| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_000913 | 3,991,335 | T→A | 11.1% | I61I (ATT→ATA) ‡ | cyaA → | adenylate cyclase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 3,991,335 | 0 | T | A | 11.1% | 804.0 / 78.1 | 252 | I61I (ATT→ATA) ‡ | cyaA | adenylate cyclase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (107/116); new base A (13/15); total (120/132) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
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Only 100 of 267 total aligned reads displayed.
GACATACGAAATATCCCGAATGCCGCGTGTTACCGTTGATGTTGGCGGAATCACAGTCATGACGGGTAGCAAATCAGGCGATACGTCTTGTACCTCTATATTGAGACTCTGAAACAGAGACTGGATGCCATAAATCAATTGCGTGTGGATCGCGCGCTTGCTGCTATGGGGCCTGCATTCCAACAGGTCTACAGTCTACTGCCGACATTGTTGCACTATCACCATCCGCTAATGCCGGGTTACCTTGATGGTAACGTTCCCAAAGGCATTTGCCTTTACACGCCTGATGAAACTCAACGCCACTACCTGAACGAGCTTGAACTGTATCGTGGAATGTCAGTACAGGATCCGCCGAAAGGTGAGCTTCCAATTACTGGTGTATACACCATGGGCAGCACCTCGTCCGTAGGGCAAAGTTGTTCCTCTGACCTGGATATCTGGGTCTGTCATCAATCCTGGCTCGATAGCGAAGAGCGCCAATTGCTACAACGTAAATGTAGCCTGCTGGAAAACTGGGCCGCCTCGCTGGGTGTGGAAGTCAGCT > NC_000913/3991066‑3991609 | ggAATCAAAGGTATTAAGGGTAGCAAATCAGGCGATACGTCTTGTACCTCTATATTGAGACTCTGAAACAGAGACTGGATGCCATAAATCAATTGCGGGTGGATCGCTCGCTTGCTGCTATGGGGCCTGCATTCCAACAGGTCTACAGTCTACTGCCGACATTGTTGCACTATCACCATCCGCTAATGCCGGGTTACCTTGATGGTAACGTTCCCAAAGGCATTTGCCTTTACACGCCTGATGAAACTCAACGCCACTACCTGAACGAGCTTGaa < 4:75017/275‑1 (MQ=255) cATGACGGGTAGCAAATCAGGCGATACGTCTTGTACCTTTATATTGAGACTCTGAAACAGAGACTGGATGCCATAAATCAATTGCGTGTGGATCGCGCGCTTGCTGCTATGGGGCCTGCATTCCAACAGGTCTACAGTCTACTGCCGACATTGTTGCACTATCACCATCCGCTAATGCCGGGTTACCTTGATGGTAACGTTCCCAAAGGCATTTGCCTTTACACGCCTGATGAAACTCAACGCCACTACCTGAACGAGCTTGAACTGTATCGTgg < 2:202842/275‑1 (MQ=255) cATGACGGGTAGCAAATCAGGCGATACGTCTTGTACCTCTATATTGAGACTCTGAAACAGAGACTGGATGCCATAAATCAATTGCGTGTGGATCGCGCGCTTGCTGCTATGGGGCCTGCATTCCAACAGGTCTACAGTCTACTGCCGACATTGTTGCACTATCACCATCCGCTAATGCCGGGTTACCTTGATGGTAACGTTCCCAAAGGCATTTGCCTTTACACGCCTGATGAAACGCAACGCCACTACCTGAACGAGCTTGAACTGTATCGTgg < 4:200772/275‑1 (MQ=255) tCAGGCGATACGTTTTGTACCTCTATAGTGAGACTATGAAACAGAGACTGGATGCCATAAATCAATTGCGTGTGGATCGCGCGCTTGCTGCTATGGGGCCTGCATTCCAACAGGTCTACAGTCTACTGCCGACATTGCTGCACTATCACCATCCGCTAATGCCGGGTTACCTTGATGGTAACGTTCCCAAAGGCATTTGCCTTTACACGCCTGATGAAACTCAACGCCACTACCTGAACGAGCTTGAACTGTATCGTGGAATGTCAGTACAGGAt < 2:402800/275‑1 (MQ=255) 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cGTTCCCAAAGGCATTTGCCTTTACACGCCTGATGAAACTCAACGCCACTACCTGAACGAGCTTGAACTGTATCGTGGAATGTCAGTACAGGATCCGCCGAAAGGTGAg > 8:328767/1‑109 (MQ=255) gTTCCCAAAGGCATTTGCCTTTACACGCCTGATGAAACTCAACGCCACTACCTGAACGAGCTTGAACTGTATCGTgg < 5:231821/77‑1 (MQ=255) cgtgtaaaGGCAAATGCCTTTGCACGCCTGATGAAACTCAACGCCACTACCTGAACGAGCTTGAACTGTATCGTGGAATGTCAGTACAGGATCCGCCGAAAGGTGAGCTTCCAATTACt < 5:799829/114‑1 (MQ=255) tCCCAAAGGCATTTGCCTTTACACGCCTGATGAAACTCAACGCCACTACCTGAACGAGCTTGAACTGTATCGTGGAATGTCAGTACAGGATCCGCCGAAAGGTGAGCTTCCAATTACTGgtg < 8:175147/122‑1 (MQ=255) gtaaaGGCAAATGCCTTTACACGCCTGATGAAACTCAACGCCACTACCTGAACGAGCTTGAACTGTATCGTGGAATGTCAGTACAGGATCCGCCGaaa > 7:1055819/3‑98 (MQ=255) taaaGGCAAATGCCTTTACACGCCTGATGAAACTCAACGCCACTACCTGAACGAGCTTGAACTGTATCGTGGAATGTCAGTACAGGATCCGCCGAAAGGTg < 5:97679/100‑1 (MQ=255) taaaGGCAAATGCCTTTACACGCCTGATGAAACTCAACGCCACTACCTGAACGAGCTTGAACTGTATCGTGGAATGTCAGTACAGGATCCGCCGAAAGGTGAGCTTCCAATTACTg < 6:534758/115‑1 (MQ=255) 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GACATACGAAATATCCCGAATGCCGCGTGTTACCGTTGATGTTGGCGGAATCACAGTCATGACGGGTAGCAAATCAGGCGATACGTCTTGTACCTCTATATTGAGACTCTGAAACAGAGACTGGATGCCATAAATCAATTGCGTGTGGATCGCGCGCTTGCTGCTATGGGGCCTGCATTCCAACAGGTCTACAGTCTACTGCCGACATTGTTGCACTATCACCATCCGCTAATGCCGGGTTACCTTGATGGTAACGTTCCCAAAGGCATTTGCCTTTACACGCCTGATGAAACTCAACGCCACTACCTGAACGAGCTTGAACTGTATCGTGGAATGTCAGTACAGGATCCGCCGAAAGGTGAGCTTCCAATTACTGGTGTATACACCATGGGCAGCACCTCGTCCGTAGGGCAAAGTTGTTCCTCTGACCTGGATATCTGGGTCTGTCATCAATCCTGGCTCGATAGCGAAGAGCGCCAATTGCTACAACGTAAATGTAGCCTGCTGGAAAACTGGGCCGCCTCGCTGGGTGTGGAAGTCAGCT > NC_000913/3991066‑3991609 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |