| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,327,213 | C→T | 6.2% | T121I (ACC→ATC) | rluB → | 23S rRNA pseudouridine(2605) synthase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,327,213 | 0 | C | T | 6.2% | 480.1 / 15.8 | 145 | T121I (ACC→ATC) | rluB | 23S rRNA pseudouridine(2605) synthase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (68/68); new base T (5/4); total (73/72) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.44e-01 | |||||||||||
Only 100 of 156 total aligned reads displayed.
TACAAACCGGAAGGTGAGTTGTGTACCCGTAACGATCCGGAAGGACGTCCAACGGTGTTTGACCGTCTGCCAAAACTGCGTGGCGCACGCTGGATTGCCGTGGGTCGCTTGGACGTTAATACCTGTGGTCTGCTGCTGTTCACCACCGATGGTGAACTG‑‑GCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAACGTGAATATGCCGTGCGTGTATTTGGTCAGGTTGACGACGCGAAACTGCGTGATTTGAGTCGTGGCGTGCAGTTGGAAGATGGTCCGGCAGCTTTTA > NC_000913/1327068‑1327359 | tACAAACCGGAAGGTGAGTTGTGTACCCGTAACGATCCGGAAGGACGTCCAACGGTGTTTGACCGTCTGCCAAAACTGCGTGGCGCACGCTGGATTGCCGTGGGTCGCTTGGACGTTAATACCTGTGGTCTGCTGCTGTTCACCACCg < 2:720630/148‑1 (MQ=255) aCAAACCGGAAGGTGAGTTGTGTACCCGTAACGATCCGGAAGGACGTCCAACGGTGTTTGACCGTCTGCCAAAACTGCGTGGCGCACGCTGGATTGCCGTGGGTCGCTTGGACGTTAATACCTGTGGTCTGCTGCTGTTCACCACCGa < 4:856493/148‑1 (MQ=255) aaaCCGGAAGGTGAGTTGTGTACCCGTAACGATCCGGAAGGACGTCCAACGGGGTTTGACCGTCTGCCAAAACTGCGTGGCGCACGCTGGATTGCCGTGGGTCGCTTGGACGTTAATACCTGTGGTCTGCTGCTGTTCACCACCGATg > 2:477395/1‑148 (MQ=255) aCCGGAAGGTGAGTTGTGTACCCGTAACGATCCGGAAGGACGTCCAACGGTGTTTGACCGTCTGCCAAAACTGCGTGGCGCACGCTGGATTGCCGTGGGTCGCTTGGACGTTAATACCTGTGGTCTGCTGCTGTTCACCATCggtggt > 3:586097/1‑148 (MQ=255) aCCGGAAGGTGAGTTGTGTACCCGTAACGATCCGGAAGGACGTCCAACGGTGTTTGACCGTCTGCCAAAACTGCGTGGCGCACGCTGGATTGCCGTGGGTCGCTTGGACGTTAATACCTGTGGTCTGCTGCTGTTCACCACCGATGGt < 3:559196/148‑1 (MQ=255) cGGAAGGTGAGTTGTGTACCCGTAACGATCCGGAAGGACGTCCAACGGTGTTTGACCGTCTGCCAAAACTGCGTGGCGCACGCTGGATTGCCGTGGGTCGCTTGGACGTTAATACCTGTGGTCTGCTGCTGTTCACCATCGGTGGTGa < 4:586097/148‑1 (MQ=255) tgtgTACCCGTAACGATCCGGAAGGACGTCCAACGGTGTTTGACCGTCTGCCAAAACTGCGTGGCGCACGCTGGATTGCCGTGGGTCGCTTGGACGTTAATACCTGTGGTCTGCTGCTGTTCACCACCGATGGTGAACTG‑‑GCAAACCg < 1:820055/148‑1 (MQ=255) tgtACCCGTGACGATCCGGAAGGACGTCCAACGGTGTTTGACCGTCTGCCAAAACTGCGTGGCGCACGCTGGATTGCCGTGGGTCGCTTGGACGTTAATACCTGTGGTCTGCTGCTGTTCACCACCGATGGTGAACTG‑‑GCAAACCGtt < 3:113591/148‑1 (MQ=255) aCCCGTAACGATCCGGAAGGACGTCCAACGGTGTTTGACCGTCTGCCAAAACTGCGTGGCGCACGCTGGATTGCCGTGGGTCGCTTGGACGTTAATACCTGTGGTCTGCTGCTGTTCACCACCGATGGTGAACTg‑‑g < 2:682430/136‑1 (MQ=255) aCCCGTAACGATCCGGAAGGACGTCCAACGGTGTTTGACCGTCTGCCAAAACTGCGTGGCGCACGCTGGATTGCCGTGGGTCGCTTGGACGTTAATACCTGTGGTCTGCTGCTGTTCACCACCGATGGTGAACTG‑‑GCAAACCg < 3:517480/143‑1 (MQ=255) aCCCGTAACGATCCGGAAGGACGTCCAACGGTGTTTGACCGTCTGCCAAAACTGCGTGGCGCACGCTGGATTGCCGTGGGTCGCTTGGACGTTAATACCTGTGGTCTGCTGCTGTTCACCACCGATGGTGAACTG‑‑GCAAACCGTTTaa > 3:120264/1‑148 (MQ=255) gTAACGATCCGGAAGGACGTCCAACGGTGTTTGACCGTCTGCCAAAACTGCGTGGCGCACGCTGGATTGCCGTGGGTCGCTTGGACGTTAATACCTGTGGTCTGCTGCTGTTCACCACCGATGGTGAACTG‑‑GCAAACCGTTTaa < 2:393483/144‑1 (MQ=255) gTAACGATCCGGAAGGACGTCCAACGGTGTTTGACCGTCTGCCAAAACTGCGTGGCGCACGCTGGATTGCCGTGGGTCGCTTGGACGTTAATACCTGTGGTCTGCTGCTGTTCACCACCGATGGTGAACTG‑‑GCAAACCGTTTaa > 1:393483/1‑144 (MQ=255) gTAACGATCCGGAAGGACGTCCAACGGTGTTTGACCGTCTGCCAAAACTGCGTGGCGCACGCTGGATTGCCGTGGGTCGCTTGGACGTTAATACCTGTGGTCTGCTGCTGTTCACCACCGATGGTGAACTG‑‑GCAAACCGTTTAATGCa < 1:477395/148‑1 (MQ=255) cGGAAGGACGTCCAACGGTGTTTGACCGTCTGCCAAAACTGCGTGGCGCACGCTGGATTGCCGTGGGTCGCTTGGACGTTAATACCTGTGGTCTGCTGCTGTTCACCACCGATGGTGAACTG‑‑GCAAACCGTTTaa < 4:244527/135‑1 (MQ=255) cGGAAGGACGTCCAACGGTGTTTGACCGTCTGCCAAAACTGCGTGGCGCACGCTGGATTGCCGTGGGTCGCTTGGACGTTAATACCTGTGGTCTGCTGCTGTTCACCACCGATGGTGAACTG‑‑GCAAACCGTTTaa > 3:244527/1‑135 (MQ=255) ggAAGGACGTCCAACGGTGTTTGACCGTCTGCCAAAACTGCGTGGCGCACGCTGGATTGCCGTGGGTCGCTTGGACGTTAATACCTGTGGTCTGCTGCTGTTCACCACCGATGGTGAACTG‑‑GCAAACCGt > 4:413689/1‑130 (MQ=255) gAAGGACGTCCAACGGTGTTTGACCGTCTGCCAAAACTGCGTGGCGCACGCTGGATTGCCGTGGGTCGCTTGGACGTTAATACCTGTGGTCTGCTGCTGTTCACCACCGATGGTGAACTG‑‑GCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTg > 4:108130/1‑148 (MQ=255) gACGTCCAACGGTGTTTGACCGTCTGCCAAAACTGCGTGGCGCACGCTGGATTGCCGTGGGTCGCTTGGACGTTAATACCTGTGGTCTGCTGCTGTTCACCACCGAt > 1:513758/1‑107 (MQ=255) tCCAACGGTGTTTGACCGTCTGCCAAAACTGCGTGGCGCACGCTGGATTGCCGTGGGTCGCTTGGACGTTAATACCTGTGGTCTGCTGCTGTTCACCACCGATGGTGAACTG‑‑GCAAACCg > 2:59703/1‑120 (MQ=255) tCCAACGGTGTTTGACCGTCTGCCAAAACTGCGTGGCGCACGCTGGATTGCCGTGGGTCGCTTGGACGTTAATACCTGTGGTCTGCTGCTGTTCACCACCGATGGTGAACTG‑‑GCAAACCGttt < 1:637107/123‑1 (MQ=255) tCCAACGGTGTTTGACCGTCTGCCAAAACTGCGTGGCGCACGCTGGATTGCCGTGGGTCGCTTGGACGTTAATACCTGTGGTCTGCTGCTGTTCACCACCGATGGTGAACTG‑‑GCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGaa < 4:338756/148‑1 (MQ=255) tgtTTGACCGTCTGCCAAAACTGCGTGGCGCACGCTGGATTGCCGTGGGTCGCTTGGACGTTAATACCTGTGGTCTGCTGCTGTTCACCACCGATGGTGAACTG‑‑GCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGa > 1:429509/1‑133 (MQ=255) tgtTTGACCGTCTGCCAAAACTGCGTGGCGCACGCTGGATTGCCGTGGGTCGCTTGGACGTTAATACCTGTGGTCTGCTGCTGTTCACCACCGATGGTGAACTG‑‑GCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGa < 2:429509/133‑1 (MQ=255) ttGACCGTCTGCCAAAACTGCGTGGCGCACGCTGGATTGCCGTGGGTCGCTTGGACGTTAATACCTGTGGTCTGCTGCTGTTCACCACCGATGGTGAACTG‑‑GCAAACCGtt < 2:204412/111‑1 (MQ=255) ttGACCGTCTGCCAAAACTGCGTGGCGCACGCTGGATTGCCGTGGGTCGCTTGGACGTTAATACCTGTGGTCTGCTGCTGTTCACCACCGATGGTGAACTG‑‑GCAAACCGTTTaa > 3:779657/1‑114 (MQ=255) ttGACCGTCTGCCAAAACTGCGTGGCGCACGCTGGATTGCCGTGGGTCGCTTGGACGTTAATACCTGTGGTCTGCTGCTGTTCACCACCGATGGTGAACTG‑‑GCAAACCGTTTaa < 4:779657/114‑1 (MQ=255) ttGACCGTCTGCCAAAACTGCGTGGCGCACGCTGGATTGCCGTGGGTCGCTTGGACGTTAATACCTGTGGTCTGCTGCTGTTCACCACCGATGGTGAACTG‑‑GCAAACCGTTTAATGCACCCa < 3:85070/122‑1 (MQ=255) ttGACCGTCTGCCAAAACTGCGTGGCGCACGCTGGATTGCCGTGGGTCGCTTGGACGTTAATACCTGTGGTCTGCTGCTGTTCACCACCGATGGTGAACTG‑‑GCAAACCGTTTAATGCACCCa > 4:85070/1‑122 (MQ=255) aCCGTCTGCCAAAACTGCGTGGCGCACGCTGGATTGCCGTGGGTCGCTTGGACGTTAATACCTGTGGTCTGCTGCTGTTCACCACCGATGGTGAACTG‑‑GCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAACGTGAATATGCcg < 3:586749/147‑1 (MQ=255) aCCGTCTGCCAAAACTGCGTGGCGCACGCTGGATTGCCGTGGGTCGCTTGGACGTTAATACCTGTGGTCTGCTGCTGTTCACCACCGATGGTGAACTG‑‑GCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAACGTGAATATGCcg > 2:1108719/1‑147 (MQ=255) aCCGTCTGCCAAAACTGCGTGGCGCACGCTGGATTGCCGTGGGTCGCTTGGACGTTAATACCTGTGGTCTGCTGCTGTTCACCACCGATGGTGAACTG‑‑GCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAACGTGAATATGCcg > 4:586749/1‑147 (MQ=255) aaaaCTGCGTGGCGCACGCTGGATTGCCGTGGGTCGCTTGGACGTTAATACCTGTGGTCTGCTGCTGTTCACCACCGATGGTGAACTG‑‑GCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAACGTGAATATGCCGTGCGTGTAttt > 3:554786/1‑148 (MQ=255) aaaCTGCGTGGCGCACGCTGGATTACCGTGGGTCGCTTGGACGTTAATACCTGTGGTCTGCTGCTGTTCACCACCGATGGTGAACTG‑‑GCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAACGTGAATATGCcgtgcg > 4:66850/1‑140 (MQ=255) aaaCTGCGTGGCGCACGCTGGATTACCGTGGGTCGCTTGGACGTTAATACCTGTGGTCTGCTGCTGTTCACCACCGATGGTGAACTG‑‑GCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAACGTGAATATGCcgtgcg < 3:66850/140‑1 (MQ=255) aaCTGCGTGGCGCACGCTGGATTGCCGTGGGTCGCTTGGACGTTAATACCTGTGGTCTGCTGCTGTTCACCACCGATGGTGAACTG‑‑GCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAACGt > 3:315634/1‑125 (MQ=255) aaCTGCGTGGCGCACGCTGGATTGCCGTGGGTCGCTTGGACGTTAATACCTGTGGTCTGCTGCTGTTCACCACCGATGGTGAACTG‑‑GCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAACGt < 4:315634/125‑1 (MQ=255) tGGCGCACGCTGGATTGCCGTGGGTCGCTTGGACGGTAATACCTGTGGTCTGCTGCTGTTCACCACCGATGGTGAACTG‑‑GCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAACGTGAATATg < 3:1080442/125‑1 (MQ=255) ggCGCACGCTGGATTGCCGTGGGTCGCTTGGACGTTAATACCTGTGGTCTGCTGCTGTTCACCACCGATGGTGAACTG‑‑GCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAACGTGAATATGCCGTGCGTGTATTTGGTCAGGTTg < 4:554786/148‑1 (MQ=255) gcgcACGCTGGATTGCCGTGGGTCGCTTGGACGTTAATACCTGTGGTCTGCTGCTGTTCACCACCGATGGTGAACTG‑‑GCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAACGTGAATATGCCGTGCGTGTAtt < 3:881497/136‑1 (MQ=255) cACGCTGGATTGCCGTGGGTCGCTTGGACGTGAATACCTGTGGTCTGCTGCTGTTCACCACCGa < 3:971415/64‑1 (MQ=255) cGCTGGATTGCCGTGGGTCGCTTGGACGTTAATACCTGTGGTCTGCTGCTGTTCACCACCGATGGTGAACTG‑‑GCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAACGTGAATATGCCGTGCGTGTATTTGGTCAGGTTGacgacg > 3:405990/1‑148 (MQ=255) cGCTGGATTGCCGTGGGTCGCTTGGACGTTAATACCTGTGGTCTGCTGCTGTTCACCACCGATGGTGAACTG‑‑GCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAACGTGAATATGCCGTGCGTGTATTTGGTCAGGTTGacgacg < 2:946321/148‑1 (MQ=255) cTGGATTGCCGTGGGTCGCTTGGACGTTAATACCTGTGGTCTGCTGCTGTTCACCACCGATGGTGAACTG‑‑TCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAACGTGa < 3:225575/111‑1 (MQ=255) cTGGATTGCCGTGGGTCGCTTGGACGTTAATACCTGTGGTCTGCTGCTGTTCACCACCGATGGTGAACTG‑‑GCAAACCGTTTAATGCACCCa < 4:710000/91‑1 (MQ=255) cTGGATTGCCGTGGGTCGCTTGGACGTTAATACCTGTGGTCTGCTGCTGTTCACCACCGATGGTGAACTG‑‑GCAAACCGTTTAATGCACCCa > 3:710000/1‑91 (MQ=255) tGCCGTGGGTCGCTTGGACGTTAATACCTGTGGTCTGCTGCTGTTCACCACCGATGGTGAACTG‑‑GCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAACGTGAATATGCCGTGCGTGTATTTGGTCAGGTTGACGACGCGAAACTg < 4:521708/148‑1 (MQ=255) tGCCGTGGGTCGCTTGGACGTTAATACCTGTGGTCTGCTGCTGTTCACCACCGATGGTGAACTG‑‑GCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAACGTGAATATGCCGTGCGTGTATTTGGTCAGGTTGACGACGCGAAACTg < 3:108130/148‑1 (MQ=255) tGCCGTGGGTCGCTTGGACGTTAATACCTGTGGTCTGCTGCTGTTCACCACCGATGGTGAACTG‑‑GCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAACGTGAATATGCCGTGCGTGTATTTGGTCAGGTTGACGACGCGAAACTg < 4:120264/148‑1 (MQ=255) tGCCGTGGGTCGCTTGGACGTTAATACCTGTGGTCTGCTGCTGTTCACCACCGATGGTGAACTG‑‑GCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAACGTGAATATGCCGTGCGTGTATTTGGTCAGGTTGACGACGCGAAACTg > 4:81630/1‑148 (MQ=255) cGTGGGTCGCTTGGACGTTAATACCTGTGGTCTGCTGCTGTTCACCACCGATGGTGAACTG‑‑GCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAACGTGAATATGCCGTGCGTGTATTTGGTCAGGTTGACGAcgcg < 2:207600/139‑1 (MQ=255) cGTGGGTCGCTTGGACGTTAATACCTGTGGTCTGCTGCTGTTCACCACCGATGGTGAACTG‑‑GCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAACGTGAATATGCCGTGCGTGTATTTGGTCAGGTTGACGAcgcg > 1:207600/1‑139 (MQ=255) cGTGGGTCGCTTGGACGTTAATACCTGTGGTCTGCTGCTGTTCACCACCGATGGTGAACTG‑‑GCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAACGTGAATATGCCGTGCGTGTATTTGGTCAGGTTGACGACGCGAAACTGCGt > 2:946308/1‑148 (MQ=255) tGGGTCGCTTGGACGTTAATACCTGTGGTCTGCTGCTGTTCACCACCGATGGTGAACTG‑‑GCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAACGTGAATATGCCGTGCGTGTATTTGGTCAGGTTGACGACGCAAAACTGCGTGa < 3:81630/148‑1 (MQ=255) tCGCTTGGACGTTAATACCTGTGGTCTGCTGCTGTTCACCACCGATGGTGAACTG‑‑GCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAACGTGAATATGCCGTGCGTGTATTTGGTCAGGTTGACGACGCGAAACTGCGTGATTTg < 1:215523/148‑1 (MQ=255) cGCTTGGACGTTAATACCTGTGGTCTGCTGCTGTTCACCACCGATGGTGAACTG‑‑GCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAACGTGAATATGCCGTGCGTGTATTTGGTCAgg > 4:696897/1‑121 (MQ=255) cGCTTGGACGTTAATACCTGTGGTCTGCTGCTGTTCACCACCGATGGTGAACTG‑‑GCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAACGTGAATATGCCGTGCGTGTATTTGGTCAgg < 3:696897/121‑1 (MQ=255) cGCTTGGACGTTAATACCTGTGGTCTGCTGCTGTTCACCACCGATGGTGAACTG‑‑GCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAACGTGAATATGCCGTGCGTGTATTTGGTCAGGTTga > 3:252674/1‑125 (MQ=255) cGCTTGGACGTTAATACCTGTGGTCTGCTGCTGTTCACCACCGATGGTGAACTG‑‑GCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAACGTGAATATGCCGTGCGTGTATTTGGTCAGGTTGACGACGCGAAACTGCGTGATTTGa < 1:946308/148‑1 (MQ=255) cGTTAATACCTGTGGTCTGCTGCTGTTCACCACCGATGGTGAACTG‑‑GCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAACg < 1:745318/84‑1 (MQ=255) cGTTAATACCTGTGGTCTGCTGCTGTTCACCACCGATGGTGAACTG‑‑GCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAACGTGAATATGCCGTGCGTGTATTTGGTCAGGTTGACGACGCGAAACTg > 1:13188/1‑130 (MQ=255) cGTTAATACCTGTGGTCTGCTGCTGTTCACCACCGATGGTGAACTG‑‑GCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAACGTGAATATGCCGTGCGTGTATTTGGTCAGGTTGACGACGCGAAACTg < 2:13188/130‑1 (MQ=255) ttAATACCTGTGGTCTGCTGCTGTTCACCACCGATGGTGAACTG‑‑GCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAACGTGAATATGCCGTGCGTGTATTTGGt > 4:1034222/1‑107 (MQ=255) ttAATACCTGTGGTCTGCTGCTGTTCACCACCGATGGTGAACTG‑‑GCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAACGTGAATATGCCGTGCGTGTATTTGGt < 3:1034222/107‑1 (MQ=255) ttAATACCTGTGGTCTGCTGCTGTTCACCACCGATGGTGAACTG‑‑GCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAACGTGAATATGCCGTGCGTGTATTTGGTCAg < 1:42123/110‑1 (MQ=255) tAATACCTGTGGTCTGCTGCTGTTCACCACCGATGGTGAACTG‑‑GCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAATGTGAATATGCCGTGCGTGTATTTGGTCAGGTTGACGACGCGAAACTGCGTGATTTGAGTCGTGGCGTg > 1:497005/1‑148 (MQ=255) tgtgGTCTGCTGCTGTTCACCACCGATGGTGAACTG‑‑GCAAACCGTTTa > 1:675221/1‑48 (MQ=255) tgtgGTCTGCTGCTGTTCACCACCGATGGTGAACTG‑‑GCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAACGTGAATATGCCGTGCGTGTATTTGGTCAGGTTGACGACGCGAAACTGCGTGa > 2:232021/1‑125 (MQ=255) tgtgGTCTGCTGCTGTTCACCACCGATGGTGAACTG‑‑GCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAACGTGAATATGCCGTGCGTGTATTTGGTCAGGTTGACGACGCGAAACTGCGTGa < 1:232021/125‑1 (MQ=255) gtgGTCTGCTGCTGTTCACCACCGATGGTGAACTG‑‑GCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAACGTGAATATGCCGTGCGTGTATTTGGTCAGGTTGACGACGCGAAACTGCGTGATTTGAGTCg < 1:905347/133‑1 (MQ=255) gtgGTCTGCTGCTGTTCACCACCGATGGTGAACTG‑‑GCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAACGTGAATATGCCGTGCGTGTATTTGGTCAGGTTGACGACGCGAAACTGCGTGATTTGAGTCg > 2:905347/1‑133 (MQ=255) ggTCTGCTGCTGTTCACCACCGATGGTGAACTG‑‑GCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAACGTGAATATGCCGTGCGTGTATTTGGTCAGGTTGACGACGCGAAACTGCGTGATTTGAGTCGTGGCGTGCAGTTGGAAg < 2:505280/148‑1 (MQ=255) ctgctgctgTTCACCACCGATGGTGAACTG‑‑GCAAACCGt < 2:664493/39‑1 (MQ=255) ctgctgctgTTCACCACCGATGGTGAACTG‑‑GCAAACCGt > 1:664493/1‑39 (MQ=255) ctgctgctgTTCACCACCGATGGTGAACTG‑‑GCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGa > 1:879517/1‑65 (MQ=255) ctgctgctgTTCACCACCGATGGTGAACTG‑‑GCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGa < 2:879517/65‑1 (MQ=255) gctgctgTTCACCACCGATGGTGAACTG‑‑GCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAACGTGAATATGCcgtg > 1:271723/1‑79 (MQ=255) gctgctgTTCACCACCGATGGTGAACTG‑‑GCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAACGTGAATATGCCGTGCGTGTATTTGGTCAGGTTGACGACGCGAAACTGCGTGATTTGAg > 2:813323/1‑123 (MQ=255) gctgctgTTCACCACCGATGGTGAACTG‑‑GCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAACATGAATATGCCGTGCGTGTATTTGGTCAGGTTGACGACGCGAAACTGCGTGATTTGAGTCGTGGCGTGCAGt < 3:430835/137‑1 (MQ=255) gctgctgTTCACCACCGATGGTGAACTG‑‑GCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAACATGAATATGCCGTGCGTGTATTTGGTCAGGTTGACGACGCGAAACTGCGTGATTTGAGTCGTGGCGTGCAGt > 4:430835/1‑137 (MQ=255) tgctgTTCACCACCGATGGTGAACTG‑‑GCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAACGTGAATATGCcgtgcg < 2:667682/79‑1 (MQ=255) gctgTTCACCACCGATGGTGAACTG‑‑GCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAACGTGAATATGCCGTGCGTGTATTTGGTCa > 4:1135176/1‑90 (MQ=255) tgTTCACCACCGATGGTGAACTG‑‑GCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTg < 2:224592/51‑1 (MQ=255) ttCACCACCGATGGTGAACTG‑‑GCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAACGTGAATATGCCGTGCGTGTATTTGGTCAGGTTg < 4:1075694/91‑1 (MQ=255) ttCACCACCGATGGTGAACTG‑‑GCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAACGTGAATATGCCGTGCGTGTATTTGGTCAGGTTGACGACGCGAAACTGCGTGAt > 1:174077/1‑111 (MQ=255) tCACCATCGGTGGTGAACTG‑‑GCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAACGTGAATATGCcgtgcg < 4:232952/73‑1 (MQ=255) tCACCATCGGTGGTGAACAGCAGCAGACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAACGTGAATATGCCGTGCGTGTATTTGGTCAGGTTGACGACGCGAAACTGCGTGATTTGAGTCGTGGCGTGCAGTTGGAAGAt < 1:759337/139‑1 (MQ=255) tCACCATCGGTGGTGAACAGCAGCAGACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAACGTGAATATGCCGTGCGTGTATTTGGTCAGGTTGACGACGCGAAACTGCGTGATTTGAGTCGTGGCGTGCAGTTGGAAGAt > 2:759337/1‑139 (MQ=255) tCACCACCGATGGTGAACTG‑‑GCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAACGTGAat > 4:952208/1‑63 (MQ=255) tCACCACCGATGGTGAACTG‑‑GCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAACGTGAATATGCCGTGCGTGTATTTGGTCAg > 2:565157/1‑86 (MQ=255) tCACCACCGATGGTGAACTG‑‑GCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAACGTGAATATGCCGTGCGTGTATTTGGTCAg < 1:565157/86‑1 (MQ=255) tCACCACCGATGGTGAACTG‑‑GCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAACGTGAATATGCCGTGCGTGTATTTGGTCAGGTTGACGACGCGAAACTGCGTGATTTGAGTCGTGGCGTGCAGTTGGAAGATGGTCCGGCAGc > 1:1030414/1‑148 (MQ=255) caccatCGGTGGTGAACTG‑‑GCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAACGTGAATATGCCGTGCGTGTATTTGGTCAGGTTGACGACGCGAAACTGCGTGATTTGAGTCGTGGCGTGCAGTTGGAAGATGGTCCGGCAGCt < 4:299229/148‑1 (MQ=255) accaccGATGGTGAACTG‑‑GCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAACg > 2:377013/1‑56 (MQ=255) ccatcGGTGGTGAACTG‑‑GCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAACGTGAATATGCCGTGCGTGTATTTGGTCAGGTTGACGACGCGAAACTGCGTGAt < 3:35860/107‑1 (MQ=255) accGATGGTGAACTG‑‑GCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAACGTGAATATGCCGTGCGTGTATTTGGTCAGGTTGACGACGCGAAACTGCGTGATTTg > 4:200121/1‑108 (MQ=255) accGATGGTGAACTG‑‑GCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAACGTGAATATGCCGTGCGTGTATTTGGTCAGGTTGACGACGCGAAACTGCGTGATTTg < 3:200121/108‑1 (MQ=255) accGATGGTGAACTG‑‑GCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAACGTGAATATGCCGTGCGTGTATTTGGTCAGGTTGACGACGCGAAACTGCGTGATTTGAGTCGTGGCGTGCAGTTGGAAGATGGTCCGGCAGCTTTTa > 1:1050210/1‑148 (MQ=255) accGATGGTGAACTG‑‑GCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAACGTGAATATGCCGTGAGTGTATTTGGTCAGGTTGACGACGCGAAACTGCGTGATTTg < 2:903245/108‑1 (MQ=255) accGATGGTGAACTG‑‑GCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAACGTGAATATGCCGTGAGTGTATTTGGTCAGGTTGACGACGCGAAACTGCGTGATTTg > 1:903245/1‑108 (MQ=255) | TACAAACCGGAAGGTGAGTTGTGTACCCGTAACGATCCGGAAGGACGTCCAACGGTGTTTGACCGTCTGCCAAAACTGCGTGGCGCACGCTGGATTGCCGTGGGTCGCTTGGACGTTAATACCTGTGGTCTGCTGCTGTTCACCACCGATGGTGAACTG‑‑GCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAACGTGAATATGCCGTGCGTGTATTTGGTCAGGTTGACGACGCGAAACTGCGTGATTTGAGTCGTGGCGTGCAGTTGGAAGATGGTCCGGCAGCTTTTA > NC_000913/1327068‑1327359 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |