| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 105,046 | A→C | 5.8% | Q355H (CAA→CAC) | ftsA → | ATP‑binding cell division FtsK recruitment protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 105,046 | 0 | A | C | 5.8% | 374.0 / 12.0 | 103 | Q355H (CAA→CAC) | ftsA | ATP‑binding cell division FtsK recruitment protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (48/49); new base C (3/3); total (51/52) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.03e-01 | |||||||||||
Only 100 of 103 total aligned reads displayed.
AAGAGATATTGCAGTTGCAGGAAAAGCTTCGCCAACAAGGGGTTAAACATCACCTGGCGGCAGGCATTGTATTAACCGGTGGCGCAGCGCAGATCGAAGGTCTTGCAGCCTGTGCTCAGCGCGTGTTTCATACGCAAGTGCGTATCGGCGCGCCGCTGAACATTACCGGTTTAACGGATTATGCTCAGGAGCCGTATTATTCGACGGCGGTGGGATTGCTTCACTATGGGAAAGAGTCACATCTTAACGGTGAAGCTGAAGTAGAAAAACGTG > NC_000913/104910‑105182 | aaGAGATATTGCAGTTGCAGGAAAAGCTTCGCCAACAAGGGGTTAAACATCACCTGGCGGCAGGCATTGTATTAACCGGTGGCGCAGCGCAGATCGAAGGTCTTGCAGCCTGTGCTCAGCGCGTGTTTCATACGCAAGTGCGTATCgg > 2:765299/1‑148 (MQ=255)aaGAGATATTGCAGTTGCAGGAAAAGCTTCGCCAACAAGGGGTTAAACATCACCTGGCGGCAGGCATTGTATTAACCGGTGGCGCAGCGCAGATCGAAGGTCTTGCAGCCTGTGCTCAGCGCGTGTTTCATACGCAAGTGCGTATCgg > 3:352130/1‑148 (MQ=255) atTGCAGTTGCAGGAAAAGCTTCGCCAACAAGGGGTTAAACATCACCTGGCGGCAGGCATTGTATTAACCGGTGGCGCAGCGCAGATCGAAGGTCTTGCAGCCTGTGCTCAGCGCGTGTTTCATACGCAAGTGCGTAACGGCGcgccg < 3:999095/148‑1 (MQ=255) gcagttgcagGAAAAGCTTCGCCAACAAGGGGTTAAACATCACCTGGCGGCAGGCATTGTATTAACCGGTGGCGCAGCGCAGATCGAAGGTCTTGCAGCCTGTGCTCAGCGCGTGTTTCATACGCAAGTGCGTATCGGCGCGCCGCTg < 4:352130/148‑1 (MQ=255) aaaaGCTTCGCCAACAAGGGGTTAAACATCACCTGGCGGCAGGCATTGTATTAACCGGTGGCGCAGCGCAGATCGAAGGTCTTGCAGCCTGTGCTCAGCGCGTGTTTCATACGCAAGTGCGTATCGGCGCGCCGCTGAACATTACCgg > 4:1108251/1‑148 (MQ=255) tCGCCAACAAGGGGTTAAACATCACCTGGCGGCAGGCATTGTATTAACCGGTGGCGCAGCGCAGATCGAAGGTCTTGCAGCCTGTGCTCAGCGCGTGTTTCATACGCACTTGCGTa > 3:970185/1‑116 (MQ=255) cGCCAACAAGGGGTTAAACATCACCTGGCGGCAGGCATTGTATTAACCGGTGGCGCAGCGCAGATCGAAGGTCTTGCAGCCTGTGCTCAGCGCGTGTTTCATACGCAAGTGCGTATCGGCGCGCCGCTGAACATTACCGGTTTAACgg < 1:765299/148‑1 (MQ=255) ccAACAAGGGGTTAAACATCACCTGGCGGCAGGCATTGTATTAACCGGTGGCGCAGCGCAGATCGAAGGTCTTGCAGCCTGTGCTCAGCGCGTGTTTCATACGCAAGTGCGTATCGGCGCGCCGCTGAACATTACCGGTTTAACGGAt > 1:853489/1‑148 (MQ=255) caacaaGGGGTTAAACATCACCTGGCGGCAGGCATTGTATTAACCGGTGGCGCAGCGCAGATCGAAGGTCTTGCAGCCTGTGCTCAGCGCGTGTTTCATACGCAAg < 1:224557/106‑1 (MQ=255) caacaaGGGGTTAAACATCACCTGGCGGCAGGCATTGTATTAACCGGTGGCGCAGCGCAGATCGAAGGTCTTGCAGCCTGTGCTCAGCGCGTGTTTCATACGCAAg > 2:224557/1‑106 (MQ=255) caacaaGGGGTTAAACATCACCTGGCGGCAGGCATTGTATTAACCGGTGGCGCAGCGCAGATCGAAGGTCTTGCAGCCTGTGCTCAGCGCGTGTTTCATACGCAAGTGCGTATCGGCGCGCCGCTGAACATTa < 3:542930/133‑1 (MQ=255) caacaaGGGGTTAAACATCACCTGGCGGCAGGCATTGTATTAACCGGTGGCGCAGCGCAGATCGAAGGTCTTGCAGCCTGTGCTCAGCGCGTGTTTCATACGCAAGTGCGTATCGGCGCGCCGCTGAACATTa > 4:542930/1‑133 (MQ=255) aacaaGGGGTTAAACATCACCTGGCGGCAGGCATTGTATTAACCGGTGGCGCAGCGCAGATCGAAGGTCTTGCAGCCTGTGCTCAGCGCGTGTTTCATACGCACTTGCGTAtg > 4:471278/1‑112 (MQ=255) acaaGGGGTTAAACATCACCTGGCGGCAGGCATTGTATTAACCGGTGGCGCAGCGCAGATCGAAGGTCTTGCAGCCTGTGCTCAGCGCGTGTTTCATACGCAAGTGCGTATCGGCGCGCCGCTGAACATTACCGGTTTAACGGATTAt < 3:1108251/148‑1 (MQ=255) acaaGGGGTTAAACATCACCTGGCGGCAGGCATTGTATTAACCGGTGGCGCAGCGCAGATCGAAGGTCTTGCAGCCTGTGCTCAGCGCGTGTTTCATACGCAAGTGCGTATCGGCGCGCCACTGAACATTACCGGTTTAACGGATTAt < 4:316334/148‑1 (MQ=255) aGGGGTTAAACATCACCTGGCGGCAGGCATTGTATTAACCGGTGGCGCAGCGCAGATCGAAGGTCTTGCAGCCTGTGCTCAGCGCGTGTTTCATACGCAAGTg < 4:746243/103‑1 (MQ=255) aGGGGTTAAACATCACCTGGCGGCAGGCATTGTATTAACCGGTGGCGCAGCGCAGATCGAAGGTCTTGCAGCCTGTGCTCAGCGCGTGTTTCATACGCAAGTg > 3:746243/1‑103 (MQ=255) ttAAACATCACCTGGCGGCAGGCATTGTATTAACCGGTGGCGCAGCGCAGATCGAAGGTCTTGCAGCCTGTGCTCAGCGCGTGTTTCATACGCAAGTGCGTATCGGCGCGCCGCTGAACATTACCGGTTTAACGGATTATGCTCAgg > 1:279529/1‑147 (MQ=255) ttAAACATCACCTGGCGGCAGGCATTGTATTAACCGGTGGCGCAGCGCAGATCGAAGGTCTTGCAGCCTGTGCTCAGCGCGTGTTTCATACGCAAGTGCGTATCGGCGCGCCGCTGAACATTACCGGTTTAACGGATTATGCTCAgg < 2:279529/147‑1 (MQ=255) tAAACATCACCTGGCGGCAGGCATTGTATTAACCGGTGGCGCAGCGCAGATCGAAGGTCTTGCAGCCTGTGCTCAGCGCGTGTTTCATACGCAAGTg > 2:741814/1‑97 (MQ=255) tAAACATCACCTGGCGGCAGGCATTGTATTAACCGGTGGCGCAGCGCAGATCGAAGGTCTTGCAGCCTGTGCTCAGCGCGTGTTTCATACGCAAGTg < 1:741814/97‑1 (MQ=255) aaCATCACCTGGCGGCAGGCATTGTATTAACCGGTGGCGCAGCGCAGATCGAAGGTCTTGCAGCCTGTGCTCAGCGCGTGTTTCATACGCAAGTGCGTATCGGCGCGCCGCTGAACATTACCGGTTTAACGGATTATGCTCAGGAGcc > 2:120452/1‑148 (MQ=255) aCATCACCTGGCGGCAGGCATTGTATTAACCGGTGGCGCAGCGCAGATCGAAGGTCTTGCAGCCTGTGCTCAGCGCGTGTTTCATACGCAAGTGCGTATCGGCGCGCCGCTGAACATTACCGGTTTAACGGATTATGCTCAGGAGCCg > 4:166836/1‑148 (MQ=255) tCACCTGGCGGCAGGCATTGTATTAACCGGTGGCGCAGCGCAGATCGAAGGTCTTGCAGCCTGTGCTCAGCGCGTGTTTCATACGCACTTGCGTAt < 2:35412/96‑1 (MQ=255) tCACCTGGCGGCAGGCATTGTATTAACCGGTGGCGCAGCGCAGATCGAAGGTCTTGCAGCCTGTGCTCAGCGCGTGTTTCATACGCACTTGCGTAt > 1:35412/1‑96 (MQ=255) cACCTGGCGGCAGGCATTGTATTAACCGGTGGCGCAGCGCAGATCGAAGGTCTTGCAGCCTGTGCTCAGCGCGTGTTTCATACGCAAGTGCGTATCGGCGCGCCGCTGAACATTACCGGTTTAACGGATTATGCTCAGGAGCCGtatt > 4:219543/1‑148 (MQ=255) tGGCGGCAGGCATTGTATTAACCGGTGGCGCAGCGCAGATCGAAGGTCTTGCAGCCTGTGCTCAGCGCGTGTTTCATACGCAAGTg > 3:876000/1‑86 (MQ=255) tGGCGGCAGGCATTGTATTAACCGGTGGCGCAGCGCAGATCGAAGGTCTTGCAGCCTGTGCTCAGCGCGTGTTTCATACGCAAGTg < 4:876000/86‑1 (MQ=255) ggcaTTGTATTAACCGGTGGCGCAGCGCAGATCGAAGGTCTTGCAGCCTGTGCTCAGCGCGTGTTTCATACGCAAGTGCGTATCGGCGCGCCGCTGa < 4:377481/97‑1 (MQ=255) ggcaTTGTATTAACCGGTGGCGCAGCGCAGATCGAAGGTCTTGCAGCCTGTGCTCAGCGCGTGTTTCATACGCAAGTGCGTATCGGCGCGCCGCTGa > 3:377481/1‑97 (MQ=255) ggcaTTGTATTAACCGGTGGCGCAGCGCAGATCGAAGGTCTTGCAGCCTGTGCTCAGCGCGTGTTTCATACGCAAGTGCGTATCGGCGCGCCGCTGAACATTACCGGTTTAACGGATTATGCTCAGGAGCCGTATTATTCg < 1:578975/141‑1 (MQ=255) ggcaTTGTATTAACCGGTGGCGCAGCGCAGATCGAAGGTCTTGCAGCCTGTGCTCAGCGCGTGTTTCATACGCAAGTGCGTATCGGCGCGCCGCTGAACATTACCGGTTTAACGGATTATGCTCAGGAGCCGTATTATTCg > 2:578975/1‑141 (MQ=255) ttGTATTAACCGGTGGCGCAGCGCAGATCGAAGGTCTTGCAGCCTGTGCTCAGCGCGTGTTTCATACGCAAGTGCGTATCGGCGCGCCGCTGAACATTACCGGTTTAACGGATTATGCTCAGGAGCCGTATTATTCGACGGCGGTggg > 2:871596/1‑148 (MQ=255) aTTAACCGGTGGCGCAGCGCAGATCGAAGGTCTTGCAGCCTGTGCTCAGCGCGTGTTTCATACGCAAGTGCGTATCGGCGCGCCGCTGAACATTACCGGTTTAACGGATTATGCTCAGGAGCCGTATTATTCGACGGCGGTGGGATTg < 3:166836/148‑1 (MQ=255) ttAACCGGTGGCGCAGCGCAGATCGAAGGTCTTGCAGCCTGTGCTCAGCGCGTGTTTCATACGCAAGTGCGTATCGGCGCGCCGCTGa < 4:522460/88‑1 (MQ=255) ttAACCGGTGGCGCAGCGCAGATCGAAGGTCTTGCAGCCTGTGCTCAGCGCGTGTTTCATACGCAAGTGCGTATCGGCGCGCCGCTGa > 3:522460/1‑88 (MQ=255) ttAACCGGTGGCGCAGCGCAGATCGAAGGTCTTGCAGCCTGTGCTCAGCGCGTGTTTCATACGCAAGTGCGTATCGGCGCGCCGCTGAACATTACCGGTTTAACgg < 3:271648/106‑1 (MQ=255) ttAACCGGTGGCGCAGCGCAGATCGAAGGTCTTGCAGCCTGTGCTCAGCGCGTGTTTCATACGCAAGTGCGTATCGGCGCGCCGCTGAACATTACCGGTTTAACgg > 4:271648/1‑106 (MQ=255) ttAACCGGTGGCGCAGCGCAGATCGAAGGTCTTGCAGCCTGTGCTCAGCGCGTGTTTCATACGCAAGTGCGTATCGGCGCGCCGCTGAACATTACCGGTTTAACGGATTATGCTCAGGAGCCGTATTATTCGACGGCGGTGGGATTGc < 1:120452/148‑1 (MQ=255) aaCCGGTGGCGCAGCGCAGATCGAAGGTCTTGCAGCCTGTGCTCAGCGCGTGTTTCATACGCAAGTGCGTATCGGCGCGCCGCTGAACATTACCGGTTTAACGGATTATg < 2:360234/110‑1 (MQ=255) aaCCGGTGGCGCAGCGCAGATCGAAGGTCTTGCAGCCTGTGCTCAGCGCGTGTTTCATACGCAAGTGCGTATCGGCGCGCCGCTGAACATTACCGGTTTAACGGATTATg > 1:360234/1‑110 (MQ=255) aaCCGGTGGCGCAGCGCAGATCGAAGGTCTTGCAGCCTGTGCTCAGCGCGTGTTTCATACGCAAGTGCGTATCGGCGCGCCGCTGAACATTACCGGTTTAACGGATTATGCTCAGGAGCCGTATTATTCGACGGCGGTGGGATTGCtt < 1:871596/148‑1 (MQ=255) aCCGGTGGCGCAGCGCAGATCGAAGGTCTTGCAGCCTGTGCTCAGCGCGTGTTTCATACGCAAGTGCGTATCGGCGCGCCGCTGAACATTACCGGTTTAACGGATTATGCTCAGGAGCCGTATTATTCGACGGCGGTGGGATTGCTTc < 2:853489/148‑1 (MQ=255) aCCGGTGGCGCAGCGCAGATCGAAGGTCTTGCAGCCTGTGCTCAGCGCGTGTTTCATACGCAAGTGCGTATCGGCGCGCCGCTGAACATTACCGGTTTAACGGATTATGCTCAGGAGCCGTATTATTCGACGGCGGTGGGATTGCTTc > 1:836324/1‑148 (MQ=255) ccGGTGGCGCAGCGCAGATCGAAGGTCTTGCAGCCTGTGCTCAGCGCGTGTTTCATACGCAAGTGCGTATCGGCGCGCCGCTGAACATTACCGGTTTAACGGATTATGCTCAgg > 1:606324/1‑114 (MQ=255) ccGGTGGCGCAGCGCAGATCGAAGGTCTTGCAGCCTGTGCTCAGCGCGTGTTTCATACGCAAGTGCGTATCGGCGCGCCGCTGAACATTACCGGTTTAACGGATTATGCTCAgg < 2:606324/114‑1 (MQ=255) cGGTGGCGCAGCGCAGATCGAAGGTCTTGCAGCCTGTGCTCAGCGCGTGTTTCATACGCAAg > 3:457907/1‑62 (MQ=255) cGGTGGCGCAGCGCAGATCGAAGGTCTTGCAGCCTGTGCTCAGCGCGTGTTTCATACGCAAg < 4:457907/62‑1 (MQ=255) cGGTGGCGCAGCGCAGATCGAAGGTCTTGCAGCCTGTGCTCAGCGCGTGTTTCATACGCAAg < 4:612714/62‑1 (MQ=255) cGGTGGCGCAGCGCAGATCGAAGGTCTTGCAGCCTGTGCTCAGCGCGTGTTTCATACGCAAg > 3:612714/1‑62 (MQ=255) ggCGCAGCGCAGATCGAAGGTCTTGCAGCCTGTGCTCAGCGCGTGTTTCATACGCAAGTGCGTATCGGCGCGCCGCt > 4:427347/1‑77 (MQ=255) ggCGCAGCGCAGATCGAAGGTCTTGCAGCCTGTGCTCAGCGCGTGTTTCATACGCAAGTGCGTATCGGCGCGCCGCt < 3:427347/77‑1 (MQ=255) ggCGCAGCGCAGATCGAAGGTCTTGCAGCCTGTGCTCAGCGCGTGTTTCATACGCAAGTGCGTATCGGCGCGCCGCTGAACATTACCGGTTTAACGGATTATGCTCAGGAGCCGTATTATTCGACGGCGGTGGGATTGCTTCACTATg < 3:219543/148‑1 (MQ=255) gcgcagATCGAAGGTCTTGCAGCCTGTGCTCAGCGCGTGTTTCATACGCAAGTGCGTATCGGCGCGCCGCTGAACATTACCGGTTTAACGGATTATGCTCAGGAGCCGTATTATTCGACGGCGGTGGGATTg < 3:73935/132‑1 (MQ=255) gcgcagATCGAAGGTCTTGCAGCCTGTGCTCAGCGCGTGTTTCATACGCAAGTGCGTATCGGCGCGCCGCTGAACATTACCGGTTTAACGGATTATGCTCAGGAGCCGTATTATTCGACGGCGGTGGGATTg > 4:73935/1‑132 (MQ=255) cagATCGAAGGTCTTGCAGCCTGTGCTCAGCGCGTGTTTCATACGCAAGTGCGTATCGGCGCGCCGCTGAACATTa < 1:155083/76‑1 (MQ=255) cagATCGAAGGTCTTGCAGCCTGTGCTCAGCGCGTGTTTCATACGCAAGTGCGTATCGGCGCGCCGCTGAACATTa > 2:155083/1‑76 (MQ=255) tCGAAGGTCTTGCAGCCTGTGCTCAGCGCGTGTTTCATACGCAAGTGCGTATCGGCGCGCCGCTGAACATTa < 1:232019/72‑1 (MQ=255) tCGAAGGTCTTGCAGCCTGTGCTCAGCGCGTGTTTCATACGCAAGTGCGTATCGGCGCGCCGCTGAACATTa > 2:232019/1‑72 (MQ=255) aGGTCTTGCAGCCTGTGCTCAGCGCGTGTTTCATACGCAAGTGCGTAt < 4:1070898/48‑1 (MQ=255) aGGTCTTGCAGCCTGTGCTCAGCGCGTGTTTCATACGCAAGTGCGTAt > 3:1070898/1‑48 (MQ=255) aGGTCTTGCAGCCTGTGCTCAGCGCGTGTTTCATACGCAAGTGCGTATCGGCGCGCCGCTGAACATTAcc > 4:434594/1‑70 (MQ=255) aGGTCTTGCAGCCTGTGCTCAGCGCGTGTTTCATACGCAAGTGCGTATCGGCGCGCCGCTGAACATTAcc < 3:434594/70‑1 (MQ=255) aGGTCTTGCAGCCTGTGCTCAGCGCGTGTTTCATACGCAAGTGCGTATCGGCGCGCCGCTGAACATTACCGGTTTAACGGATTATGCTCAgg > 1:64950/1‑92 (MQ=255) aGGTCTTGCAGCCTGTGCTCAGCGCGTGTTTCATACGCAAGTGCGTATCGGCGCGCCGCTGAACATTACCGGTTTAACGGATTATGCTCAgg < 2:64950/92‑1 (MQ=255) tGCAGCCTGTGCTCAGCGCGTGTTTCATACGCAAGTGCGTATCGGCGCGCCGCTGAACATTACCGGTTTAACGGATTATGCTCAGGAGCCGTATTATTCGACGGCGGTGGGATTGCTTCACTATg > 1:464829/1‑125 (MQ=255) tGCAGCCTGTGCTCAGCGCGTGTTTCATACGCAAGTGCGTATCGGCGCGCCGCTGAACATTACCGGTTTAACGGATTATGCTCAGGAGCCGTATTATTCGACGGCGGTGGGATTGCTTCACTATg < 2:464829/125‑1 (MQ=255) tGCAGCCTGTGCTCAGCGCGTGTTTCATACGCAAGTGCGTATCGGCGCGCCGCTGAACATTACCGGTTTAACGGATTATGCTCAGGAGCCGTATTATTCGACGGCGGTGGGATTGCTTCACTATGGGAAAGAGTCACATCTTAACGGt > 2:32877/1‑148 (MQ=255) gCAGCCTGTGCTCAGCGCGTGTTTCATACGCAAGTGCGTATCGGCGCGCCGCTGAACATTACCGGTTTAACGGATTATGCTCAGGAGCCGtattat < 1:417520/96‑1 (MQ=255) gCAGCCTGTGCTCAGCGCGTGTTTCATACGCAAGTGCGTATCGGCGCGCCGCTGAACATTACCGGTTTAACGGATTATGCTCAGGAGCCGtattat > 2:417520/1‑96 (MQ=255) gCAGCCTGTGCTCAGCGCGTGTTTCATACGCAAGTGCGTATCGGCGCGCCGCTGAACATTACCGGTTTAACGGATTATGCTCAGGAGCCGTATTATTCGACGGCGGTGGGATTGCTTCACTATGGGAAAGAGTCACATCTTAACGGTg > 4:913696/1‑148 (MQ=255) gCCTGTGCTCAGCGCGTGTTTCATACGCAAGTGCGTATCGGCGCGCCGCTGAACATTACCGGTTTAACGGATTATGCTCAGGAGCCGTATTATTCGACGGCGGTGGGATTGCTTCACTATGGGAAAGAGTCACATCTTAACGGTGAAg < 1:32877/148‑1 (MQ=255) cTCAGCGCGTGTTTCATACGCAAGTGCGTATCGGCGCGCCGCTGAACATTACCGGTTTAACGGATTATGCTCAGGAGCCGTATTATTCGAcggcgg > 1:229455/1‑96 (MQ=255) cTCAGCGCGTGTTTCATACGCAAGTGCGTATCGGCGCGCCGCTGAACATTACCGGTTTAACGGATTATGCTCAGGAGCCGTATTATTCGAcggcgg < 2:229455/96‑1 (MQ=255) cAGCGCGTGTTTCATACGCAAGTGCGTATCGGCGCGCCGCTGAACATTACCGGTTTAACGGATTATGCTCAGGAGCCGTATTATTCGACGGCGGTGGGATTGCTTCACTATGGGAAAGAGTCACATCTTAACGGTGAAGCTGAAGTAg > 1:908277/1‑148 (MQ=255) gcgcGTGTTTCATACGCAAGTGCGTATCGGCGCGCCGCTGAACATTACCGGTTTAACGGATTATGCTCAGGAGCCGt > 3:1144673/1‑77 (MQ=255) gcgcGTGTTTCATACGCAAGTGCGTATCGGCGCGCCGCTGAACATTACCGGTTTAACGGATTATGCTCAGGAGCCGt < 4:1144673/77‑1 (MQ=255) gcgcGTGTTTCATACGCAAGTGCGTATCGGCGCGCCGCTGAACATTACCGGTTTAACGGATTATGCTCAGGAGCCGTATTATTCGACGGCGGTGGGa < 3:330523/97‑1 (MQ=255) gcgcGTGTTTCATACGCAAGTGCGTATCGGCGCGCCGCTGAACATTACCGGTTTAACGGATTATGCTCAGGAGCCGTATTATTCGACGGCGGTGGGa > 4:330523/1‑97 (MQ=255) gcgcGTGTTTCATACGCAAGTGCGTATCGGCGCGCCGCTGAACATTACCGGTTTAACGGATTATGCTCAGGAGCCGTATTATTCGACGGCGGTGGGATTGCTTCACTATGGGAAAGAGTCACATCTTAACGGTGAAGCTGAAGTAGaa > 1:75529/1‑148 (MQ=255) cgcgTGTTTCATACGCAAGTGCGTATCGGCGCGCCGCTGAACATTACCGGTTTAACGGATTATGCTCAGGAGCCGTATTATTCGACGGCGGTGGGATTGCTTCACTATGGGAAAGAGTCACATCTTAACGGTGAAGCTGAAGTAGaaa < 2:75529/148‑1 (MQ=255) gcgTGTTTCATACGCAAGTGCGTATCGGCGCGCCGCTGAACATTACCGGTTTAACGGATTATGCTCAGGAGCCGtatta > 2:813917/1‑79 (MQ=255) gcgTGTTTCATACGCAAGTGCGTATCGGCGCGCCGCTGAACATTACCGGTTTAACGGATTATGCTCAGGAGCCGtatta < 1:813917/79‑1 (MQ=255) cgTGTTTCATACGCAAGTGCGTATCGGCGCGCCGCTGAACATTACCGGTTTAACGGATTATGCTCAGGAGCCGTATTATTCGACGGCGGTGGGATTGCTTCACTATGGGaa < 3:433216/111‑1 (MQ=255) cgTGTTTCATACGCAAGTGCGTATCGGCGCGCCGCTGAACATTACCGGTTTAACGGATTATGCTCAGGAGCCGTATTATTCGACGGCGGTGGGATTGCTTCACTATGGGaa > 4:433216/1‑111 (MQ=255) gtgtTTCATACGCAAGTGCGTATCGGCGCGCCGCTGAACATTACCGGTTTAACGGATTATGCTCAGGAGCCGTATTATTCGACGGCGGTGGGATTGCTTCACTATGGGAAAGAGTCACATCTTAACGGTGAAGCTGAAGTAGAAAAAc < 2:836324/148‑1 (MQ=255) tttCATACGCAAGTGCGTATCGGCGCGCCGCTGAACATTACCGGTTTAACGGATTATGCTCAGGAGCCGTATTATTCGACGGCGGTGGGATTGCTTCACTATGGGAAAGAGTCACATCTTAACGGTGAAGCTGAAGTAGAAAAACgtg < 3:913696/148‑1 (MQ=255) ttCATACGCAAGTGCGTATCGGCGCGCCGCTGAACATTACCGGTTTAACGGATTATGCTCAGGAGCCGTATTATTCGACGGCGGTGGGATTGCTTCACTATGGGAAAGAGTCACATCTTa > 1:1071458/1‑120 (MQ=255) ttCATACGCAAGTGCGTATCGGCGCGCCGCTGAACATTACCGGTTTAACGGATTATGCTCAGGAGCCGTATTATTCGACGGCGGTGGGATTGCTTCACTATGGGAAAGAGTCACATCTTa < 2:1071458/120‑1 (MQ=255) ttCATACGCAAGTGCGTATCGGCGCGCCGCTGAACATTACCGGTTTAACGGATTATGCTCAGGAGCCGTATTATTCGACGGCGGTGGGATTGCTTCACTATGGGAAAGAGTCACATCTTAACGGTGAAGCTGa < 4:1051891/133‑1 (MQ=255) ttCATACGCAAGTGCGTATCGGCGCGCCGCTGAACATTACCGGTTTAACGGATTATGCTCAGGAGCCGTATTATTCGACGGCGGTGGGATTGCTTCACTATGGGAAAGAGTCACATCTTAACGGTGAAGCTGa > 3:1051891/1‑133 (MQ=255) ttCATACGCAAGTGCGTATCGGCGCGCCGCTGAACATTACCGGTTTAACGGATTATGCTCAGGAGCCGTATTATTCGACGGCGGTGGGATTGCTTCACTATGGGAAAGAGTCACATCTTAACGGTGAAGCTGAAGTAGAAAAACg > 1:271675/1‑145 (MQ=255) tACGCAAGTGCGTATCGGCGCGCCGCTGAACATTACCGGTTTAACGGATTATGCTCAGGAGCCGTATTATTCGACGGCGGTGGGATTGCTTCACTATGGGAAAGAGTCACATCTTAACGGTGAAGCTGa > 2:829489/1‑129 (MQ=255) tACGCAAGTGCGTATCGGCGCGCCGCTGAACATTACCGGTTTAACGGATTATGCTCAGGAGCCGTATTATTCGACGGCGGTGGGATTGCTTCACTATGGGAAAGAGTCACATCTTAACGGTGAAGCTGa < 1:829489/129‑1 (MQ=255) tACGCAAGTGCGTATCGGCGCGCCGCTGAACATTACCGGTTTAACGGATTATGCTCAGGAGCCGTATTATTCGACGGCGGTGGGATTGCTTCACTATGGGAAAGAGTCACATCTTAACGGTGAAGCTGAAGTAGAAAAACgtg < 3:1021147/143‑1 (MQ=255) tACGCAAGTGCGTATCGGCGCGCCGCTGAACATTACCGGTTTAACGGATTATGCTCAGGAGCCGTATTATTCGACGGCGGTGGGATTGCTTCACTATGGGAAAGAGTCACATCTTAACGGTGAAGCTGAAGTAGAAAAACgtg > 4:1021147/1‑143 (MQ=255) aCGCAAGTGCGTATCGGCGCGCCGCTGAACATTACCGGTTTAACGGATTATGCTCAGGAGCCGTATTATTCGACGGCGGTGGGATTGCTTCACTATGGGAAAGAGTCACATCTTAACGGTGa < 2:1017172/122‑1 (MQ=255) aCGCAAGTGCGTATCGGCGCGCCGCTGAACATTACCGGTTTAACGGATTATGCTCAGGAGCCGTATTATTCGACGGCGGTGGGATTGCTTCACTATGGGAAAGAGTCACATCTTAACGGTGa > 1:1017172/1‑122 (MQ=255) cAAGTGCGTATCGGCGCGCCGCTGAACATTACCGGTTTAACGGATTATGCTCAGGAGCCGTATTATTCGACGGCGGTGGGATTGCTTCACTATGGGAAAGAGTCACATCTTAACgg < 1:956646/116‑1 (MQ=255) cAAGTGCGTATCGGCGCGCCGCTGAACATTACCGGTTTAACGGATTATGCTCAGGAGCCGTATTATTCGACGGCGGTGGGATTGCTTCACTATGGGAAAGAGTCACATCTTAACgg > 2:956646/1‑116 (MQ=255) | AAGAGATATTGCAGTTGCAGGAAAAGCTTCGCCAACAAGGGGTTAAACATCACCTGGCGGCAGGCATTGTATTAACCGGTGGCGCAGCGCAGATCGAAGGTCTTGCAGCCTGTGCTCAGCGCGTGTTTCATACGCAAGTGCGTATCGGCGCGCCGCTGAACATTACCGGTTTAACGGATTATGCTCAGGAGCCGTATTATTCGACGGCGGTGGGATTGCTTCACTATGGGAAAGAGTCACATCTTAACGGTGAAGCTGAAGTAGAAAAACGTG > NC_000913/104910‑105182 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |