| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,844,348 | G→T | 5.0% | A129S (GCC→TCC) | adeD → | cryptic adenine deaminase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,844,348 | 0 | G | T | 5.0% | 547.8 / 15.3 | 161 | A129S (GCC→TCC) | adeD | cryptic adenine deaminase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (84/68); new base T (4/4); total (89/72) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.81e-01 | |||||||||||
Only 100 of 163 total aligned reads displayed.
TATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCCGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGCATATTGAATCCAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTGACGACCGTTATTTGCGACCCTCATGAAATCGTCAACGTGATGGGCGAAGCCGGATTCGCCTGGTTTGCCCGCTGTGCCGAACAGGCAAGGCAAAACCAGTACTTACAGGTCAGCTCTTGCGTACCCGCCCTGGAAGGCTGCGATGTTAACGGTGCCAGTTTTACCCTTGAACAGATGCTCGCCTGGCGGGACCATCCGCAGGTTACCGGCCTTGCAGAAATGATGGACTACCCTGGCGTAATTAGCGGGCAGAATGCGCTGCTCGATAAACTGGATGCATTTCGCCACCTGACGCTGGACGGTCACTGCCCGGGTTTGGG > NC_000913/3844077‑3844619 | tATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCCGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGCATATTGAATCCAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTGACGACCGTTATTTGCGACCCTCATGAAATCGTCAACGTGATGGGCGAAGCCg > 2:243172/1‑275 (MQ=255) cGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCCGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGCATATTGAATCCAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTGACGACCGTTATTTGCGACCCTCATGAAATCGTCAACGTGATGGGCGAAGCCGGAtt > 2:192427/1‑273 (MQ=255) aTGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCCGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGCATATTGAATCCAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTGACGACCGTTATTTGCGACCCTCATGAAATCGTCAACGTGATGGGCGAAGCCGGATTCGCCTGGTTTGcc > 4:319743/1‑275 (MQ=255) gagaAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCCGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGCATATTGAATCCAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTGACGACCGTTATTTGCGACCCTCATGAAATCGTCAACGTGATGGGCGAAGCCGGATTCGCCTGGTTTGCCCGCtgt > 2:382742/1‑275 (MQ=255) gggtgaaaGGACGTTACAGTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGGGGCTCCGGCTTTGCAGGGGATTGATGCGCGCGGGGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGCATATTGAATCCAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTGACGACCGTTATTTGCGACCCTCATGAAATCGTCAACGTGATGGGCGAAGCCGGATTCGCCTGGTTTGCCCGCTGTGCCGAACAGGCAAGGCaaaa < 4:16959/269‑1 (MQ=255) tgtaaggtctgTTCCATTCCCGGTGTTGGNNCAGAATACGCGGAGGCCCCGGCTTTGCGGGNGTTTCATGCTCGCGGCGCAACGGCTGTGCCAGGTTTTATTGATGCTCACCTGCATATTGAATCCAGCATGATGANGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTGACGACCGTTATTTGCGACCCTCATGAAGTCGTCAACGTGATGGGCGAAGCCGGATTCGCCTGGTTTGCCCGCTGTGCCGAACAGGCAAGGCAAAACCa < 3:67580/265‑1 (MQ=255) aTTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCCGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGCATATTGAATCCAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTGACGACCGTTATTTGCGACCCTCATGAAATCGTCAACGTGATGGGCGAAGCCGGCTTCGCCTGGTTTGCCCGCTGTGCCGAAcaggccaggc > 2:16959/1‑268 (MQ=255) tAAAGGGTGTTACTGTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCCGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGCATATTGAATCCAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTGACGACCGTTATTTGCGACCCTCATGAAATCGTCAACGTGATGGGCGAAGCCGGATTCGCCTGGTTTGCCCGCTGTGCCGAACAGGCAAGGCAAAACCAGt < 4:176273/275‑1 (MQ=255) aGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCCGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCTCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACATGCATATTGAATCCAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTGAACCCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTGGCGACCGTTATTTGCGACCCTCATGAAATCGACAACGTGATGGGCGAAGACGGATTCGCCTGGATTGCCCGCTGTGCCGACACGACAAGACAAAACCAATaat > 4:475720/1‑273 (MQ=255) tGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCCGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGCATATTGAATCCAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTGACGACCGTTATTTGCGACCCTCATGAAATCGTCAACGTGATGGGCGAAGCCGGATTCGCCTGGTTTGCCCGCTGTGCCGAACAGGCAAGGCAACACCAGTACTTACAGGTCAGc > 1:10740/1‑274 (MQ=255) tGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCCGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGCATATTGAATCCAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTGACGACCGTTATTTGCGACCCTCATGAAATCGTCAACGTGATGGGCGAAGCCGGATTCGCCTGGTTTGCACGCTGTGCCGAACAGGCAAGGCAAAACCAGTACTTACAGGTCAGc > 1:60526/1‑274 (MQ=255) gtgtTGGCGCAGAATACACTGATGCTCCGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGCATATTGAATCCAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTGACGACCGTTATTTGCGACCCTCATGAAATCGTCAACGTGATGGGCGAAGCCGGATTCGCCTGGTTTGCCCGCTGTGCCGAACAGGCAAGGCAAAACCAGTACTTACAGGTCAGCTCTTGc > 2:224369/1‑275 (MQ=255) aaTACACTGATGCTCCGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGCATATTGAATCCAGCATGATGACGCCGGTCCCTTTTGAAACCGCTACCCTGCCCCGCGGCCTGACGACCGTTATTTGCGACCCCCATGACATCGTCAACGTGCTGGGCGAAGCCGGATTCGCCTGGTTTCCCCGCTGTGCCGAACAGTCAAGGCAAAACCAGTACTTACAGTCCCGCCCTTGCGCACCCCCCCTg > 4:109427/1‑275 (MQ=255) gCTCCGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGCATATTGAATCCAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTGACGACCGTTATTTGCGACCCTCATGAAATCGTCAACGTGATGGGCGAAGCCGGATTCGCCTGGTTTGCCCGCTGTGCCGAACAGGCAAGGCAAAACCAGTACTTACAGGTCAGCTCTTGCGTACCCGCCCTGGAAGGCt < 2:105127/271‑1 (MQ=255) cTCCGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGCATATTGAATCCAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTGACGACCGTTATTTGCGACCCTCATGAAATCGTCAACGTGATGGGCGAAGCCGGATTCGCCTGGTTTGCCCGCTGTGCCGAACCGGCCAGGCAAAACCAGTACCTACCGGTCAGCCCTTGCGTACCCTCCCTTGAAGGCTGCGAt > 4:496202/1‑275 (MQ=255) gCTTTGCGCGGGATTGATGTTCGCGGCGCAAAGGGGGTGCCAGGGTTTATTGATGTTCACCTGCATATTGAATCCAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTGACGACCGTTATTTGCGACCCTCATGAAATCGTCAACGTGATGGGCGAAGCCGGATTCGCCTGGTTTGCCCGCTGTGCCGAACAGGCAAGGCAAAACCAGTACTTACAGGTCAGCTCTTGCGTACCCGCCCTGGAAGGCTGCGATGTTaa < 4:192426/275‑1 (MQ=255) tGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGCATATTGAATCCAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTGACGACCGTTATTTGCGACCCTCATGAAATCGTCAACGTGATGGGCGAAGCCGGATTCGCCTGGTTTGCCCGCTGTGCCGAACAGGCAAGGCAAAACCAGTACTTACAGGTCAGCTCTTGCGTACCCGCCCTGGAAGGCTGCGATGTTAACgg > 2:480764/1‑274 (MQ=255) aGCGGTTTGGTGCTGGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTTTTTATGCTCCCCTGCATATTGAAGCCAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTGACGACCGTTATTTGCGACCCTCATGAAATCGTCAACGTGATGGGCGAAGCCGGATTCGCCTGGTTTGCCCGCTGTGCCGAACAGGCAAGGCAAAACCAGTACTTACAGGTCAGCTCTTGCGTACCCGCCCTGGAAGGCTGCGATGTTAACGGTGc < 4:480763/274‑1 (MQ=255) aTTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGCATATTGAATCCAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTGACGACCGTTATTTGCGACCCTCATGAAATCGTCAACGTGATGGGCGAAGCCGGATTCGCCTGGTTTGCCCGCTGTGCCGAACAGGCAAGGCAAAACCAGTACTTACAGGTCAGCTCTTGCGTACCCGCCCTGGAAGGCTGCGATGTTAACGGTGCCAGttt < 4:252829/275‑1 (MQ=255) tgctgccggggaaaCGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATTCTCACCTGCATATTGAATCCAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTGACGACCGTTATTTGCGACCCTCATGAAATCGTCAACGTGATGGGCGAAGCCGGATTCGCCTGGTTTGCCCGCTGTGCCGAACAGGCAAGGCAAAACCAGTACTTACAGGTCAGCTCTTGCGTACCCGCCCTGGAAGGCTGCGATGTTAACGGTGCCAGTTTTAccc < 4:382741/263‑1 (MQ=255) gggTTTATTGCTGCGCACCCGCATAGTGGATCCAGCACAATGAGGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCGGCCGCGCGGCCTGACGACCGTTATTTGCGCCCCGCAGGAAATCGTCAACGGGATGGGCGAAGCCGGCTTCGCCTGGTTTGCCCGCTGTGCCGAACAGGCAAGGCAAAACGAGTACTTACAGGGCAGCTCTTGCGTACCCGCCCTGGAAGGCTGCGATGTTAACGGTGCCAGTTTTACCCTTGAACAGATGCTCGCCTGGCGGGa < 4:107027/275‑1 (MQ=255) gggttATTGATGCTCACTTGCATATTGAATCCAGCAGAATGACGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTGACGACCGTTATTTGCGACCCTCATGAAATCGTCAACGTGATGGGCGAAGCCGGATTCGCCTGGTTTGCCCGCTGTGCCGAACAGGCAAGGCAAAACCAGTACTTACAGGTCAGCTCTTGCGTACCCGCCCTGGAAGGCTGCGATGTTAACGGTGCCAGTTTTACCCTTGAACAGATGCTCGCCTGGCGGGa < 4:224368/271‑1 (MQ=255) tttATTGATGCTCACCTGCATATTGAATCCAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTGACGACCGTTATTTGCGACCCTCATGAAATCGTCAACGTGATGGGCGAAGCCgg > 7:811058/1‑134 (MQ=255) tATTGATGCTCACCTGCATATTGAATCCAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTGACGACCGTTATTTGCGACCCTCATGAAATCGTCAACGTGATGGGCGAAGCCGGATTCGCCTGGTTTGcc < 7:847316/148‑1 (MQ=255) tGCTCACCTGCATATTGAATCCAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTGACGACCGTTATTTGCGACCCTCATGAAATCGTCAACGTGATGGGCGAAGCCGGATTCGCCTGGTTTGCCCGc > 5:249097/1‑145 (MQ=255) tGCTCACCTGCATATTGAATCCAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTGACGACCGTTATTTGCGACCCTCATGAAATCGTCAACGTGATGGGCGAAGCCGGATTCGCCTGGTTTGCCCGCTGTGCCGAACAGGCAAGGCAAAACCAGTACTTACAGGTCAGCCCTTGCGTACCCCCCATGGCAGGCTGCGATGTTACCGGTGCCAGTTTTACCCTTTAAAAGATGCTCCCCTGGGGGGACCATCCGCAgg > 4:305595/1‑275 (MQ=255) gCTCACCTGCATATTGAATCCAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTGACGACCGTTATTTGCGACCCTCATGAAATCGTCAACGTGATGTGCGAAGCCGGATTCGCCTGGTTTGCCCGCTGTGCCGAACAGGCAAGGCCAAACCAGTACTTAACGGTCAGCTCTTGCGTACCCGCCTTGGAAGGCTGCGATGTTAACGGCTCCAGTTTTACCCTTTAACAGATGCTAGCCTGGCGGGACCATCCGCAggc > 2:290163/1‑274 (MQ=255) gCTCACCTGCATATTGAATCCAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTGACGACCGTTATTTGCGACCCTCATGAAATCGTCAACGTGATGGGCGAAGCCGGATTCGCCTGGTTTGCCCGCTGTGCCGAACAGGCACGGCAAAACCAGTACTTACACGTCAGCTCTTGCGTACCCGCCCTGGAAGGCTGCGATGTGAACGGTGCCTGTTTTACCCTTGAACAGATGCTCGCCCTGCGGGACCATCCGCAggc > 1:38112/1‑274 (MQ=255) cTCACCTGCATATTGAATCCAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTGACGACCGTTATTTGCGACCCTCATGAACTCGTCAACGTGATGGGCGAAGCCGGATTCGCCTGGTTTGCCCGCTGTGCCGAACAGGCAAGGCAACACCAGTACTTACAGGTCAGCTCTTGCGTACCCTCCCTGGCAGGCTGCGATGTTAACGGTGCCAGTTTTACCCTTGAACAGATGCTCGCCTGGCGGGACCATCCGCAGGtt > 4:126308/1‑275 (MQ=255) cACCTGCATATTGAATCCAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTGACGACCGTTATTTGCGACCCTCATGAAATCGTCAACGTGATGGGCGAAGCCGGATTCGCCTGGTTTg > 2:50062/1‑136 (MQ=255) cACCTGCATATTGAATCCAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTGACGACCGTTATTTGCGACCCTCATGAAATCGTCAACGTGATGGGCGAAGCCGGATTCGCCTGGTTTGCCCGCtg < 7:56212/143‑1 (MQ=255) aCCTGCGAATTGATTCCAGCCGAGTGCGGCAGGTCACTTTTGAAACCCTGTCCCTGCCCCGCGGCCTGACGACCGTTATTTGCGACCCTCATGAAATCGTCAACGTGATGGGCGAAGCCGGATTCGCCTGGTTTGCCCGCTGTGCCGAACAGGCAAGGCAAAACCAGTACTTACAGGTCAGCTCTTGCGTACCCGCCCTGGAAGGCTGCGATGTTAACGGTGCCAGTTTTACCCTTGAACAGATGCTCGCCTGGCGGGACCATCCGCAGGTTAc < 4:434927/274‑1 (MQ=255) aCCTGCATATTGAATCCAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTGAAACCACTACCCTGCCGCGCGGCCTGACGACCGTTATTTGCGACCCTCATGAAATCGTCAACGTGATGGGCGAAGCCGGATTCGCCTGGTTTGCCCGCTGTGCCGa < 8:56504/148‑1 (MQ=255) cATATTGAATCCAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTGACGACCGTTATTTGCGACCCTCATGAAATCGTCAACGTGATGGGCGAAGCCGGATTCGCCTGGTTTGCCCGCTGTGCCGAACagg > 8:419309/1‑148 (MQ=255) tatTGAATCCAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTGACGACCGTTATTTGCGACCCTCATGAAATCGTCAACGTGATGGGCGAAGCCGGATTCGCCTGGTTTGCCCGCTGTGCCGAACaggca > 6:566641/1‑148 (MQ=255) tatTGAATCCAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTGACGACCGTTATTTGCGACCCTCATGAAATCGTCAACGTGATGGGCGAAGCCGGATTCGCCTGGTTTGCCCGCTGTGCCGAACaggca < 7:419309/148‑1 (MQ=255) tGAATCCAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTGACGACCGTTATTTGCGACCCTCATGAAATCGTCAACGTGATGGGCGAAGCCGGATTCGCCTGGTTTGcc > 8:425867/1‑127 (MQ=255) tGAATCCAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTGACGACCGTTATTTGCGACCCTCATGAAATCGTCAACGTGATGGGCGAAGCCGGATTCGCCTGGTTTGCCCGCTGTGCCGAACaggcaagg > 6:443543/1‑148 (MQ=255) aaTCCAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTGACGACCGTTATTTGCGACCCTCATGAAATCGTCAACGTGATGGGCGAAGCCGGATTCGcc < 5:902910/116‑1 (MQ=255) aaTCCAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTGACGACCGTTATTTGCGACCCTCATGAAATCGTCAACGTGATGGGCGAAGCCGGATTCGCCTGGTTTGCCCGCTGTGCCGAACAGGCAAGGCAAAACCAGTACTTACAGGTCAGCTCTTGc > 1:101011/1‑176 (MQ=255) aaTCCAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTGACGACCGTTATTTGCGACCCTCATGAAATCGTCAACGTGATGGGCGAAGCCGGATTCGCCTGGTTTGCACGCTGTGCCGAACAGGCAAGGCAAAACCATTACTGACAGGTCAGCTCTTGCGTACCCGCCCTGGAAGGCTGCGATGTTCACGGTGCCAGTTTTACCCTTGCACAGATGCTCGCCTGGCGGGACCATCCGCAGGTTACCGGCCtgtcgcgt > 1:7482/1‑268 (MQ=255) tCCAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTGACGACCGTTATTTGCGACCCTCATGAAATCGTCAACGTGATGGGCGAAGCCGGATTCGCCTGGTTTGCCCGCTGTGCCGAACAGGCAAGGCaaa < 7:366980/148‑1 (MQ=255) tCCAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTGACGACCGTTATTGGCGACCCACATGAAATCGTCAACGTGATGGGCGAAGCCGGATTCGCCTGGTTTGCCCGCTGTGCCGAACAGGCAAGGCAAAACCAGt < 2:89180/154‑1 (MQ=255) cATGATGACGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTGACGACCGTTATTTGCGACCCTCATGAAATCGTCAACGTGATGGGCGAATCCGGCTTCGcc > 6:468244/1‑109 (MQ=255) cATGATGACGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTGACGACCGTTATTTGCGACCCTCATGAAATCGTCAACGTGATGGGCGAATCCGGCTTCGcc < 5:468244/109‑1 (MQ=255) tgaCGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTGACGACCGTTATTTGCGACCCTCATGAAATCGTCAACGTGATGGGCGAAGCCGGATTCGCCTGGTTTGCCCGCTGTGCCGAACAGGCAAGGCAAAACCAGTACTTACAGGTCAGCTCTTGCGTACCCGCCCTGGAAGGCTGCGATGTTAACGGTGCCAGTTTTACCCTTGAACAGATGCTCGCCTGGCGGGACCATCCGCAGGTTACCGGCCTTGCAGAAATGATGGACTAc > 2:196569/1‑275 (MQ=255) aCGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTGACGACCGTTATTTGCGACCCTCATGAAATCGTCAACGTGATGGGCGAAGCCGGATTCGCCTgg < 5:1084303/105‑1 (MQ=255) aCGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTGACGACCGTTATTTGCGACCCTCATGAAATCGTCAACGTGATGGGCGAAGCCGGATTCGCCTgg > 6:1084303/1‑105 (MQ=255) ccGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTGACGACCGTTATTTGCGACCCTCATGAAATCGTCAACGTGATGGGCGAAGCCGGATTCg < 7:633859/97‑1 (MQ=255) ccGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTGACGACCGTTATTTGCGACCCTCATGAAATCGTCAACGTGATGGGCGAAGCCGGATTCGCCTGGTTTGCCCGCTGTGCCGAACAGGCAAGGCAAAACCAGTACTTACAGGTCAGCTCTTGCGTACCCGCCCTGGAAGGCTGCGATGTTAACGGTGCCAGTTTTACCCTTGAACAGATGCTCGCCTGGCGGGACCATCCGCAGGTTACCGGCCTTGCAGAAATGATGGACTACCCTg > 4:236804/1‑274 (MQ=255) ggTCACTTTTGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTGACGACCGTTATTTGCGACCCTCATGAAATCGTCAACGTGATGGGCGAAGCCGGATTCGCCTGGTTTGCCCGCTGTGCCGAACAGGCAAGGCAAAACCAGTACTTACAGGTc < 5:566641/148‑1 (MQ=255) tttGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTGACGACCGTTATTTGCGACCCTCATGAAATCGTCAACGTGATGGGCGAAGCCGGATTCGCCTGGTTTGcc > 5:684147/1‑99 (MQ=255) tttGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTGACGACCGTTATTTGCGACCCTCATGAAATCGTCAACGTGATGGGCGAAGCCGGATTCGCCTGGTTTGcc < 6:684147/99‑1 (MQ=255) tttGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTGACGACCGTTATTTGCGACCCTCATGAAATCGTCAACGTGATGGGCGAAGCCGGATTCGCCTGGTTTGCCCGCTGTGCCGAACag > 6:108501/1‑114 (MQ=255) tttGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTGACGACCGTTATTTGCGACCCTCATGAAATCGTCAACGTGATGGGCGAAGCCGGATTCGCCTGGTTTGCCCGCTGTGCCGAACAGGCAAGGCAAAACCAg < 5:138161/129‑1 (MQ=255) ttGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTGACGACCGTTATTTGCGACCCTCATGAAATCGTCAACGTGATGGGCGAAGCCGGATTCGc < 7:534356/88‑1 (MQ=255) ttGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTGACGACCGTTATTTGCGACCCTCATGAAATCGTCAACGTGATGGGCGAAGCCGGATTCGc > 8:534356/1‑88 (MQ=255) aCCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTGACGACCGTTATTTGCGACCCTCATGAAATCGTCAACGTGATGGGCGAAGCCGGATTCGCCTGGTTTGCCCGCTGTGCCGAACAGGCAAGGCAAAACCAGTACTTACAGGTCAGCTCTTGCGTAc > 8:1006447/1‑148 (MQ=255) aCCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTGACGACCGTTATTTGCGACCCTCATGAAATCGTCAACGTGATGGGCGAAGCCGGATTCGCCTGGTTTGCCCGCTGTGCCGAACAGGCAAGGCAAAACCAGTACTTACAGGTCAGCTCTTGCGTAc > 6:804262/1‑148 (MQ=255) ccGCTACCCTGCCGCGCGGCCTGACGACCGTTATTTGCGACCCTCATGAAATCGTCAACGTGATGGGCGAAGCCGGATTCGCCTGGTTTGCCCGCTGTGCCGAACAGGCAAGGCAAAACCAGTACTTACAGGTc < 7:498066/134‑1 (MQ=255) gCTACCCTGCCGCGCGGCCTGACGACCGTTATTTGCGACCCTCATGAAATCGTCAACGTGATGGGCGAAGCCGGATTCGCCTGGTTTGCCCGCTGTGCCGAACAGGCAAGGCAAAACCAGTACTTACAGGTCAGCTCTTGCGTACCCGCCCTGGAAGGCTGCGATGTTAACGGTTCCAGTTTTCCCCTTCAACAGATGCCCGCCTGGCGCGACCATCCGCAGGTTACCGGACTTGCAGAAATGCTGGACACCCCTGGCGTAATTTGCGGGCAGaa > 4:53243/1‑275 (MQ=255) tACCCTGCCGCGCGGCCTGACGACCGTTATTTGCGACCCTCATGAAATCGTCAACGTGATGGGCGAAGCCGGATTCGCCTGGTTTGCCCGCTGTGCCGAACAGGCAAGGCAAAACCAGTACTTACAGGTCAGCTCTTGCGTACCCGcc < 5:804262/148‑1 (MQ=255) tGCCGCGCGGCCTGACGACCGTTATTTGCGACCCTCATGAAATCGTCAACGTGATGGGCGAAGCCGGATTCGCCTGGTTTGCCCGCTGTGCCGAACagg < 8:500102/99‑1 (MQ=255) tGCCGCGCGGCCTGACGACCGTTATTTGCGACCCTCATGAAATCGTCAACGTGATGGGCGAAGCCGGATTCGCCTGGTTTGCCCGCTGTGCCGAACAGGCAAGGCAAAACCAGTACTTACAGGTCAGCTCTTGCGTACCCGCCCTGGa < 7:20116/148‑1 (MQ=255) gCCGCGCGGCCTGACGACCGTTATTTGCGACCCTCATGAAATCGTCAACGTGATGGGCGAAGCCGGATTCGCCTGGTTTGCCCGCTGTGCCGAACAGGCAAGGCAAAACCAGTACt < 8:989194/116‑1 (MQ=255) ccGCGCGGCCTGACGACCGTTATTTGCGACCCTCATGAAATCGTCAACGTGATGGGCGAAGCCGGATTCGCCTGGTTTGCCCGCTGTGCCGAACAGGCAAGGCAAAACCAGTACTTACAGGTCAGCTCTTGCGTACCCGCCCTGGAAGGCTGCGCTGTTAACGGTGCCCGTTTTACCCTTGAAAAGATGCTCGCCGGGCGGGACCCACCGCAGGTTACCGGCCTTGCCGAAATGATGGACTACCCTGGCGTAATTAACGGGCAGAATgcgaggc > 4:35711/1‑270 (MQ=255) ggacTGACGACCGTTATTTGCGACCCTCATGAAATCGTCAACGTGATGGGCGAAGCCGGATTCGCCTGGTTTGCCCGCTGTGCCGAACAGGCAAGGCAAAACCAGTACTTACAGGTCAGCTCTTGCGTACCCGCCCTGGAAGGCTGCg < 7:1006447/145‑1 (MQ=255) ccTGACGACCGTTATTTGCGACCCTCATGAAATCGTCAACGTGATGGGCGAAGCCGGATTCGCCTGGTTTg < 8:15150/71‑1 (MQ=255) gacgacCGTTATTTGCGACCCTCATGAAATCGTCAACGTGATGGGCGAAGCCGGATTCGCCTGGTTTGCCCGCTGTGCCGAACAGGCAAGGCAAAACCAGTACTTACAGGTCAGCTCTTGCGTACCCGCCCTGGAAg < 8:80416/137‑1 (MQ=255) gacgacCGTTATTTGCGACCCTCATGAAATCGTCAACGTGATGGGCGAAGCCGGATTCGCCTGGTTTGCCCGCTGTGCCGAACAGGCAAGGCAAAACCAGTACTTACAGGTCAGCTCTTGCGTACCCGCCCTGGAAg > 7:80416/1‑137 (MQ=255) acgacCGTTATTTGCGACCCTCATGAAATCGTCAACGTGATGGGCGAAGCCGGATTCGCCTGGTTTGCCCGCTGTGCCGAACaggca < 6:825371/87‑1 (MQ=255) acgacCGTTATTTGCGACCCTCATGAAATCGTCAACGTGATGGGCGAAGCCGGATTCGCCTGGTTTGCCCGCTGTGCCGAACaggca > 5:825371/1‑87 (MQ=255) cgacCGTTATTTGCGACCCTCATGAAATCGTCAACGTGATGGGCGAAGCCGGATTCGCCTGGTTTGCCCGCTGTGCCGAACAGGCAAGGCAAAACCAGTACTTACAGGTCAGCTCTTGCGTACCCGCCCTGGAAGGCTGCGATGTTaa > 6:198762/1‑148 (MQ=255) acCGTTATTTGCGACCCTCATGAAATCGTCAACGTGATGGGCGAAGTCGGATTCGCCTGGTTTGCCCGCTGTGCCGAACAGGCAAGGCAAAACCAGTACTTACAGGTCAGCTCTTGCGTACCCGCCCTGGAAGGCTGCGATGTTa < 7:985548/145‑1 (MQ=255) ccGTTATTTGCGACCCTCATGAAATCGTCAACGTGATGGGCGAAGCCGGATTCGCCTGGTTTGCCCGCTGTGCCGAACAGGCAAGGCAAAACCAGTACTTACAGGTCAGCTCTTGCGTACCCGCCCTGGa > 6:997588/1‑130 (MQ=255) ccGTTATTTGCGACCCTCATGAAATCGTCAACGTGATGGGCGAAGCCGGATTCGCCTGGTTTGCCCGCTGTGCCGAACAGGCAAGGCAAAACCAGTACTTACAGGTCAGCTCTTGCGTACCCGCCCTGGa < 5:997588/130‑1 (MQ=255) aTTTGCGACCCTCATGAAATCGTCAACGTGATGGGCGAAGCCGGATTCGCCTGGTTGGCCCGCTGTGCCGAACAGGCAAGGCAAAACCAGTACTTACAGGTCAGCTCTTGCGTACCCGCCCTGGAAGGCTGCGAt > 6:916864/1‑135 (MQ=255) aTTTGCGACCCTCATGAAATCGTCAACGTCATGGGCGAAGCCGGATTCGCCTGGTTTGCCCGCTGTGCCGAACAGGGAAGGCAAAACCAGTACTTACAGGTCAGCTCTTGCGTACCCGCCCTGGAAGGCTGCGAt < 5:916864/135‑1 (MQ=255) ccaCCCTCAGGAAATCGTCCACGGTAGGGNGGGAGTCCGATTCCCCTGGTTTGCCNGCTGGGACGAACCGGCAAGGCAAAACCATGAATTACAGGTCAGCTCTTGAGGAACCGCCCTGGAAGGCTTCGATGTTAACNGTGCCAGTTTTACCCTTGAACATATGCTCGCCTGGCGGGACCATCCGCAGGTTACCGGCCTTGCAGAAATGATGGACTACCCTGGCGTAATTAGCGGGCAGAATGCGCTGCTCGATAAACTGGATGCATTTCGCCAcc < 3:104566/273‑1 (MQ=255) gACCCTCATGAAATCGTCAACGTGATGGGCGAAGCCGGATTCGCCTGGTTTGCCCGCTGTGCCGAACAGGCAAGGCAAAACCAGTACTTACAGGTCAGCTCTTGCGTACCCGCCCTGGAAGGCTGCGATGTTAACGGTGCCAGTTTTACCCTTGAACAGATGCTCGCCTGGCGGGACCATCCGCAGGTTACCGGCCTTGCAGAAATGATGGACTACCCTGGCGTAATTAGCGGGCAGAATGCGCTGCTCGATAAACTGGATGCATTTCGCCACCt < 2:496203/275‑1 (MQ=255) aCCCTCATGAAATCGTCAACGTGATGGGCGAAGCCGGATTCGCCTGGTTTGCCCGCTGTGCCGAACAGGCAAGGCAAAACCAGTACTTACAGGTCAGCTCTTGCGTACCCGCCCTGGAAGGCTGCGATGTTAACGGTGCCAGTTTTACCCTTGAACAGATGCTCGCCTGGCGGGACCATCCGCAGGTTACCGGCCTTGCAGAAATGATGGACTACCCTGGCGTAATTAGCGGGCAGAATGCGCTGCTCGATAAACTGGATGCATTTCGCCACCt > 4:474661/1‑274 (MQ=255) aaaTCGTCAACGTGATGGGCGAAGCCGGATTCGCCTGGTTTGCCCGCTGTGCCGAACAGGCAAGGCAAAACCAGTACTTa < 8:19822/80‑1 (MQ=255) aaaTCGTCAACGTGATGGGCGAAGCCGGATTCGCCTGGTTTGCCCGCTGTGCCGAACAGGCAAGGCAAAACCAGTACTTa > 7:19822/1‑80 (MQ=255) aaaTCGTCAACGTGATGGGCGAAGCCGGATTCGCCTGGTTTGCCCGCTGTGCCGAACAGGCAAGGCAAAACCAGTACTTACa > 8:309174/1‑82 (MQ=255) aTCGTCAACGTGATGGGCGAAGCCGGATTCGCCTGGTTTGCCCGCTGTGCCGAACAGGCAAGGCAAAACCAGTACTTACAGGTCAGCTCTTGCGTACCCGCCCTGGAAGGCTGCGATGTTAACGGTGCCAGTTTTACCCTTGAACAGa < 6:169049/148‑1 (MQ=255) aTCGTCAACGTGATGGGCGAAGCCGGATTCGCCTGGTTTGCCCGCTGTGCCGAACAGGCAAGGCAAAACCAGTACTTACAGGTCAGCTCTTGCGTACCCGCCCTGGAAGGCTGCGATGTTAACGGTGCCAGTTTTACCCTTGAACAGa > 8:886120/1‑148 (MQ=255) tCGTCAACGTGATGGGCGAAGCCGGATTCGCCTGGTTTGCCCGCTGTGCCGAACAGGCAAGGCAAAACCAGTACTTACAGGTCAGctc < 6:867288/88‑1 (MQ=255) aCGTGATGGGCGAAGCCGGATTCGCCTGGTTTGCCCGCTGTGCCGAACAGGCAAGGCAAAACCAGTACTTACAGGTCAGCTCTTGCGTACCCGcc > 8:1116569/1‑95 (MQ=255) aCGTGATGGGCGAAGCCGGATTCGCCTGGTTTGCCCGCTGTGCCGAACAGGCAAGGCAAAACCAGTACTTACAGGTCAGCTCTTGCGTACCCGcc < 7:1116569/95‑1 (MQ=255) tGATGGGCGAAGCCGGATTCGCCTGGTTTGCCCGCTGTGCCGAACAGGCAAGGCAAAACCAGTACTTACAGGTCAGCTCTTGCGTACCCGCCCTGGAAGGCTGCGATGTTAACGGTGCCAGTTTTACCCtt > 8:816460/1‑131 (MQ=255) ccaggCGAATCCGGCTTCGCCTGGTTTGCCCGCTGTGCCGAACAGGCAAGGCAAAACCAGTACTTACAGGTCAGCTCTTGCGTACCCGCCCTGGAAGGCTGCGATg < 8:657561/103‑1 (MQ=255) tGGGCGAAGCCGGATTCGCCTGGTTTGCCCGCTGTGCCGAACAGGCAAGGCAAAACCAGTACTTACAGGTCAGCTCTTGCGTACCCGCCCTGGAAGGCTGCGATGTTAACGGTGCCAGTTTTACCCTTGAACAGATGCTCGCCTGGCGGGACCATCCGCAGGTTACCGGCCTTGCAGAAATGATGGACTACCCTGGCGTAATTAGCGGGCAGAATGCGCTGCTCGATAAACTGGATGCATTTCGCCACCTGACCCTGGACGGTCACTGCCCGGGt > 1:159349/1‑275 (MQ=255) tGGGCGAAGCCGGATTCGCCTGGCTTGCCCGCTGTGCCGAACAGGCAAGGCAAAACCAGTACTTACAGGTCAGCTCTTGCGTACCCGCCCTGGAAGGCt > 7:963664/1‑99 (MQ=255) cgggCGAAGCCGGATTCGCCTGGTTTGCCCGCTGTGCCGAACAGGCAAGGCAAAACCAGTACTCACAGGTCAGCTCTTGCGTACCCGCCCTGGAAGGCt < 8:963664/98‑1 (MQ=255) caggCGAATCCGGCTTCGCCTGGTTTGCCCGCTGTGCCGAACAGGCAAGGCAAAACCAGTACTTACAGGTCAGCTCTTGCGTACCCGCCCTGGAAGGCTGCGATGTTa > 5:1061671/3‑108 (MQ=255) cGAAGCCGGATTCGCCTGGTTTGCCCGCTGTGCCGAAc < 7:993831/38‑1 (MQ=255) aaGCTGGATTCGCCTGGTTTGCCCGCTGTGCCGAACAGGCAAGGAAAAACAAGTACTTACAGGTCAGCTCTTGCGTACCCGCCCTGGAAGGCTGCGATGTTAACGGTGCCAGTTTTACCCTTGAACAGATGCTCGCCTGGCGGGACCATCCGCAGGTTACCGGCCTTGCAGAAATGATGGACTACCCTGGCGTAATTAGCGGGCAGAATGCGCTGCTCGATAAACTGGATGCATTTCGCCACCTGACGCTGGACGGTCACTGCCCGGGTTTggg < 2:331384/274‑1 (MQ=255) aGCCGGATTCGCCTGGTTTGCCCGCTGTGCCGAACAGGCAAGGCAAAACCAGTACTTACAGGTCAGCTCTTGCGTACCCGCCCTGGAAGGCTGCGATGTTAACGGTGCCAGTTTTACCCTTGAACAGATGCTCGCCTGGCGGGACCAt < 5:198762/148‑1 (MQ=255) gCCGGATTCGCCTGGTTTGCCCGCTGTGCCGAACAGGCAAGGCAAAACCAGTACTTACAGGTCAGCTCTTGCGTACCCGCCCTGGAAGGCTGCGATGTTAACGGTGCCAGTTTTa < 6:554771/115‑1 (MQ=255) gCCGGATTCGCCTGGTTTGCCCGCTGTGCCGAACAGGCAAGGCAAAACCAGTACTTACAGGTCAGCTCTTGCGTACCCGCCCTGGAAGGCTGCGATGTTAACGGTGCCAGTTTTa > 5:554771/1‑115 (MQ=255) | TATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCCGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGCATATTGAATCCAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTGACGACCGTTATTTGCGACCCTCATGAAATCGTCAACGTGATGGGCGAAGCCGGATTCGCCTGGTTTGCCCGCTGTGCCGAACAGGCAAGGCAAAACCAGTACTTACAGGTCAGCTCTTGCGTACCCGCCCTGGAAGGCTGCGATGTTAACGGTGCCAGTTTTACCCTTGAACAGATGCTCGCCTGGCGGGACCATCCGCAGGTTACCGGCCTTGCAGAAATGATGGACTACCCTGGCGTAATTAGCGGGCAGAATGCGCTGCTCGATAAACTGGATGCATTTCGCCACCTGACGCTGGACGGTCACTGCCCGGGTTTGGG > NC_000913/3844077‑3844619 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |