| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 585,863 | T→C | 12.6% | intergenic (‑230/‑194) | ompT ← / → pauD | DLP12 prophage; outer membrane protease VII; outer membrane protein 3b/tRNA‑OTHER |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 585,863 | 0 | T | C | 12.6% | 230.5 / 20.8 | 80 | intergenic (‑230/‑194) | ompT/pauD | DLP12 prophage; outer membrane protease VII; outer membrane protein 3b/tRNA‑OTHER |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (37/32); new base C (5/5); total (43/37) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.72e-01 | |||||||||||
TAGTATTGAATGATTATCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTGAGACACATAAGGCCTCGCAATGGCTTGCAAGGCTTTACATGTTTTGAGGTAGTGGGACGTGTGAGCGCAGAGATGGCGCGGTAAGTTGTTGACTTAAAATGTCGTTCTAGGAACTTCTAAGTCGTGGGCCGCAGGTTCGAATCCTGCAGGGCGCGCCATTTCTTCC > NC_000913/585732‑586109 | tAGTATTGAATGATTATCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTagag > 5:871630/1‑137 (MQ=255)tAGTATTGAATGATTATCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTagag < 6:871630/137‑1 (MQ=255) tATTGAATGATTATCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTGAGACACTTAAGGCCTCGCAATGGCTTCCAAGGCTTTAATTGTTTTGAGGTATTGGGACGTGTGAgc > 4:469657/1‑275 (MQ=255) aaTGATTATCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATa > 4:66202/1‑146 (MQ=255) aTTATCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCAt < 2:66203/146‑1 (MQ=255) ttATCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTGAGACACATAAGGCCTCGCAATGGCt > 4:120000/1‑224 (MQ=255) tCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAAc > 4:211219/1‑194 (MQ=255) cacaATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCa < 8:850182/123‑1 (MQ=255) cacaATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCa > 7:850182/1‑123 (MQ=255) cacaATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTGAGACACATAAGGCCTCGCAATGGCTTGCa < 2:120001/224‑1 (MQ=255) aaTGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTgag < 2:211220/194‑1 (MQ=255) aTCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTCGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTGAGACACATAAGGCCTCGCAATGGCTTGCACGGCTTTACATGTTTTGAGGTAGTGGGATGTGTGAGCGCAGAGTTGGCGCGGTAAGttgttg > 1:12936/1‑275 (MQ=255) ttAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGc < 8:392444/98‑1 (MQ=255) ttAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGc > 7:392444/1‑98 (MQ=255) tGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAAc > 4:571197/1‑160 (MQ=255) tATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATg > 7:843655/1‑106 (MQ=255) tATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATg < 8:843655/106‑1 (MQ=255) aTTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTgag < 2:571198/160‑1 (MQ=255) aTTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTGAGACACATAAGGCCTCGCAATGGCTTGCAAGGCTTTACATGTTTTGAGGTAGTGGGACGTGTGAGCGCAGAGATGGCGCGGTAAGTTGTTGACTTAAAATGTCGTTCTAGGAACtt > 2:276524/1‑274 (MQ=255) tttCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAAt > 2:540644/1‑116 (MQ=255) ttCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGa > 6:664961/1‑101 (MQ=255) ttCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGa < 5:664961/101‑1 (MQ=255) tCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTGAGACACATAAGGCCTCGCAATGGCTTGCAAGGCTTTACATGTTTTGCGTTAGTGGGACGTGTGAGCGCAGAGATGGCGCGGTAAGTTGTTGACTTAAAAGGTCGTTCTAGGTACTTCTAAGTc > 1:52102/1‑275 (MQ=255) atatTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACt < 4:540643/116‑1 (MQ=255) ttCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGtttttt > 8:243098/1‑121 (MQ=255) ttCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGtttttt < 7:243098/121‑1 (MQ=255) tCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCa < 5:152141/105‑1 (MQ=255) tCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCa > 6:152141/1‑105 (MQ=255) gTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAaga > 8:202119/1‑130 (MQ=255) gTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAaga < 7:202119/130‑1 (MQ=255) tttACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTa < 6:854462/104‑1 (MQ=255) tttACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTa > 5:854462/1‑104 (MQ=255) aCTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTAt > 5:991206/1‑92 (MQ=255) aCTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTAt < 6:991206/92‑1 (MQ=255) tgGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTa > 4:567643/1‑85 (MQ=255) gTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGaaa > 5:988371/1‑68 (MQ=255) gTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGaaa < 6:988371/68‑1 (MQ=255) tttttttATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCata < 8:7908/58‑1 (MQ=255) tttttttATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCata > 7:7908/1‑58 (MQ=255) ttttttATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCt < 2:567644/85‑1 (MQ=255) aTGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATaa > 3:83366/1‑54 (MQ=255) ttttGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGa < 1:83366/54‑1 (MQ=255) tgCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATg > 5:39254/1‑56 (MQ=255) tgCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATg < 6:39254/56‑1 (MQ=255) tgCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGtttttt < 8:633226/84‑1 (MQ=255) tgCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGtttttt > 7:633226/1‑84 (MQ=255) tgCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAaga > 6:390854/1‑97 (MQ=255) tgCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAaga < 5:390854/97‑1 (MQ=255) tgCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTGAGACACATAAGGCCTCGCAATGGCTTGCAAGGCTTTACATGTTTTGAGGTAGTGGGACGTGTGAGCGCAGAGATGGCGCGGTAAGTTGTTGACTTAAAATGTCGTTCTAGGAACTTCTAAGTCGTGGGCCGCAGGTTCAAATCCTGCAGGGCGCGCCATTTCTTcc < 4:276523/275‑1 (MQ=255) tCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTg < 5:234692/101‑1 (MQ=255) tCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTg > 6:234692/1‑101 (MQ=255) aTTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGa > 8:401296/1‑90 (MQ=255) aTTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGa < 7:401296/90‑1 (MQ=255) tttAAGTGCAATGCCTGTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGAAAAAACTGAGACAAATAAGAACTCGCAATGGCTTGCAAGGCTTTACATGNTTTGAGGTAGTGGGACGTTTAAGAGCACAGATGGCGCGGTAAGTTGTTGACTTCAAATGTCGTTCTAGGAACTTCTAAGTCTGGGGCCGCACGTTCGacctct > 3:107184/1‑237 (MQ=255) ttAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAagag > 7:1086114/1‑85 (MQ=255) ttAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAagag < 8:1086114/85‑1 (MQ=255) aGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTGAGACACATAAGGCCTCGCaa > 7:93505/1‑113 (MQ=255) aGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTGAGACACATAAGGCCTCGCaa < 8:93505/113‑1 (MQ=255) tataTGCCTCTAAAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTa < 5:263492/63‑1 (MQ=39) tataTGCCTCTAAAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTa > 6:263492/4‑66 (MQ=39) tataTGCCTCTAAAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACaaaa < 6:445266/84‑1 (MQ=255) tataTGCCTCTAAAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACaaaa > 5:445266/4‑87 (MQ=255) ataTGCCTCTAAAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTGAGACACATAAGGCCTCGCAATGGCTTGCAAGGCTTTACATGttt > 6:106537/3‑133 (MQ=255) ataTGCCTCTAAAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTGAGACACATAAGGCCTCGCAATGGCTTGCAAGGCTTTACATGttt < 5:106537/131‑1 (MQ=255) taTGCCTCTAAAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTa > 5:775282/2‑52 (MQ=38) taTGCCTCTAAAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTa < 6:775282/51‑1 (MQ=38) taTGCCTCTAAAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGtttttt < 5:684060/62‑1 (MQ=255) taTGCCTCTAAAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGtttttt > 6:684060/2‑63 (MQ=255) cATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAACGAGGGACAAAACTGAGACACATAAGGCCTCGCAATGGCTTGCAAGGCTTTACATGTTTTGAGGTAGTGGGACgt > 5:522464/1‑148 (MQ=255) aTGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTGAGACACATAAGGCCTCGCAATGGCTTGCAAGGCTTTACATGTTTTGAGGTAg > 8:815712/1‑139 (MQ=255) aTGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTGAGACACATAAGGCCTCGCAATGGCTTGCAAGGCTTTACATGTTTTGAGGTAg < 7:815712/139‑1 (MQ=255) tGCCTTTAGAGGCATATTAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAag < 5:283440/73‑1 (MQ=255) tGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCTTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAag > 6:283440/1‑73 (MQ=255) tGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTGAGACACATAAGGCCTCGCAATGGCTTGCAAGGCTTTACATg < 5:1036958/127‑1 (MQ=255) tGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTGAGACACATAAGGCCTCGCAATGGCTTGCAAGGCTTTACATg > 6:1036958/1‑127 (MQ=255) tGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTGAGACACATAAGGCCTCGCAATGGCTTGCAAGGCTTTACATGTTTTGa < 7:970047/133‑1 (MQ=255) tGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTGAGACACATAAGGCCTCGCAATGGCTTGCAAGGCTTTACATGTTTTGa > 8:970047/1‑133 (MQ=255) tGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTGAGACACATAAGGCCTCGCAATGGCTTGCAAGGCTTTACATGTTTTGAGGTAGTGGGACgtgt > 5:740600/1‑148 (MQ=255) ccTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGtttttt < 8:546864/59‑1 (MQ=255) ccTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGtttttt > 7:546864/1‑59 (MQ=255) tttAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTg < 8:984288/82‑1 (MQ=255) tttAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTg > 7:984288/1‑82 (MQ=255) ttAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTGAGACACATAAGGCCTCGCaa < 8:934520/101‑1 (MQ=255) ttAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTGAGACACATAAGGCCTCGCaa > 7:934520/1‑101 (MQ=255) ttAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTGAGACACATAAGGCCTCGCAATGGCTTGCAAGGCTTTACATGTTTTGAGGTAGTGGGACGtgtg > 6:248135/1‑144 (MQ=255) ttAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTGAGACACATAAGGCCTCGCAATGGCTTGCAAGGCTTTACATGTTTTGAGGTAGTGGGACGtgtg < 5:248135/144‑1 (MQ=255) | TAGTATTGAATGATTATCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTGAGACACATAAGGCCTCGCAATGGCTTGCAAGGCTTTACATGTTTTGAGGTAGTGGGACGTGTGAGCGCAGAGATGGCGCGGTAAGTTGTTGACTTAAAATGTCGTTCTAGGAACTTCTAAGTCGTGGGCCGCAGGTTCGAATCCTGCAGGGCGCGCCATTTCTTCC > NC_000913/585732‑586109 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |