| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,606,417 | A→T | 5.0% | intergenic (‑16/+252) | leuQ ← / ← rsmC | tRNA‑Leu/16S rRNA m(2)G1207 methyltransferase, SAM‑dependent |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,606,417 | 0 | A | T | 5.0% | 432.2 / 8.7 | 119 | intergenic (‑16/+252) | leuQ/rsmC | tRNA‑Leu/16S rRNA m(2)G1207 methyltransferase, SAM‑dependent |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (61/52); new base T (3/3); total (64/55) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.96e-01 | |||||||||||
Only 100 of 124 total aligned reads displayed.
TACCAATTCCGCCACCTTCGCACAGTCATCTTACTTTTTTTGATATCGCCTCGTTTGGTGCGAGGGGGGGGACTTGAACCCCCACGTCCGTAAGAACACTAACACCTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCCCAGTGCGAGCAATATCAACGTGGTTTTTGGTGCGAGGGGGGGGACTTGAACCCCCACGTCCGTAAGGACACTAACACCTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTTCGTCAATAGTTAATTATCGACAGAGGTGTAATTGCTGGAAAAATGTCCATCAGGAAACTAGCGTGC‑AGGTTTGGTATGCATGCGGGGGCAGATGCCAGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCTGGCCTACGAAGGGCTAACGTGCAGGTTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGACACGGTATTCGGCGAGATAATTAACCTTTCTTCGCCTGG > NC_000913/4606145‑4606687 | tACCAATTCCGCCACCTTCGCACAGTCATCTTACTTTTTTTGATATCGCCTCGTTTGGTGCGAGGGGGGGGACTTGAACCCCCACGTCCGTAAGAACACTAACACCTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCCCACTGCGAGCAATATCAACGTGGTTTTTGGTCCGAGGGGGGGGACTTGAACCCCCCCGTCCGTAAGGACACTAACACCTGAAACTAGCGCTCCTACCAATTCCACCCCCTTCACCTACCATAAATTCTTaa > 1:116849/1‑274 (MQ=37) ggtgggACTTGAACCCCCACTTCCGGCAGAAAACTAGCACCTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATACCGCCACCTTCGCCCGGTACGAGCAATATCAACGTGGTTTTTGGTGCGAGGGGGGGGACTTGAACCCCCACGTCCGTAAGGACACTAACACCTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTTCGTCAATAGTTAATTATCGa < 2:478596/272‑1 (MQ=255) gTCCGTAAGAACACTAACACCTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCCCAGTGCGAGCAATATCAACGTGGTTTTTGGTGCGAGGGGGGGGACTTGAACCCCCACGTCCGTAAGGACACTAACACCTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTaaaa < 1:116457/191‑1 (MQ=255) gTAAGAACACTAACACCTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCCCAGCGCGAGCAATCACAACGTAGTTTTTGGTCCGAAGGGGGGTACTTGAACCCCCACGTCCGTAAGGACACTAACACCTGCAGCTAGCACGTCTACCAATTCCGCCACCTTCCACTACACGCACTTCTTAAAAAGAATTGCATCCACGGGCGCTCATCCTATGCGTTGTTCGCTTTTCGTCAATAGTTACATATCGAAATCGGTGTCATGGCTGCaatact > 4:438469/1‑271 (MQ=19) acacTAACACCTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCCCAGTGCGAGCAATATCAACGTGGTTTTTGGTGCGAGGGGGGGGACTTGAACCCCCACGTCCGTAAGGACACTAACACCTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTTCGTCAATAGTTAATTATCGACAGAGGTGTAATTGCTGGAAAAATGTCCAt < 2:447480/275‑1 (MQ=255) acacCAACACCTGAGCCTACCGCGTCTACCACTGCCGCCACCTTCGCCCAGTGCGAGCAATATCAACGTGGTTTTTGGTGCGAGGGGGGGGACTTGAACCCCCACGTCCGTAAGGACACTAACACCTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTTCGTCAATAGTTAATTATCGACAGAGGTGTAATTGCTGGAAAAATGTCCAt < 2:147676/275‑1 (MQ=255) ccTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCCCAGTGCGAGCAATATCAACGTGGTTTTTGGTGCGAGGGGGGGGACTTGAACCCCCACGTCCGTAAGGACACTAACACCTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTTCGTCAATAGTTAATTATCGACAGAGGTGTAATTGCTGGAAAAATGTCCATCAGGAAACt > 2:92134/1‑275 (MQ=255) gAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCCCAGTGCGAGCAATATCAACGTGGTTTTTGGTGCGAGGGGGGGGACTTGAACCCCCACGTCCGTAAGGACACTAACACCTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGa > 2:149588/1‑186 (MQ=255) gAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCCCAGTGCGAGCAATATCAACGTGGTTTTTGGTGCGAGGGGGGGGACTTGAACCCCCACGTCCGTAAGGACACTAACACCTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGAATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTTCGTCAATAGTTAATTATCGACAGAGGTGTAATTGATTGATAAATGTCTATCAGGAAACTAGc > 2:354628/1‑275 (MQ=255) gAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCCCAGTGCGAGCAATAACAAAGTGGTTTTTGGTCCGAGGGGGGGGACTTGGACCTCCACGTCTGTAAGGACACTAATACCTGAAGCTAGCGCGTATACCAATTCCGCTACCTTCGCAGACTATCACTTCTTAAAAAGACTTGCTACCACGGAGGCCCATCCAAGTCGACTTCAGCTTTTCGTTAATAGGTAATTCTCGACCGAGGTGTAATTGCTGGAAAAATGTCCATCAGGAAACTact > 4:80229/1‑273 (MQ=37) cTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCCCAGTGCGAGCAATATCAACGTGGTTTTTGGTGCGAGGGGGGGGACTTGAACCCCCACGTCCGTAAGGACACTAACACCTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTTCGTCAATAGTTAATTATCGACAGAGGTGTAATTGCTGGAAAAATGTCCATCAGGaaa < 2:80230/266‑1 (MQ=255) gctcgTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCCCAGTGCGAGCAATTACAACGTGGGTTTTGGTGCGAGGGGGGGGACTTGAACCCCCACGTCCGTAAGGACACTAACACCTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTTCGTCAATAGTTAATTATCGACAGAGGTGTAATTGCTGGAAAAATGTCCATCAGGAAACTAGCGTGC‑Agg < 2:243352/272‑1 (MQ=255) tCTACCAATTCCGCCACCTTCGCCCAGTACCAGCAATATCAACGTGGTTTTTGGTGCGAGGCGGGGGCCTTTAACCCCCACGTCCGTAAGAACACTAACACCTGAACCTAGCGCGTCTACCTATTCCGCCCCCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGACGCTCCTGCTAGTGGTTTACAGGTTTTCGGTCAGAGTTAATTATCCAACGAGGTTTAATTCCGAAAAAACTGTACAACAGGAAAC‑AACGTGCGAGGTTTgg > 4:430574/1‑275 (MQ=21) ccAATGCCGCCACCGTCGCCCAGTGCGAGGAATATCAACGTGGTTCTTGGTGCGAGGGGAGGCACTTGAACCCCCACGTCCGTAAGGACACTAACAACTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTTCGTCAATAGTTAATTATCGACAGAGGTGTAATTGCTGGAAAAATGTCCATCAGGAAACTAGCGTg < 2:430575/262‑1 (MQ=255) aaTTCCGCCACCTTCGCCCAGTGCGAGCAATATCAACGTGGTTTTTGGTGCGAGGGGGGGGACTTGAACCCCCACGTCCGTAAGGACACTAACACCTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTa < 6:816271/148‑1 (MQ=255) cGCCACCTTCGCCCAGTGCGAGCAATATCAACGTGGTTTTTGGTGCGAGGGGGGGGACTTGAACCCCCACGTCCGTAAGGACACTAACACCTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAg > 5:662784/1‑148 (MQ=255) tGCGAGCAATATCAACGTGGTTTTTGGTGCGAGGGGGGGGACTTGAACCCCCACGTCCGTAAGGACACTAACACCTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTTCGTCAATAGTTAATTATCGACAGAGGTGTAATTGCTGGAAAAATGTCCATCAGGAAACTAGCGTGC‑AGGTTTGGTATGCATGCGGGGGca > 2:126434/1‑264 (MQ=255) tGCGAGCAAAATCAACGTGGTTTTTGGTGCGAGGGGGGGGACTTGAACCCCCACGTCCGTAAGGACACTAACACCTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTTCGTCAATAGTTAATTATCGACAGAGGTGTAATTGCTGGAAAAATGTCCATCAGGAAACTAGCGTGC‑AGGTTTGGTATGCATGCGGGGGca < 4:126433/264‑1 (MQ=255) aGCAATATCAACGTGGTTTTTGGTGCGAGGGGGGGGACTTGAACCCCCACGTCCGTAAGGACACTAACACCTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTTCGTCAATAGTTAATTATCGACAGAGGTGTAATTGCTGGAAAAATGTCCATCAGGAAACTAGCGTGC‑AGGTTTGGTATGCATGCGGGGGCAGATGCCAGATGCGAc > 2:465788/1‑275 (MQ=255) atCAACGGGGTGTTTGGGGCGAGGGGGGGGACGTGAACCCCCACGTCCGTAAGGACACTAACACCTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTTCGTCAATAGTTAATTATCGACAGAGGTGTAATTGCTGGAAAAATGTCCATCAGGAAACTAGCGTGC‑AGGTTTGGTATGCATGCGGGGGCAGATGCCAGATGCGACGCTGgc < 2:146485/275‑1 (MQ=255) tttttGGTGCGAGGGGGGGGACTTGAACCCCCACGTCCGTAAGGACACTAACACCTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTTCGTCAATAGTTAATTATCGACAGAGGTGTAATTGCTGGAAAAATGTCCATCAGGAAACTAGCGTGC‑AGGTTTGGTATGCATGCGGGGGCAGATGCCAGATGCGACGCTGGCGCGTCTTAt > 2:132880/1‑274 (MQ=255) ttttGGTGCGAGGGGGGGGACTTGAACCCCCACGTCCGTAAGGACACTAACACCTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTTCGTCAATAGTTAATTAt > 2:538505/1‑170 (MQ=255) ggTGCGAGGGGGGGGACNTGAANCCCCACGTCCGTAAGGACACTAANACCTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTTCGTCAATAGTTAATTATCGAc < 4:538504/170‑1 (MQ=255) cGAGGGGGTGGACTTGAACCCCCACGTCCGTAAGGACACTAACACCTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTTCGTCAATAGTTAATTATCGACAGAGGTGTAATTGCTGGAAAAATGTCCATCAGGAAACTAGCGTGC‑AGGTTTGGTATGCATGCGGGGGCAGATGCCAGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCTGGCCTACg < 1:39687/275‑1 (MQ=255) cGAGGGGGGGGACTTGAACCCCCACGTCCGTAAGGACACTAACACCTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTTCGt < 6:662784/148‑1 (MQ=255) ggggggggACTTGAACCCCCACGTCCGTAAGGACACTAACACCTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTTTTAAGAATTg < 7:334819/105‑1 (MQ=255) ggggggggACTTGAACCCCCACGTCCGTAAGGACACTAACACCTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTTTTAAGAATTg > 8:334819/1‑105 (MQ=255) gggggACTTGAACCCCCACGTCCGTAAGGACACTAACACCTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTTCGTCAATAGTTAATTATCGACAGAGGTGTAATTGCTGGAAAAATGTCCATCAGGAAACTAGCGTGC‑AGGTTTGGTATGCATGCGGGGGCAGATGCCAGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCTGCCCTACGAAGGGc > 2:396525/1‑275 (MQ=255) aCTTGAACCCCCACGTCCGTAAGGACACTAACACCTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTTCGTCAATAGTTAAt > 6:118686/1‑148 (MQ=255) tttaaCCCCCACGTCCGTAAGGACCCTACCACCTTGTGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAATAATTGCAACCTCGGAGGCGCATCCTGGTGGTTTTCAGCTTTTCGTCAATAGTTAATTATCGACAGAGGTGTAATTGCTGGAGAAATGTCCATCAGGAAACTAGCGTGC‑AGGTTTGGTATGCATGCGGGGGCAGATG‑CAGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCTGGCCTACGAAGGGCTAACGTGc < 4:145193/272‑1 (MQ=255) tGAACCCCCACGTCCGTAAGGACACTAACACCTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTAcc < 8:1083296/99‑1 (MQ=255) tGAACCCCCACGTCCGTAAGGACACTAACACCTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTAcc > 7:1083296/1‑99 (MQ=255) aaCCCCCACGTCCGTAAGGACACTAACACCTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCtttt < 7:470098/129‑1 (MQ=255) aaCCCCCACGTCCGTAAGGACACTAACACCTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCtttt > 8:470098/1‑129 (MQ=255) ccACGTCCGTAAGGACACTAACACCTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTTCGTCAATAGTTAATTATCGACAGAGGTGTAATTGCTGGAAAAATGTCCATCAGGAAACTAGCGTGT‑AGGTTTGGTATGCATCCGGGGGCAGATGCCAGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCTGGCCTCCGACTGGCTACGGTGAAGGtttt > 2:537611/1‑275 (MQ=255) aCGTCCGTAAGGACACTAACACCTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTTCGTCAATAGTTAATTATCGACAGAGGTGTAATTGCTGGAAAAATGTCCATCAGGAAACTAGCGTGC‑AGGTTTGGTATGCATGCGGGGGcagatgccagatgc > 4:160806/1‑224 (MQ=255) aCGTCCGTAAGGACACTAACACCTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTTCGTCAATAGTTAATTATCGACAGAGGTGTAATTGCTGGAAAAATGTCCATCAGGAAACTAGCGTGC‑AGGTTTGGTATGCATGCGGGGGCAGATGCCAGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATTTGTCCTACGAAGGGCTAACGTTCAGGTTTTGt > 1:17394/1‑275 (MQ=255) tAAGGACACTAACACCTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGgcg < 6:548043/92‑1 (MQ=255) tAAGGACACTAACACCTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGgcg > 5:548043/1‑92 (MQ=255) tAAGGACACTAACACCTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTTCGTCa > 6:131206/1‑120 (MQ=255) tAAGGACACTAACACCTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTTCGTCa < 5:131206/120‑1 (MQ=255) tAAGGACACTAACACCTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTTCGTCAATAGTTAATTATCGACAGAGGTGTAATTGCTGGAAAAATGTCCATCAGGAAACTAGCGTGC‑AGGTTTGGTATGCATGCGGGGGCAGATGCCAGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCTGGCCTACGAAGGGCTAACGTGCAGGTTTTGTAGGTCg > 2:477638/1‑274 (MQ=255) tAAGGACACTAACACCTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTTCGTCAATAGTTAATTATCGACAGAGGTGTAATTGCTGGAAAAATGTCCATCAGGAAACTAGCGTGC‑AGGTTTGGTATGCATGCGGGGGCAGATGCCAGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCTGGCCTACCAAGGGCTAACGTGCAGGTTTTGTAGGTCg > 2:71304/1‑274 (MQ=255) tAAGGACACTAACACCTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTTCGTCAATAGTTAATTATCGACAGAGGTGTAATTGCTGGAAAAATGTCCATCAGGAAACTAGCGTGC‑AGGTTTGGTATGCATGCGGGGGCAGATGCCAGATGCGACGCTGGCCCGTCTTATCTGGCCTACGAGGGGCTAACGTGCTGGTTTTGTAGGTCg > 4:217892/1‑274 (MQ=255) aGGACCCTAACACCTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTTCGTCAATAGTTAATTATCGACAGAGgtg < 8:1035499/141‑1 (MQ=255) aGGACACTAACACCTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTTCGTCAATAGTTAATTATCGACAGAGgtg > 7:1035499/1‑141 (MQ=255) cacTAACACCTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGt < 6:459758/95‑1 (MQ=255) cacTAACACCTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGt > 5:459758/1‑95 (MQ=255) acTAACACCTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTTCGTCAATAGTTAATTATCGACTGAGGTGTAATTGCTGGAAAAATGTCCATCAGGAAACTAGCGTGC‑AGGTTTGGTATGCATGCGGGGGCAGATGCCAGATGCGACGCTGGCGCGTCTTAACTGGCCTACGAAGGCCTAACGTGCAGGTTTTGTAGGTCggcacagg > 4:341349/1‑268 (MQ=255) acTAACACCTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCACACCCACAATACTTAAAAAGATATCCTCCCGCGTCGTCCCATTCTGGGGGTTTTAAGCTTCTCGTCCATAATTAATCTCAGACCGAAGTGTAATTGGTCTAACAATTCCGCACAGGAACCTAGCTTTC‑AGTTTTGATATGCTTGCGTGTGCTGGTACCGGCTTCGCCTCTGCCCCGACCTACCTGGCCTACGAAACGCCCAGATGCCGGTTTTGttcatgttgatagc > 4:129322/1‑261 (MQ=255) cTAACACCTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTaaaa > 6:515010/1‑63 (MQ=255) cTAACACCTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTTCGTCAATAGt < 5:444547/117‑1 (MQ=255) tAACACCTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTTCGTCAATAGTTAATTATCGACAGAGGTGTAATTGCTGGAAAAATGTCCATCAGGAAACTAGCGTGC‑AGGTTTGGTATGCATGCGGGGGCAGATGCCAGATGCGACGATGGCGCGTCTTATCTGGCCTACGAAGGGCTAACGTGCAGGTTTTGTAGGTCGGATAAGGCGt > 4:384393/1‑275 (MQ=255) aaCACCTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTTCGTCAATAGTTAATTATCGACaga > 8:179074/1‑129 (MQ=255) aaCACCTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTTCGTCAATAGTTAATTATCGACaga < 7:179074/129‑1 (MQ=255) ccTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCCCGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTTCGTCAATAGTTAATTATCGACAGAGGTGTAATTGCTGGAAAAATGTCCATCAGGAAACTAGCGTGC‑AGGTTTGGTATGCATGCGGGGGCAGATGCCAGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCTGGCCTACGAAGGGCTAACGTGCAGGTTTGGTAGGTCGGATAAGGCGTTCAcg > 2:115564/1‑275 (MQ=255) tGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCtt < 5:647274/97‑1 (MQ=255) tGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCtt > 6:647274/1‑97 (MQ=255) tGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAACTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTTCGTCAATAGTTAATTATCGACAGAGgtg < 8:860912/127‑1 (MQ=255) tGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAACTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTTCGTCAATAGTTAATTATCGACAGAGgtg > 7:860912/1‑127 (MQ=255) gAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTTCGTCAATAGTTa > 7:210345/1‑110 (MQ=255) gAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTTCGTCAATAGTTa < 8:210345/110‑1 (MQ=255) aGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTTCGTCAATAGTTAATTATCGACAGAGGTGTAATTGCTGGAAAAATGTCCATCAGGAAACTAGc > 4:250797/1‑154 (MQ=255) cgcgTCTACCAATTCCGCAACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTTCGTCAATAGTTAATTATCGACAGAGGTGTAATTGCTGGAAAAATGTCCATCAGGAAACTAGCGTGC‑AGGTTTGGTATGCATGCGGGGGAAGATGCCAGATGCGACGCTGGCCCGTATTAAATGGACTACGACGGCCGAACGTACCGGTTTTTTAGGTCGGATAAGGCGTTCACCCAGCCTCCgcc > 4:241439/1‑273 (MQ=255) gcgTCTACCAATTCTGCCACCTTCGAATACCAGCAATTCTTAAAAAGAATGGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTTCGTCAATAGTTAATTATCGACAGAGGTGTAATTGCTGGAAAAATGTCCATCAGGAAACTAGCGTGC‑AGGTTTGGTATGCATGCGGGGGCAGAGGCCAGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCTGGCCTACGAAGGGCTAACGTGCAGGTTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGaca < 2:397718/275‑1 (MQ=255) gcgTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTTCGTCAATAGTTAATTATCGACAGAGGTGTAATTGCTGGAAAAATGTCCATCAGGAAACTAGCGTGC‑AGGTTTGGTATGCATGCGGGGGCAGATGCCAGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCTGGCCTACGAAGGGCTAACGTGCAGGTTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGaca < 2:129323/275‑1 (MQ=255) gcgTCTACCAATTCCGCCAACTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTTCGGCAATAGTTAATTATCGACAGAGGTGTAATTGCTGGAAAAATGTCCATCAGGAAACTAGCGTGC‑AGGTTTGGTATGCATGCGGGGGCAGATGCCAGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCTGGCCTACGAAGGGCTAACGTGCAGGTTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGaca < 2:49480/275‑1 (MQ=255) cgTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTTCGTCAATAGTTAATTATCGACAGAGGTGTAATTGCTGGAAAAATGTCCATCAGGAAACTAGCGTGc < 2:250798/154‑1 (MQ=255) ccAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGtttt < 7:1038834/74‑1 (MQ=255) ccAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGtttt > 8:1038834/1‑74 (MQ=255) ccAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTTCGTCAATAGTTAATTATCGACaga < 8:760022/106‑1 (MQ=255) ccAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTTCGTCAATAGTTAATTATCGACaga > 7:760022/1‑106 (MQ=255) ccAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTTCGTCAATAGTTAATTATCGACAGAGGTGTAATTGCt < 7:55637/118‑1 (MQ=255) ccAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTTCGTCAATAGTTAATTATCGACAGAGGTGTAATTGCt > 8:55637/1‑118 (MQ=255) cAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCt < 7:763293/64‑1 (MQ=255) cAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTTCg > 8:795860/1‑83 (MQ=255) cAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTTCg < 7:795860/83‑1 (MQ=255) cAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTTCGTCa < 6:900045/86‑1 (MQ=255) aaTTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGt < 7:1112382/66‑1 (MQ=255) aaTTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGt > 8:1112382/1‑66 (MQ=255) ttCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTTCGTCAATAGTTAATTATCGACag < 8:604203/101‑1 (MQ=255) ttCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTTCGTCAATAGTTAATTATCGACag > 7:604203/1‑101 (MQ=255) ccACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTTCGTCAATAGTTAATTATCGACAGAGgt > 8:942600/1‑100 (MQ=255) ccACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTTCGTCAATAGTTAATTATCGACAGAGgt > 8:766954/1‑100 (MQ=255) ccACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTTCGTCAATAGTTAATTATCGACAGAGgt < 7:942600/100‑1 (MQ=255) cACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTTCGTCAATAGTTAATTATCGACAGAGGTGTAATTGCTGGAAAAATGTCCATc > 5:593328/1‑123 (MQ=255) cACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTTCGTCAATAGTTAATTATCGACAGAGGTGTAATTGCTGGAAAAATGTCCATc < 6:593328/123‑1 (MQ=255) ttCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTTCGTCAATAGTTAATTATCGACAGAGGTGTAATTGCTGGAAAAAt > 7:985112/1‑112 (MQ=255) cGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTTCGTCGATAGTTAATTATCGACAGAGGTGTAATTGCTGGAAAAATGTCCATCAGGAAACTAGCGTGC‑AGGTTTGGTATGCATGCGGGGGCAGATGCCAGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCTGGCCTACGAAGGGCTAACGTGCAGGTTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGACACGGTATTCGGCGAGATAATTAAc < 1:120415/275‑1 (MQ=255) cATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTTCGTCAATAGTTAATTATCGACAGAGGTGTAATTGCTGGAAAAATGTCCa > 5:406956/1‑108 (MQ=255) cATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTTCGTCAATAGTTAATTATCGACAGAGGTGTAATTGCTGGAAAAATGTCCa < 6:406956/108‑1 (MQ=255) cATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTTCGTCAATAGTTAATTATCGACAGAGGTGTAATTGCTGGAAAAATGTCCATCAGGAAACTAGCGTGC‑AGGTTTGGTATGCATGCGGGGGCAGATGCCAGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCTGGCCTACGAAGGGCTAACGTGCAGGTTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGACACGGTATTCGGCGGGATAATTAACCTttctt > 2:245541/1‑275 (MQ=255) aTCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTTCGTCAATAGTTAATTATCGACAGAGGTGTAATTGCTGGAAAAATGTCCATCAGGAAACTAGCGTGC‑AGGTTTGGTATGCATGCGGGGGCAGATGCCAGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCTGGCCTACGAAGGGCTAACGTGCAGGTTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGACACGGTATTCGGCGAGATAATTAACCTttcttc > 2:151014/1‑275 (MQ=255) gcAATTCTTTTTAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTTCGTCAATAGTTAATTATCGACAGAGGTGTAATTGc < 8:1139753/91‑1 (MQ=255) gcAATTCTTTTTAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTTCGTCAATAGTTAATTATCGACAGAGGTGTAATTGc > 7:1139753/2‑92 (MQ=255) gcAATTCTTTTTAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGGTTTCAGCTTTTCGTCAATAGTTAATTATCGACAGAGGTGTAATTGc > 5:605028/2‑92 (MQ=255) cAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTTCGTCAATAGTTAATTATCGACAGAGGTGTAATTGCTGGAAAAATGTCCATCAGGAAACTAg > 5:1096961/1‑117 (MQ=255) cAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTTCGTCAATAGTTAATTATCGACAGAGGTGTAATTGCTGGAAAAATGTCCATCAGGAAACTAg < 6:1096961/117‑1 (MQ=255) ttttAAAAAGAATTGCTACCACGGGGGCGCATTTTAGTGGTTTTCAGCTTTTCGTCAATAGTTAATTATCGACAGAGGTGTAATTGCTGGAAAAATGTCCATCAGGAAACTAGCGTGC‑AGGTTTGGTATGCATGCGGGGGCAGATGCCAGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCTGGCCTACGAAGGGCTAACGTGCAGGTTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGACACGGTATTCGGCGAGATAATTAACCTTTCTTCGCCTgg < 4:465787/273‑1 (MQ=255) tCTTAAAAAAAATTGTTACACCGGGGGCGCATTCTAGTGGTTTTAAGCTTTTCTTCAATAGTTAATTATCGACAGAGGTGTAATTGCTGGAAAAATGTCCATCAGGAAACTAGCGTGC‑AGGTTTGGTATGCATGCGGGGGCAGATGCCAGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCTGGCCTACGAAGGGCTAACGTGCAGGTTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGACACGGTATTCGGCGAGATAATTAACCTTTCTTCGCCTgg < 4:92133/275‑1 (MQ=255) | TACCAATTCCGCCACCTTCGCACAGTCATCTTACTTTTTTTGATATCGCCTCGTTTGGTGCGAGGGGGGGGACTTGAACCCCCACGTCCGTAAGAACACTAACACCTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCCCAGTGCGAGCAATATCAACGTGGTTTTTGGTGCGAGGGGGGGGACTTGAACCCCCACGTCCGTAAGGACACTAACACCTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTTCGTCAATAGTTAATTATCGACAGAGGTGTAATTGCTGGAAAAATGTCCATCAGGAAACTAGCGTGC‑AGGTTTGGTATGCATGCGGGGGCAGATGCCAGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCTGGCCTACGAAGGGCTAACGTGCAGGTTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGACACGGTATTCGGCGAGATAATTAACCTTTCTTCGCCTGG > NC_000913/4606145‑4606687 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |