Missing coverage evidence... | ||||||||||
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seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
* | * | ÷ | NC_000913 | 1530052 | 1530168 | 117 | 14 [12] | [12] 14 | ydcD | putative immunity protein for RhsE |
AAAAAATTAGTAGAGGGAATGGTCATTTTATAAGTATAATGGTTAATAATTACAGGACGCACTGTGGAGTGGTTGATATAAATCTTAATTTTTTCAATGATATTCTTTATAGCGTGCGATTAAAAAACATTAGTAAACTGGAGAATATGGAGTTCTGCGCTACAAAACAACGGGTGTATTTTAGTGATAAAAACAA > NC_000913/1530103‑1530298 | aaaaaaTTGGTAGAGGGAATGGTCATTTTATAAGTATAATGGTTAATAATTACAGGACGCACTGTGGAGTGGTTg > 1:966137/1‑75 (MQ=255) aaaaaaTTAGTAGAGGGAATCGTCATTTTATAAGTATAATGGTTAATAATTACAGGACGCACTGTGGAGTGGTTg < 2:966137/75‑1 (MQ=255) aaaaaTTAGTAGAGGGAATGGTCATTTTATAAGTATAATGGTTAATAATTACAGGACGCACTGTGGAGTGGTTGat > 3:1088514/1‑76 (MQ=255) aaaaaTTAGTAGAGGGAATGGTCATTTTATAAGTATAATGGTTAATAATTACAGGACGCACTGTGGAGTGGTTGat < 4:1088514/76‑1 (MQ=255) tCATTTTATAAGTATAATGGTTAATAATTACAGGACGCACTGTGGAGTGGTTGATATAAATCTTAATTTTTTCAATGATATTCTTTATAGCGTGCGATTAAAAAACATTAGTAAACTGGAGAATATgg > 1:9605/1‑128 (MQ=255) tCATTTTATAAGTATAATGGTTAATAATTACAGGACGCACTGTGGAGTGGTTGATATAAATCTTAATTTTTTCAATGATATTCTTTATAGCGTGCGATTAAAAAACATTAGTAAACTGGAGAATATgg < 2:9605/128‑1 (MQ=255) ttAATAATTACAGGACGCACTGTGGAGTGGTTGATATAAATCTTAATTTTTTCAATGATATTCTTTATAGCGTGCGATTAAAAAACATTAGTAAACTGGAGAATATgg > 1:402649/1‑108 (MQ=255) ttAATAATTACAGGACGCACTGTGGAGTGGTTGATATAAATCTTAATTTTTTCAATGATATTCTTTATAGCGTGCGATTAAAAAACATTAGTAAACTGGAGAATATgg < 2:402649/108‑1 (MQ=255) aataatTACAGGACGCACTGTGGAGTGGTTGATATAAATCTTAATTTTTTCAATGATATTCtt < 1:685935/63‑1 (MQ=255) aataatTACAGGACGCACTGTGGAGTGGTTGATATAAATCTTAATTTTTTCAATGATATTCtt > 2:685935/1‑63 (MQ=255) atTACAGGACGCACTGTGGAGTGGTTGATATAAATCTTAATTTTTTCAATGATATTCTTTATAGCGTGCGATTAAAAAACATTAGTAAAc > 1:506387/1‑90 (MQ=255) atTACAGGACGCACTGTGGAGTGGTTGATATAAATCTTAATTTTTTCAATGATATTCTTTATAGCGTGCGATTAAAAAACATTAGTAAAc < 2:506387/90‑1 (MQ=255) gAGTGGTTGATATAAATCTTAATTTTTTCAATGATATTCTTTATAGCGTGCGATTAAAAAACATTAGTAAACTGGAGAATATGGAGTTCTGCGCTACAAAACAACGGGTGTATTTTAGTGATAAAAACaa > 1:909019/1‑130 (MQ=255) gAGTGGTTGATATAAATCTTAATTTTTTCAATGATATTCTTTATAGCGTGCGATTAAAAAACATTAGTAAACTGGAGAATATGGAGTTCTGCGCTACAAAACAACGGGTGTATTTTAGTGATAAAAACaa < 2:909019/130‑1 (MQ=255) | AAAAAATTAGTAGAGGGAATGGTCATTTTATAAGTATAATGGTTAATAATTACAGGACGCACTGTGGAGTGGTTGATATAAATCTTAATTTTTTCAATGATATTCTTTATAGCGTGCGATTAAAAAACATTAGTAAACTGGAGAATATGGAGTTCTGCGCTACAAAACAACGGGTGTATTTTAGTGATAAAAACAA > NC_000913/1530103‑1530298 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |