| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_000913 | 2,581,765 | T→C | 6.0% | D338G (GAC→GGC) | ypfG ← | DUF1176 family protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 2,581,765 | 0 | T | C | 6.0% | 378.4 / 8.6 | 120 | D338G (GAC→GGC) | ypfG | DUF1176 family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (58/52); new base C (6/3); total (64/56) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.03e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.36e-01 | |||||||||||
Only 100 of 120 total aligned reads displayed.
AAGTATGTTGGTCTGAAAGGGGCAATTGTCGGGATGACGGGTTACGGGGAATCTGCTCCGGCGGATAAGCTGTTCCCGTTCTTTGGCTTTACCGCCGAGAATATTGTGGCAAAAGCGCATAAGGTGCTGGGAGTGAAAGGTGCCTGATGGTGATTGCCGGATGCTGATTGCCGGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCCGGCCTACAGCGTCTTATCCGGCCTACATGTCCCGCCATTTTGTTTAACGGGTGATCCACAACGTGGGCCAGGCGTCTGGCCCATGCCAGTTATCGCAGGTGGGTTCTGCGGCGTAACGCACCAGGCGAAAACGCTGACCGTCAAAGCGCCAGCGCGCCTGAATGCCACAATCGCTTAATCCGCGCCCTTTCGCTAAGGTCACCAGTTCACGCGATTTCTCATCAAATGTTGCGTTCATCAGTTCCAGTTCATTCGTCTCCTGACCGTTGTTGAACGGCAAACGCAACCGAACCGGGCGCGAAGCTAGTGGCTTTTTACGCGACACAATCCATGCCAAATCAATGG > NC_000913/2581493‑2582035 | tggttggTTGGGGTGAAGGGGGAAATTGTCGGGATGACGGGTTACGGGGAATATGTGCCGGCGGATAAGCACTTCCAGTTCTTTGGGTTTACCACCGAGAATATTGTGGCAAAAGCGCATAAGGTGCTGGGAGTGAAAGGTGCCTGATGGTGATTGCCAGATGCTGATTGCCGGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCCGGCCTACAGCGTCTTATCCGGCCTACATGTCCCGCCATTTTGTTTAACGGGTGATCCACAACGTGGGCCAGGCGTc < 4:321949/268‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |