| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,776,126 | C→G | 7.7% | S185S (TCC→TCG) ‡ | mtlR → | mannitol operon repressor |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,776,126 | 0 | C | G | 7.7% | 873.0 / 45.8 | 247 | S185S (TCC→TCG) ‡ | mtlR | mannitol operon repressor |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (115/113); new base G (9/10); total (124/123) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.16e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.22e-01 | |||||||||||
Only 100 of 261 total aligned reads displayed.
GGCGTTACCACCGCCGCCACAGTTTGAACCAGCAGACTCCAGTTTGTATGCAATGCAAATTCAGCGCTATCAACAGGCTGTGCGATCAACAATGGTCCTTTCACTGACTGAGCTGATTTCCAAAATCAGCTTAAAAAAAGCCTTTCAAAAGTAAGCAACGTCTGCTTACTGCCCCTCTACCTGCTTCGGCCGATAAAGCCGACGATAATACTCCAGACGTTGTAGATATAACGGCACGCTTTCATCGGGTATTCCGGACGGAATCGCG > NC_000913/3776006‑3776273 | ggcgTTACCACCGCCGCCACAGTTTGAACCAGCAGACTCCAGTTTGTATGCAATGCAAATTCAGCGCTATCAACAGGCTGTGCGATCAACAATGGTCCTTTCACTGACTGAGCTGATTTcc > 3:386098/1‑121 (MQ=255) ccaccGCCGCCACAGTTTGAACCAGCAGACTCCAGTTTGTATGCAATGCAAATTCAGCGCTATCAACAGGCTGTGCGATCAACAATGGTCCTTTCACTGACTGAGCTGATTTCCaa < 2:612449/116‑1 (MQ=255) accGCCGCCACAGTTTGAACCAGCAGACTCCAGTTTGTATGCAATGCAAATTCAGCGCTATCAACAGGCTGTGCGATCAACAATGGTCCTTTCACTGACTGAGCTGATTTTGGAAATCAg > 4:817518/1‑120 (MQ=255) accGCCGCCACAGTTTGAACCAGCAGACTCCAGTTTGTATGCAATGCAAATTCAGCGCTATCAACAGGCTGTGCGATCAACAATGGTCCTTTCACTGACTGAGCTGATTTCCAAAATCa > 2:604712/1‑119 (MQ=255) accGCCGCCACAGTTTGAACCAGCAGACTCCAGTTTGTATGCAATGCAAATTCAGCGCTATCAACAGGCTGTGCGATCAACAATGGTCCTTTCACTGACTGAGCTGATTTCCAAAATCa < 1:604712/119‑1 (MQ=255) accGCCGCCACAGTTTGAACCAGCAGACTCCAGTTTGTATGCAATGCAAATTCAGCGCTATCAACAGGCTGTGCGATCAACAATGGTCCTTTCACTGACTAAGCTGATTTTGGAAATCAg > 4:906732/1‑120 (MQ=255) ccgccACAGTTTGAACCAGCAGACTCCAGTTTGTATGCAATGCAAATTCAGCGCTATCAACAGGCTGTGCGATCAACAATGGTCCTTTCACTGACTGAGCTGATTTCCAAAATCAGCTTAAAAAAAGCCTTTCAAAAGTAAGCAACGt > 4:545786/1‑148 (MQ=255) cacaGTTTGAACCAGCAGACTCCAGTTTGTATGCAATGCAAATTCAGCGCTATCAACAGGCTGTGCGATCAACAATGGTCCTTTCACTGACTGAGCTGATTTCCAAAATCAGCTTAAAAAAAGCCTTTCaaa < 2:804717/132‑1 (MQ=255) caGTTTGAACCAGCAGACTCCAGTTTGTATGCAATGCAAATTCAGCGCTATCAACAGGCTGTGCGATCAACAATGGTCCTTTCACTGACTGAGCTGATTTCCAAAATCAGCTTAAAAAAAGCCTTTCaaa < 4:44983/130‑1 (MQ=255) caGTTTGAACCAGCAGACTCCAGTTTGTATGCAATGCAAATTCAGCGCTATCAACAGGCTGTGCGATCAACAATGGTCCTTTCACTGACTGAGCTGATTTCCAAAATCAGCTTAAAAAAAGCCTTTCAAAAGTa > 1:496316/1‑134 (MQ=255) gAACCAGCAGACTCCAGTTTGTATGCAATGCAAATTCAGCGCTATCAACAGGCTGTGCGATCAACAATGGTCCTTTCACTGACTGAGCTGATTTCCAAAATCAGCTTAAAAAAAGCCTTTCAAAAGTAAGCAACGTCTGCTTACTGcc < 3:184110/148‑1 (MQ=255) aaCCAGCAGACTCCAGTTTGTATGCAATGCAAATTCAGCGCTATCAACAGGCTGTGCGATCAACAATGGTCCTTTCACTGACTGAGCTGATTTCCAAATTCAGCTTAAAAAAAGCCTTTCAAAAGTAAGCAACGTCTg > 2:68175/1‑138 (MQ=255) aCCAGCAGACTCCAGTTTGTATGCAATGCAAATTCAGCGCTATCAACAGGCTGTGCGATCAACAATGGTCCTTTCACTGACTGAGCTGATTTCCAAAATCAGCTTaaaaaa > 4:346347/1‑111 (MQ=255) agcagACTCCAGTTTGTATGCAATGCAAATTCAGCGCTATCAACAGGCTGTGCGATCAACAATGGTCCTTTCACTGACTGAGCTGATTTCCAAAATCAGCTTAAAAAAAGCCtt > 2:207897/1‑114 (MQ=255) aCTCCAGTTTGTATGCAATGCAAATTCAGCGCTATCAACAGGCTGTGCGATCAACAATGGTCCTTTCACTGACTGAGCTGATTTCCAAAATCAGCTTAAAAAAAGCCTTTCAAAAGTAAGCAACGTCTGCTTACTGCCCCTCTACCTg < 1:245269/148‑1 (MQ=255) ccAGTTTGTATGCAATGCAAATTCAGCGCTATCAACAGGCTGTGCGATCAACAATGGTCCTTTCACTGACTGAGCTGATTTTGGAAATCAGCtc > 3:922023/1‑93 (MQ=255) ccAGTTTGTATGCAATGCAAATTCAGCGCTATCAACAGGCTGTGCGATCAACAATGGTCCTTTCACTGACTGAGCTGATTTCCAAAATCAGCTTaaaaaa > 2:494279/1‑100 (MQ=255) ccAGTTTGTATGCAATGCAAATTCAGCGCTATCAACAGGCTGTGCGATCAACAATGGTCCTTTCACTGACTGAGCTGATTTCCAAAATCAGCTTAAAAAAAGCCTTTCAAAAGTAAGCAACGt > 3:82846/1‑123 (MQ=255) ccAGTTTGTATGCAATGCAAATTCAGCGCTATCAACAGGCTGTGCGATCAACAATGGTCCTTTCACTGACTGAGCTGATTTCCAAAATCAGCTTAAAAAAAGCCTTTCAAAAGTAAGCAACGTCTg > 4:113792/1‑126 (MQ=255) ccAGTTTGTATGCAATGCAAATTCAGCGCTATCAACAGGCTGTGCGATCAACAATGGTCCTTTCACTGACTGAGCTGATTTCCAAAATCAGCTTAAAAAAAGCCTTTCAAAAGTAAGCAACGTCTg < 3:113792/126‑1 (MQ=255) ttGTATGCAATGCAAATTCAGCGCTATCAACAGGCTGTGCGATCAACAATGGTCCTTTCACTGACTGAGCTGATTTCCAAAATCAGCTTAAAAAAAGCCTTTCAAAAGTAAGCAACGTCTGCTTACTGcc < 1:153139/130‑1 (MQ=255) tATGCAATGCAAATTCAGCGCTATCAACAGGCTGTGCGATCAACAATGGTCCTTTCACTGACTGAGCTGATTTCCAAAATCa < 1:683244/82‑1 (MQ=255) atgcaatgcaAATTCAGCGCTATCAACAGGCTGTGCGATCAACAATGGTCCTTTCACTGACTGAGCTGATTTTGGAAATCAGCt > 1:556197/1‑84 (MQ=255) atgcaatgcaAATTCAGCGCTATCAACAGGCTGTGCGATCAACAATGGTCCTTTCACTGACTGAGCTGATTTCCAAAATCAGCTTAAAAAAAGCCTTTCaaa > 1:655646/1‑102 (MQ=255) atgcaatgcaAATTCAGCGCTATCAACAGGCTGTGCGATCAACAATGGTCCTTTCACTGACTGAGCTGATTTCCAAAATCAGCTTAAAAAAAGCCTTTCaaa > 1:283351/1‑102 (MQ=255) atgcaatgcaAATTCAGCGCTATCAACAGGCTGTGCGATCAACAATGGTCCTTTCACTGACTGAGCTGATTTCCAAAATCAGCTTAAAAAAAGCCTTTCaaa < 2:655646/102‑1 (MQ=255) gcaatgcaaATTCAGCGCTATCAACAGGCTGTGCGATCAACAATGGTCCTTTCACTGACTGAGCTGATTTCCAAAATCAGCTTAAAAAAAGCCTTTCAAAAGTAAGCAACGTCTGCTTACTGCCCCTCTACCTGCTTCGGCCGATaaa > 2:1093902/1‑148 (MQ=255) caatgcaaATTCAGCGCTATCAACAGGCTGTGCGATCAACAATGGTCCTTTCACTGACTGAGCTGATTTCCAAAATCAGCTTAAAAAAAGCCTTTCaaa < 1:120589/99‑1 (MQ=255) atgcaaATTCAGCGCTATCAACAGGCTGTGCGATCAACAATGGTCCTTTCACTGACTGAGCTGATTTCCAAAATCAGCTTAAAAAAAGCCtt > 3:847978/1‑92 (MQ=255) tgcaaATTCAGCGCTATCAACAGGCTGTGCGATCAACAATGGTCCTTTCACTGACTGAGCTGATTTTGGAAATCAGCtc > 4:1027037/1‑78 (MQ=38) tgcaaATTCAGCGCTATCAACAGGCTGTGCGATCAACAATGGTCCTTTCACTGACTGAGCTGATTTCCAAAATCAGCTTaaaaaa > 1:1026399/1‑85 (MQ=255) gcaaATTCAGCGCTATCAACAGGCTGTGCGATCAACAATGGTCCTTTCACTGACTGAGCTGATTTCCAAAATCAGCTTAAAAAAAGCCTTTCAAAAGTAAGCAACGTCTGCTTACTg < 2:516086/117‑1 (MQ=255) caaATTCAGCGCTATCAACAGGCTGTGCGATCAACAATGGTCCTTTCACTGACTGAGCTGATTTCCAAAATCAGCTTAAAAAAAGCCTTTCAAAAGTAAGCAACGTCTGCTTACTGCCCCTCTACCTGCt < 4:1077564/130‑1 (MQ=255) aaaTTCAGCGCTATCAACAGGCTGTGCGATCAACAATGGTCCTTTCACTGACTGAGCTGATTTCCAAAATCAGCTTAAAAAAAGCCTTTCAAAAGTAAGCAACGTCTGCTTACTGCCCCTCTACCTGCTTCGGCCGATAAAGCcgacg < 4:830063/148‑1 (MQ=255) aaTTCAGCGCTATCAACAGGCTGTGCGATCAACAATGGTCCTTTCACTGACTGAGCTGATTTCCAAAATCAGCTTAAAAAAAGCCTTTCAAAAGTAAGCAACGTCTGCTTACTGCCCctc > 1:615955/1‑120 (MQ=255) aaTTCAGCGCTATCAACAGGCTGTGCGATCAACAATGGTCCTTTCACTGACTGAGCTGATTTCCAAAATCAGCTTAAAAAAAGCCTTTCAAAAGTAAGCAACGTCTGCTTACTGCCCct > 4:1045550/1‑119 (MQ=255) ttCAGCGCTATCAACAGGCTGTGCGATCAACAATGGTCCTTTCACTGACTGAGCTGATTTCCAAAATCAGCTTAAAAAAAGCCTTTCAAAAGTAAGCAACGTCTGCTTACTGCCCCTCTACCTGCTTCGGCCGATAAAGCCGACGata > 2:152758/1‑148 (MQ=255) ttCAGCGCTATCAACAGGCTGTGCGATCAACAATGGTCCTTACACTGACTGAGCTGATTTCCAAAATCAGCTTAAAAAAAGCCTTTCAAAAGTAAGCAACGTCTGCTTACTGCCCCTCTACCTGCTTCgg > 4:955608/1‑130 (MQ=255) tCAGCGCTATCAACAGGCTGTGCGATCAACAATGGTCCTTTCACTGACTGAGCTGATTTCCAAAATCAGCTTAAAAAAAGCCTTTCAAAAGTAAGCa < 4:292188/97‑1 (MQ=255) tCAGCGCTATCAACAGGCTGTGCGATCAACAATGGTCCTTTCACTGACTGAGCTGATTTCCAAAATCAGCTTAAAAAAAGCCTTTCAAAAGTAAGCa > 3:292188/1‑97 (MQ=255) cAGCGCTATCAACAGGCTGTGCGATCAACAATGGTCCTTTCACTGACTGAGCTGATTTCCAAAATCAGCTTAAAAAAAGCCTTTCAAAAGTAAGCAACGTCTGCTTACTGCCCCTCTACCTGCTTCGGCCGATAAAGCCGACGataat < 1:1093902/148‑1 (MQ=255) tATCAACAGGCTGTGCGATCAACAATGGTCCTTTCACTGACTGAGCTGATTTCCAAAATCAGCTTAAAAAAAGCCTTTCAAAAGTAAGCAACGTCTGCTTACTGCCCCTCTACCTGCTTCGGCCGATAAAGCCGACGATAATACTCCa < 1:984518/148‑1 (MQ=255) aTCAACAGGCTGTGCGATCAACAATGGTCCTTTCACTGACTGAGCTGATTTCCAAAATCAGCTTaaaaaa < 3:49853/70‑1 (MQ=255) aTCAACAGGCTGTGCGATCAACAATGGTCCTTTCACTGACTGAGCTGATTTCCAAAATCAGCTTAAAAAAAGCCtt > 3:1025919/1‑76 (MQ=255) aTCAACAGGCTGTGCGATCAACAATGGTCCTTTCACTGACTGAGCTGATTTCCAAAATCAGCTTAAAAAAAGCCTTTCaaa < 3:1114835/81‑1 (MQ=255) tCAACAGGCTGTGCGATCAACAATGGTCCTTTCACTGACTGAGCTGATTTCCAAAATCAGCTTAAAAAAAGCCTTTCAAAAGTAAGCAACGTCTGCTTACTGCCCCTCTACCTGCTTCGGCCGATAAAGCCGACGATAATACTc < 1:1017075/144‑1 (MQ=255) cAACAGGCTGTGCGATCAACAATGGTCCTTTCACTGACTGAGCTGATTTCCAAAATCAGCTTAAAAAAAGCCTTTCAAAAGTa > 3:103073/1‑83 (MQ=255) aCAGGCTGTGCGATCAACAATGGTCCTTTCACTGACTGAGCTGATTTCCAAAATCAGCTTAAAAAAAGCCTTTCAAAAGTAAGCAACGTCTg < 1:358025/92‑1 (MQ=255) aCAGGCTGTGCGATCAACAATGGTCCTTTCACTGACTGAGCTGATTTCCAAAATCAGCTTAAAAAAAGCCTTTCAAAAGTAAGCAACGTCTGCTTACTGCCCCTCTACCTGCTTCGGCCg < 2:739900/120‑1 (MQ=255) aGGCTGTGCGATCAACAATGGTCCTTTCACTGACTGAGCTGATTTCCAAAATCAGCTTAAAAAAAGCCTTTCAAAAGTAAGCAACGTCTGCTTACTGCCCCTCTACCTGCTTCGGCCGa > 2:1078478/1‑119 (MQ=255) aGGCTGTGCGATCAACAATGGTCCTTTCACTGACTGAGCTGATTTCCAAAATCAGCTTAAAAAAAGCCTTTCAAAAGTAAGCAACGTCTGCTTACTGCCCCTCTACCTGCTTCGGCCGATAAAGCCGACGATAATACTCCAGACGTTg < 3:636852/148‑1 (MQ=255) cTGTGCGATCAACAATGGTCCTTTCACTGACTGAGCTGATTTCCAAAATCAGCTTAAAAAAAGCCTTTCAAAAGTAAGc > 2:433303/1‑79 (MQ=255) gtgCGATCAACAATGGTCCTTTCACTGACTGAGCTGATTTCCAAAATCAGCTTAAAAAAAGCCTTTCAAAAGTAAGCAACGTCTGCTTACTGCCCCTCTACCTGCTTCGGCCGATAAAGCCGACGATAATACTCCAGACGTTGTAGat < 3:544487/148‑1 (MQ=255) cGATCAACAATGGTCCTTTCACTGACTGAGCTGATTTCCAAAATCAGCTTAAAAAAAGCCTTTCAAAAGTAAGCAACGTCTGCTTACTGCCCCTCTAc < 2:314065/98‑1 (MQ=255) cGATCAACAATGGTCCTTTCACTGACTGAGCTGATTTCCAAAATCAGCTTAAAAAAAGCCTTTCAAAAGTAAGCAACGTCTGCTTACTGCCCCTCTAc > 1:314065/1‑98 (MQ=255) gATCAACAATGGTCCTTTCACTGACTGAGCTGATTTCCAAAATCAGCTTAAAAAAAGCCTTTCAAAAGTAAGCAACGTCTGCTTACTGCCCCTCTACCTGCTTCGGc < 3:969791/107‑1 (MQ=255) tCAACAATGGTCCTTTCACTGACTGAGCTGATTTCCAAAATCAGCTTAAAAAAAGCCTTTCAAAAGTAAGCAACGTCTg < 3:193940/79‑1 (MQ=255) tCAACAATGGTCCTTTCACTGACTGAGCTGATTTCCAAAATCAGCTTAAAAAAAGCCTTTCAAAAGTAAGCAACGTCTg > 4:193940/1‑79 (MQ=255) caacaaTGGTCCTTTCACTGACTGAGCTGATTTCCAAAATCAGCTTAAAAAAAGCCTTTCAAAAGTAAGCAACGTCTGCTTACTGCCCCTCTACCTGCTTCGGCCGATAAAGCCGACGATAATACTCCAGACGTTGTAGATATAACgg > 1:436212/1‑148 (MQ=255) acaaTGGTCCTTTCACTGACTGAGCTGATTTCCAAAATCAGCTTAAAAAAAGCCt > 4:896812/1‑55 (MQ=255) acaaTGGTCCTTTCACTGACTGAGCTGATTTCCAAAATCAGCTTAAAAAAAGCCt < 3:708931/55‑1 (MQ=255) acaaTGGTCCTTTCACTGACTGAGCTGATTTCCAAAATCAGCTTAAAAAAAGCCt > 4:708931/1‑55 (MQ=255) acaaTGGTCCTTTCACTGACTGAGCTGATTTCCAAAATCAGCTTAAAAAAAGCCTTTCAAAAGTAAGCAACGTCTGCTTa < 3:899375/80‑1 (MQ=255) acaaTGGTCCTTTCACTGACTGAGCTGATTTCCAAAATCAGCTTAAAAAAAGCCTTTCAAAAGTAAGCAACGTCTGCTTACTGCCCCTCTACCTg > 2:338339/1‑95 (MQ=255) acaaTGGTCCTTTCACTGACTGAGCTGATTTCCAAAATCAGCTTAAAAAAAGCCTTTCAAAAGTAAGCAACGTCTGCTTACTGCCCCTCTACCTGCtt > 2:567617/1‑98 (MQ=255) acaaTGGTCCTTTCACTGACTGAGCTGATTTCCAAAATCAGCCTAAAAAAAGCCttt > 2:119920/1‑57 (MQ=255) caaTGGTCCTTTCACTGACTGAGCTGATTTCCAAAATCAGCTTAAAAAAAGCCTTTCAAAAGTAAGCAACGTCTg > 4:799518/1‑75 (MQ=255) caaTGGTCCTTTCACTGACTGAGCTGATTTCCAAAATCAGCTTAAAAAAAGCCTTTCAAAAGTAAGCAACGTCTg < 3:799518/75‑1 (MQ=255) caaTGGTCCTTTCACTGACTGAGCTGATTTCCAAAATCAGCTTAAAAAAAGCCTTTCAAAAGTAAGCAACGTCTGCTTACTGCCCCTCTACCTGCTTCGGCCGATAAAGCCGACGATAATACTCCAGACGTTGt < 1:881299/134‑1 (MQ=255) caaTGGTCCTTTCACTGACTGAGCTGATTTCCAAAATCAGCTTAAAAAAAGCCTTTCAAAAGTAAGCAACGTCTGCTTACTGCCCCTCTACCTGCTTCGGCCGATAAAGCCGACGATAATACTCCAGACGTTGt < 3:337635/134‑1 (MQ=255) caaTGGTCCTTTCACTGACTGAGCTGATTTCCAAAATCAGCTTAAAAAAAGCCTTTCAAAAGTAAGCAACGTCTGCTTACTGCCCCTCTACCTGCTTCGGCCGATAAAGCCGACGATAATACTCCAGACGTTGt > 2:881299/1‑134 (MQ=255) aTGGTCCTTTCACTGACTGAGCTGATTTCCAAAATCAGCTTAAAAAAAGCCTTTCaaa > 3:739878/1‑58 (MQ=255) aTGGTCCTTTCACTGACTGAGCTGATTTCCAAAATCAGCTTAAAAAAAGCCTTTCAAAAGTAAGCAACGTCTGCt > 1:849874/1‑75 (MQ=255) aTGGTCCTTTCACTGACTGAGCTGATTTCCAAAATCAGCTTAAAAAAAGCCTTTCAAAAGTAAGCAACGTCTGCt < 2:849874/75‑1 (MQ=255) aTGGTCCTTTCACTGACTGAGCTGAGTTCCAAAATCAGCTTAAAAAAAGCCTTTCAAAAGGAAGCAACGTCTGCTTACTGCCCCTCTACCTGCTTCGGCCGATAAAGCCGACGATAATACTCCAGACGTTGTAGATATAACGGCACGc > 2:264295/1‑148 (MQ=255) tGGTCCTTTCACTGACTGAGCTGATTTCCAAAATCAGCTTAAAAAAAGCCTTTCAAAAGTAAGCAACGTCTGCTTAc > 1:587481/1‑77 (MQ=255) tCCTTTCACTGACTGAGCTGATTTCCAAAATCAGCTTAAAAAAAGCCTTTCAAAAGTAAGCAACGTCTGCTTACTGCCCCTCTACCTGc > 4:501866/1‑89 (MQ=255) ttCACTGACTGAGCTGATTTCCAAAATCAGCTTAAAAAAAGCCTTTCAAAAGTAAg > 4:485060/1‑56 (MQ=255) ttCACTGACTGAGCTGATTTCCAAAATCAGCTTAAAAAAAGCCTTTCAAAAGTAAGCAACGTCTg > 3:451567/1‑65 (MQ=255) ttCACTGACTGAGCTGATTTCCAAAATCAGCTTAAAAAAAGCCTTTCAAAAGTAAGCAACGTCTGCTTACTGCCCCTCTACCTGCTTCGGCCGATAAAGCcg < 3:667032/102‑1 (MQ=255) ttCACTGACTGAGCTGATTTCCAAAATCAGCTTAAAAAAAGCCTTTCAAAAGTAAGCAACGTCTGCTTACTGCCCCTCTACCTGCTTCGGCCGATAAAGCCGACGATAATACTCCAGACGTTGTAGATATAACGGCACGCTTTCATCg > 1:830317/1‑148 (MQ=255) ctgactgaGCTGATTTCCAAAATCAGCTTAAAAAAAGCCTTTCAAAAGTAAGCAACGTCTGCTTACTGCCCCTCTACCTGCTTCGGCCGATaa > 4:160023/1‑93 (MQ=255) gactgaGCTGATTTCCAAAATCAGCTTAAAAAAAGCCTTTCAAAAGTAAGCAACGTCTGCTTACTGCCCCTCTACCTGCTTCgg < 1:432286/84‑1 (MQ=255) ctgaGCTGATTTCCAAAATCAGCTTAAAAAAAGCCTTTCAAAAGTAAGCAACGTCTGCTTACTGCCCCTCTACCTGCTTCGGc < 4:331510/83‑1 (MQ=255) gaGCTGATTTCCAAAATCAGCTTAAAAAAAGCCTTTCAAAAGTAAGCAACGTCTGCTTACTGCCCCTCTACCTGCTTCGGCCGATAAAGCCGACGATAATACTCCAGACGTTGTAGATATAACgg > 4:234300/1‑125 (MQ=255) gaGCTGATTTCCAAAATCAGCTTAAAAAAAGCCTTTCAAAAGTAAGCAACGTCTGCTTACTGCCCCTCTACCTGCTTCGGCCGATAAAGCCGACGATAATACTCCAGACGTTGTAGATATAACgg < 3:234300/125‑1 (MQ=255) tGATTTCCAAAATCAGCTTAAAAAAAGCCTTTCAAAAGTAAGCAACGTCTGCTTACTGCCCCTCTACCTGCtt > 1:769134/1‑73 (MQ=255) tGATTTCCAAAATCAGCTTAAAAAAAGCCTTTCAAAAGTAAGCAACGTCTGCTTACTGCCCCTCTACCTGCTTCGGCCGATAAAGCCGACGATAATACTCCAGACGTTGTAGATATAACGGCACGCTTTCATCGGGTATTCcggacgg > 2:404028/1‑148 (MQ=255) gATTTCCAAAATCAGCTTAAAAAAAGCCTTTCAAAAGTAAGCAACGTCTGCTTACTGCCCCTCTACCTGCTTCGGCCGATAAAGCCGACGata > 4:209575/1‑93 (MQ=255) gATTTCCAAAATCAGCTTAAAAAAAGCCTTTCAAAAGTAAGCAACGTCTGCTTACTGCCCCTCTACCTGCTTCGGCCGATAAAGCCGACGata < 3:209575/93‑1 (MQ=255) ttCCAAAATCAGCTTAAAAAAAGCCTTTCAAAAGTAAGCAACGTCTGCTTACTGCCCCTCTACCTGCTTCGGCCGATAAAGCCGACGATAATACTCCAGACGTTGTAGAtata < 2:507155/113‑1 (MQ=255) ttCCAAAATCAGCTTAAAAAAAGCCTTTCAAAAGTAAGCAACGTCTGCTTACTGCCCCTCTACCTGCTTCGGCCGATAAAGCCGACGATAATACTCCAGACGTTGTAGAtata > 1:507155/1‑113 (MQ=255) tCCAAAATCAGCTTAAAAAAAGCCTTTCAAAAGTAAGCAACGTCTGCTTACTGCCCCTCTACCTGCTTCGGCCGATAAAGCCGACGATAATACTCCAGACGTTGTAGATATAACGGCACGCTTTCATCGGGTATTCCGGACGGAATcg < 4:732284/148‑1 (MQ=255) ccAAAATCAGCTTAAAAAAAGCCTTTCAAAAGTAAGCAACGTCTGCTTACTGCCCCTCTACCTGCTTCGGCCGATAAAGCCGACGATAATACTCCAg > 1:777539/1‑97 (MQ=255) ccAAAATCAGCTTAAAAAAAGCCTTTCAAAAGTAAGCAACGTCTGCTTACTGCCCCTCTACCTGCTTCGGCCGATAAAGCCGACGATAATACTCCAg < 2:777539/97‑1 (MQ=255) ccAAAATCAGCTTAAAAAAAGCCTTTCAAAAGTAAGCAACGTCTGCTTACTGCCCCTCTACCTGCTTCGGCCGATAAAGCCGACGATAATACTCCAGa > 2:93577/1‑98 (MQ=255) ccAAAATCAGCTTAAAAAAAGCCTTTCAAAAGTAAGCAACGTCTGCTTACTGCCCCTCTACCTGCTTCGGCCGATAAAGCCGACGATAATACTCCAGa < 1:93577/98‑1 (MQ=255) ccAAAACCAGCTTAAAAAAAGCCTTTCAAAAGTAAGCAACGTCTGCTTACTGCCCCTCTACCTGCTTCGGCCGATAAAGCcgacg < 3:1077172/85‑1 (MQ=255) cAAAATCAGCTTAAAAAAAGCCTTTCAAAAGTAAGCAACGTCTGCTTACTGCCCCTCTACCTGCTTCGGCCGATAAAGCCGACGATAATACt < 4:656919/92‑1 (MQ=255) cAAAATCAGCTTAAAAAAAGCCTTTCAAAAGTAAGCAACGTCTGCTTACTGCCCCTCTACCTGCTTCGGCCGATAAAGCCGACGATAATACTCCAGACGTTGTAGATATAACGGCACGCTTTCATCg < 1:108554/127‑1 (MQ=255) | GGCGTTACCACCGCCGCCACAGTTTGAACCAGCAGACTCCAGTTTGTATGCAATGCAAATTCAGCGCTATCAACAGGCTGTGCGATCAACAATGGTCCTTTCACTGACTGAGCTGATTTCCAAAATCAGCTTAAAAAAAGCCTTTCAAAAGTAAGCAACGTCTGCTTACTGCCCCTCTACCTGCTTCGGCCGATAAAGCCGACGATAATACTCCAGACGTTGTAGATATAACGGCACGCTTTCATCGGGTATTCCGGACGGAATCGCG > NC_000913/3776006‑3776273 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |