| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,917,686 | A→C | 5.1% | S194A (TCA→GCA) | atpG ← | F1 sector of membrane‑bound ATP synthase, gamma subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,917,686 | 0 | A | C | 5.1% | 292.2 / 5.5 | 79 | S194A (TCA→GCA) | atpG | F1 sector of membrane‑bound ATP synthase, gamma subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (37/38); new base C (2/2); total (39/40) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.88e-01 | |||||||||||
GGCCTGCTCGCTGGCCAGGTTTTCAACCACGCCCTGATAAACCTGAGATTCGACATAACGACGCAGCAGGGTATCCAGCAACGCCTTCGGATCGGGTTCGTACAGGTAATCCCAGGATTTATGTTTCAGATCATCATCATCTGATGCCGGTAACGGCAGCAGCTGGCTGATGGTCGGAACCTGAGACATGGTGTTAATAAATTTGTTGCTGACAATGTAAAGCTTGTCCAGACGGCCTTCGTCGTAGGCCTGCAACATCACTTTTACCGGACCGATCAGTTCGGACAGGGA > NC_000913/3917543‑3917833 | ggcCTGCTCGCTGGCCAGGTTTTCAACCACGCCCTGATAAACCTGAGATTCGACATAACGACGCAGCAGGGTATCCAGCAACGCCTTCGGATCGGGTTCGTACAGGTAATCCCAGGATTTATGTTTCAGATCATCATCATCTGATGcc < 4:783849/148‑1 (MQ=255) ggTTTTCAACCACGCCCTGATAAACCTGAGATTCGACATAACGACGCAGCAGGGTATCCAGCAACGCCTTCGGATCGGGTTCGTACAGGTAATCCCAGGATTTATGTTTCAGATCATCATCATCTGATGCCGGTAACGGCAGCAgctg > 4:155676/1‑148 (MQ=255) cAACCACGCCCTGATAAACCTGAGATTCGACATAACGACGCAGCAGGGTATCCAGCAACGCCTTCGGATCGGGTTCGTACAGGTAATCCCAGGATTTATGTTTCAGAGCATCATCATCTGATGCCGGTAACGGCAGCAGCTGGCTGAt < 3:155676/148‑1 (MQ=255) aCCACGCCCTGATAAACCTGAGATTCGACATAACGACGCAGCAGGGTATCCAGCAACGCCTTCGGATCGGGTTCGTACAGGTAATCCCAGGATTTATGTTTCAGATCATCATCATCTGATGCCGGTAACGGCAGCAGCTGGCTGATgg > 4:915202/1‑148 (MQ=255) ccACGCCCTGATAAACCTGAGATTCGACATAACGACGCAGCAGGGTATCCAGCAACGCCTTCGGATCGGGTTCGTACAGGTAATCCCAGGATTTATGTTTCAGATCATCATCATCTGCTGCCGTTACCGgcat < 4:928869/133‑2 (MQ=255) ccACGCCCTGATAAACCTGAGATTCGACATAACGACGCAGCAGGGTATCCAGCAACGCCTTCGGATCGGGTTCGTACAGGTAATCCCAGGATTTATGTTTCAGATCATCATCATCTGCTGCCGTTACCGgcat > 3:928869/1‑132 (MQ=255) aTAAACCTGAGATTCGACATAACGACGCAGCAGGGTATCCAGCAACGCCTTCGGATCGGGTTCGTACAGGTAATCCCAGGATTTATGTTTCAGATCATCATCATCTGATGc > 3:597230/1‑111 (MQ=255) aTAAACCTGAGATTCGACATAACGACGCAGCAGGGTATCCAGCAACGCCTTCGGATCGGGTTCGTACAGGTAATCCCAGGATTTATGTTTCAGATCATCATCATCTGATGc < 4:597230/111‑1 (MQ=255) cTGAGATTCGACATAACGACGCAGCAGGGTATCCAGCAACGCCTTCGGATCGGGTTCGTACAGGTAATCCCAGGATTTATGTTTCAGATCATCATCATCTGATGCCGGTAACGGCAGCAGCTGGCTGCTGGTCGGAACCTg < 3:81718/141‑1 (MQ=255) cTGAGATTCGACATAACGACGCAGCAGGGTATCCAGCAACGCCTTCGGATCGGGTTCGTACAGGTAATCCCAGGATTTATGTTTCAGATCATCATCATCTGATGCCGGTAACGGCAGCAGCTGGCTGATGGTCGGAACCTg > 4:81718/1‑141 (MQ=255) gagaTTCGACATAACGACGCAGCAGGGTATCCAGCAACGCCTTCGGATCGGGTTCGTACAGGTAATCCCAGGATTTATGTTTCAGATCATCATCATCTGATGCCGGTAACGGCAGCAGCTGGCTGATGGTCGGAACCTGAGACATGgt > 4:816316/1‑148 (MQ=255) gagaTTCGACATAACGACGCAGCAGGGTATCCAGCAACGCCTTCGGATCGGGTTCGTACAGGTAATCCCAGGATTTATGTTTCAGATCATCATCATCTGATGCCGGTAACGGCAGCAGCTGGCTGATGGTCGGAACCTGAGACATGgt > 1:145488/1‑148 (MQ=255) ttCGACATAACGACGCAGCAGGGTATCCAGCAACGCCTTCGGATCGGGTTCGTACAGGTAATCCCAGGATTTATGTTTCAGATCATCATCATCTGATGCCGGTAACGGCAGCAGCTGGCTGATGGt > 3:477098/1‑126 (MQ=255) ttCGACATAACGACGCAGCAGGGTATCCAGCAACGCCTTCGGATCGGGTTCGTACAGGTAATCCCAGGATTTATGTTTCAGATCATCATCATCTGATGCCGGTAACGGCAGCAGCTGGCTGATGGt < 4:477098/126‑1 (MQ=255) tCGACATAACGACGCAGCAGGGTATCCAGCAACGCCTTCGGATCGGGTTCGTACAGGTAATCCCAGGATTTATGTTTCAGATCATCATCATCTGATGCCGGTAACgg < 2:843058/107‑1 (MQ=255) tCGACATAACGACGCAGCAGGGTATCCAGCAACGCCTTCGGATCGGGTTCGTACAGGTAATCCCAGGATTTATGTTTCAGATCATCATCATCTGATGCCGGTAACgg > 1:843058/1‑107 (MQ=255) tAACGACGCAGCAGGGTATCCAGCAACGCCTTCGGATCGGGTTCGTACATGTAATCCCAGGATTTATGTTTCAGATCATCATCATCTGATGCCGGTAACgg < 2:328295/101‑1 (MQ=255) tAACGACGCAGCAGGGTATCCAGCAACGCCTTCGGATCGGGTTCGTACAGGTAATCCCAGGATTTATGTTTCAGATCATCATCATCTGATGCCGGTAACGGCAGCAGCTGGCTGATGGTCGGa > 2:955416/1‑123 (MQ=255) tAACGACGCAGCAGGGTATCCAGCAACGCCTTCGGATCGGGTTCGTACAGGTAATCCCAGGATTTATGTTTCAGATCATCATCATCTGATGCCGGTAACGGCAGCAGCTGGCTGATGGTCGGa < 1:955416/123‑1 (MQ=255) tAACGACGCAGCAGGGTATCCAGCAACGCCTTCGGATCGAGTTCGTACAGGTAATCCCAGGATTTATGTTTCAGATCATCATCATCTGATGCCGGTAACgg > 1:328295/1‑101 (MQ=255) aaCGACGCAGCAGGGTATCCAGCAACGCCTTCGGATCGGGTTCGTACAGGTAATCCCAGGATTTATGTTTCAGATCATCATCATCTGATGCCGGTAACGGCAGCAGCTGGCTGATGGTCGGAACCTGAGACATGGTGTTAATAAAttt < 2:145488/148‑1 (MQ=255) cgacgCAGCAGGGTATCCAGCAACGCCTTCGGATCGGGTTCGTACAGGTAATCCCAGGATTTATGTTTCAGATCATCATCATCTGATGCCGGTAACGGCAGCAGCTGGCTGATGGTCGGAACCTGAGACa < 1:1097846/130‑1 (MQ=255) cgacgCAGCAGGGTATCCAGCAACGCCTTCGGATCGGGTTCGTACAGGTAATCCCAGGATTTATGTTTCAGATCATCATCATCTGATGCCGGTAACGGCAGCAGCTGGCTGATGGTCGGAACCTGAGACa > 2:1097846/1‑130 (MQ=255) cgacgCAGCAGGGTATCCAGCAACGCCTTCGGATCGGGTTCGTACAGGTAATCCCAGGATTTATGTTTCAGATCATCATCATCTGATGCCGGTAACGGCAGCAGCTGGCTGATGGTCGGAACCTGAGACATGGTGTTAATAAATttgt > 3:304645/1‑148 (MQ=255) acgCAGCAGGGTATCCAGCAACGCCTTCGGATCGGGTTCGTACAGGTAATCCCAGGATTTATGTTTCAGATCATCATCATCTGATGCCGGTAACGGCAGCAGCTGGCTGATGGTCGGAAcc > 3:179153/1‑121 (MQ=255) acgCAGCAGGGTATCCAGCAACGCCTTCGGATCGGGTTCGTACAGGTAATCCCAGGATTTATGTTTCAGATCATCATCATCTGATGCCGGTAACGGCAGCAGCTGGCTGATGGTCGGAAcc < 4:179153/121‑1 (MQ=255) gggTATCCAGCAACGCCTTCGGATCGGGTTCGTACAGGTAATCCCAGGATTTATGTTTCAGATCATCATCATCTGATGCCGGTAACGGCAGCAGCTGGCTGATGGTCGGAACCTGAGACATGGTGTtaataa > 2:572447/1‑132 (MQ=255) gggTATCCAGCAACGCCTTCGGATCGGGTTCGTACAGGTAATCCCAGGATTTATGTTTCAGATCATCATCATCTGATGCCGGTAACGGCAGCAGCTGGCTGATGGTCGGAACCTGAGACATGGTGTtaataa < 1:572447/132‑1 (MQ=255) 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gCAACGCCTTCGGATCGGGTTCGTACAGGTAATCCCAGGATTTATGTTTCAGATCATCATCATCTGATGCCGGTAACGGCAGCAGCTGGCTGATGGTCGGAACCTGAGACATGGTGTTAATAAATTTGTTGCTGACAATGTAAAGCtt < 3:915202/148‑1 (MQ=255) cAACGCCTTCGGATCGGGTTCGTACAGGTAATCCCAGGATTTATGTTTCAGATCATCATCATCTGATGCCGGTAACGGCAGCAGCTGGCTGATGGTCGGAACCTGAGACATGGTGTTAATAAATTTGTTGCTGACAATGTAAAGCTTg > 3:31076/1‑148 (MQ=255) ccTTCGGATCGGGTTCGTACAGGTAATCCCAGGATTTATGTTTCAGATCATCATCATCTGATGCCGGTAACGGCAGCAGCTGGCTGATGGTCGGAACCTGAGACATGGTGTTAATAAATTTGTTGCTGACAATGTAAAGCTTGTCCAg < 4:31076/148‑1 (MQ=255) cTTCGGATCGGGTTCGTACAGGTAATCCCAGGATTTATGTTTCAGATCATCATCATCTGATGCCGGTAACGGCAGCAGCTGGCTGAt < 1:1127569/87‑1 (MQ=255) cTTCGGATCGGGTTCGTACAGGTAATCCCAGGATTTATGTTTCAGATCATCATCATCTGATGCCGGTAACGGCAGCAGCTGGCTGAt > 2:1127569/1‑87 (MQ=255) ttCGGATCGGGTTCGTACAGGTAATCCCAGGATTTATGTTTCAGATCATCATCATCTGATGCCGGTAACGGCAGCAGCTGGCTGATGGTCGGAACCTGAGACATGGTGTTAATAAATTTGTTGCTGACa > 1:815852/1‑129 (MQ=255) ttCGGATCGGGTTCGTACAGGTAATCCCAGGATTTATGTTTCAGATCATCATCATCTGATGCCGGTAACGGCAGCAGCTGGCTGATGGTCGGAACCTGAGACATGGTGTTAATAAATTTGTTGCTGACa < 2:815852/129‑1 (MQ=255) ttCGGATCGGGTTCGTACAGGTAATCCCAGGATTTATGTTTCAGATCATCATCATCTGATGCCGGTAACGGCAGCAGCTGGCTGATGGTCGGAACCTGAGACATGGTGTTAATAAATTTGTTGCTGACa < 4:750086/129‑1 (MQ=255) ttCGGATCGGGTTCGTACAGGTAATCCCAGGATTTATGTTTCAGATCATCATCATCTGATGCCGGTAACGGCAGCAGCTGGCTGATGGTCGGAACCTGAGACATGGTGTTAATAAATTTGTTGCTGACa > 3:750086/1‑129 (MQ=255) tCGGGTTCGTACAGGTAATCCCAGGATTTATGTTTCAGATCATCATCATCTGATGCCGGTAACGGCAGCAGCTGGCTGATGGTCGGAACCTGAGACATGGTGTTAATAAATTTGTTGCTGACAATGTAAAGCTTGTCCAGACGGCCtt > 1:688494/1‑148 (MQ=255) cGTACAGGTAATCCCAGGATTTATGTTTCAGATCATCATCATCTGATGCCGGTAACGGCAGCAGCTGGCTGATGGTCGGAACCTGAGACATGGTGTTAATAAATTTGTTGCTGACAATGTAAAGCTTGTCCAGACGGCCtt > 3:482404/1‑141 (MQ=255) cGTACAGGTAATCCCAGGATTTATGTTTCAGATCATCATCATCTGATGCCGGTAACGGCAGCAGCTGGCTGATGGTCGGAACCTGAGACATGGTGTTAATAAATTTGTTGCTGACAATGTAAAGCTTGTCCAGACGGCCtt < 4:482404/141‑1 (MQ=255) tACAGGTAATCCCAGGATTTATGTTTCAGATCATCATCATCTGCTGCCGTTACCGgca > 4:81372/1‑58 (MQ=38) tACAGGTAATCCCAGGATTTATGTTTCAGATCATCATCATCTGCTGCCGTTACCGgca < 3:81372/58‑1 (MQ=38) ggTAATCCCAGGATTTATGTTTCAGATCATCATCATCTGATGCCGGTAACGGCAGCAGCTGGCTGATGGTCGGAACCTGAGACAt > 1:209402/1‑85 (MQ=255) ggTAATCCCAGGATTTATGTTTCAGATCATCATCATCTGATGCCGGTAACGGCAGCAGCTGGCTGATGGTCGGAACCTGAGACAt < 2:209402/85‑1 (MQ=255) tAATCCCAGGATTTATGTTTCAGATCATCATCATCTGATGCCGGTAACGGCAGCAGCTGGCTGATGGTCGGAACCTGAGACATGGTGTTAATAAATTTGTTGCTGACAATGTAAAGCTTGTCCAGACGGc > 1:285214/1‑130 (MQ=255) tAATCCCAGGATTTATGTTTCAGATCATCATCATCTGATGCCGGTAACGGCAGCAGCTGGCTGATGGTCGGAACCTGAGACATGGTGTTAATAAATTTGTTGCTGACAATGTAAAGCTTGTCCAGACGGc < 2:285214/130‑1 (MQ=255) ccAGGATTTATGTTTCAGATCATCATCATCTGATGCCGGTAACGGCAGCAGCTGGCTGATGGTCGGAACCTGAGACATGGTGTTAATAAATttgtt < 2:793576/96‑1 (MQ=255) ccAGGATTTATGTTTCAGATCATCATCATCTGATGCCGGTAACGGCAGCAGCTGGCTGATGGTCGGAACCTGAGACATGGTGTTAATAAATttgtt > 1:793576/1‑96 (MQ=255) aGGATTTATGTTTCAGATCATCATCATCTGATGCCGGTAACGGCAGCAGCTGGCTGa < 3:78462/57‑1 (MQ=255) aGGATTTATGTTTCAGATCATCATCATCTGATGCCGGTAACGGCAGCAGCTGGCTGa > 4:78462/1‑57 (MQ=255) aGGATTTATGTTTCAGATCATCATCATCTGATGCCGGTAACGGCAGCAGCTGGCTGATGGTCGGAACCTGAGACATgg > 2:471342/1‑78 (MQ=255) aGGATTTATGTTTCAGATCATCATCATCTGATGCCGGTAACGGCAGCAGCTGGCTGATGGTCGGAACCTGAGACATgg < 1:471342/78‑1 (MQ=255) aGGATTTATGTTTCAGATCATCATCATCTGATGCCGGTAACGGCAGCAGCTGGCTGATGGTCGGAACCTGAGACATGGTGTTAATAAATTTGTTGCTGACAATGTAAAGCTTGTCCAGACGGCCTtcgt > 1:284550/1‑129 (MQ=255) aGGATTTATGTTTCAGATCATCATCATCTGATGCCGGTAACGGCAGCAGCTGGCTGATGGTCGGAACCTGAGACATGGTGTTAATAAATTTGTTGCTGACAATGTAAAGCTTGTCCAGACGGCCTtcgt < 2:284550/129‑1 (MQ=255) ggATTTATGTTTCAGATCATCATCATCTGATGCCGGTAACGGCAGCAGCTGGCTGATGGTCGGAACCTGAGACATGGTGTTAATAAATTTGTTGCTGACAATGTAAAGCTTGTCCAGACGGCCTtcgtcg > 3:555770/1‑130 (MQ=255) ggATTTATGTTTCAGATCATCATCATCTGATGCCGGTAACGGCAGCAGCTGGCTGATGGTCGGAACCTGAGACATGGTGTTAATAAATTTGTTGCTGACAATGTAAAGCTTGTCCAGACGGCCTtcgtcg < 4:555770/130‑1 (MQ=255) ggATTTATGTTTCAGATCATCATCATCTGATGCCGGTAACGGCAGCAGCTGGCTGATGGTCGGAACCTGAGACATGGTGTTAATAAATTTGTTGCTGACAATGTAAAGCTTGTCCAGACGGCCTTCGTCGTAgg < 2:526297/134‑1 (MQ=255) ggATTTATGTTTCAGATCATCATCATCTGATGCCGGTAACGGCAGCAGCTGGCTGATGGTCGGAACCTGAGACATGGTGTTAATAAATTTGTTGCTGACAATGTAAAGCTTGTCCAGACGGCCTTCGTCGTAgg > 1:526297/1‑134 (MQ=255) ggATTTATGTTTCAGATCATCATCATCTGATGCCGGTAACGGCAGCAGCTGGCTGATGGTCGGAACCTGAGACATGGTGTTAATAAATTTGTTGCTGACAATGTAAAGCTTGTCCAGACGGCCTTCGTCGTAGGCCTGCAACATCACt < 2:688494/148‑1 (MQ=255) cAGATCATCATCATCTGATGCCGGTAACGGCAGCAGCTGGCTGATGGTCGGAACCTGAGACATGGTGTTAATAAATTTGTTGCTGACAATGTAAAGCTTGTCCAGACGGCCTTCGTCGTAGGCCTGCAACATCACTTTTACCGGACCg > 1:769103/1‑148 (MQ=255) atcatcatcatcTGATGCCGGTAACGGCAGCAGCTGGCTGATGGTCGGAACCTGAGACATGGTGTTAATAAATTTGTTGCTGACAATGTAAAGCTTGTCCAGACGGCCTTCGTCGTAGGCCTGCAACATCACTTTTACCGGACCGa > 1:156279/1‑146 (MQ=255) atcatcatcatcTGATGCCGGTAACGGCAGCAGCTGGCTGATGGTCGGAACCTGAGACATGGTGTTAATAAATTTGTTGCTGACAATGTAAAGCTTGTCCAGACGGCCTTCGTCGTAGGCCTGCAACATCACTTTTACCGGACCGa < 2:156279/146‑1 (MQ=255) tcatcatcatcTGATGCCGGTAACGGCAGCAGCTGGCTGATGGTCGGAACCTGAGACATGGTGTTAATAAATTTGTTGCTGACAATGTAAAGCTTGTCCAGACGGCCTTCGTCGTAGGCCTGCAACATCACttt < 1:1102469/134‑1 (MQ=255) tcatcatcatcTGATGCCGGTAACGGCAGCAGCTGGCTGATGGTCGGAACCTGAGACATGGTGTTAATAAATTTGTTGCTGACAATGTAAAGCTTGTCCAGACGGCCTTCGTCGTAGGCCTGCAACATCACttt > 2:1102469/1‑134 (MQ=255) atcatcatcTGATGCCGGTAACGGCAGCAGCTGGCTGATGGTCGGAACCTGAGACATGGTGTTAATAAATTTGTTGCTGACAATGTAAAGCTTGTCCAGACGGCCTTCGTCGTAGGCCTGCAACATCACTTTTACCGGACCGATCAGt < 2:769103/148‑1 (MQ=255) catcatcTGATGCCGGTAACGGCAGCAGCTGGCTGATGGTCGGAACCTGAGACATGGTGTTAATAAATTTGTTGCTGACAATGTAAAGCTTGTCCAGACGGCCTTCGTCGTAGGCCTGCAACATCACTTTTACCGGACCGa > 2:402661/1‑141 (MQ=255) catcatcTGATGCCGGTAACGGCAGCAGCTGGCTGATGGTCGGAACCTGAGACATGGTGTTAATAAATTTGTTGCTGACAATGTAAAGCTTGTCCAGACGGCCTTCGTCGTAGGCCTGCAACATCACTTTTACCGGACCGa < 1:402661/141‑1 (MQ=255) atcatcTGATGCCGGTAACGGCAGCAGCTGGCTGATGGTCGGAACCTGAGACATGGTGTTAATAAATTTGTTGCTGACAATGTAAAGCTTGTc > 2:209080/1‑93 (MQ=255) atcatcTGATGCCGGTAACGGCAGCAGCTGGCTGATGGTCGGAACCTGAGACATGGTGTTAATAAATTTGTTGCTGACAATGTAAAGCTTGTc < 1:209080/93‑1 (MQ=255) catcTGATGCCGGTAACGGCAGCAGCTGGCTGATGGTCGGAACCTGAGACATGGTGTTAATAAATTTGTTGCTGACAATGTAAAGCTTGTCCAGACGGCCTtcgt < 1:654613/105‑1 (MQ=255) catcTGATGCCGGTAACGGCAGCAGCTGGCTGATGGTCGGAACCTGAGACATGGTGTTAATAAATTTGTTGCTGACAATGTAAAGCTTGTCCAGACGGCCTtcgt > 2:654613/1‑105 (MQ=255) tGATGCCGGTAACGGCAGCAGCTGGCTGATGGTCGGAACCTGAGACATGGTGTTAATAAATTTGTTGCTGACAATGTAAAGCTTGTCCAGACGGCCTTCGTCGTAGGCCTGCAACATCACTTTTACCgg < 4:139590/129‑1 (MQ=255) tGATGCCGGTAACGGCAGCAGCTGGCTGATGGTCGGAACCTGAGACATGGTGTTAATAAATTTGTTGCTGACAATGTAAAGCTTGTCCAGACGGCCTTCGTCGTAGGCCTGCAACATCACTTTTACCgg > 3:139590/1‑129 (MQ=255) aTGCCGGTAACGGCAGCAGCTGGCTGATGGTCGGAACCTGAGACATGGTGTTAATAAATTTGTTGCTGACAATGTAAAGCTTGTCCAGACGGCCTTCGTCGTAGGCCTGCAACATCACTTTTACCGGACCGATCAGTTCGGACAGGGa > 3:129313/1‑148 (MQ=255) | GGCCTGCTCGCTGGCCAGGTTTTCAACCACGCCCTGATAAACCTGAGATTCGACATAACGACGCAGCAGGGTATCCAGCAACGCCTTCGGATCGGGTTCGTACAGGTAATCCCAGGATTTATGTTTCAGATCATCATCATCTGATGCCGGTAACGGCAGCAGCTGGCTGATGGTCGGAACCTGAGACATGGTGTTAATAAATTTGTTGCTGACAATGTAAAGCTTGTCCAGACGGCCTTCGTCGTAGGCCTGCAACATCACTTTTACCGGACCGATCAGTTCGGACAGGGA > NC_000913/3917543‑3917833 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |