| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 3999947 = | 43 (0.460) | 5 (0.060) | 5/190 | NT | 10.4% | coding (1965/2163 nt) | uvrD | DNA‑dependent ATPase I and helicase II |
| ? | NC_000913 | 3999973 = | 45 (0.510) | coding (1991/2163 nt) | uvrD | DNA‑dependent ATPase I and helicase II | |||||
TACGCGGAAACCCGCCGTCTGTATGGTAAAGAGGTTTACCATCGCCCGTCGCGCTTTATCGGCGAGCTGCCGGAAGAGTGTGTGGAAGAGGTGCGCCTGCGCGCCACGGTAAGCCGCCCGGTCAGCCATCAGCGGATGGGTACGCCGATGGTCGAGAACGACAGCGGCTACAAGCTCGGCCAGCGCGTACGCCACGCTAAGTTTGGTGAAGGCACCATTGTCAATATGGAAGGCAGCGGTGAGCATAGCCGTTTGCA > NC_000913/3999822‑4000078 | tACGCGGAAACCCGCCGTCTGTATGGTAAAGAGGTTTACCATCGCCCGTCGCGCTTTATCGGCGAGCTGCCGGAAGAGTGTGTGGAAGAGGTGCGCCTGCGCGCCACGGTAAGCCGCCCGGTCAGCCATCAGCGGATGGGTACGCCGa > 1:963544/1‑148 (MQ=255)ctggccctgaaatgccacctgcaaacggctatgctcaccgctgccttccatattgacaatggtgccttcaccaaacttagcgtggcgtacgcgctggccgagcttgtagccgctgtcgttctcgacc > 1:273582‑M1/126‑127 (MQ=255)ctggccctgaaatgccacctgcaaacggctatgctcaccgctgccttccatattgacaatggtgccttcaccaaacttagcgtggcgtacgcgctggccgagcttgtagccgctgtcgttctcgacc < 2:273582‑M1/2‑1 (MQ=255)ctggccctgaaatgccacctgcaaacggctatgctcaccgctgccttccatattgacaatggtgccttcaccaaacttagcgtggcgtacgcgctggccgagcttgtagccgctgtcgttctcgaCCAt < 4:665384‑M1/4‑1 (MQ=255)ctggccctgaaatgccacctgcaaacggctatgctcaccgctgccttccatattgacaatggtgccttcaccaaacttagcgtggcgtacgcgctggccgagcttgtagccgctgtcgttctcgaCCAt > 3:665384‑M1/126‑129 (MQ=255) tggccctgaaatgccacctgcaaacggctatgctcaccgctgccttccatattgacaatggtgccttcaccaaacttagcgtggcgtacgcgctggccgagcttgtagccgctgtcgttctcgaCCa > 4:96648‑M1/125‑127 (MQ=255) tggccctgaaatgccacctgcaaacggctatgctcaccgctgccttccatattgacaatggtgccttcaccaaacttagcgtggcgtacgcgctggccgagcttctagccgctgtcgttctcgaCCa < 3:96648‑M1/3‑1 (MQ=255) aCGCGGAAACCCGCCGTCTGTATGGTAAAGAGGTTTACCATCGCCCGTCGCGCTTTATCGGCGAGCTGCCGGAAGAGTGTGTGGAAGAGGTGCGCCTGCGCGCCACGGTAAGCCGCCCGGTCAGCCATCAGCGGATGGGTACGCCGAt > 3:1044590/1‑148 (MQ=255) ggccctgaaatgccacctgcaaacggctatgctcaccgctgccttccatattgacaatggtgccttcaccaaacttagcgtggcgtacgcgctggccgagcttgtagccgctgtcgttctcgaCCATCAGCGGATGGGTACGCCGATg > 1:182037‑M1/124‑148 (MQ=255) cgGAAACCCGCCGTCTGTATGGTAAAGAGGTTTACCATCGCCCGTCGCGCTTTATCGGCGAGCTGCCGGAAGAGTGTGTGGAAGAGGTGCGCCTGCGGGCCACGGTAAGCCGCCCGGTCAGCCATCAGCGGATGGGTACGCCGATGGt < 2:963544/148‑1 (MQ=255) cgccgTCTGTATGGTAAAGAGGTTTACCATCGCCCGTCGCGCTTTATCGGCGAGCTGCCGGAAGAGTGTGTGGAAGAGGTGCGCCTGCGCGCCACGGTAAGCCGCCCGGTCAGCCATCAGCGGATGGGTACGCCGATGGTCGAGAACg > 3:462711/1‑148 (MQ=255) tCTGTATGGTAAAGAGGTTTACCATCGCCCGTCGCGCTTTATCGGCGAGCTGCCGGAAGAGTGTGTGGAAGAGGTGCGCCTGCGCGCCACGGTAAGCCGCCCGGTCAGCCATCAGCGGATGGGTACGCCGATGGTCGAGAACg > 1:1092406/1‑143 (MQ=255) tCTGTATGGTAAAGAGGTTTACCATCGCCCGTCGCGCTTTATCGGCGAGCTGCCGGAAGAGTGTGTGGAAGAGGTGCGCCTGCGCGCCACGGTAAGCCGCCCGGTCAGCCATCAGCGGATGGGTACGCCGATGGTCGAGAACg < 2:1092406/143‑1 (MQ=255) gTATGGTAAAGAGGTTTACCATCGCCCGTCGCGCTTTATCGGCGAGCTGCCGGAAGAGTGTGTGGAAGAGGTGCGCCTGCGCGCCACGGTAAGCCGCCCGGTCAGCCATCAGCGGATGGGTACGCCGATGGTCGAGAACGACAGCGGc < 4:462711/148‑1 (MQ=255) aacggctatgctcaccgctgccttccatattgacaatggtgccttcaccaaacttagcgtggcgtacgcgctggccgagcttgtagccgctgtcgttctcgaCCAt > 2:452019‑M1/103‑106 (MQ=255) aacggctatgctcaccgctgccttccatattgacaatggtgccttcaccaaacttagcgtggcgtacgcgctggccgagcttgtagccgctgtcgttctcgaCCAt < 1:452019‑M1/4‑1 (MQ=255) gTAAAGAGGTTTACCATCGCCCGTCGCGCTTTATCGGCGAGCTGCCGGAAGAGTGTGTGGAAGAGGTGCGCCTGCGCGCCACGGTAAGCCGCCCGGTCAGCCATCAGCGGATGGGTACGCCGATGGt < 1:487269/127‑1 (MQ=255) gTAAAGAGGTTTACCATCGCCCGTCGCGCTTTATCGGCGAGCTGCCGGAAGAGTGTGTGGAAGAGGTGCGCCTGCGCGCCACGGTAAGCCGCCCGGTCAGCCATCAGCGGATGGGTACGCCGATGGt > 2:487269/1‑127 (MQ=255) cggctatgctcaccgctgccttccatattgacaatggtgccttcaccaaacttagcgtggcgtacgcgctggccgagcttgtagccgctgtcgttctcgac > 2:687302‑M1/101‑101 (MQ=255) cggctatgctcaccgctgccttccatattgacaatggtgccttcaccaaacttagcgtggcgtacgcgctggccgagcttgtagccgctgtcgttctcgac < 1:687302‑M1/1‑1 (MQ=255) aaGAGGTTTACCATCGCCCGTCGCGCTTTATCGGCGAGCTGCCGGAAGAGTGTGTGGAAGAGGTGCGCCTGCGCGCCACGGTAAGCCGCCCGGTCAGCCATCAGCGGATGGGTACGCCGATGGTCGAGAACGACAGCGGCTACAAGCt < 1:749632/148‑1 (MQ=255) agagGTTTACCATCGCCCGTCGCGCTTTATCGGCGAGCTGCCGGAAGAGTGTGTGGAAGAGGTGCGCCTGCGCGCCACGGTAAGCCGCCCGGTCAGCCATCAGCGGa > 4:415424/1‑107 (MQ=255) agagGTTTACCATCGCCCGTCGCGCTTTATCGGCGAGCTGCCGGAAGAGTGTGTGGAAGAGGTGCGCCTGCGCGCCACGGTAAGCCGCCCGGTCAGCCATCAGCGGa < 3:415424/107‑1 (MQ=255) agagGTTTACCATCGCCCGTCGCGCTTTATCGGCGAGCTGCCGGAAGAGTGTGTGGAAGAGGTGCGCCTGCGCGCCACGGTAAGCCGCCCGGTCAGCCATCAGCGGa > 1:619573/1‑107 (MQ=255) agagGTTTACCATCGCCCGTCGCGCTTTATCGGCGAGCTGCCGGAAGAGTGTGTGGAAGAGGTGCGCCTGCGCGCCACGGTAAGCCGCCCGGTCAGCCATAAGCGGa < 2:619573/107‑1 (MQ=255) ggTTTACCATCGCCCGTCGCGCTTTATCGGCGAGCTGCCGGAAGAGTGTGTGGAAGAGGTGCGCCTGCGCGCCACGGTAAGCCGCCCGGTCAGCCATCAGCGGATGGGTACGCCGATgg < 2:910266/119‑1 (MQ=255) ggTTTACCATCGCCCGTCGCGCTTTATCGGCGAGCTGCCGGAAGAGTGTGTGGAAGAGGTGCGCCTGCGCGCCACGGTAAGCCGCCCGGTCAGCCATCAGCGGATGGGTACGCCGATgg > 1:910266/1‑119 (MQ=255) tttACCATCGCCCGTCGCGCTTTATCGGCGAGCTGCCGGAAGAGTGTGTGGAAGAGGTGCGCCTGCGCGCCACGGTAAGCCGCCCGGTCAGCCATCAGCgg < 2:328830/101‑1 (MQ=255) tttACCATCGCCCGTCGCGCTTTATCGGCGAGCTGCCGGAAGAGTGTGTGGAAGAGGTGCGCCTGCGCGCCACGGTAAGCCGCCCGGTCAGCCATCAGCgg > 1:328830/1‑101 (MQ=255) tttACCATCGCCCGTCGCGCTTTATCGGCGAGCTGCCGGAAGAGTGTGTGGAAGAGGTGCGCCTGCGCGCCACGGTAAGCCGCCCGGTCAGCCATCAGCGGATGGGTACGCCGATGGt > 3:218108/1‑118 (MQ=255) tttACCATCGCCCGTCGCGCTTTATCGGCGAGCTGCCGGAAGAGTGTGTGGAAGAGGTGCGCCTGCGCGCCACGGTAAGCCGCCCGGTCAGCCATCAGCGGATGGGTACGCCGATGGt < 4:218108/118‑1 (MQ=255) cATCGCCCGTCGCGCTTTATCGGCGAGCTGCCGGAAGAGTGTGTGGAAGAGGTGCGCCTGCGCGCCACGGTAAGCCGCCCGGTCAGCCATCAGCGGATGGGTACGCCGATGGTCGAGAACGACAGCGGc < 2:1108163/129‑1 (MQ=255) cATCGCCCGTCGCGCTTTATCGGCGAGCTGCCGGAAGAGTGTGTGGAAGAGGTGCGCCTGCGCGCCACGGTAAGCCGCCCGGTCAGCCATCAGCGGATGGGTACGCCGATGGTCGAGAACGACAGCGGc > 1:1108163/1‑129 (MQ=255) attgacaatggtgccttcaccaaacttagcgtggcgtacgcgctggccgagcttgtagccgctgtcgttctcgaCCATCAGCGGATGGGTACGCCGATGGt > 2:1043224‑M1/75‑101 (MQ=255) attgacaatggtgccttcaccaaacttagcgtggcgtacgcgctggccgagcttgtagccgctgtcgttctcgaCCATCAGCGGATGGGTACGCCGATGGt < 1:1043224‑M1/27‑1 (MQ=255) ttgacaatggtgccttcaccaaacttagcgtggcgtacgcgctggccgagcttgtagccgctgtcgttctcgaCCATCAGCGGATGGGTACGCCGATGGTCg > 3:621683‑M1/74‑102 (MQ=255) ttgacaatggtgccttcaccaaacttagcgtggcgtacgcgctggccgagcttgtagccgctgtcgttctcgaCCATCAGCGGATGGGTACGCCGATGGTCg < 4:621683‑M1/29‑1 (MQ=255) tATCGGCGAGCTGCCGGAAGAGTGTGTGGAAGAGGTGCGCCTGCGCGCCACGGTAAGCCGCCCGGTCAGCCATCAGCGGATGGGTACGCCGATGGTCGAGAACGACAGCGGCTACAAGCTCGGCCAGCGCGTACGCCACGCTAAGttt > 4:788704/1‑148 (MQ=255) gAAGAGTGTGTGGAAGAGGTGCGCCTGCGCGCCACGGTAAGCCGCCCGGTCAGCCATCAGCGGATGGGTACGCCGATGGTCGAGAACGACAGCGGCTACAAGCTCGGCCAGCGCGt < 4:470226/116‑1 (MQ=255) gAAGAGTGTGTGGAAGAGGTGCGCCTGCGCGCCACGGTAAGCCGCCCGGTCAGCCATCAGCGGATGGGTACGCCGATGGTCGAGAACGACAGCGGCTACAAGCTCGGCCAGCGCGt > 3:470226/1‑116 (MQ=255) gAAGAGTGTGTGGAAGAGGTGCGCCTGCGCGCCACGGTAAGCCGCCCGGTCAGCCATCAGCGGATGGGTACGCCGATGGTCGAGAACGACAGCGGCTACAAGCTCGGCCAGCGCGTACGCCACGCTAAGTTTGGTGAAGGCACCATTg > 4:216693/1‑148 (MQ=255) aaGAGTGTGTGGAAGAGGTGCGCCTGCGCGCCACGGTAAGCCGCCCGGTCAGCCATCAGCGGATGGGTACGCCGATGGTCGAGAACGACAGCGGCTACAAGCTCGGCCAGCGCGTACGCCACGCTAAGTTTGGTGa < 2:728033/136‑1 (MQ=255) aaGAGTGTGTGGAAGAGGTGCGCCTGCGCGCCACGGTAAGCCGCCCGGTCAGCCATCAGCGGATGGGTACGCCGATGGTCGAGAACGACAGCGGCTACAAGCTCGGCCAGCGCGTACGCCACGCTAAGTTTGGTGa > 1:728033/1‑136 (MQ=255) gtgGAAGAGGTGCGCCTGCGCGCCACGGTAAGCCGCCCGGTCAGCCATCAGCGGATGGGTACGCCGATGGTCGAGAACGACAGCGGCTACAAGCTCGGc < 4:160192/99‑1 (MQ=255) gtgGAAGAGGTGCGCCTGCGCGCCACGGTAAGCCGCCCGGTCAGCCATCAGCGGATGGGTACGCCGATGGTCGAGAACGACAGCGGCTACAAGCTCGGc > 3:160192/1‑99 (MQ=255) tgGAAGAGGTGCGCCTGCGCGCCACGGTAAGCCGCCCGGTCAGCCATCAGCGGATGGGTACGCCGATGGTCGAGAACGACAGCGGCTACAAGCTCGGCCAGCGCGTACGCCACGCTAAGTTTGGTGAAGGCACCATTGTCAATATGGa < 3:216693/148‑1 (MQ=255) aaGAGGTGCGCCTGCGCGCCACGGTAAGCCGCCCGGTCAGCCATCAGCGGATGGGTACGCCGATGGTCGAGAACGACAGCGGCTACAAGCTCGGCCAGCGCGTACGCCACGCTAAGTTTGGTGAAg < 1:748606/126‑1 (MQ=255) aaGAGGTGCGCCTGCGCGCCACGGTAAGCCGCCCGGTCAGCCATCAGCGGATGGGTACGCCGATGGTCGAGAACGACAGCGGCTACAAGCTCGGCCAGCGCGTACGCCACGCTAAGTTTGGTGAAg > 2:748606/1‑126 (MQ=255) agagGTGCGCCTGCGCGCCACGGTAAGCCGCCCGGTCAGCCATCAGCGGATGGGTACGCCGATGGTCGAGAACGACAGCGGCTACAAGCTCGGCCAGCGCGTACGCCACGCTAAGTTTGGTGAAGGCACCATTGTCAATATGGa < 2:775067/144‑1 (MQ=255) agagGTGCGCCTGCGCGCCACGGTAAGCCGCCCGGTCAGCCATCAGCGGATGGGTACGCCGATGGTCGAGAACGACAGCGGCTACAAGCTCGGCCAGCGCGTACGCCACGCTAAGTTTGGTGAAGGCACCATTGTCAATATGGa > 1:775067/1‑144 (MQ=255) tGCGCCTGCGCGCCACGGTAAGCCGCCCGGTCAGCCATCAGCGGATGGGTACGCCGATGGTCGAGAACGACAGCGGCTACAAGCTCGGCCAGCGCGTACGCCACGCTAAGTTTgg > 2:695753/1‑115 (MQ=255) tGCGCCTGCGCGCCACGGTAAGCCGCCCGGTCAGCCATCAGCGGATGGGTACGCCGATGGTCGAGAACGACAGCGGCTACAAGCTCGGCCAGCGCGTACGCCACGCTAAGTTTgg < 1:695753/115‑1 (MQ=255) tGCGCCTGCGCGCCACGGTAAGCCGCCCGGTCAGCCATCAGCGGATGGGTACGCCGATGGTCGAGAACGACAGCGGCTACAAGCTCGGCCAGCGCGTACGCCACGCTAAGTTTGGTGAAGGCACCATTGTCAATATGGa > 1:348267/1‑139 (MQ=255) tGCGCCTGCGCGCCACGGTAAGCCGCCCGGTCAGCCATCAGCGGATGGGTACGCCGATGGTCGAGAACGACAGCGGCTACAAGCTCGGCCAGCGCGTACGCCACGCTAAGTTTGGTGAAGGCACCATTGTCAATATGGa < 2:348267/139‑1 (MQ=255) ccACGGTAAGCCGCCCGGTCAGCCATCAGCGGATGGGTACGCCGATGGTCGAGAACGACAGCGGCTACAAGCTCGGCCAGCGCGTACGCCACGCTAAGTTTGGTGAAGGCACCATTGTCAATATGGAAGGCAGCGGTGAGCATAGCCg > 3:540003/1‑148 (MQ=255) tAAGCCGCCCGGTCAGCCATCAGCGGATGGGTACGCCGATGGTCGAGAACGACAGCGGCTACAAGCTCGGCCAGCGCGTACGCCACGCTAAGTTTGGTGAAGGCACCATTGTCAATATGGAAGGCAGCGGTGAGc < 1:256297/135‑1 (MQ=255) tAAGCCGCCCGGTCAGCCATCAGCGGATGGGTACGCCGATGGTCGAGAACGACAGCGGCTACAAGCTCGGCCAGCGCGTACGCCACGCTAAGTTTGGTGAAGGCACCATTGTCAATATGGAAGGCAGCGGTGAGc > 2:256297/1‑135 (MQ=255) tAAGCCGCCCGGTCAGCCATCAGCGGATGGGTACGCCGATGGTCGAGAACGACAGCGGCTACAAGCTCGGCCAGCGCGTACGCCACGCTAAGTTTGGTGAAGGCACCATTGTCAATATGGAAGGCAGCGGTGAGCATAGCCGTTTGCa > 2:205225/1‑148 (MQ=255) gTCAGCCATCAGCGGATGGGTACGCCGATGGTCGAGAACGACAGCGGCTACAAGCTCGGCCAGCGCGTACGCCACGCTAAGTTTGGTGAAGGCTCCATTGTCAATATGGAAg > 1:810520/1‑112 (MQ=255) gTCAGCCATCAGCGGATGGGTACGCCGATGGTCGAGAACGACAGCGGCTACAAGCTCGGCCAGCGCGTACGCCACGCTAAGTTTGGTGAAGGCACCATTGTCAATATGGAAg < 2:810520/112‑1 (MQ=255) | TACGCGGAAACCCGCCGTCTGTATGGTAAAGAGGTTTACCATCGCCCGTCGCGCTTTATCGGCGAGCTGCCGGAAGAGTGTGTGGAAGAGGTGCGCCTGCGCGCCACGGTAAGCCGCCCGGTCAGCCATCAGCGGATGGGTACGCCGATGGTCGAGAACGACAGCGGCTACAAGCTCGGCCAGCGCGTACGCCACGCTAAGTTTGGTGAAGGCACCATTGTCAATATGGAAGGCAGCGGTGAGCATAGCCGTTTGCA > NC_000913/3999822‑4000078 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |