Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 475,971 | 0 | C | G | 13.4% | 677.1 / 87.3 | 217 | intergenic (+20/+11) | ybaY/ybaZ | outer membrane lipoprotein/excision repair protein, alkyltransferase‑like protein ATL |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (90/98); new base G (14/15); total (104/113) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.91e-06 |
Only 100 of 221 total aligned reads displayed.
CGGCAGATGTTCAGCCGAACGCGCGTATTCTGTTGAGTGCGGCGATTACCGTGAATGACAAACTGGTATTTATCACCGATACCGTTCAGCCGGTGATCAACCAGGGCGGAACTAAAGCCGACCTGACATTGGTGCCGGTACAGCAAACCGCCGTGCCGGTTCAGGCCAGCGGTGGCGCAACGACTACCGTACCTTCGACTTCACCAACTCAGGTGAATCCGTCTTCGGCAGTTCCAGCTCCTACGCAATATTAAGCGACGTTAACCCTCTCCGCCCGGAGAGGGTTAGTAGTTCCAGCGATAACGCTGCAAGTCGATTTGCCCGCTTCCCGATACCATCACACCTTCTGCCAGTAATGCCTGTCGCTGACGCTGTAAATCCGGTCCGGTTAGCGAAATTGTGCCGTGGCGATTAACCACCCGGTGCCAGGGTAAGGTGCTGCCTTCAGGGAGACGCTTTAACACACCGCCCACCTGGCGCGCGGCGCGGGGCGATCCCGCCAGTTTCGCCACATCACCGTAAGTGGTGACATAGCCTTCGGGAA > NC_000913/475698‑476241 | cGGCAGATGTTCAGCCGAACGCGCGTATTCTGTTGAGTGCGGCGATTACCGTGAATGACAAACTGGTATTTATCACCGATACCGTTCAGCCGGTGATCAACCAGGGCGGAACTAAAGCCGACCTGACATTGGTGCCGGTACAGCAAACCGCCGTGCCGGTTCAGGCCAGCGGTGGCGCAACGACTACCGTACCTTCGACTTCACCAACTCAGGTGAATCCGTCTTCGGCAGTTCCAGCTCCTACGCAATATTAAGCGACGTTAACCCTCTCCGcc > 2:520788/1‑275 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |