| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,202,686 | C→T | 8.0% | L266F (CTC→TTC) | cca → | fused tRNA nucleotidyl transferase/2'3'‑cyclic phosphodiesterase/2'nucleotidase and phosphatase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,202,686 | 0 | C | T | 8.0% | 391.7 / 17.6 | 124 | L266F (CTC→TTC) | cca | fused tRNA nucleotidyl transferase/2'3'‑cyclic phosphodiesterase/2'nucleotidase and phosphatase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (57/57); new base T (5/5); total (62/62) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.19e-01 | |||||||||||
Only 100 of 131 total aligned reads displayed.
AACGGGTATGGAAAGAGACGGAAAGCGCCCTCACCACCCGCAATCCACAGGTGTTCTTCCAGGTACTGCGCGATTGCGGCGCACTGCGCGTTTTATTCCCGGAAATTGACGCACTGTTTGGCGTTCCGGCCCCTGCCAAGTGGCATCCGGAAATCGATACGGGTATTCATACCTTAATGACGCTCTCAATGGCGGCGATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGAAATTCGCGATTTAGCCAGAC‑TGGTGGCTGAGTTTCACGATCTCATCCACACCTTCCCAATGCTGAACCCAAAAACCATCGTCAAATTATTTGATTCCATCGATGCCTGGCGTAAACCGCAGCGTGTCGAGCAACTGGCGCTGACCAGCGAGGCTGACGTGCGCGGCAGAACCGGTTTTGAATCAGCG > NC_000913/3202414‑3202955 | aaCGGGTATGGAAAGAGACGGAAAGCGCCCTCACCACCCGCAATCCACAGGTGTTCTTCCAGGTACTGCGCGATTGCGGCGCACTGCGCGTTTTATTCCCGGAAATTGACGCACTGTTTGGCGTTCCGGCCCCTGCCAAGTGGCATCCGGAAATCGATACGGGTATTCATACCTTAATGACGCTCTCAATGGCGGCGATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAActc > 4:375064/1‑275 (MQ=255) ggAAAGAGACGGAAAGCGCCCTCACCACCCGCAATCCACAGGTGTTCTTCCAGGTACGGCGCGATTGCGGCGCACTGCGCGTTTTATTCCCGGAAATTGACGCACTGTTTGGCGTTCCGGCCCCTGCCAAGTGGCATCCGGAAATCGATACGGGTATTCATACCTTAATGACGCTCTCAATGGCGGCGATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCcgcg < 2:344817/274‑1 (MQ=255) agaCGGAAAGCGCCCTCACCACCCGCAATCCACAGGTGTTCTTCCAGGTACTGCGCGATTGCGGCGCACTGCGCGTTTTATTCCCGGAAATTGACGCAAGGTTTGGCGTTCCGGCCCCTGCCAATTGGCATCCGGAAATCGATACGGGTATTCATACCTTAATGACGCTCTCAATGGCGGCTATTCTGAGTCCGCTGNTCGATGTCCGTTTCGCAATTTTATGCCCCGCACTCGGTACAGGGTTGACGCCGCCTGACCTCTTGCcgacgcctca > 3:121613/1‑266 (MQ=255) aCGGAAAGCGCCTTCACCACCCGCAATCCACAGGTGTTCTTCCAGGTACTGCGCGATTGCGGCGCACTGCGCGTTTTATTCCCGGAAATTGACGCACTGTTTGGCGTTCCGGCCCCTGCCAAGTGGCATCCGGAAATCGATACGGGTATTCATACCTTAATGCCGCTCTCAATGGCGGCGATGCTGAGTCCGCAGGTCGACGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGATGCCGCCAGAACTCTGGCCGCTTCAtaatg > 4:62055/1‑274 (MQ=255) tCACCACCCGCAATCCACAGTTGTTCTTCCAGGTACTGCGCGATTGCGGCGCACTGCGCGTTTTATTCCCGGAAATTGACGCACTGTTTGGCGTTCCGGCCCCTGCCAAGTGGCATCCGGAAATCGATACGGGTATTCATACCTTAATGACGCTCTCAATGGCGGCGATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCcgg < 2:364280/273‑1 (MQ=255) accaccCGCAAGCAACAGGTGGTCGTCCAGGTACTGCGCGATTGCGGCTCACTGCGCGTTTTATTCCCGGAAATTGACGCACTGTTTGGCGTTCCGGCCCCTGCCAAGTGGCATCCGGAAATCGATACGGGTATTCATACCTTAATGACGCTCTCAATGGCGGCGATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCcggcg < 1:121613/273‑1 (MQ=255) tCCACAGGTGTTCTTCCAGGTACTGCGCGATTGCGGCGCACTGCGCGTTTTATTCCCGGAAATTGACGCACTGTTTGGCGTTCCGGCCCCTGCCAAGTGGCATCCGGAAATCGATACGGGTATTCATACCTTAATGACGCTCTCAATGGCGGCGATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAg < 2:203194/275‑1 (MQ=255) cacaGGTGTTCTTCCAGGTACTGCGCGATTGCGGCGCACTGCGCGTTTTATTCTCGGAAATTGACGCACTGTTTGGCGTTCCGGCCCCTGCCAAGTGGCATCCGGAAATCGATACGGGTATTCATACCTTAATGACGCTCTCACTGGCGGCGATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTCAAGGGCTGACGCAGCACGAACTCTGTCCGCGTCATCATGGTCATGGCCTGGCGGGTGTTAGGCTAGTg > 2:89892/1‑275 (MQ=255) cgcgATTGCGGCGCACTGCGCGTTTTATTCCCGGAAATTGACGCACTGTTTGGCGTTCCGGCCCCTGCCAAGTGGCATCCGGAAATCGATACGGGTATTCATACCTTAATGACGCTCTCAATGGCGGCGATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTATGGGAACAACTATGCCAGCCTCTg > 1:149460/1‑273 (MQ=255) tgtATTCCCGGAAAGGGGCGCACGGTTTGGCGTTCCGGCCCCTGCCAGGTGGTATCCGGAAGTCGATACGGGTATTCAGACCTTAATGACGCTCTCAAGGGGGGCGATGCTGGGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCAGCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGAAATTCGCGAt < 4:127658/272‑1 (MQ=255) tCCCGGAAATTGACGCACTGTTTGGCGTTCAGGCCCCTGCCAAGTGGCATCCGGAAATCGATACGGGTATTCATACCTTAATGACGCTCTCAATGGCGGCGATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGAAATTCGCGATTTAGcc < 2:419142/275‑1 (MQ=255) tttGGCGTTCCGGCCCCTGCCAAGTGGCATCCGGAAATCGATACGGGTATTCATACCTTAATGACGCTCTCAATGGCGGCGATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCCGCGCGTGCCAAATGAAATTCGCGATTTCGCCAGAT‑TGGTGGCTGAGTTTc > 2:418465/1‑274 (MQ=255) gCGTTCCGG‑CCCTGCCAAGTGGCATCCGGAAATCGATACGGGTATTCATACCTTAATGACGCTCTCAATGGCGGCGATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGAAATTCGCGATTTAGCCAGAC‑TGGTGGCTGAGTTTCACGAtc < 2:477095/275‑1 (MQ=255) tCCGGCCCCTGCCAAGTGGCATCCGGAAATCGATACGGGTATTCATACCTTAATGACGCTCTCAATGGCGGCGATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTCAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCCTGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGAAATTCGCGATTTAGCCAGAC‑TGGTGGCTGAGTTTCACGATCTCa > 4:158724/1‑275 (MQ=255) tCCGGCCCCTGCCAAGTGGCATCCGGAAATCGATACGGGTATTCATACCTTAATGACGCTCTCAATGGCGGCGATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTCAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGAAATTCCCGATTTAGCCAGAC‑TGGGTGCTGAGTTTCACGATCCCa > 4:44566/1‑275 (MQ=255) tCCGGCCCCTGCCAAGTGGCATCCGGAAATCGATACGGGTATTCATACCTTAATGACGCTCTCAATGGCGGCGATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGAAATTCGCGATTTAGCCAGAC‑tgg > 2:174220/1‑254 (MQ=255) tCCGGCCCCTGCCAAGTGGCATCCGGAAATCGATACGGGTATTCATACCTTAATGACGCTCTCAATGGCGGCGATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGAAATTCGCGATTTAGCCAGAC‑TGGTGGCTGAGttt > 2:491410/1‑265 (MQ=255) cGGCCCCTGCCAAGTGGCATCCGGAAATCGATACGGGTATTCATACCTTAATGACGCTCTCAATGGCGGCGATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCACCTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACCACTATGCCAGCGTCTGCGCGGGCCCAGTGAAATTCGCGATTTAGCCAGAC‑TGGTGGCTGGGGTTCACGACCTCATc > 4:247282/1‑275 (MQ=255) cGGCCCCTGCCAAGTGGCATCCGGAAATCGATACGGGTATTCATACCTTAATGACGCTCTCAATGGCGGCGATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGAAATTCGCGATTTAGCCAGAC‑TGGTGGCTGAGTTTCACGAtc > 2:528854/1‑270 (MQ=255) cGGCCCCTGCCAAGTGGCATCCGGAAATCGATACGGGTATTCATACCTTAATGACGCTCTCAATGGCGGCGATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGAAATTCGCGATTTAGCCAGAC‑TGGTGGCTGAGTTTCACGATCTCATc > 2:23514/1‑275 (MQ=255) ggCCCCTGCCAAGGTGCATGCGGAAATCGAAACGGGTAGTCAGAGCTTAATGACGCTCTCAATGGGGGGAGTGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCTTTTCGCAGCGTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGGCGCCGCAAGAACTCGGGCCGCGTCATCATGGTCAGGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGAAATGCGCGATTTAGCCAGAC‑TGGTGGCTGAGTTTCACGATCTCATc < 4:414189/274‑1 (MQ=255) gccgctacaagggggCATCCGACGATCGTNNNGGTTTTTCCTCACTTATTGGCGCTCTACTTGGAGGCGATGCTTAGTCCGAAGGTGCTGGTCCGGTTCGCAACTTTATGCCACGATGTAGGTAAAGGGCTGACGCCGACAGAACTCGGGCCGCGGCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCTGCGTCTGCGCGTGCCAAATGAAATTCGCGATTTAGCCAGAC‑TGGTGGCTGAGTTTCACGATCTCATCca < 3:160396/262‑1 (MQ=255) gCCCCTGCCAAGTGGCATCCGGAAATCGATACGGGTATTCATACCTTAATGACGCTCTCAATGGCGGCGATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGAAATTCGCGATTTAGCCAGAC‑TGGTGGc < 4:174219/254‑1 (MQ=255) gCCCCTGCCAAGTGGCATCCGGAAATCGATACGGGTATTCATACCTTAATGACGCTCTCAATGGCGGCGATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGAAATTCGCGATTTAGCCAGAC‑TGGTGGCTGAGTTTCACg < 4:491409/265‑1 (MQ=255) ccccTGCCAAGTGGCATCCGGAAATCGATACGGGTATTCATACCTTAATGACGCTCTCAATGGCGGCGATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTg < 5:603983/148‑1 (MQ=255) cgtGCCCAGTGGACTCCGAAAATCGATGCGGGTGTTCTTCACATAATGACGCACGCGAAGGTGGCGCTGCTGAGTCAGCAGGTCGATGTCCGTTACGCAACTTTATGCGACGATCGCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGAAATTCGCGATTTAGCCAGAC‑TGGTGGCTGAGTTTCACGATCTCATCCacac < 4:210751/273‑1 (MQ=255) ccggCCAAGTGGCGTCCGGAAATTGTTTCGGGTATTCATACCTTACTGGCCGTCTCAAGGGGGGCGTTGTTGAGCCCGCAGGTCGATGTCCGGTTCGCCACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCCGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGAAATTCGCGATTTAGCCAGAC‑TGGTGGCTGAGTTTCACGATCTCATacacac < 4:491434/272‑1 (MQ=255) ccggCCAAGTGGCATCCGGAAATGTATACTGCGTTTCAAACCTTAATGACGCTCTCAATGGCGGCGCGTCTTGGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTAGGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGAAATTCGCGATTTAGCCAGAC‑TGGTGGCTGAGTTTCACGATCTCATCCacac < 4:62759/272‑1 (MQ=255) tGCCAAGTGGCATCCGGAAATCGATACGGGTATTCATACCTTAATGACGCTCTCAATGGCGGCGATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCGGCCAGAGTTCTGGcgg < 6:532954/148‑3 (MQ=255) tGCCAAGTGGCATCCGGAAATCGATACGGGTATTCATACCTTAATGACGCTCTCAATGGCGGCGATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAActct > 6:101592/1‑143 (MQ=255) tGCCAAGTGGCATCCGGAAATCGATACGGGTATTCATACCTTAATGACGCTCTCAATGGCGGCGATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAActct < 5:101592/143‑1 (MQ=255) tGGCATCCGGAAATCGATACGGGTATTCATACCTTAATGACGCTCTCAATGGCGGCGATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAActc > 7:184952/1‑135 (MQ=255) tGGCATCCGGAAATCGATACGGGTATTCATACCTTAATGACGCTCTCAATGGCGGCGATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAActc < 8:184952/135‑1 (MQ=255) cATCCGGAAATCGATACGGGTATTCATACCTTAATGACGCTCTCAATGGCGGCGATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCAtcatg < 7:562517/148‑1 (MQ=255) cATCCGGAAATCGATACGGGTATTCATACCTTAATGACGCTCTCAATGGCGGCGATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCAtcatg < 8:769405/148‑1 (MQ=255) tCCGGAAATCGATACGGGTATTCATACCTTAATGACGCTCTCAATGGCGGCGATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCa > 4:284507/1‑205 (MQ=255) tCCGGAAATCGATACGGGTATTCATACCTTAATGACGCTCTCAATGGCGGCGATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGAAATTCGCGATTTAGCCAGAC‑TGGTGGCTGAGTTTCACGATCTCATCCACACCTTCCCAATGCTg > 2:533945/1‑274 (MQ=255) tCCGGAAATCGATACGGGTATTCATACCTTAATGACGCTCTCAATGGCGGCGATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCCCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGAAATTCGCGATTTAGCCAGAC‑TGGTGGCTGAGTTTCACGATCTCATCCACACCTTCCCAATGCTGa > 2:388435/1‑275 (MQ=255) gAAATCGATACGGGTATTCATACCTTAATGACGCTCTCAATGGCGGCGATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATg < 2:284508/205‑1 (MQ=255) aaaTCGATACGGGTATTCATACCTTAATGACGCTCTCAATGGCGGCGATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCAtcatggtcatgg > 7:302872/1‑148 (MQ=255) cGGGTATTCATACCTTAATGACGCTCTCAATGGCGGCGATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCggg < 8:302872/148‑1 (MQ=255) ttCATACCTTAATGACGCTCTCAATGGCGGCGATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGAAATTCGCGATTTAGCCAGAC‑TGGTGGCTGAGTTTCACGATCTCATCCACACCTTCCCAATGCTGAACCCAAAAACCATCGTCaa > 2:164655/1‑274 (MQ=255) tCATACCTTAATGACGCTCTCAATGGCGGCGATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCAtcatggtca < 6:103797/129‑1 (MQ=255) tCATACCTTAATGACGCTCTCAATGGCGGCGATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCAtcatggtca > 5:103797/1‑129 (MQ=255) aTACCTTAATGACGCTCTCAATGGCGGCGATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCggg < 6:795460/139‑1 (MQ=255) aTACCTTAATGACGCTCTCAATGGCGGCGATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCggg > 5:795460/1‑139 (MQ=255) aCCTTAATGACGCTCTCAATGGCGGCGATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAg < 8:312577/148‑1 (MQ=255) aCCTTAATGACGCTCTCAATGGCGGCGATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGAAATTCGCGATTTAGCCAGAC‑TGGTGGCTGAGTTTCACGATCTCATCCACACCTTCCCAATGCTGAACCCAAAAACCATCGTCAAattat > 2:84210/1‑274 (MQ=255) cTTAATGACGCTCTCAATGGCGGCGATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGAAATTCGCGATTTAGCCAGAC‑TGGTGGCTGAGTTTCACGATCTCATCCACACCTTCCCAATGCTGAACCCAAAAACCATCGTCAAattatt > 2:23244/1‑273 (MQ=255) cTTAATGACGCTCTCAATGGCGGCGATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTACGCCAGCGTCTGCTCGTGCCAAATGAAATTCGCGATTTAGCCAGACGTGGT‑GCTGAGTTTCACGTACTCATACACCCCTTCCCAATGCTGAACCCACAAACCACCGTCGAattatt > 4:87331/1‑273 (MQ=255) ttAATGACGCTCTCAATGGCGGCGATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCAtcatggt > 8:559913/1‑120 (MQ=255) ttAATGACGCTCTCAATGGCGGCGATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTgg > 6:962878/1‑148 (MQ=255) tAATGACGCTCTCAATGGCGGCGATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCGGCCAGAGTTCTg > 7:97687/1‑103 (MQ=255) tAATGACGCTCTCAATGGCGGCGATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCGGCCAGAGTTCTg < 8:97687/103‑1 (MQ=255) aaTGACGCTCTCAATGGCGGCGATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCACATGAAATTCGCGATTTAGCCAGAC‑TGGTTGCTGATTTTCACTATCTAATCACCAACTTCCCACTGCTGAACCCAAAAACAATCCGCCAATTATTTGAt > 1:15496/1‑274 (MQ=255) aaTGACGCTCTCAATGGCGGCGATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGGGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGAAATTCGCGAGTTAGCCAGAC‑TGGTGGCTGAGTTTCACGATCTCATCCACACCTTCCCAAAGCTGAACCCAAAAACCAACGGCAAATAATTTTAtt > 4:406543/1‑275 (MQ=255) aCGCTCTCAATGGCGGCGATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTa < 6:739173/133‑1 (MQ=255) aCGCTCTCAATGGCGGCGATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTa > 5:739173/1‑133 (MQ=255) ctctCAATGGCGGCGATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATTGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGAAATTCGCGATTTAGCCAGAC‑TGGTGGCTGAGTTTCACGATCTCATCCACACCTTCCCAATGCTGAACCCAAAAACCa > 1:73459/1‑250 (MQ=255) ctctCAATGGCGGCGATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGc > 2:556547/1‑117 (MQ=255) ctctCAATGGCGGCGATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGACATTCGGGATTTAGCCATAC‑TGGTGGCAGAGTTTCACGTTCTCATCCACACCTTCCCAATGCTGAACCCAAAAACCTAATCCAAATTATTTGATTCCATct > 4:202412/1‑273 (MQ=255) ctctCAATGGCGGCGATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGAAATTCGCGATTTAGCCAGAC‑TGGTGGCTGAGTTTCACGATCTCATCCACACCTTCCCAATGCTGAACCCAAAAACCATCGTCAAATTATTTGATTCCATCg > 2:199220/1‑274 (MQ=255) tcAATGGAGGCGATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGAAACATTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGAAATTCGCGATTTAGCCAGAC‑TGGTGGCTGAGTTTCACGATCTCATCCACACCTTCCCAATGCTGAACCCAAAAACCATCGTCAAATTATTTGATTCCATCGATGc < 1:69086/275‑1 (MQ=255) cAATGGCGGCGATGTTGAGTGCGTAGGTGGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCcgg < 4:556546/117‑1 (MQ=255) cAATGGCGGCGATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGgtgt > 7:347990/1‑124 (MQ=255) cAATGGCGGCGATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGaacaac > 5:794575/1‑141 (MQ=255) cAATGGCGGCGATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGaacaac < 6:794575/141‑1 (MQ=255) cAATGGCGGCGATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGAAATTCGCGAt < 1:61875/179‑1 (MQ=255) ggggtGCGGAGGCCGCAGGTGGATTGCCGTTTCGCAACTTTATGCCCCGATTTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCAGGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGAAATTCGCGATTTAGCCAGAC‑TGGTGGCTGAGTTTCACGATCTCATCCACACCTTCCCAATGCTGAACCCAAAAACCATCGTCAAATTATTTGATTCCATCGATGCCTGGCGTa < 4:23514/270‑1 (MQ=255) cgATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGc > 4:492412/1‑104 (MQ=255) cgATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCTAATGAAATTCGCGATTTAGCCAGAC‑TGGTGGCTGAGTTTCACGCTCTCATCCACACCTTCCCAATGCTGAACCCAAAAACCATCGTCAAATTATTTGATTCCATCGATCCCTGGCGaaaa > 1:103591/1‑275 (MQ=255) tGCTGAGTCTGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCGGCCAGAGTTCTGGcgg > 8:481543/1‑81 (MQ=38) tGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCGGCCAGAGTTCTGGcgg < 7:481543/83‑3 (MQ=39) gCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCcgg < 2:492413/104‑1 (MQ=255) cTGGGTCCGGAGGGGCATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGGTCCCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGAAATTCGCGATTTAGCCAGAC‑TGGTGGCTGAGTTTCACGATCTCATCCACACCTTCCCAATGCTGAACCCAAAAACCATCGTCAAATTATTTGATTCCATCGATGCCTGGCGTAAACCGCa < 4:23244/275‑1 (MQ=255) gTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAGAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCcgg > 8:703942/1‑99 (MQ=255) gTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCCCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCcgg < 7:703942/99‑1 (MQ=255) ccGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGgtgt > 5:126972/1‑104 (MQ=255) ccGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGgtgt < 6:126972/104‑1 (MQ=255) cAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGgtg < 5:139389/100‑1 (MQ=255) cAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGgtg > 6:139389/1‑100 (MQ=255) tCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTAt > 5:625172/1‑117 (MQ=255) tCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTAt < 6:625172/117‑1 (MQ=255) gTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGcc > 8:895419/1‑82 (MQ=255) gTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGcc < 7:895419/82‑1 (MQ=255) ccGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCcggcg > 5:973220/1‑85 (MQ=255) tATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCggg < 5:600041/73‑1 (MQ=255) tATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCggg > 6:600041/1‑73 (MQ=255) aCGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGtt < 6:344119/71‑1 (MQ=255) aCGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTa > 7:985794/1‑72 (MQ=255) gcggccAGAGTTCTGGCGGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTAt > 7:1093302/4‑68 (MQ=37) gcggccAGAGTTCTGGCGGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGAAATTCGCGATTTAGCCAGAC‑TGGTGGCTg > 5:106599/4‑122 (MQ=255) cggccAGAGTTCTGGCGGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGAAATTCGCGATTTAGCCAGAC‑TGGTGGCTGAGTTTCa > 8:56630/3‑128 (MQ=255) cggccAGAGTTCTGGCGGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGAAATTCGCGATTTAGCCAGAC‑TGGTGGCTGAGTTTCa < 7:56630/126‑1 (MQ=255) gccAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGAAATTCGCGATTTAGCCAGAC‑TGGTGGCTGAGTTTCACGATCTCATCCACACCTTCCCAATGCTGAACCCAAAAACCATCGTCAAATTATTTGATTCCATCGATGCCTGGCGTAAACCGCAGCGTGTCGAGCAACTGGCGCTGACCAGCGAGGCTGACGTGCGCGGCAGAACCGGTTTTGAATCAg > 2:368237/1‑275 (MQ=255) ccAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGAAATTCGCGATTTAGCCAGAC‑TGGTGGCTGAGTTTCACGATCTCATCCACACCTTCCCaa > 7:818133/1‑148 (MQ=255) aGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGAAATTcg > 8:480469/1‑93 (MQ=255) aGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGAAATTcg < 7:480469/93‑1 (MQ=255) aCTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGAAATTCGCGATTTAGCCAGAC‑TGGTGGCTGAGTTTCACGATCTCATcc > 5:362735/1‑131 (MQ=255) ctctGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGAAATTCGCGATTTAGCCAGAC‑TGGTGGCTGAGTTTCACGATCTCATCCACACCTTCCCAATGCTGa < 8:818133/148‑1 (MQ=255) | AACGGGTATGGAAAGAGACGGAAAGCGCCCTCACCACCCGCAATCCACAGGTGTTCTTCCAGGTACTGCGCGATTGCGGCGCACTGCGCGTTTTATTCCCGGAAATTGACGCACTGTTTGGCGTTCCGGCCCCTGCCAAGTGGCATCCGGAAATCGATACGGGTATTCATACCTTAATGACGCTCTCAATGGCGGCGATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGAAATTCGCGATTTAGCCAGAC‑TGGTGGCTGAGTTTCACGATCTCATCCACACCTTCCCAATGCTGAACCCAAAAACCATCGTCAAATTATTTGATTCCATCGATGCCTGGCGTAAACCGCAGCGTGTCGAGCAACTGGCGCTGACCAGCGAGGCTGACGTGCGCGGCAGAACCGGTTTTGAATCAGCG > NC_000913/3202414‑3202955 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |