Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_000913 | 3,778,879 | T→C | 5.5% | V494A (GTC→GCC) | lldP → | L‑lactate permease |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 3,778,879 | 0 | T | C | 5.5% | 2469.8 / 77.5 | 714 | V494A (GTC→GCC) | lldP | L‑lactate permease |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (339/330); new base C (22/19); total (362/352) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.50e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 727 total aligned reads displayed.
AAAGAACTGGCTCTGCCCATCTACTCCATCGGTATGGTGCTGGCATTCGCCTTTATTTCGAACTATTCCGGACTGTCATCAACACTGGCGCTGGCACTGGCGCACACCGGTCATGCATTCACCTTCTTCTCGCCGTTCCTCGGCTGGCTGGGGGTATTCCTGACCGGGTCGGATACCTCATCTAACGCCCTGTTCGCCGCGCTGCAAGCCACCGCAGCACAACAAATTGGCGTCTCTGATCTGTTGCTGGTTGCCGCCAATACCACCGGTGGCGTCACCGGTAAGATGATCTCCCCGCAATCTATCGCTATCGCCTGTGCGGCGGTAGGCCTGGTGGGCAAAGAGTCTGATTTGTTCCGCTTTACTGTCAAACACAGCCTGATCTTCACCTGTATAGTGGGCGTGATCACCACGCTTCAGGCTTATGTCTTAACGTGGATGATTCCTTAATGATTGTTTTACCCAGACGCCTGTCAGACGAGGTTGCCGATCGTGTGCGGGCGCTGATTGATGAAAAAAACCTGGAAGCGGGCATGAAGTTGCCCGCTG > NC_000913/3778605‑3779153 | aaaaaaCGGGCTCTGCCCCGCTACTCCAACCGGTTGGTGCTGCCATGCGCCTTTATTTCGAACTATTCCGGACTGTCATCAACACTGGCGCTGGCACTGGCTCACACCGGTCATGCATTCACCTTCTTCTCGCCGTTCCTCGGCTGGCTGGGGGTATTCCTGACCGGGTCTGATACCTCATCTAACGCCCTGTTCGCCGCGCTGCAAGCCACCGCAGCACAACAAATTGGCGTCTCTGATCTGTTGCTGGTTGCCGCCAATACCACCGGTGGCGt < 4:349007/275‑1 (MQ=255) aataaCTTGCTCGGCCCATCTACTCCATCGGTATGGTGCTGGCATTCGCCTTTATTTCGAACTATTCCGGACTGTCATCAACACTGGCGCTGGCACTGGCGCACACCGGTCATGCATTCACCTTCTTCTCGCCGTTCCTCGGCTGGCTGGGGGTATTCCTGACCGGGTCGGATACCTCATCTAACGCCCTGTTCGCCGCGCTGCAAGCCACCGCAGCACAACAAATTGGCGTCTCTGATCTGTTGCTGGTTGCCGCCAATACCACCGGTGGCGTc < 2:249833/272‑1 (MQ=255) ctctGCCCATCTACTCCATCGGTATGGTGCTGGCATTCGCCTTTATTTCGCACTATTCCGGACTGTCATCAACACTGGCGCTGGCACTGGCGCACACCGGTCATGCATTCACCTTCTTCTCGCCGTTCCTCGGTTGGCTGGGGGTATTTCTGATCGGGTCGGATTCCTCCTCTAACGCCCTGTTCGCTGCCCTGCAAGCACCTGCAGCCCAACCAATTCGCGTCTCTGCTCTTTTGTTGGTTGCCGCAACTCCCACCGGTGGCGTCACCGGtca > 4:244670/1‑272 (MQ=255) tCTACTCCATCGGTATGGTGCTGGCATTCGCCTTTATTTCGAACTATTCCGGACTGTCATCAACACTGGCGCTGGCACTGGCGCACACCGGTCATGCATTCACCTTCTTCTCGCCGTTCCTCGGCTGGCTGGGGGTATTCCTGACCGGGTCGGATACCTCATCTAACGCCCTGTTCGCCGCGCTGCAAGCCACCGCAGCACACCAAATTGGCGTCTCTGATCTGTTGCTGGTTTCCGCCAATACCACCGTTGGCGCCACCGGTAAGATGTtct > 1:100783/1‑273 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |