| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 444575 | 34 (0.360) | 4 (0.050) | 4/164 | NT | 12.7% | intergenic (‑60/‑108) | panE/yajQ | 2‑dehydropantoate reductase, NADPH‑specific/phage Phi6 host factor, ATP/GTP binding protein |
| ? | NC_000913 | = 444587 | 27 (0.350) | intergenic (‑72/‑96) | panE/yajQ | 2‑dehydropantoate reductase, NADPH‑specific/phage Phi6 host factor, ATP/GTP binding protein | |||||
Only 100 of 103 total aligned reads displayed.
CCCTGAACTTCATGACCCTGTTTGCAAAGTGCTGTAAGCCATAATTGCCCTAAGGCACCGCATCCCAATACGGTAATTTTCATTGTTCCTCCTCACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATCAAAAATGAAGGGAGAGGAAAAGATGCCATCTTTCGATATTGTCTCTGAAGTTGATCTTC > NC_000913/444433‑444719 | cccTGAACTTCATGACCCTGTTTGCAAAGTGCTGTAAGCCATAATTGCCCTAAGGCACCGCATCCCAATACGGTAATTTTCATTGTTCCTCCTCACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGt > 4:71234/1‑148 (MQ=255)cccTGAACTTCATGACCCTGTTTGCAAAGTGCTGTAAGCCATAATTGCCCTAAGGCACCGCATCCCAATACGGTAATTTTCATTGTTCCTCCTCACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGt > 4:452447/1‑148 (MQ=255) aaCTTCATGACCCTGTTTGCAAAGTGCTGTAAGCCATAATTGCCCTAAGGCACCGCATCCCAATACGGTAATTTTCATTGTTCCTCCTCACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGa < 4:322674/148‑1 (MQ=255) tCATGACCCTGTTTGCAAAGTGCTGTAAGCCATAATTGCCCTAAGGCACCGCATCCCAATACGGTAATTTTCATTGTTCCTCCTCACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGa < 2:607364/144‑1 (MQ=255) tCATGACCCTGTTTGCAAAGTGCTGTAAGCCATAATTGCCCTAAGGCACCGCATCCCAATACGGTAATTTTCATTGTTCCTCCTCACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGa > 1:607364/1‑144 (MQ=255) aTGACCCTGTTTGCAAAGTGCTGTAAGCCATAATTGCCCTAAGGCACCGCATCCCAATACGGTAATTTTCATTGTTCCTCCTCACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTatgc > 3:452447‑M2/1‑144 (MQ=255) aTGACCCTGTTTGCAAAGTGCTGTAAGCCATAATTGCCCTAAGGCACCGCATCCCAATACGGTAATTTTCATTGTTCCTCCTCACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTatgc > 3:71234‑M2/1‑144 (MQ=255) aCCCTGTTTGCAAAGTGCTGTAAGCCATAATTGCCCTAAGGCACCGCATCCCAATACGGTAATTTTCATTGTTCCTCCTCACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTatgcaca < 4:272201‑M2/148‑8 (MQ=255) cTGTTTGCAAAGTGCTGTAAGCCATAATTGCCCTAAGGCACCGCATCCCAATACGGTAATTTTCATTGTTCCTCCTCACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTatgc > 3:236673‑M2/1‑138 (MQ=255) cTGTTTGCAAAGTGCTGTAAGCCATAATTGCCCTAAGGCACCGCATCCCAATACGGTAATTTTCATTGTTCCTCCTCACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTatgc < 4:236673‑M2/142‑5 (MQ=255) tttGCAAAGTGCTGTAAGCCATAATTGCCCTAAGGCACCGCATCCCAATACGGTAATTTTCATTGTTCCTCCTCACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTatgcacaattaag > 3:272201‑M2/1‑135 (MQ=255) aaaGTGCTGTAAGCCATAATTGCCCTAAGGCACCGCATCCCAATACGGTAATTTTCATTGTTCCTCCTCACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTatgcacaattaagggata > 1:1057423‑M2/1‑130 (MQ=255) aaGTGCTGTAAGCCATAATTGCCCTAAGGCACCGCATCCCAATACGGTAATTTTCATTGTTCCTCCTCACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTatgc < 2:178889‑M2/133‑5 (MQ=255) aaGTGCTGTAAGCCATAATTGCCCTAAGGCACCGCATCCCAATACGGTAATTTTCATTGTTCCTCCTCACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTatgc > 1:178889‑M2/1‑129 (MQ=255) aGTGCTGTAAGCCATAATTGCCCTAAGGCACCGCATCCCAATACGGTAATTTTCATTGTTCCTCCTCACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTg < 4:16973/123‑1 (MQ=255) aGTGCTGTAAGCCATAATTGCCCTAAGGCACCGCATCCCAATACGGTAATTTTCATTGTTCCTCCTCACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTg > 3:16973/1‑123 (MQ=255) aGTGCTGTAAGCCATAATTGCCCTAAGGCACCGCATCCCAATACGGTAATTTTCATTGTTCCTCCTCACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACg > 1:944266/1‑148 (MQ=255) tAAGCCATAATTGCCCTAAGGCACCGCATCCCAATACGGTAATTTTCATTGTTCCTCCTCACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGt < 1:519259/148‑1 (MQ=255) aaGCCATAATTGCCCTAAGGCACCGCATCCCAATACGGTAATTTTCATTGTTCCTCCTCACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGc > 3:553384/1‑110 (MQ=255) aaGCCATAATTGCCCTAAGGCACCGCATCCCAATACGGTAATTTTCATTGTTCCTCCTCACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGc < 4:553384/110‑1 (MQ=255) ttGCCCTAAGGCACCGCATCCCAATACGGTAATTTTCATTGTTCCTCCTCACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTatgcacaatta > 1:244108‑M2/1‑111 (MQ=255) cTAAGGCACCGCATCCCAATACGGTAATTTTCATTGTTCCTCCTCACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATagtcgcaacagcatgcacaattaagggat < 1:191174‑M1/123‑30 (MQ=255) cTAAGGCACCGCATCCCAATACGGTAATTTTCATTGTTCCTCCTCACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATagtcgcaacagcatgcacaattaagggat > 2:191174‑M1/1‑94 (MQ=255) tAAGGCACCGCATCCCAATACGGTAATTTTCATTGTTCCTCCTCACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACt < 4:863321/105‑1 (MQ=255) aGGCACCGCATCCCAATACGGTAATTTTCATTGTTCCTCCTCACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCg < 2:137112/100‑1 (MQ=255) aGGCACCGCATCCCAATACGGTAATTTTCATTGTTCCTCCTCACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCg > 1:137112/1‑100 (MQ=255) aaTACGGTAATTTTCATTGTTCCTCCTCACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTatgcacaatta < 3:864562‑M2/100‑12 (MQ=255) aaTACGGTAATTTTCATTGTTCCTCCTCACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTatgcacaatta > 4:864562‑M2/1‑89 (MQ=255) aTACGGTAATTTTCATTGTTCCTCCTCACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTatgcacaattaa < 1:973574‑M2/100‑13 (MQ=255) aTACGGTAATTTTCATTGTTCCTCCTCACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTatgcacaattaa > 2:973574‑M2/1‑88 (MQ=255) tACGGTAATTTTCATTGTTCCTCCTCACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCg < 2:59069/126‑1 (MQ=255) tACGGTAATTTTCATTGTTCCTCCTCACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCg > 1:59069/1‑126 (MQ=255) gTAATTTTCATTGTTCCTCCTCACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTatgcacaattaag > 3:763621‑M2/1‑83 (MQ=255) gTAATTTTCATTGTTCCTCCTCACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTatgcacaattaag < 4:763621‑M2/96‑14 (MQ=255) tCATTGTTCCTCCTCACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTatgcacaattaaggga > 3:938295‑M2/1‑76 (MQ=255) tCATTGTTCCTCCTCACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTatgcacaattaaggga < 4:938295‑M2/92‑17 (MQ=255) tGTTCCTCCTCACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTatgcagaattaa > 4:202767‑M2/1‑72 (MQ=255) tGTTCCTCCTCACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTatgcagaattaa < 3:202767‑M2/84‑13 (MQ=255) tGTTCCTCCTCACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTatgcacaattaa < 1:250842‑M2/84‑13 (MQ=255) tGTTCCTCCTCACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTatgcacaattaa > 2:250842‑M2/1‑72 (MQ=255) cACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACt < 4:101584/62‑1 (MQ=255) cACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACt > 3:956487/1‑62 (MQ=255) cACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACt > 3:101584/1‑62 (MQ=255) cGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATagtcgcaacagcatgcaca < 1:178693‑M1/65‑20 (MQ=255) cGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATagtcgcaacagcatgcaca > 2:178693‑M1/1‑46 (MQ=255) aCCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTatgcacaattaag < 1:1102246‑M2/67‑14 (MQ=255) aCCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTatgcacaattaag > 2:1102246‑M2/1‑54 (MQ=255) aCCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAgg < 3:547738/86‑1 (MQ=255) aCCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAgg > 4:547738/1‑86 (MQ=255) cTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGa < 3:131939/48‑1 (MQ=255) cTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGa > 4:131939/1‑48 (MQ=255) aTAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATCAAAAATGAAGGGAGAGGAAAAGATGCCATCTTTCGata > 2:680289/1‑148 (MQ=255) tATCCCTTAATTGTGCATagtcgcaacagcatgcacaattaagggatagccttattgaacacccggagtggttgcgggtgaggaggaacaatgaaaattaccgtattgggatgcggtgccttagggcaattatggcttacagcacttt > 1:1057423‑M1/1‑18 (MQ=255) aTCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTatgcacaattaagggatagccttattgaacacccggagtggttgcgggtgaggaggaacaatgaaaattaccgtattgggatgcggtgccttag > 2:191174‑M2/1‑29 (MQ=255) aTCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTatgcacaattaagggatagccttattgaacacccggagtggttgcgggtgaggaggaacaatgaaaattaccgtattgggatgcggtgccttag < 1:191174‑M2/123‑95 (MQ=255) tCCCTTAATTGTGCATagtcgcaacagcatgcacaattaagggatagccttattgaacacccggagtggttgcgggtgaggaggaacaatga < 4:938295‑M1/92‑77 (MQ=255) tCCCTTAATTGTGCATagtcgcaacagcatgcacaattaagggatagccttattgaacacccggagtggttgcgggtgaggaggaacaatga > 3:938295‑M1/1‑16 (MQ=255) cTTAATTGTGCATagtcgcaacagcatgcacaattaagggatagccttattgaacacccggagtggttgcgggtgaggaggaacaatgaaaattaccgtattgggatgcggtgccttagggcaattatggcttacagcactttgcaaa > 3:272201‑M1/1‑13 (MQ=255) cTTAATTGTGCATagtcgcaacagcatgcacaattaagggatagccttattgaacacccggagtggttgcgggtgaggaggaacaatgaaaattac < 4:763621‑M1/96‑84 (MQ=255) cTTAATTGTGCATagtcgcaacagcatgcacaattaagggatagccttattgaacacccggagtggttgcgggtgaggaggaacaatgaaaattac > 3:763621‑M1/1‑13 (MQ=255) cTTAATTGTGCATagtcgcaacagcatgcacaattaagggatagccttattgaacacccggagtggt < 1:1102246‑M1/67‑55 (MQ=255) cTTAATTGTGCATagtcgcaacagcatgcacaattaagggatagccttattgaacacccggagtggt > 2:1102246‑M1/1‑13 (MQ=255) ttAATTGTGCATagtcgcaacagcatgcacaattaagggatagccttattgaacacccggagtggttgcgggtgaggaggaacaatgaaaattaccgtat > 2:973574‑M1/1‑12 (MQ=255) ttAATTGTGCATagtcgcaacagcatgcacaattaagggatagccttattgaacacccggagtggttgcgggtgaggaggaacaatgaaaattaccgtat < 1:973574‑M1/100‑89 (MQ=255) ttAATTGTGCATagtcgcaacagcatgcacaattaagggatagccttattgaacacccggagtggttgcgggtgaggaggaaca < 1:250842‑M1/84‑73 (MQ=255) ttAATTGTGCATagtcgcaacagcatgcacaattaagggatagccttattgaacacccggagtggttgcgggtgaggaggaaca > 2:250842‑M1/1‑12 (MQ=255) ttAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCtt < 3:1028931/91‑1 (MQ=255) ttAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCtt > 4:1028931/1‑91 (MQ=255) ttAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATCAAAAATGa < 2:391828/105‑1 (MQ=255) ttAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATCAAAAATGa < 4:58251/105‑1 (MQ=255) ttAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATCAAAAATGa > 3:58251/1‑105 (MQ=255) ttAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATCAAAAATGa > 1:391828/1‑105 (MQ=255) ttAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATCAAAAATGAAGGGAGAGGAAAAGATGCCATCTTTCGATAtt < 3:1008168/137‑1 (MQ=255) ttAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATCAAAAATGAAGGGAGAGGAAAAGATGCCATCTTTCGATAtt > 4:1008168/1‑137 (MQ=255) ttAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATCAAAAATGAAGGGAGAGGAAAAGATGCCATCTTTCGATATTGTCTCTGa < 4:1036137/145‑1 (MQ=255) ttAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATCAAAAATGAAGGGAGAGGAAAAGATGCCATCTTTCGATATTGTCTCTGa > 3:1036137/1‑145 (MQ=255) ttAATTCTGCATagtcgcaacagcatgcacaattaagggatagccttattgaacacccggagtggttgcgggtgaggaggaaca > 4:202767‑M1/1‑12 (MQ=255) ttAATTCTGCATagtcgcaacagcatgcacaattaagggatagccttattgaacacccggagtggttgcgggtgaggaggaaca < 3:202767‑M1/84‑73 (MQ=255) tAATTGTGCATagtcgcaacagcatgcacaattaagggatagccttattgaacacccggagtggttgcgggtgaggaggaacaatgaaaattaccgtattgggatgcggtgccttagggcaa < 2:244108‑M1/122‑112 (MQ=255) tAATTGTGCATagtcgcaacagcatgcacaattaagggatagccttattgaacacccggagtggttgcgggtgaggaggaacaatgaaaattaccgtattgggatgcggtgccttagggcaa > 1:244108‑M1/1‑11 (MQ=255) tAATTGTGCATagtcgcaacagcatgcacaattaagggatagccttattgaacacccggagtggttgcgggtgaggaggaacaatgaaaattaccgtatt > 4:864562‑M1/1‑11 (MQ=255) tAATTGTGCATagtcgcaacagcatgcacaattaagggatagccttattgaacacccggagtggttgcgggtgaggaggaacaatgaaaattaccgtatt < 3:864562‑M1/100‑90 (MQ=255) tAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTaa < 1:939181/71‑1 (MQ=255) tAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTaa > 2:939181/1‑71 (MQ=255) tgtgCATagtcgcaacagcatgcacaattaagggatagccttattgaacacccggagtggttgcgggtgaggaggaacaatgaaaattaccgtattgggatgcggtgccttagggcaattatggcttacagcactttgcaaacagggt < 4:272201‑M1/148‑142 (MQ=255) tgtgCATGCTGTTGCGACTatgcacaattaagggatagccttattgaacacccggagtggttgcg > 2:178693‑M2/1‑19 (MQ=255) tgtgCATGCTGTTGCGACTatgcacaattaagggatagccttattgaacacccggagtggttgcg < 1:178693‑M2/65‑47 (MQ=255) tgCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATCAAAAATGAAGGGAGAGGAAAAGATGCCATCTTTCGATATTGTCTCTGAAGTTGATCtt > 4:54531/1‑148 (MQ=255) gCATagtcgcaacagcatgcacaattaagggatagccttattgaacacccggagtggttgcgggtgaggaggaacaatgaaaattaccgtattgggatgcggtgccttagggcaattatggcttacagcactttgcaaacagggtcat > 3:71234‑M1/1‑4 (MQ=255) gCATagtcgcaacagcatgcacaattaagggatagccttattgaacacccggagtggttgcgggtgaggaggaacaatgaaaattaccgtattgggatgcggtgccttagggcaattatggcttacagcactttgcaaacagggtcat > 3:452447‑M1/1‑4 (MQ=255) gCATagtcgcaacagcatgcacaattaagggatagccttattgaacacccggagtggttgcgggtgaggaggaacaatgaaaattaccgtattgggatgcggtgccttagggcaattatggcttacagcactttgcaaacag < 4:236673‑M1/142‑139 (MQ=255) gCATagtcgcaacagcatgcacaattaagggatagccttattgaacacccggagtggttgcgggtgaggaggaacaatgaaaattaccgtattgggatgcggtgccttagggcaattatggcttacagcactttgcaaacag > 3:236673‑M1/1‑4 (MQ=255) gCATagtcgcaacagcatgcacaattaagggatagccttattgaacacccggagtggttgcgggtgaggaggaacaatgaaaattaccgtattgggatgcggtgccttagggcaattatggcttacagcactt > 1:178889‑M1/1‑4 (MQ=255) gCATagtcgcaacagcatgcacaattaagggatagccttattgaacacccggagtggttgcgggtgaggaggaacaatgaaaattaccgtattgggatgcggtgccttagggcaattatggcttacagcactt < 2:178889‑M1/133‑130 (MQ=255) cATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAATGGATACGTCCTGGTGCAgg > 3:728170/1‑47 (MQ=255) cATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAgg < 4:728170/47‑1 (MQ=255) cATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATCAAAAATGAAGGGAGAGGAAAAGATGCCATCTTTCGATATTGTCTCTGa < 3:682233/136‑1 (MQ=255) cATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATCAAAAATGAAGGGAGAGGAAAAGATGCCATCTTTCGATATTGTCTCTGa > 4:682233/1‑136 (MQ=255) tGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATCAAAAATGAAGGGAGAGGaaa < 1:535669/106‑1 (MQ=255) tGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATCAAAAATGAAGGGAGAGGaaa > 2:535669/1‑106 (MQ=255) | CCCTGAACTTCATGACCCTGTTTGCAAAGTGCTGTAAGCCATAATTGCCCTAAGGCACCGCATCCCAATACGGTAATTTTCATTGTTCCTCCTCACCCGCAACCACTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATCAAAAATGAAGGGAGAGGAAAAGATGCCATCTTTCGATATTGTCTCTGAAGTTGATCTTC > NC_000913/444433‑444719 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |