Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 4,376,280 | 0 | G | A | 5.5% | 485.8 / 13.5 | 151 | intergenic (+15/‑37) | efp/ecnA | polyproline‑specific translation elongation factor EF‑P/entericidin A membrane lipoprotein, antidote entericidin B |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (61/79); new base A (4/4); total (66/85) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.31e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 155 total aligned reads displayed.
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2:281169/1‑231 (MQ=255) gAAGTAATGCGGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATGAAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGCACGCTGCTCACGGGCTg > 7:643466/1‑114 (MQ=255) gAAGTAATGCGGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATGAAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGCACGCTGCTCACGGGCTg < 8:643466/114‑1 (MQ=255) gAAGTAATGCGGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGAACCATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATGAAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGCACGCTGCTCACGGGCTGTAACACCGCTCGCGGTTTCGGCGAAGACATCAAACATCTCGGCAACTCCATCTCTCGCGCTGCCAGCTAATTTTTCTTCTCTTCCGAAAAATCATCAGATTCCCATCATTTTTGGCGATGTTGTCTATTATTAATTTGCTATAGGCAAACATAAATAACAt < 1:17773/275‑1 (MQ=255) tGCGGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATGAAACGCCCTATCGTTTTTGTTTTGCTTGCCAGCACGCTGCTCACGGGCTGTAACACCGCTTGCGGTTTCGGCGAAGACATCAAAATTCACGGAAACTCCCTCTCCCGCGCTGCCAGCTATATTTTTTTCTCTCTCCAAAANCAATATGATTCACATCTCTTTTGGCTTAGTTTGTTTTTATTAACTTTCTATAGGCAAAActaaataaggttttttat > 3:121293/1‑265 (MQ=255) gtggtgCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATGAAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGCACgctgct > 2:281679/1‑91 (MQ=255) tgCAGCCTGCAGGCCGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATGAAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGCACGCTGCTCACGGGCTGTAACACCGCTCGCGGTTTCGGCGAAGACATCaa > 6:1118324/1‑129 (MQ=255) cGGCCTTCAGGGTGACCCATCACTTATTCTGGTCAGAGCTGATGAAACGCCTTATCTTTCGTGTTTTGCTTGCCAGCACGCTGCTCACGGGCTGTAACACCGCTCGCGGTTTCGGCGAAGACATCAAACAGCTCGGCAACTCCATCTCTCGCGCTGCCAGCTAATTTTTCTTCTCTTCCGAAAAATCATCAGATTCCCATCATTTTTGGCGATGTTGTCTATTATTAATTTGCTATAGTCAAACATAAATAACATTACCTAAAAGGAAGACGTTa < 4:118630/275‑1 (MQ=255) | GCTAAATGGCTGCTGGATCAGGCAGAGTGTATCGTAACTCTGTGGAATGGTCAGCCGATCTCCGTTACTCCGCCGAACTTCGTTGAACTGGAAATCGTTGATACCGATCCGGGCCTGAAAGGTGATACCGCAGGTACTGGTGGCAAACCGGCTACCCTGTCTACTGGCGCTGTGGTTAAAGTTCCGCTGTTTGTACAAATCGGCGAAGTCATCAAAGTGGATACCCGCTCTGGTGAATACGTCTCTCGCGTGAAGTAATGCGGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTATTCAGGTCAGAGATGATGAAACGCCTTATCGTTCTTGTTTTGCTTGCCAGCACGCTGCTCACGGGCTGTAACACCGCTCGCGGTTTCGGCGAAGACATCAAACATCTCGGCAACTCCATCTCTCGCGCTGCCAGCTAATTTTTCTTCTCTTCCGAAAAATCATCAGATTCCCATCATTTTTGGCGATGTTGTCTATTATTAATTTGCTATAGGCAAACATAAATAACATTACCTAAAAGGAAGACGTTA > NC_000913/4376008‑4376553 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |