| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,136,028 | A→C | 7.2% | V155V (GTA→GTC) ‡ | flgH → | flagellar protein of basal‑body outer‑membrane L ring |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,136,028 | 0 | A | C | 7.2% | 292.0 / 9.8 | 82 | V155V (GTA→GTC) ‡ | flgH | flagellar protein of basal‑body outer‑membrane L ring |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (38/38); new base C (3/3); total (41/41) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
TACTGTGCCGCGCTATTTGCAGGGGCTGTTTGGTAACGCTCGTGCCGATGTCGAAGCCTCCGGTGGTAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGC > NC_000913/1135884‑1136175 | tACTGTGCCGCGCTATTTGCAGGGGCTGTTTGGTAACGCTCGTGCCGATGTCGAAGCCTCCGGTGGTAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTA‑CTg < 1:113153/148‑1 (MQ=255) gcTATTTGCAGGGGCTGTTTGGTAACGCTCGTGCCGATGTCGAAGCCTCCGGTGGTAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTA‑CTGGTCa > 1:703257/1‑141 (MQ=255) gcTATTTGCAGGGGCTGTTTGGTAACGCTCGTGCCGATGTCGAAGCCTCCGGTGGTAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTA‑CTGGTCa < 2:703257/141‑1 (MQ=255) ggCTGTTTGGTAACGCTCGTGCCGATGTCGAAGCCTCCGGTGGTAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATgtggt > 2:783265/1‑148 (MQ=255) ggTAACGCTCGTGCCGATGTCGAAGCCTCCGGTGGTAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGaaa > 1:196039/1‑148 (MQ=255) tAACGCTCGTGCCGATGTCGAAGCCTCCGGTGGTAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTA‑CTgg < 3:337619/116‑1 (MQ=255) tAACGCTCGTGCCGATGTCGAAGCCTCCGGTGGTAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTA‑CTgg > 4:337619/1‑116 (MQ=255) aCGCTCGTGCCGATGTCGAAGCCTCCGGTGGTAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCAtgt < 2:830964/133‑1 (MQ=255) aCGCTCGTGCCGATGTCGAAGCCTCCGGTGGTAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCAtgt > 1:830964/1‑133 (MQ=255) gTGCCGATGTCGAAGCCTCCGGTGGTAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGc < 2:196039/148‑1 (MQ=255) tGCCGATGTCGAAGCCTCCGGTGGTAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTA‑Ct < 4:334393/105‑1 (MQ=255) tGCCGATGTCGAAGCCTCCGGTGGTAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTA‑Ct > 1:17834/1‑105 (MQ=255) tGCCGATGTCGAAGCCTCCGGTGGTAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTA‑Ct < 2:17834/105‑1 (MQ=255) tGCCGATGTCGAAGCCTCCGGTGGTAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTA‑Ct > 3:334393/1‑105 (MQ=255) gATGTCGAAGCCTCCGGTGGTAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTA‑CTGGTCaa > 2:411470/1‑107 (MQ=255) gATGTCGAAGCCTCCGGTGGTAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTA‑CTGGTCaa < 1:411470/107‑1 (MQ=255) gATGTCGAAGCCTCCGGTGGTAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTA‑CTGGTCAACGGCa < 1:797652/112‑1 (MQ=255) gATGTCGAAGCCTCCGGTGGTAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTA‑CTGGTCAACGGCa > 2:797652/1‑112 (MQ=255) tCGAAGCCTCCGGTGGTAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTggtggg > 4:206232/1‑124 (MQ=255) tCGAAGCCTCCGGTGGTAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTggtggg < 3:206232/124‑1 (MQ=255) tCGAAGCCTCCGGTGGTAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATCa < 1:783265/148‑1 (MQ=255) ccGGTGGTAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTA‑CTGGTCAACGGCAAc > 3:25475/1‑101 (MQ=255) ccGGTGGTAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTA‑CTGGTCAACGGCAAc < 4:25475/101‑1 (MQ=255) tggtAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGcc > 4:218807/1‑127 (MQ=255) tggtAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGcc < 3:218807/127‑1 (MQ=255) acacGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTa > 2:570543/1‑77 (MQ=255) acacGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTa < 1:570543/77‑1 (MQ=255) cacGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCTAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATCAg < 1:917656/130‑1 (MQ=255) cacGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGAGGGTGACGGTTGACCAGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATCAg > 2:917656/1‑130 (MQ=255) cacGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTTACGGTTGACCAGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATgtggtg < 3:1144874/103‑1 (MQ=255) cacGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATgtggtg > 4:1144874/1‑103 (MQ=255) tCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTg > 1:915120/1‑89 (MQ=255) tCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTg < 2:915120/89‑1 (MQ=255) aCGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCg > 3:798133/1‑139 (MQ=255) aCGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCg < 4:798133/139‑1 (MQ=255) aCGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTctct > 4:168506/1‑146 (MQ=255) aCGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTctct < 3:168506/146‑1 (MQ=255) gCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTAGCTtctc > 3:34916/1‑131 (MQ=255) gCCAATGCCAGCAATACCTATAGCGGCACGGTGACGGTGACGGTTGACCAGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTtctc < 4:34916/131‑1 (MQ=255) gCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATCAgg < 4:502506/103‑1 (MQ=255) gCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATCAgg > 3:502506/1‑103 (MQ=255) tttAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTAt > 4:172852/1‑104 (MQ=255) tttAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTAt < 3:172852/104‑1 (MQ=255) ttAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGt > 1:1030954/1‑121 (MQ=255) ttAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGt < 2:1030954/121‑1 (MQ=255) gCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATc > 1:5273/1‑81 (MQ=255) gCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATc < 2:5273/81‑1 (MQ=255) gCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTAt < 3:944937/97‑1 (MQ=255) gCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTAt > 4:944937/1‑97 (MQ=255) cACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTA‑CTGGTCaa < 1:888888/36‑1 (MQ=255) cACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTA‑CTGGTCaa > 2:888888/1‑36 (MQ=255) cGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCa > 4:340265/1‑119 (MQ=255) cGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCa < 3:340265/119‑1 (MQ=255) tgacggtgacggTTGACCAGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTc > 3:548301/1‑148 (MQ=255) gacggtgacggtTGACCAGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATc > 4:555513/1‑74 (MQ=255) gacggtgacggtTGACCAGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATc < 3:555513/74‑1 (MQ=255) gacggtgacggtTGACCAGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTgg > 2:591678/1‑107 (MQ=255) gacggtgacggtTGACCAGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTgg < 1:591678/107‑1 (MQ=255) gacggtTGACCAGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGaaaa < 4:729745/51‑1 (MQ=255) gacggtTGACCAGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGaaaa > 3:729745/1‑51 (MQ=255) gtTGACCAGTAC‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTaa < 3:95213/101‑1 (MQ=255) gtTGACCA‑GTACCTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTaa > 4:95213/1‑101 (MQ=255) ttGACCAGTAC‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATCAGGGTa < 1:2370/69‑1 (MQ=38) ttGACCAGTAC‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATCAGGGTa > 2:2370/1‑69 (MQ=38) ttGACCAGTAC‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAAt > 1:231061/1‑101 (MQ=255) ttGACCAGTAC‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAAt < 2:231061/101‑1 (MQ=255) ttGACCAGTAC‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAAt > 3:745672/1‑101 (MQ=255) ttGACCAGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATc < 2:773872/102‑1 (MQ=255) ttGACCAGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATc > 1:773872/1‑102 (MQ=255) ttGACCAGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCAc < 2:86018/105‑1 (MQ=255) ttGACCAGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCAc > 1:86018/1‑105 (MQ=255) ttGACCA‑GTACCTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAAt < 4:745672/101‑1 (MQ=255) ttGACCA‑GTACCTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCa < 2:1066644/104‑1 (MQ=255) ttGACCA‑GTACCTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCa > 1:1066644/1‑104 (MQ=255) aCCAGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAAta < 1:554013/123‑1 (MQ=255) aCCAGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAAta > 2:554013/1‑123 (MQ=255) ccAGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAAtac < 1:441169/123‑1 (MQ=255) ccAGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAAtac > 2:441169/1‑123 (MQ=255) aGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTACTCAGGTgg > 2:239096/1‑141 (MQ=255) aGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTACTCAGGTgg < 1:239096/141‑1 (MQ=255) ggTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATCAg < 2:126747/58‑1 (MQ=255) ggTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATCAg > 1:126747/1‑58 (MQ=255) gTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCt > 3:822876/1‑76 (MQ=255) gTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCt < 4:822876/76‑1 (MQ=255) a‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATgcgcgc > 3:235648/1‑148 (MQ=255) | TACTGTGCCGCGCTATTTGCAGGGGCTGTTTGGTAACGCTCGTGCCGATGTCGAAGCCTCCGGTGGTAACACGTTCAACGGAAAGGGCGGGGCCAATGCCAGCAATACCTTTAGCGGCACGTTGACGGTGACGGTTGACCAGGTA‑CTGGTCAACGGCAACCTGCATGTGGTGGGTGAAAAACAGATTGCCATTAATCAGGGTACCGAATTTATTCGCTTCTCTGGCGTGGTTAATCCACGCACTATCAGCGGCAGCAATACCGTACCGTCTACTCAGGTGGCGGATGCGCGC > NC_000913/1135884‑1136175 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |