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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 4,447,850 | 0 | G | C | 7.0% | 913.8 / 47.6 | 260 | V1247L (GTA→CTA) | tamB | translocation and assembly module for autotransporter export, inner membrane subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (125/114); new base C (9/9); total (136/124) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
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Only 100 of 266 total aligned reads displayed.
GACAGTGCGGCAATGACCTCGATGCTGATTGGTTTGGGGGTTGCGCAAAGTGGCCAGATTGTGGGTAAAATCGGCGAGACGTTTGGCGTAAGCAATTTAGCGCTCGACACCCAGGGAGTAGGCGACTCCTCCCAGGTAGTGGTCAGCGGCTATGTATTGCCAGGTCTGCAAGTGAAATACGGCGTGGGTATATTTGACTCTATAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATTTGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTGGGCGATTTCAGTATCGATAACTACCAGTTGTATAGCCTGGGCCACTATCCAGGCGCAGTTCCGGGGAACGGAACGGTACACGGTGAAGTTTATCGTATTGACAACGCCACGCTGGCCGAACTTGATGCCTTGCGCACCAGGGGCGGTG > NC_000913/4447586‑4448116 | tGCGCAAAGTGGCCAGATTGTGGGTAAAATCGGCGAGACGTTTGGCGTAAGCAATTTAGCGCTCGACACCCAGGGAGTAGGCGACTCCTCCCAGGTAGTGGTCAGCGGCTATGTATTGCCAGGTCTGCAAGTGAAATACGGCGTGGGTATATTTGACTCTATAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCCGGCACTGGATTTGCTCTATCAGTTCGGGTTTTAGCAATGCGaa > 4:465715/1‑274 (MQ=255) tAAAATCGGCGAGACGTGTGGCATAAGCAATTTAGCGCTCGACACCCAAGGAGTAGGCAACTCCTCCCAGGTAGTGGTCAGAGTCTATGTATTACCAGGTCTGCAAGTGAAATACGGCGTGGGTATATTTGACTCTATAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAACCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATTTGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGcc < 1:72699/274‑1 (MQ=255) gggtttgtgtgaaGCAATTTAGTGCTCGNNNCCCGGGGGGTAGGCGACTCCTCCAAGGTTGTGTTGAGCGGTTATGTATTGCCAGGTCTGGAATTGAAATACGGTGTGGGTATATTTGACTCTATAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCGATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATGTGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCaa < 3:153082/263‑1 (MQ=255) gTTTGGCGTAAGCAATTTAGCGCTCGACACCCAGGGAGTAGGCGACTCCTCCCAGGTAGTGGTCAGCGGCTATGTATTGCCAGGTCTGCAAGTGAAATACGGCGTGGGTATATTTGACTCTATAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATTTGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACa < 2:378567/274‑1 (MQ=255) 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atatCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATTTGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTGGGCGATTTCAGTATCGATAACTACCAGTTGTATAGCCTGGGCCACTATCCAGGCGCAGTTCCGGGGAACGGAACGGTACACGGTGAAGttt < 2:523335/232‑1 (MQ=255) tatCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATTTGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTGGGCGATTTCAGTATCGATAACTACCAGTTGTATAGCCTGGGCCACTATCCAGGCGCAGTTCCGGGGAACGGAACGGTACACGGTGATGTTTATCGTATTGACAACGCCACGCTGGCCGAACTTGTCGCCTTgccc > 4:51939/1‑273 (MQ=255) atCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATTTGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCAc > 8:422475/1‑115 (MQ=255) cTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATTTGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCacaaaca < 7:120906/100‑1 (MQ=255) ggAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATTTGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAAc > 8:321116/1‑105 (MQ=255) 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tgtCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATTTGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCTACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGa > 7:739957/1‑110 (MQ=255) tgtCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATTTGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTGGTCGATTTCAGTATCGATAAc > 8:860465/1‑148 (MQ=255) tgtCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATTTGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTGGGCGATTTCAGTATCGATa > 5:593717/1‑146 (MQ=255) tCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATTTGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACt < 8:512124/124‑1 (MQ=255) cTGGTGTAGACCAGGCACTGGATTTGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTGGGCGATTTc > 8:59737/1‑133 (MQ=255) tGGTGTAGACCAGGCACTGGATTTGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTgg < 7:330547/124‑1 (MQ=255) gtAGACCAGGCACTGGATTTGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAAc > 7:593575/1‑89 (MQ=255) gtAGACCAGGCACTGGATTTGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTGGGCGATTTCAGTATCGATAACTACCAg < 2:565092/146‑1 (MQ=255) | GACAGTGCGGCAATGACCTCGATGCTGATTGGTTTGGGGGTTGCGCAAAGTGGCCAGATTGTGGGTAAAATCGGCGAGACGTTTGGCGTAAGCAATTTAGCGCTCGACACCCAGGGAGTAGGCGACTCCTCCCAGGTAGTGGTCAGCGGCTATGTATTGCCAGGTCTGCAAGTGAAATACGGCGTGGGTATATTTGACTCTATAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATTTGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTGGGCGATTTCAGTATCGATAACTACCAGTTGTATAGCCTGGGCCACTATCCAGGCGCAGTTCCGGGGAACGGAACGGTACACGGTGAAGTTTATCGTATTGACAACGCCACGCTGGCCGAACTTGATGCCTTGCGCACCAGGGGCGGTG > NC_000913/4447586‑4448116 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |