCATCATGGCGTGCGAGGTACAAAGCATAAAACAACGACCGTTGTTAGCTTCGATGATCGGTCGCAGCATTGCCGCTAACGGGCGAGCAGAACCTGGCTGGTTGGTTTGCGGCAGATTGCGCAGCACACA‑GAGTAACGCCTGGCGGCTGTa < 2:211868/275‑1 (MQ=255) cacaAGAAGCGCATTACCGGCGCTGACAAATTGCTGCAACAGTTGCCCTTTGCTGGTTTCCCCCTGCAACAATACAGGAAGCGTCATGGTAGCGCGGAACTGCTCGGCCAGATCGCGCATCATGGCGTGCGAGGTACAAAGCATAAAACAACGACCGTTGTTAGCTTCGATGATCGGTCGCAGCATTGCCGCTAACTGGCGAACCGAACCTGGCTGGTTGGGTTGCGGCCGTTTGCGCAGCACCCA‑ACGTAACGCCTGGCGGCTGTataccagtg > 4:248937/1‑267 (MQ=255) gaagCGCATTACCGGCGCTGACAAATTGCTGCAACAGTTGCCCTTTGCTGGTTTCCCCCTGCAACAATACAGGAAGCGTCATGGTAGCGCGGAACTGCTCGGCCAGATCGCGCATCATGGCGTGCGAGGTACAAAGCATAAAACAACGACCGTTGTTAGCTTCGATGATCGGTCGCAGCATTGCCGCTAACTGGCGAGCAGAACCTGGCTGGTTGGTTGGCGGAAGATTGCGCGGCAAACA‑GAGTAACGCCTGGCGGCTGTATTCAATtgggct > 2:86791/1‑274 (MQ=255) gaagCGCATTACCGGCGCTGACAAATTGCTGCAACAGTTGCCCTTTGCTGGTTTCCCCCTGCAACAATACAGGAAGCGTCATGGTAGCGCGGAACTGCTCGGCCAGATCGCGCATCATGGCGTGCGAGGTACAAAGCATAAAACAACGACCGTTGTTAGCTTCGATGATCGGTCGCAGCATTGCCGCTAACTGGCGAGCAGAACCGGGCTGGTTGGTTTGGGGCAGTGTGCCTAGC‑CACACGAGTAACCCCTGGCGGCGTTGATCAAAtgggcc > 4:4357/1‑273 (MQ=255) agCGCATTACCGGCGCTGACAAATTGCTGCAACAGTTGCCCTTTGCTGGTTTCCCCCTGCAACAATACAGGAAGCGTCATGGTAGCGCGGAACTGCTCGGCCAGATCGCGCATCATGGCGTGCGAGGTACAAAGCATAAAACAACGAc < 7:997570/148‑1 (MQ=255) ttACCGGCGCTGACAAATTGCTGCAACAGTTGCCCTTTGCTGGTTTCCCCCTGCAACAATACAGGAAGCGTCATGGTAGCGCGGAACTGCTCGGCCAGATCGCGCATCATGGCGTGCGAGGTACAAAGCATAAAACAACGACCgttg > 5:679511/1‑147 (MQ=255) ttACCGGCGCTGACAAATTGCTGCAACAGTTGCCCTTTGCTGGTTTCCCCCTGCAACAATACAGGAAGCGTCATGGTAGCGCGGAACTGCTCGGCCAGATCGCGCATCATGGCGTGCGAGGTACAAAGCATAAAACAACGACCgttg < 6:679511/147‑1 (MQ=255) gcgcTGACAAATTGCTGCAACAGTTGCCCTTTGCTGGTTTCCCCCTGCAACAATACAGGAAGCGTCATGGTAGCGCGGAACTGCTCGGCCAGATCGCGCATCATGGCGTGCGAGGTACAAAGCATAAAACAACGACCGTTGTTAGCTTCGATGATCGGTCGCAGCATTGCCGCTAACTGGCGAGCAGAACCTGGCTGGTTGGTTTGCGGCAGATTGCGCAGCACACA‑GAGTAACGCCTGGCGGCTGTAATCAAATGGGCTGGGCAACAGCAACGa > 2:81686/1‑275 (MQ=255) cTGACAAATTGCTGCAACAGTTGCCCTTTGCTGGTTTCCCCCTGCAACAATACAGGAAGCGTCATGGTAGCGCGGAACTGCTCGGCCAGATCGCGCATCATGGCGTGCGAGGTACAAAGCATAAAACAACGAc < 7:240309/133‑1 (MQ=255) ttGCTGCAACAGTTGCCCTTTGCTGGTTTCCCCCTGCAACAATACAGGAAGCGTCATGGTAGCGCGGAACTGCTCGGCCAGATCGCGCATCATGGCGTGCGAGGCACAAAGCATAAAACAACGACCGTTGTTAGCTTCGATGATCGGTCGCAGCATTGCCGCTAACTGGCGAGCAGAACCTGGCTGGTTGGTTTCGGGCAGGTTGCGCAGCACCAA‑GAGTAACGCCCGGCGGCGGTaa > 4:264366/1‑238 (MQ=255) ttGCCCTTTGCTGGTTTCCCCCTGCAACAATACAGGAAGCGTCATGGTAGCGCGGAACTGCTCGGCCAGATCGCGCATCATGGCGTGCGAGGTACAAAGCATAAAACAACGACCGTTGTTAGCTTCGATGATCGGTCGCAGCATTGCCGCTAACTGGCGAGCAGAACCTGGCTGGTTGGTTTGCGGCAGATTGCGCAGCACACA‑GAGTAACGCCTGGCGGCTGTAATCAAATGGGCTGGGCAACAGCAACGACTCGGCCTGTTCGATGCCAAGcc > 2:287645/1‑275 (MQ=255) ggCCCTTTGCTGTTTTCCCCCTGCAACAATACAGGAAGCGTCATGGTAGCGCGGAACTGCTCGGCCAGATCGCGCATCATGGCGTGCGAGGTACAAAGCATAAAACAACGACCGTTGTTAGCTTCGATGATCGGTCGCAGCATTGCCGCTAACTGGCGAGCAGAACCTGGCTGGTTGGTTTGCGGCAGATTGCGCAGCACACA‑GAGTAACGCCTGGCGGCTGTAATCAAATGGGCTGGGCAACAGCAACGACTCGGCCTGTTCGATGCCAAGCcg < 1:98668/274‑1 (MQ=255) cccTTTGCGGGTTACCCCCGGCAACAATACAGGAAGCGTCATGGTCGCGCGGAACTGCCCGGCCAGATCGCGCATCATGGCGTGCGAGGTACAAAGCATAAAACAACGACCGTTGTTAGCTTCGATGATCGGTCGCAGCATTGCCGCTAACTGGCGAGCAGAACCTGGCTGGTTGGTTTGCGGCAGATTGCGCAGCACACA‑GAGTAACGCCTGGCGGCTGTAATCAAATGGGCTGGGCAACAGCAACGACTCGGCCTGTTCGATGCCAAGCcgcg < 2:499559/275‑1 (MQ=255) ccTTTGCTGGTTTCCCCCTGCAACAATACAGGAAGCGTCATGGTAGCGCGGAACTGCTCGGCCAGATCGCGCATCATGGCGTGCGAGGTACAAAGCATAAAACAACGGTCgttgtttt < 8:1117715/118‑3 (MQ=255) ccTTTGCTGGTTTCCCCCTGCAACAATACAGGAAGCGTCATGGTAGCGCGGAACTGCTCGGCCAGATCGCGCATCATGGCGTGCGAGGTACAAAGCATAAAACAACGGTCgttgtttt > 7:1117715/1‑116 (MQ=255) ccTTTGCTGGTTTCCCCCTGCAACAATACAGGAAGCGTCATGGTAGCGCGGAACTGCTCGGCCAGATCGCGCATCATGGCGTGCGAGGTACAAAGCATAAAACAACGACCGTTGTTAGCTTCga < 6:257328/124‑1 (MQ=255) ccTTTGCTGGTTTCCCCCTGCAACAATACAGGAAGCGTCATGGTAGCGCGGAACTGCTCGGCCAGATCGCGCATCATGGCGTGCGAGGTACAAAGCATAAAACAACGACCGTTGTTAGCTTCga > 5:257328/1‑124 (MQ=255) cTTTGCTGGTTTCCCCCTGCAACAATACAGGAAGCGTCATGGTAGCGCGGAACTGCTCGGCCAGATCGCGCATCATGGCGTGCGAGGTACAAAGCATAAAACAACGACCGTTGTTAGCTTCGATGATCGGTCGCAGCATTGCCGCTaa > 6:388604/1‑148 (MQ=255) ttGCTGGTTTCCCCCTGCAACAATACAGGAAGCGTCATGGTAGCGCGGAACTGCTCGGCCAGATCGCGCATCATGGCGTGCGAGGTACAAAGCATAAAACAACGGTCgttgtttta > 6:50761/1‑113 (MQ=255) gCTGGTTTCCCCCTGCAACAATACAGGAAGCGTCATGGTAGCGCGGAACTGCTCGGCCAGATCGCGCATCATGGCGTGCGAGGTACAAAGCATAAAACAACGACCGTTGTTAGCtt < 6:314867/116‑1 (MQ=255) gCTGGTTTCCCCCTGCAACAATACAGGAAGCGTCATGGTAGCGCGGAACTGCTCGGCCAGATCGCGCATCATGGCGTGCGAGGTACAAAGCATAAAACAACGACCGTTGTTAGCtt > 5:314867/1‑116 (MQ=255) cTGGTTTCCCCCTGCAACAATACAGGAAGCGTCATGGAAGCGCGAAACTGCTCGGCCAGGTCGCGCATCATGGCGTGCGAGGTACAAAGCATAAAACAACGACCGTTGTTAGCTTCGATGATCGGTCGCAGCATTGCCGCTAACTGGCGAGCAGAACCTGGCTGGTTGGTTTGCGGCAGATTGCGCAGCACACA‑GAGTAACGCCTGGCGGCTGTAATCAAATGGGCTGGGCAACAGCAACGACTCGGCCTGTTCGATGCCAAGCCGCGAGGTGaa < 2:408163/275‑1 (MQ=255) tGGTTTCCCCCTGCAACAATACAGGAAGCGTCATGGTAGCGCGGAACTGCTCGGCCAGATCGCGCATCATGGCGTGCGAGTTACAAAGCATAAAACAACGACCGTTGTTAGCTTCGATGATCGGTCGCAGCATTGCCGCTAACTGGCGAGCAGAACCTGGCTGGTTGGTTTGCGGCAGATTGCGCAGCACACA‑GAGTAACGCCTGGCGGCTGTAATCAAATGGGCTGGGCAACAGCAACGACTCGGCCTGTTCGATGCCAAGCCGCGAGGTGaaa < 4:98118/275‑1 (MQ=255) ggTTTCCCCCTGCAACAATACAGGAAGCGTCATGGTAGCGCGGAACTGCTCGGCCAGATCGCGCATCATGGCGTGCGAGGTACAAAGCATAAAACAACGACCGTTGTTAGCTTCGATGATCGGTCGCAGCATTGCCGCTAACTGGCGa > 5:932426/1‑148 (MQ=255) tttCCCCCTGCAACAATACAGGAAGCGTCATGGTAGCGCGGAACTGCTCGGCCAGATCGCGCATCATGGCGTGCGAGGTACAAAGCATAAAACAACGACCGTTGTTAGCTTCgatgat > 8:311302/1‑118 (MQ=255) ttCCCCCTGCAACAATACAGGAAGCGTCATGGTAGCGCGGAACTGCTCGGCCAGATCGCGCATCATGGCGTGCGAGGTACAAAGCATAAAACAACGACCGTTGTTAGCTTCGATGATCGGTCGCAGCATTGCCGCTAACTgg < 5:623512/142‑1 (MQ=255) ttCCCCCTGCAACAATACAGGAAGCGTCATGGTAGCGCGGAACTGCTCGGCCAGATCGCGCATCATGGCGTGCGAGGTACAAAGCATAAAACAACGACCGTTGTTAGCTTCGATGATCGGTCGCAGCATTGCCGCTAACTgg > 6:623512/1‑142 (MQ=255) cccccTGCAACAATACAGGAAGCGTCATGGTAGCGCGGAACTGCTCGGCCAGCTCGCGCATCATGGCGTGCGAGGTACAAAGCATAAAACAACGACCGTTGTTAGCTGCGATGATCGGTCGCAGCATTGCCGCTAACTGGCGAGCAGACCCTGGCTGGTTGGTTTGCGGCAGATTGCGCAGCACACA‑GAGTAACGCCTGGCGGCTGTAATCAAATGGGCTGGGCAACAGCAACGACTCGGCCTGTTCGATGCCAAGCCGCGAGGTGAAatg < 2:537184/271‑1 (MQ=255) ccTGCAACAATACAGGAAGCGTCATGGTAGCGCGGAACTGCTCGGCCAGATCGCGCATCATGGCGTGCGAGGTACAAAGCATAAAACAACGACCGTTGTTAGCTTCGATGATCGGTCGCAGCATTGCCGCTAACTGGCGAGCAGAAcc > 5:126618/1‑148 (MQ=255) gCAACAATACAGGAAGCGTCATGGTAGCGCGGAACTGCTCGGCCAGATCGCGCATCATGGCGTGCGAGGTACAAAGCATAAAACAACGACCGTTGTTAGCTTCGATGATCGGTCGCAGCATTGCCGCTAACTGGCGAGCAGAACCTGGCTGGTTGGTTTGCGGCAGATTGCGCAGCACACA‑GAGTAACGCCTGGCGGCTGTAATCAAATGGGCTGGGCAACAGCAACGACTCGGCCTGTTCGATGCCAAGCCGGGGGGTGAACTGATGCAGAtcg > 4:126905/1‑275 (MQ=255) gaaaaTACAGGAAGGTGCATGGTAGCGCGGAATTGCTCGGCCAGATCGCGCACCATGGCGTGCGAGGTAAAAAGCATAAAACAACGACCGTTGTTAGCTTCGATGATCGGTCGCAGCATTGCCGCTAACTGGCGAGCAGAACCGGGCTGGTTGGTTTGCGGCAGATTGCGCAGCACACA‑GAGTAACGCCTGGCGGCTGTAATCAAATGGGCTGGGCAACAGCAACGACTCGGCCTGTTCGATGCCAAGCCGCGAGGTGAAATGATGCAGAtcgt < 4:464259/271‑1 (MQ=255) aaTACAGGAAGCGTCATGGTAGCGCGGAACTGCTCGGCCAGATCGCGCATCATGGCGTGCGAGGTACAAAGCATAAAACAACGACCGTTGTTAGCTTCGATGATCGGTCGCAGCATTGCCGCTAACTGGCGAGCAGAACCTGGCtggt < 5:388604/148‑1 (MQ=255) aTACAGGAAGCGTCATGGTAGCGCGGAACTGCTCGGCCAGATCGCGCATCATGGCGTGCGAGGTACAAAGCATAAAACAACGACCgttgt < 6:771620/90‑1 (MQ=255) tACAGGAAGCGTCATGGTAGCGCGGAACTGCTCGGCCAGATCGCGCATCATGGCGTGCGAGGTACAAAGCATAAAACAACGGTCgttgtt < 7:28917/90‑1 (MQ=255) cAGGAAGCGTCATGGTAGCGCGGAACTGCTCGGCCAGATCGCGCATCATGGCGTGCGAGGTACAAAGCATAAAACAACGACCGTTGTTAGCTTCGATGATCGGTCGCAGCATTGCCGCTCACTGGCGAGCAGAACCTGGCTGGTTGGTTTGCGGCAGATTGCGGCGCACACA‑GAGTAACGCCTGGCGGCTGTAATCAAATGGGCTGGGCACCGACAACCACTCGGCCCGTTCGATGCCCAGCCGCGAGGGGAAACGATGCAGAACGGCGTGCAcc > 4:487061/1‑275 (MQ=255) cAGGAAGCGTCATGGTAGCGCGGAACTGCTCGGCCAGATCGCGCATCATGGCGTGCGAGGTACAAAGCATAAAACAACGACCGTTGTTAGCTTCGATGATCGGTCGCAGCATTGCCGCTAACTGGCGAGCAGAACCTGGCTGGTTGGTTTGCGGCAGATTGCGCAGCCCACA‑GAGTAACGCCTGGCGGCTGTAATCAAATGGGCTGGGCAACAGCAACGACTCGGCCTGTTCGATCCCAAGCCGCGCGGTGAACTGATGCAGATCGTCGttaccc > 2:384025/1‑271 (MQ=255) cAGGAAGCGTCATGGTAGCGCGGAACTGCTCGGCCAGATCGCGCATCATGGCGTGCGAGGTACAAAGCATAAAACAACGACCGTTGTTAGCTTCGATGATCGGTCGCAGCATTGCCGCTAACTGGCGAGCAGAACCTGGCTGGTTGGTTTGCGGCAGATTGCGCAGCACACA‑GAGTAACGCCTGGCGGCTGTAATCAAATGGGCTGGGCAACAGCAACGACTCGGCCTGTTCGATGCCAAGCCGCGAGGTGAAATGATGCAGATCGTCGTTCAcc > 2:261788/1‑275 (MQ=255) aGGAAGCGTCATGGTAGCGCGGAACTGCTCGGCCAGATCGCGCATCATGGCGTGCGAGGTACAAAGCATAAAACAACGACCGTTGTTAGCTTCGATGATCGGTCGCAGCATTGCCGCTAACTGGCGAGCAGAACCTGGCtggt > 6:1113057/1‑143 (MQ=255) ggAAGCGTCATGGTAGCGCGGAACTGCTCGGCCAGATCGCGCATCATGGCGTGCGAGGTACAAAGCATAAAACAACGACCGTTGTTAGCTTCGATGATCGGTCGCAGCATTGCCGCTAACTGGCGAGCAGAACCTGGCTGGTTGGttt < 6:805635/148‑1 (MQ=255) gAAGCGTCATGGTAGCGCGGAACTGCTCGGCCAGATCGCGCATCATGGCGTGCGAGGTACAAAGCATAAAACAACGACCGTTGTTAGCTTCGATGATCGGTCgc < 5:802852/104‑1 (MQ=255) gAAGCGTCATGGTAGCGCGGAACTGCTCGGCCAGATCGCGCATCATGGCGTGCGAGGTACAAAGCATAAAACAACGACCGTTGTTAGCTTCGATGATCGGTCgc > 6:802852/1‑104 (MQ=255) gAAGCGTCATGGTAGCGCGGAACTGCTCGGCCAGATCGCGCATCATGGCGTGCGAGGTACAAAGCATAAAACAACGACCGTTGTTAGCTTCGATGATCGGTCGCAGCATTGCCGCTAACTGGCGAGCAGAACCTGGCTGGTTGGTTTg < 6:428007/148‑1 (MQ=255) gAAGCGTCATGGTAGCGCGGAACTGCTCGGCCAGATCGCGCATCATGGCGTGCGAGGTACAAAGCATAAAACAACGACCGTTGTTAGCTTCGATGATCGGTCGCAGCATTGCCGCTAACTGGCGAGCAGAACCTGGCTGGTTGGTTTGCGGCAGATTGCGCAGCACACA‑GAGTAACGCCTGGCGGCTGTAATCAAAtgggct > 4:74873/1‑202 (MQ=255) aaGCGTCATGGTAGCGCGGAACTGCTCGGCCAGATCGCGCATCATGGCGTGCGAGGTACAAAGCATAAAACAACGACCGTTGTTAGCTTCGATGATCGGTCGCAGCATTGCCGCTAACTGGCGAGCAGAACCTGGCTGGTTGGTTTg > 5:484108/1‑147 (MQ=255) aGCGTCATGGTAGCGCGGAACTGCTCGGCCAGATCGCGCATCATGGCGTGCGAGGTACAAAGCATAAAACAACGACCGTTGTTAGCTTCGCTGATCGGTCGCAGCATTGCCGCTAACTGGCGAGCAGAACCTGGCTGGTAGGTTTGCGGCAGATTGCGCAGCACACA‑GAGTAACGCCTGGCGGCTGTAATCAAATGGGCTGGGCAACAGCAACGACTCGGCCTGGTCGCTGCCAAGCCGCGAGGTGAACTGATGCAGATCGTCGTTCACCGAcc > 2:464260/1‑273 (MQ=255) tCATGGTAGCGCGGAACTGCTCGGCCAGATCGCGCATCATGGCGTGCGAGGTACAAAGCATAAAACAACGGTCgttgtttta < 5:752452/82‑4 (MQ=255) tCATGGTAGCGCGGAACTGCTCGGCCAGATCGCGCATCATGGCGTGCGAGGTACAAAGCATAAAACAACGACCGTTGTTAGCTTCGATGATCGGTCGCAGCATTGCCGCTAACTGGCGAGCAGAAc > 6:898139/1‑126 (MQ=255) tCATGGTAGCGCGGAACTGCTCGGCCAGATCGCGCATCATGGCGTGCGAGGTACAAAGCATAAAACAACGACCGTTGTTAGCTTCGATGATCGGTCGCAGCATTGCCGCTAACTGGCGAGCAGAACCTGGCtggt < 8:296107/135‑1 (MQ=255) tCATGGTAGCGCGGAACTGCTCGGCCAGATCGCGCATCATGGCGTGCGAGGTACAAAGCATAAAACAACGACCGTTGTTAGCTTCGATGATCGGTCGCAGCATTGCCGCTAACTGGCGAGCAGAACCTGGCTGGTTGGTTTTCGGCAGATTGCGCAGCACACA‑GAGTAACGCCTGGCGGCTGGAATCAAATGGGCTGGGCAACAGCAACGACTCGGCCTGTTCGATGCCAACCCGGCGGGTGAAATGATGCAGATCGGCGTTCACCGACAGCGtg > 4:348447/1‑274 (MQ=255) tCATGGTAGCGCGGAACTGCTCGGCCAGATCGCGCATCATGGCGTGCGAGGTACAAAGCATAAAACAACGACCGTTGTTAGCTTCGATGATCGGTCGCAGCATTGCCGCTAACTGGCGAGCAGAACCTGGCTGGTTGGTTTGCGGCAGATTGCGCAGCACACA‑GAGTAACGCCTg > 4:71142/1‑175 (MQ=255) ggTAGCGCGGAACTGCTCGGCCAGATCGCGCATCATGGCGTGCGAGGTACAAAGCATAAAACAACGACCGTTGTTAGCTTCGATGATCGGTCGCAGCATTGCCGCTAACTGGCGAGCAGAACCTGGCTGGTTGGTTTGCGGCAGATTGCGCAGCACACA‑GAGTAACGCCTggcgg < 2:71143/175‑1 (MQ=255) acggCTCAGCCAGATCGGGCATCATGGCGGTGGAGGTACAAAGCAAAAAACAACGACCGTTGTTAGCTTCGATGATCGGTCGCAGCATTGCCGCTAACTGGCGGGCAGAACCTGGCTGGTTGGTTTGCGGCAGATTGCGCAGCACACA‑GAGGAACGCCTGGCGGCTGTAATCAAATGGGCTGGGCAACAGCAACGACTCGGCCTGTTCGATGCCAAGCCGCGAGGTGAAATGATGCAGATCGTCGTTCACCGACAGCGTTGCTGAGGTGAAGATc < 4:336627/272‑1 (MQ=255) aCTGCTCGGCCAGATCGCGCATCATGGCGTGCGAGGTACAAAGCATAAAACAACGACCGTTGTTAGCTTCGATGATCGGTCGCAGCATTGCCGCTAACTGGCGAGCAGAACCTGGCTGGTTGGTTTGCGGCAGATTGCGCAGCACACA‑GAGTAACGCCTGGCGGCTGTAATCAAATGGGCTGGGCAACAGCAACGACTCGGCCTGTTCGATGCCAAGCCGCGAGGTGAAATGATGCAGATCGTCGTTCACCGACAGCGTTGCTGAGGTGAAGATc < 4:287644/275‑1 (MQ=255) tCGGCCAGATCGCGCATCATGGCGTGCGAGGTACAAAGCATAAAACAACGACCGTTGTTAGCTTCGATGATCGGTCGCAGCATTGCCGCTAACTGGCGAGCAGAACCTGGCTGGTTGGTTTGCGGCAGATTGCGCAGCACACA‑GAGTa > 8:191134/1‑148 (MQ=255) ccAGATCGCGCATCATGGCGTGCGAGGTACAAAGCATAAAACAACGACCGTTGTTAGCTTCGATGATCGGTCGCAGCATTGCCGCTAACTGGCGAGCAGAACctggct > 5:816847/1‑108 (MQ=255) cAGATCGCGCATCATGGCGTGCGAGGTACAAAGCATAAAACAACGACCGTTGTTAGCTTCGATGATCGGTCGCAGCATTGCCGCTAACTGGCGAGCAGAACCTGGCTGGTTGGTTTGCGGCa > 8:635838/1‑122 (MQ=255) cAGATCGCGCATCATGGCGTGCGAGGTACAAAGCATAAAACAACGACCGTTGTTAGCTTCGATGATCGGTCGCAGCATTGCCGCTAACTGGCGAGCAGAACCTGGCTGGTTGGTTTGCGGCa < 7:635838/122‑1 (MQ=255) tCGCGCATCATGGCGTGCGAGGTACAAAGCATAAAACAACGACCGTTGTTAGCTTCGATGATCGGTCGCAGCATTGCCGCTAACTGGCGAGCAGAACCTGGCTGGTTGGTTTGCGGCAGATTGCGCAGCACACA‑GAGTAACGCCTggc > 7:704693/1‑148 (MQ=255) gcgcATCATGGCGTGCGAGGTACAAAGCATAAAACAACGACCGTTGTTAGCTTCGATGATCGGTCGCAGCATTGCCGCTAACTGGCGAGCAGAACCTGGCTGGTTGGTTTGCGGCAGATTGCGCAGCACACA‑GAGTAACGCCTggcgg < 8:704693/148‑1 (MQ=255) catcagGGCGTGCGAGGTACAAAGCATAAAACAACGACCGTTGGTAGCTTCGATGATCGGTCGCAGCATTGCCGCTAACTGGCGAGCAGAACCTGGCGGGTTGGTTTGCGGCAGATTGCGCAGCACACA‑GAGTAACGCCTGGCGGCTGTAATCAAATGGGCTGGGAAACAGCAACGACTCGGCCTGTTCGATGCCAAGCCGCGAGGTGAAATGATGCAGATCGTCGTTCACCGACAGCGTTGCTGAGGTGAAGATCCAGCTACCGGGTTTTTgc < 1:143266/274‑1 (MQ=255) catGGCGTGCGAGGTACAAAGCATAAAACAACGACCGTTGTTAGCTTCGATGATCGGTCGCAGCATTGCCGCTAACTGGCGAGCAGAACCTGGCTGGTTGGTTTGCGGCAGAt > 8:1125314/1‑113 (MQ=255) catGGCGTGCGAGGTACAAAGCATAAAACAACGACCGTTGTTAGCTTCGATGATCGGTCGCAGCATTGCCGCTAACTGGCGAGCAGAACCTGGCTGGTTGGTTTGCGGCAGAt < 7:1125314/113‑1 (MQ=255) cGTGCGAGGTACAAAGCATAAAACAACGACCGTTGTTAGCTTCGATGATCGGTCGCAGCATTGCCGCTAACTGGCGAGCAGAACCTGGCTGGTTGGTTTGCGGCAGATTGCGCAGCACACA‑GAGTAACGCCTGGCGGCTGTAATCAAATGGGCTGGGCAACAGCAACGACTCGGCCTGTTCGATGCCAAGCCGCGAGGTGAAATGAGTCAGATCGTCGTTCACCGACAGCGTTGCTGAGGTGAAGATCCAGCTACCGGGTTTTTGCGCCATTaa > 4:203635/1‑274 (MQ=255) gCGAGGTACAAAGCATAAAACAACGACCGTTGTTAGCTTCGATGATCGGTCGCAGCATTGCCGCTAACTGGCg < 6:1108180/73‑1 (MQ=255) gCGAGGTACAAAGCATAAAACAACGACCGTTGTTAGCTTCGATGATCGGTCGCAGCATTGCCGCTAACTGGCg > 5:1108180/1‑73 (MQ=255) gCGAGGTACAAAGCATAAAACAACGACCGTTGTTAGCTTCGATGATCGGTCGCAGCATTGCCGCTAACTGGCGAGCAGAACCTGGCTGGTTGGTTTGCGGCAGATTGCGCAGCACACA‑GAGTAACGCCTGGCGGCTGTAATCAAATGGGCTGGGCAACAGCAACGACTCGGCCTGTTCGATGCCAAGCCGCGAGGTGAAATGATGCAGATCGTCGTTCACCGACAGCGTTGCTGAGGTGAAGATCCAGCTACCGGGTTTTTGCGCCATTAActct < 2:168117/275‑1 (MQ=255) gTACAAAGCATAAAACAACGACCGTTGTTAGCTTCGATGATCGGTCGCAGCATTGCCGCTAACTGGCGAGCAGAACCTGGCTGGTTGGTTTg > 5:848842/1‑92 (MQ=255) aaaGCATAAAACAACGACCGTTGTTAGCTTCGATGATCGGTCGCAGCATTGCCGCTAACTGGCGAGCAGAACCTGGCTGGTTGGTTTGCGGCAGATTGCGCAGCACACA‑GAGTAACGCCTg < 7:819653/121‑1 (MQ=255) aaaGCATAAAACAACGACCGTTGTTAGCTTCGATGATCGGTCGCAGCATTGCCGCTAACTGGCGAGCAGAACCTGGCTGGTTGGTTTGCGGCAGATTGCGCAGCACACA‑GAGTAACGCCTg > 8:819653/1‑121 (MQ=255) aGCATAAAACAACGACCGTTGTTAGCTTCGATGATCGGTCGCAGCATTGCCGCTAACTGGCGAGCAGAACCTGGCTGGTTGGTTTGCGGCAGATTGCGCAGCACACA‑GAGTAACGCCTGGCGGCt < 8:276015/125‑1 (MQ=255) aGCATAAAACAACGACCGTTGTTAGCTTCGATGATCGGTCGCAGCATTGCCGCTAACTGGCGAGCAGAACCTGGCTGGTTGGTTTGCGGCAGATTGCGCAGCACACA‑GAGTAACGCCTGGCGGCTGTAATCAAATGGGCTGGGCAACa > 7:1097281/1‑148 (MQ=255) acaaaaCCACGGCCGTTGTTAGGTTCGGTGTTCGGTGGCAGCATTGCCGCTAACTGGCGAGAAGACCCGGGCGGGTTGGTTTGCGGATGCTCGCGCAGCACCGC‑GGTTAACGCCTGTCGGCTGTAATCAAATGGGCTGGGCAACAGCAACGACTCGGCCTGTTCGATGCCAAGCCGCGAGGTGAAATGATGCAGATCGTCGGTCACCGACAGCGTTGCTGAGGTGAAGCTCCAGCTACCGGGTTTTTGCGCCATTAACTCTTTGAATTTATCCg < 4:312211/272‑1 (MQ=255) aTAAAACAACGACCGTTGTTAGCTTCGATGATCGGTCGCAGCATTGCCGCTAACTGGCGAGCAGAACCTGGCTGGTTGGTTTGCGGCAGATTGCGCAGCACACA‑GAGTAACGCCTGGCGGCTGTAATCAAATGGGCTGGGCAACAGCAACGACTCGGCCTGTTCGATGCCAAGCCGCGAGGTGAAATGATGCAGATCGTCGTTCACCGACAGCGTTGCTGAGGTGAAGATCCAGCTACCGGGTTTTTGCGCCATTAACTCTTTGAATTTATCCg < 2:248938/274‑1 (MQ=255) aaaaaCAAGGACTGTGGGTGGCTTCGAGGGCCGATCGAAGCATTGCACCTAACTGGAGGGCAGAACCGGGCTGGTTGGTTTGCGGCAGATTGCGCAGCACACA‑GAGTAACGCCTGGCGGCTGTAATCAAATGGGCTGGGCAACAGCAACGACTCGGCCTGTTCGATGCCAAGCCGCGAGGTGAAATGATGCAGATCGTCGTTCACCGACAGCGTTGCTGAGGTGAAGATCCAGCTACCGGGTTTTTGCGCCATTAACTCTTTGAATTTATCCGc < 4:387167/273‑1 (MQ=255) ctaacaacGGTCGTTGTTAGCTTCGATGATCGGTCGCAGCATTGCCGCTAACTGGCGAGCAGAACCTGGCTGGTTGGTTTGCGGCAGATTGCGCAGCACACA‑GAGTAACGCCTGGCGTCTGTAATCAAAtgggct > 7:933325/3‑135 (MQ=255) ctaacaacGGTCGTTGTTAGCTTCGATGATCGGTCGCAGCATTGCCGCTAACTGGCGAGCAGAACCTGGCTGGTTGGTTTGCGGCAGATTGCGCAGCACACA‑GAGTAACGCCTGGCGGCTGTAATCAAAtgggct < 8:933325/133‑1 (MQ=255) aaaaCAACGACCGTTGTTAGCTTCGATGATCGGTCGCAGCATTGCCGCTAACTGGCGAGCAGAACCTGGCTGGTTGGTTTGCGTCAGATTGCGCAGCACACA‑GAGTAACGCCTGGCGGCTGTAATCAAATGGGCTGGGCAACAGCAACGACTCGGCCTGTTCGATGCCAAGCCGCGAGGTGAAATGATGCAGATCGTCGTTCACCGACAGCGTTGCTGAGGTGAAGATCCAGCTACCGGGTTTTTGCGCCCTTAACTCTTTGAATTTATCCGCCa > 2:245870/1‑275 (MQ=255) aaaaCAACGACCGTTGTTAGCTTCGATGATCGGTCGCAGCATTGCCGCTAACTGGCGAGCAGAACCTGGCTGGTTGGTTTGCGGCAGATTGCGCAGCACACA‑GAGTAACGCCTGGCGGCTGTAATCAAATGGGCTGGGCAACAGCAACGACTCGGCCTGTTCGATGCCAAGCCGCGAGGTGAAATGATGCAGATCGTCGTTCACCGACAGCGTTGCTGAGGTGAAGATCCAGCTACCGGGTTTTTGCGCCATTAACTCTTTGAATTTATCCGCCa > 2:336684/1‑275 (MQ=255) aaaCAACGACCGTTGTTAGCTTCGATGATCGGTCGCAGCATTGCCGCTAACTGGCGAGCAGAACCTGGCTGGTTGGTTTGCGGCAGATTGCGCAGCACACA‑GAGTAACGCCTGGCGGCTGTAATCaa > 7:603918/1‑127 (MQ=255) aaaCAACGACCGTTGTTAGCTTCGATGATCGGTCGCAGCATTGCCGCTAACTGGCGAGCAGAACCTGGCTGGTTGGTTTGCGGCAGATTGCGCAGCACACA‑GAGTAACGCCTGGCGGCTGTAATCAAATGGGCTGGGCAATAGCAACg < 6:838915/148‑1 (MQ=255) aacaacGGTCGTTGTTAGCTTCGATGATCGGTCGCAGCATTGCCGCTAACTGGCGAGCAGAACCTGGCTGGTTGGTTTGCGGCAGATTGCGCAGCACACA‑GAGTAACGCCTGGCGGCTGTAATCAAATGGGCTGGGCAACAGCAACGa > 5:722618/1‑148 (MQ=255) aacaacGACCGTTGTTAGCTTCGATGATCGGTCGCAGCATTGCCGCTAACTGGCGAGCAGAACCTGGCTGGTTGGTTTGCGGCAGATTGCGCAGCACACA‑GAGTAACGCCTGGCGGCTGTAATCAAATGGGCTGGGCAACAGCAACGa < 6:172207/148‑1 (MQ=255) aacaacGACCGTTGTTAGCTTCGATGATCGGTCGCAGCATTGCCGCTAACTGGCGAGCAGAACCTGGCTGGTTGGTTTGCGGCAGATTGCGCAGCACACA‑GAGTAACGCCTGGCGGCTGTAATCAAATGGGCTGGGCAACAGCAACGa > 5:172207/1‑148 (MQ=255) acaacGGTCGTTGTTAGCTTCGATGATCGGTCGCAGCATTGCCGCTAACTGGCGAGCAGAACCTGGCTGGTTGGTTTGCGGCAGATTGCGCAGCACACA‑GAGTAACGCCTGGCGGCTGTAATCAAATGGGCTGGGCAACAGCAACGAc > 8:304751/1‑148 (MQ=255) acaacGACCGTTGTTAGCTTCGATGATCGGTCGCAGCATTGCCGCTAACTGGCGAGCAGAACCTGGCTGGTTGGTTTGCGGCAGATTGCgca < 5:797395/92‑1 (MQ=255) acaacGACCGTTGTTAGCTTCGATGATCGGTCGCAGCATTGCCGCTAACTGGCGAGCAGAACCTGGCTGGTTGGTTTGCGGCAGATTGCGCAGCACACA‑GAGTAACGCCTGGCGGCTGTAATCaa < 5:511316/125‑1 (MQ=255) caacGACCGTTGTTAGCTTCGATGATCGGTCGCAGCATTGCCGCTa > 5:961292/1‑46 (MQ=255) caacGACCGTTGTTAGCTTCGATGATCGGTCGCAGCATTGCCGCTAACTGGCGAGCAGAACCTGGCTGGTTGGTTTGCGGCAGATTGCGCAGCACACA‑GAGTAACGCCTggcggc > 6:957761/1‑115 (MQ=255) acGACCGTTGTTAGCTTCGATGATCGGTCGCAGCATTGCCGCTAACTGGCGAGCAGAACCTGGCTGGTTGGTTTGCGGCAGATTGCGCAGCACACA‑GAGTAACGCCTGGCGGCTGTAATCaa < 7:302880/122‑1 (MQ=255) cGACCGTTGTTAGCTTCGATGATCGGTCGCAGCATTGCCGCTAACTGGCGAGCAGAACCTGGCTGGTTGGTTTGCGGCAGATTGCGCAGCACACA‑GAGTAACGCCTGGCGGCTGTAATCAAATGGGCTGGGCAACAGCAACGACTCGGCCTGTTCGATGCCAAGCCGCGAGGTGAAATGATGCAGATCGTCGTTCACNCACAGCGTTGCCGGCGTGAAGACCCAGCTACCGGGTTTTTGCGCACTTAACTCTTTGAATTTAAACGCCACGCTGAg > 3:119870/1‑275 (MQ=255) | GTGGATCATCCGGCGAGGTAAACGGCAATTTGTCGATAATTACCAATGACAATGTATCGCCACGCACGTCCACCCCTTCCCAGAAACTGCTGGTTGCCACAAGAAGCGCATTACCGGCGCTGACAAATTGCTGCAACAGTTGCCCTTTGCTGGTTTCCCCCTGCAACAATACAGGAAGCGTCATGGTAGCGCGGAACTGCTCGGCCAGATCGCGCATCATGGCGTGCGAGGTACAAAGCATAAAACAACGACCGTTGTTAGCTTCGATGATCGGTCGCAGCATTGCCGCTAACTGGCGAGCAGAACCTGGCTGGTTGGTTTGCGGCAGATTGCGCAGCACACA‑GAGTAACGCCTGGCGGCTGTAATCAAATGGGCTGGGCAACAGCAACGACTCGGCCTGTTCGATGCCAAGCCGCGAGGTGAAATGATGCAGATCGTCGTTCACCGACAGCGTTGCTGAGGTGAAGATCCAGCTACCGGGTTTTTGCGCCATTAACTCTTTGAATTTATCCGCCACGCTGAGCG > NC_000913/1891591‑1892115 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |