Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 2,581,762 | 0 | G | A | 5.9% | 356.3 / 8.9 | 114 | A339V (GCC→GTC) | ypfG | DUF1176 family protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (56/50); new base A (4/3); total (61/53) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.53e-01 |
Only 100 of 121 total aligned reads displayed.
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GTACAAGTATGTTGGTCTGAAAGGGGCAATTGTCGGGATGACGGGTTACGGGGAATCTGCTCCGGCGGATAAGCTGTTCCCGTTCTTTGGCTTTACCGCCGAGAATATTGTGGCAAAAGCGCATAAGGTGCTGGGAGTGAAAGGTGCCTGATGGTGATTGCCGGATGCTGATTGCCGGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCCGGCCTACAGCGTCTTATCCGGCCTACATGTCCCGCCATTTTGTTTAACGGGTGATCCACAACGTGGGCCAGGCGTCTGGCCCATGCCAGTTATCGCA‑GGTGGGTTCTGCGGCGTAACGCACCAGGCGAAAACGCTGACCGTCAAAGCGCCAGCGCGCCTGAATGCCACAATCGCTTAATCCGCGCCCTTTCGCTAAGGTCACCAGTTCACGCGATTTCTCATCAAATGTTGCGTTCATCAGTTCCAGTTCATTCGTCTCCTGACCGTTGTTGAACGGCAAACGCAACCGAACCGGGCGCGAAGCTAGTGGCTTTTTACGCGACACAATCCATGCCAAATCAATGG > NC_000913/2581489‑2582035 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |