| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 3,202,012 | 0 | A | T | 6.3% | 405.3 / 14.2 | 118 | Q41L (CAG→CTG) | cca | fused tRNA nucleotidyl transferase/2'3'‑cyclic phosphodiesterase/2'nucleotidase and phosphatase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (63/46); new base T (2/5); total (66/52) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.38e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.41e-03 | |||||||||||
Only 100 of 125 total aligned reads displayed.
TGGCTTGCTGCTCGGTCTGGTACTGCCGCACCTGATCCCAAGCCGCAAACGCAAAGATCGCTGGATGAACTAAATCGCCTTCTTCGTTGCACTGTCTTATTATTAGGAATTGTGTATTTGACGAAGGGATGATGGCGTGAAGATTTATCTGGTCGGTGGTGCTGTTCGGGATGCATTGTTAGGGCTACCGGTCAAAGACAGAGATTGGGTGGTGGTCGGCAGTACGCCACAGGAGATGCTCGACGCGGGCTACCAGCAGGTAGGCCGCGATTTTCCTGTGTTTCTGCATCCGCAAACGCATGAAGAGTATGCGCTGGCACGTACCGAACGGAAATCCGGTTCCGGTTACACCGGTTTTACTTGCTATGCCGCACCGGATGTCACGCTGGAAGATGATCTTAAGCGTCGCGATCTGACCATTAATGCGCTGGCCCAGGACGATAACGGCGAGATTATCGACCCGTACAACGGTCTGGGCGATCTGCAAAATCGTCTGTTGCGCCATGTTTCCCCCGCTTTTGG > NC_000913/3201755‑3202276 | tggcttgCTGCTCGGTCTGGTACTGCCGCACCTGATCCCAAGCCGCAAACGCAAAGATCGCTGGATGAACTAAATCGCCTTCTTCGTTGCACTGTCTTATTATTAGGCATTGTGTAATTGACGAAGGGATGATGGCGTGAAGATTTATCTGGTCGGTGGTGCTGTTCGGGATGCATTGTTAGGGCTACCGGTCAAAGATTGAGATTGGGTGGTGGTCGGCAGTAGGCCACAGGAGATGCTCGACGCTGGCTACCAGCGGGTAGGGCGCGAtttt > 1:150612/1‑274 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |