| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,968,073 | T→C | 5.0% | A143A (GCA→GCG) ‡ | cheB ← | fused chemotaxis regulator: protein‑glutamate methylesterase in two‑component regulatory system with CheA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,968,073 | 0 | T | C | 5.0% | 341.1 / 4.2 | 96 | A143A (GCA→GCG) ‡ | cheB | fused chemotaxis regulator: protein‑glutamate methylesterase in two‑component regulatory system with CheA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (46/45); new base C (2/3); total (48/48) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.95e-01 | |||||||||||
AATTAACAGTGCCGGGCTGGAAAGCGGCAACGGTTGCAGTACGTGACGAATTGCCTCAGTTCCACCCGTTGAAGCACCAATCGCAATCAGTTTTTCAGAACTCAACAACGGCCCCGCCTTCAGCGTTGTCGGTGCCGACAATGGCTTATGTGCTGCAAGGCTCGCCTTTGCTGCCGTACGCACCTTTTCAGCAATCATTTCGTTATACGCCAGCATACCTTCGCGAATACCCAGTTGCGGTTTGGTGACAAAATCTATCGCCCCCAGCTCCAGC > NC_000913/1967941‑1968214 | aaTTAACAGTGCCGGGCTGGAAAGCGGCAACGGTTGCAGTACGTGACGAATTGCCTCAGTTCCACCCGTTGAAGCACCAATCGCAATCAGTTTTTCAGAACTCAACAACGGCCCCGCCTTCAGCGTTGTCGGTGCCGACAAt < 2:1052817/142‑1 (MQ=255)aaTTAACAGTGCCGGGCTGGAAAGCGGCAACGGTTGCAGTACGTGACGAATTGCCTCAGTTCCACCCGTTGAAGCACCAATCGCAATCAGTTTTTCAGAACTCAACAACGGCCCCGCCTTCAGCGTTGTCGGTGCCGACAAt > 1:1052817/1‑142 (MQ=255) aCAGTGCCGGGCTGGAAAGCGGCAACGGTTGCAGTACGTGACGAATTGCCTCAGTTCCACCCGTTGAAGCACCAATCGCAATCAGTTTTTCAGAACTCAACAACGGCCCCGCCTTCAGCGTTGTCGGTGCCGACaa > 4:234393/1‑136 (MQ=255) aCAGTGCCGGGCTGGAAAGCGGCAACGGTTGCAGTACGTGACGAATTGCCTCAGTTCCACCCGTTGAAGCACCAATCGCAATCAGTTTTTCAGAACTCAACAACGGCCCCGCCTTCAGCGTTGTCGGTGCCGACaa < 3:234393/136‑1 (MQ=255) gCCGGGCTGGAAAGCGGCAACGGTTGCAGTACGTGACGAATTGCCTCAGTTCCACCCGTTGAAGCACCAATCGCAATCAGTTTTTCAGAACTCAACAACGGCCCCGCCTTCAGCGTTGTCGGTGCCGACAATGGCTTATGTGCTGCa > 2:532062/1‑147 (MQ=255) gCCGGGCTGGAAAGCGGCAACGGTTGCAGTACGTGACGAATTGCCTCAGTTCCACCCGTTGAAGCACCAATCGCAATCAGTTTTTCAGAACTCAACAACGGCCCCGCCTTCAGCGTTGTCGGTGCCGACAATGGCTTATGTGCTGCa < 1:532062/147‑1 (MQ=255) cGGGCTGGAAAGCGGCAACGGTTGCAGTACGTGACGAATTGCCTCAGTTCCACCCGTTGAAGCACCAATCGCAATCAGTTTTTCAGAACTCAACAACGGCCCCGCCTTCAGCGTTGTCGGTGCCGACAATGGCTTATGTGCTGCAAgg < 2:116756/148‑1 (MQ=255) ggAAAGCGGCAACGGTTGCAGTACGTGACGAATTGCCTCAGTTCCACCCGTTGAAGCACCAATCGCAATCAGTTTTTCAGAACTCAACAACGGCCCCGCCTTCAGCGTTGTCGGTGCCGACAATGGCTTATGTGCTGCAAGGCTCGcc > 4:277101/1‑148 (MQ=255) cAACGGTTGCAGTACGTGACGAATTGCCTCAGTTCCACCCGTTGAAGCACCAATCGCAATCAGTTTTTCAGAACTCAACAACGGCCCCGCCTTCAGCGTTGTCGGTGCCGACAATGGCTTATGTGCTGCAAGGCTCGCCTTTGCTGcc < 3:277101/148‑1 (MQ=255) aCGGTTGCAGTACGTGACGAATTGCCTCAGTTCCACCCGTTGAAGCACCAATCGCAATCAGTTTTTCAGAACTCAACAACGGCCCCGCCTTCAGCGTTGTCGGTGCCGACAATGGCTTAtgtg > 2:158180/1‑123 (MQ=255) aCGGTTGCAGTACGTGACGAATTGCCTCAGTTCCACCCGTTGAAGCACCAATCGCAATCAGTTTTTCAGAACTCAACAACGGCCCCGCCTTCAGCGTTGTCGGTGCCGACAATGGCTTAtgtg < 1:158180/123‑1 (MQ=255) aCGGTTGCAGTACGTGACGAATTGCCTCAGTTCCACCCGTTGAAGCACCAATCGCAATCAGTTTTTCAGAACTCAACAACGGCCCCGCCTTCAGCGTTGTCGGTGCCGACAATGGCTTATGTGCTGCAAGGCTCGCCTTTGCTGCCGt < 1:714086/148‑1 (MQ=255) aCGGTTGCAGTACGTGACGAATTGCCTCAGTTCCACCCGTTGAAGCACCAATCGCAATCAGTTTTTCAGAACTCAACAACGGCCCCGCCTTCAGCGTTGTCGGTGCCGACAATGGCTTATGTGCTGCAAGGCTCGCCTTTGCTGCCGt > 2:714086/1‑148 (MQ=255) aGTACGTGACGAATTGCCTCAGTTCCACCCGTTGAAGCACCAATCGCAATCAGTTTTTCAGAACTCAACAACGGCCCCGCCTTCAGCGTTGTCGGTGCCGACAATGGCTTATGTGCTGCAAGGCTCGCCTTTGCTGCCGTACGCACCt > 4:714332/1‑148 (MQ=255) gTACGTGACGAATTGCCTCAGTTCCACCCGTTGAAGCACCAATCGCAATCAGTTTTTCAGAACTCAACAACGGCCCCGCCTTCAGCGTTGTCGGTGCCGACAATGGCTTATGTGCTGCAAGGCTCGCCTTTGCTGCCGTACGCACCtt > 3:376229/1‑148 (MQ=255) gACGAATTGCCTCAGTTCCACCCGTTGAAGCACCAATCGCAATCAGTTTTTCAGAACTCAACAACGGCCCCGCCTTCAGCGTTGTCGGTGCCGACAAt > 4:590833/1‑98 (MQ=255) gACGAATTGCCTCAGTTCCACCCGTTGAAGCACCAATCGCAATCAGTTTTTCAGAACTCAACAACGGCCCCGCCTTCAGCGTTGTCGGTGCCGACAAt < 3:590833/98‑1 (MQ=255) aCGAATTGCCTCAGTTCCACCCGTTGAAGCACCAATCGCAATCAGTTTTTCAGAACTCAACAACGGCCCCGCCTTCAGCGTTGTCGGTGCCGACAATgg < 1:891374/99‑1 (MQ=255) aCGAATTGCCTCAGTTCCACCCGTTGAAGCACCAATCGCAATCAGTTTTTCAGAACTCAACAACGGCCCCGCCTTCAGCGTTGTCGGTGCCGACAATgg > 2:891374/1‑99 (MQ=255) aCGAATTGCCTCAGTTCCACCCGTTGAAGCACCAATCGCAATCAGTTTTTCAGAACTCAACAACGGCCCCGCCTTCAGCGTTGTCGGTGCCGACAATGGCTTATGTGCTGCAAGGCTCGCCTTTGCTGCCGTACGCACCTTTTCAGCa < 1:572816/148‑1 (MQ=255) aCGAATTGCCTCAGTTCCACCCGTTGAAGCACCAATCGCAATCAGTTTTTCAGAACTCAACAACGGCCCCGCCTTCAGCGTTGTCGGTGCCGACAATGGCTTATGTGCTGCAAGGCTCGCCTTTGCTGCCGTACGCACCTTTTCAGCa > 2:572816/1‑148 (MQ=255) gAATTGCCTCAGTTCCACCCGTTGAAGCACCAATCGCAATCAGTTTTTCAGAACTCAACAACGGCCCCGCCTTCAGCGTTGTCGGTGCCGACAATGGCTTATGTGCTGCAAGGCTCGCCTTTGCTGCCGTACGCACCTTTTCAGCAAt < 4:376229/148‑1 (MQ=255) aaTTGCCTCAGTTCCACCCGTTGAAGCACCAATCGCAATCAGTTTTTCAGAACTCAACAACGGCCCCGCCTTCAGCGTTGTCGGTGCCGACAATGGCTTATGTGCTGCa > 1:227388/1‑109 (MQ=255) aaTTGCCTCAGTTCCACCCGTTGAAGCACCAATCGCAATCAGTTTTTCAGAACTCAACAACGGCCCCGCCTTCAGCGTTGTCGGTGCCGACAATGGCTTATGTGCTGCa < 2:227388/109‑1 (MQ=255) aaTTGCCTCAGTTCCACCCGTTGAAGCACCAATCGCAATCAGTTTTTCAGAACTCAACAACGGCCCCGCCTTCAGCGTTGTCGGTGCCGACAATGGCTTATGTGCTGCAAGGCTCg > 3:315681/1‑116 (MQ=255) aaTTGCCTCAGTTCCACCCGTTGAAGCACCAATCGCAATCAGTTTTTCAGAACTCAACAACGGCCCCGCCTTCAGCGTTGTCGGTGCCGACAATGGCTTATGTGCTGCAAGGCTCg < 4:315681/116‑1 (MQ=255) aaTTGCCTCAGTTCCACCCGTTGAAGCACCAATCGCAATCAGTTTTTCAGAACTCAACAACGGCCCCGCCTTCAGCGTTGTCGGTGCCGACAATGGCTTATGTGCTGCAAGGCTCGCCTTTGCTGCCGTACGCACCtttt > 2:913998/1‑140 (MQ=255) aaTTGCCTCAGTTCCACCCGTTGAAGCACCAATCGCAATCAGTTTTTCAGAACTCAACAACGGCCCCGCCTTCAGCGTTGTCGGTGCCGACAATGGCTTATGTGCTGCAAGGCTCGCCTTTGCTGCCGTACGCACCtttt < 1:913998/140‑1 (MQ=255) aTTGCCTCAGTTCCACCCGTTGAAGCACCAATCGCAATCAGTTTTTCAGAACTCAACAACGGCCCCGCCTTCAGCGTTGTCGGTGCCGACAATGGCTTATGTGCTGCAAGGCTCGCCTTTGCTGCCGTa < 3:471509/129‑1 (MQ=255) aTTGCCTCAGTTCCACCCGTTGAAGCACCAATCGCAATCAGTTTTTCAGAACTCAACAACGGCCCCGCCTTCAGCGTTGTCGGTGCCGACAATGGCTTATGTGCTGCAAGGCTCGCCTTTGCTGCCGTa > 4:471509/1‑129 (MQ=255) aTTGCCTCAGTTCCACCCGTTGAAGCACCAATCGCAATCAGTTTTTCAGAACTCAACAACGGCCCCGCCTTCAGCGTTGTCGGTGCCGACAATGGCTTATGTGCTGCAAGGCTCGCCTTTGCTGCCGTa > 4:58972/1‑129 (MQ=255) aTTGCCTCAGTTCCACCCGTTGAAGCACCAATCGCAATCAGTTTTTCAGAACTCAACAACGGCCCCGCCTTCAGCGTTGTCGGTGCCGACAATGGCTTATGTGCTGCAAGGCTCGCCTTTGCTGCCGTa < 3:58972/129‑1 (MQ=255) cAGTTCCACCCGTTGAAGCACCAATCGCAATCAGTTTTTCAGAACTCAACAACGGCCCCGCCTTCAGCGTTGTCGGTGCCGACAATGGCTTATGTGCTGCAAGGCTCGCCTTtg < 1:431750/114‑1 (MQ=255) cAGTTCCACCCGTTGAAGCACCAATCGCAATCAGTTTTTCAGAACTCAACAACGGCCCCGCCTTCAGCGTTGTCGGTGCCGACAATGGCTTATGTGCTGCAAGGCTCGCCTTtg > 2:431750/1‑114 (MQ=255) cAGTTCCACCCGTTGAAGCACCAATCGCAATCAGTTTTTCAGAACTCAACAACGGCCCCGCCTTCAGCGTTGTCGGTGCCGACAATGGCTTATGTGCTGCAAGGCTCGCCTTTGCTGCCGTACGCACCTTTTCAGCAATCATTTCGtt > 2:803891/1‑148 (MQ=255) cAGTTCCACCCGTTGAAGCACCAATCGCAATCAGTTTTTCAGAACTCAACAACGGCCCCGCCTTCAGCGTTGTCGGTGCCGACAATGGCTTATGTGCTGCAAGGCTCGCCTTTGCTGCCGTACGCACCTTTTCAGCAATCATTTCGtt < 3:714332/148‑1 (MQ=255) cccGTTGAAGCACCAATCGCAATCAGTTTTTCAGAACTCAACAACGGCCCCGCCTTCAGCGTTGTCGGTGCCGACAATGGCTTATGTGCTGCAAGGCTCGCCTTTGCTGCCGTACGCACCTTTTCAGCAATCATTTCGTTATACGCCa > 1:211595/1‑148 (MQ=255) ccGTTGAAGCACCAATCGCAATCAGTTTTTCAGAACTCAACAACGGCCCCGCCTTCAGCGTTGTCGGTGCCGACAATGGCTTa < 4:290246/83‑1 (MQ=255) ccGTTGAAGCACCAATCGCAATCAGTTTTTCAGAACTCAACAACGGCCCCGCCTTCAGCGTTGTCGGTGCCGACAATGGCTTa > 3:290246/1‑83 (MQ=255) cGTTGAAGCACCAATCGCAATCAGTTTTTCAGAACTCAACAACGGCCCCGCCTTCAGCGTTGTCGGTGCCGACAATGGCTTATGTGCTGCAAGGCTCGCCTTTGCTGCCg < 1:871434/110‑1 (MQ=255) cGTTGAAGCACCAATCGCAATCAGTTTTTCAGAACTCAACAACGGCCCCGCCTTCAGCGTTGTCGGTGCCGACAATGGCTTATGTGCTGCAAGGCTCGCCTTTGCTGCCg > 2:871434/1‑110 (MQ=255) ttGAAGCACCAATCGCAATCAGTTTTTCAGAACTCAACAACGGCCCCGCCTTCAGCGTTGTCGGTGCCGACAATGGCTTATGTGCTGCAAGGCTCGCCTTTGCTGCCGTACGCACCttt < 3:801012/119‑1 (MQ=255) ttGAAGCACCAATCGCAATCAGTTTTTCAGAACTCAACAACGGCCCCGCCTTCAGCGTTGTCGGTGCCGACAATGGCTTATGTGCTGCAAGGCTCGCCTTTGCTGCCGTACGCACCttt > 4:801012/1‑119 (MQ=255) tGAAGCACCAATCGCAATCAGTTTTTCAGAACTCAACAACGGCCCCGCCTTCAGCGTTGTCGGTGCCGACAATGGCTTATGTGCTGCAAGGCTCGCCTTTGCTGCCGTACGCACCTTTTCAGCAATCATTTCGTTATACGCCAGCATa < 1:803891/148‑1 (MQ=255) aaGCACCAATCGCAATCAGTTTTTCAGAACTCAACAACGGCCCCGCCTTCAGCGTTGTCGGTGCCGACAATGGCTTATGTGCTGCAAGGCTCGCCTTTGCTGCCGTACGCACCTTTTCAGCAATCATTTCGTTATACGCCAGCATAcc > 3:543736/1‑148 (MQ=255) aGCACCAATCGCAATCAGTTTTTCAGAACTCAACAACGGCCCCGCCTTCAGCGTTGTCGGTGCCGACAATGGCTTATGTGCTGCAAGGCTCGCCTTTGCTGCCGTa > 3:142392/1‑106 (MQ=255) aGCACCAATCGCAATCAGTTTTTCAGAACTCAACAACGGCCCCGCCTTCAGCGTTGTCGGTGCCGACAATGGCTTATGTGCTGCAAGGCTCGCCTTTGCTGCCGTa < 4:142392/106‑1 (MQ=255) gCACCAATCGCAATCAGTTTTTCAGAACTCAACAACGGCCCCGCCTTCAGCGTTGTCGGTGCCGACAATGGCTTATGTGCTGCAAGGCTCGCCTTTGCTGCCGTACGCACCTTTTCAGCAATCATTTCGTTATACGCCAGCATACCtt < 4:543736/148‑1 (MQ=255) gCACCAATCGCAATCAGTTTTTCAGAACTCAACAACGGCCCCGCCTTCAGCGTTGTCGGTGCCGACAATGGCTTATGTGCTGCAAGGCTCGCCTTTGCTGCCGTACGCACCTTTTCAGCAATCATTTCGTTATACGCCAGCATACCtt > 1:986196/1‑148 (MQ=255) cAATCGCAATCAGTTTTTCAGAACTCAACAACGGCCCCGCCTTCAGCGTTGTCGGTGCCGACAATGGCTTATGTGCTGCAAGGCTCGCCTTTGCTGCCGTACGCACCTTTTCAGCAATCATTTCGTTATACGCCAGCATACCtt < 1:296498/144‑1 (MQ=255) cAATCGCAATCAGTTTTTCAGAACTCAACAACGGCCCCGCCTTCAGCGTTGTCGGTGCCGACAATGGCTTATGTGCTGCAAGGCTCGCCTTTGCTGCCGTACGCACCTTTTCAGCAATCATTTCGTTATACGCCAGCATACCtt > 2:296498/1‑144 (MQ=255) aaTCGCAATCAGTTTTTCAGAACTCAACAACGGCCCCGCCTTCAGCGTTGTCGGTGCCGACAATGGCTTATGTGCTGCAAGGCTCGCCTTTGCTGCCGTACGCACCTTTTCAGCAATCATTTCGTTATACGCCa < 3:238093/134‑1 (MQ=255) aaTCGCAATCAGTTTTTCAGAACTCAACAACGGCCCCGCCTTCAGCGTTGTCGGTGCCGACAATGGCTTATGTGCTGCAAGGCTCGCCTTTGCTGCCGTACGCACCTTTTCAGCAATCATTTCGTTATACGCCa > 4:238093/1‑134 (MQ=255) tCGCAATCAGTTTTTCAGAACTCAACAACGGCCCCGCCTTCAGCGTTGTCGGTGCCGACAATGGCTTATGTGCTGCAAGGCTCGCCTTTGCTGCCGTACGCACCTTTTCAGCAATCATTTCGTTATACGCCAGCATACCTTCGCGAAt > 1:303229/1‑148 (MQ=255) cAATCAGTTTTTCAGAACTCAACAACGGCCCCGCCTTCAGCGTTGTCGGTGCCGACAATGGCTTATGTGCTGCAAGGCTCGCCTTTGCTGCCGTACGCACCTTTTCAGCAAt > 1:41092/1‑112 (MQ=255) cAATCAGTTTTTCAGAACTCAACAACGGCCCCGCCTTCAGCGTTGTCGGTGCCGACAATGGCTTATGTGCTGCAAGGCTCGCCTTTGCTGCCGTACGCACCTTTTCAGCAAt < 2:41092/112‑1 (MQ=255) aaTCAGTTTTTCAGAACTCAACAACGGCCCCGCCTTCAGCGTTGTCGGTGCCGACAATGGCTTATGtgctg < 3:416941/71‑1 (MQ=255) aaTCAGTTTTTCAGAACTCAACAACGGCCCCGCCTTCAGCGTTGTCGGTGCCGACAATGGCTTATGtgctg > 4:416941/1‑71 (MQ=255) aTCAGTTTTTCAGAACTCAACAACGGCCCCGCCTTCAGCGTTGTCGGTGCCGACAATGGCTTATGTGCTGCAAGGCTCGCCTTTGCTGCCGTACGCACCTTTTCAGCAATCATTTCGTTATACGCCAGCATACCTTCGCGAATAcc < 2:356147/146‑1 (MQ=255) aTCAGTTTTTCAGAACTCAACAACGGCCCCGCCTTCAGCGTTGTCGGTGCCGACAATGGCTTATGTGCTGCAAGGCTCGCCTTTGCTGCCGTACGCACCTTTTCAGCAATCATTTCGTTATACGCCAGCATACCTTCGCGAATAcc > 1:356147/1‑146 (MQ=255) tttttCAGAACTCAACAACGGCCCCGCCTTCAGCGTTGTCGGTGCCGACAATGGCTTATGTGCTGCAAGGCTCGCCTTTGCTGCCGTACGCACCTTTTCAGCAATCATTTCGTTATACGCCAGCATACCTTCGCGAATACCCAGTTGc < 2:303229/148‑1 (MQ=255) ttttCAGAACTCAACAACGGCGCCGCCTTCAGCGTTGTCGGTGCCGACAATGGCTTATGTGCTGCAAGGCTCGCCTTTGCTGCCGTACGCACCTTTTc > 1:686267/1‑98 (MQ=255) ttttCAGAACTCAACAACGGCCCCGCCTTCAGCGTTGTCGGTGCCGACAATGGCTTATGTGCTGCAAGGCTCGCCTTTGCTGCCGTACGCACCTTTTc < 2:686267/98‑1 (MQ=255) ttttCAGAACTCAACAACGGCCCCGCCTTCAGCGTTGTCGGTGCCGACAATGGCTTATGTGCTGCAAGGCTCGCCTTTGCTGCCGTACGCACCTTTTCAGCAATCATTTCGTTATACGCCAGCa < 3:501033/124‑1 (MQ=255) ttttCAGAACTCAACAACGGCCCCGCCTTCAGCGTTGTCGGTGCCGACAATGGCTTATGTGCTGCAAGGCTCGCCTTTGCTGCCGTACGCACCTTTTCAGCAATCATTTCGTTATACGCCAGCa > 4:501033/1‑124 (MQ=255) ttttCAGAACTCAACAACGGCCCCGCCTTCAGCGTTGTCGGTGCCGACAATGGCTTATGTGCTGCAAGGCTCGCCTTTGCTGCCGTACGCACCTTTTCAGCAATCATTTCGTTATACGCCAGCATACCTTCGCGAATACCCAGTTGCg > 2:470567/1‑148 (MQ=255) 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cTCAACAACGGCCCCGCCTTCAGCGTTGTCGGTGCCGACAATGGCTTATGTGCTGCAAGGCTCGCCTTTGCTGCCGTACGCACCTTTTc > 1:574077/1‑89 (MQ=255) caacaaCGGCCCCGCCTTCAGCGTTGTCGGTGCCGACAATGGCTTATGTGCTGCAAGGCTCGCCTTTGCTGCCGTACGCACCTTTTCAGCAAt > 2:672853/1‑93 (MQ=255) caacaaCGGCCCCGCCTTCAGCGTTGTCGGTGCCGACAATGGCTTATGTGCTGCAAGGCTCGCCTTTGCTGCCGTACGCACCTTTTCAGCAAt < 1:672853/93‑1 (MQ=255) caacaaCGGCCCCGCCTTCAGCGTTGTCGGTGCCGACAATGGCTTATGTGCTGCAAGGCTCGCCTTTGCTGCCGTACGCACCTTTTCAGCAATCATTTCGTTATACGCCAGCATACCTTCGCGAATACCCAGTTGCGGTTTgg > 1:1085897/1‑143 (MQ=255) caacaaCGGCCCCGCCTTCAGCGTTGTCGGTGCCGACAATGGCTTATGTGCTGCAAGGCTCGCCTTTGCTGCCGTACGCACCTTTTCAGCAATCATTTCGTTATACGCCAGCATACCTTCGCGAATACCCAGTTGCGGTTTgg < 2:1085897/143‑1 (MQ=255) aacGGCCCCGCCTTCAGCGTTGTCGGTGCCGACAATGGCTTATGTGCTGCAAGGCTCGCCTTTGCTGCCGTACGCACCTTTTCAGCAATCATTTCGTTATACGCCAGCATACCtt < 1:513430/115‑1 (MQ=255) aacGGCCCCGCCTTCAGCGTTGTCGGTGCCGACAATGGCTTATGTGCTGCAAGGCTCGCCTTTGCTGCCGTACGCACCTTTTCAGCAATCATTTCGTTATACGCCAGCATACCtt > 2:513430/1‑115 (MQ=255) 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tGTCGGTGCCGACAATGGCTTATGTGCTGCAAGGCTCGCCTTTGCTGCCGTACGCACCTTTTCAGCAATCATTTCGTTATACGCCAGCATACCTTCGCGAATACCCAGTTGCGGTTTGGTGACAAAATCTATCGCCCCCAGCTCCAgc > 4:692360/1‑148 (MQ=255) tGTCGGCACCGACAATGGCTTATGTGCTGCAAGGCTCGCCTTTGCTGCCGTACGCACCTTTTCAGCAATCATTTCGTTATACGCCAGCATACCTTCGCGAATACCCAGTTGCGGTTTGGTGACAAAATCTATCGCCCCCAGCTcc > 1:675121/1‑145 (MQ=255) tGTCGGCACCGACAATGGCTTATGTGCTGCAAGGCTCGCCTTTGCTGCCGTACGCACCTTTTCAGCAATCATTTCGTTATACGCCAGCATACCTTCGCGAATACCCAGTTGCGGTTTGGTGACAAAATCTATCGCCCCCAGCTcc < 2:675121/145‑1 (MQ=255) cGGTGCCGACAATGGCTTATGTGCTGCAAGGCTCGCCTTTGCTGCCGTACGCACCTTTTCAGCAATCATTTCGTTATACGCCAGCATACCTTCGCGAATACCCAGTTGCGGtt > 3:444968/1‑113 (MQ=255) cGGTGCCGACAATGGCTTATGTGCTGCAAGGCTCGCCTTTGCTGCCGTACGCACCTTTTCAGCAATCATTTCGTTATACGCCAGCATACCTTCGCGAATACCCAGTTGCGGtt < 4:444968/113‑1 (MQ=255) tGCCGACAATGGCTTATGTGCTGCAAGGCTCGCCTTTGCTGCCGTACGCACCTTTTCAGCAATCATTTCGTTATACGCCAGCATACCTTCGCGa < 2:183650/94‑1 (MQ=255) tGCCGACAATGGCTTATGTGCTGCAAGGCTCGCCTTTGCTGCCGTACGCACCTTTTCAGCAATCATTTCGTTATACGCCAGCATACCTTCGCGa > 1:183650/1‑94 (MQ=255) | AATTAACAGTGCCGGGCTGGAAAGCGGCAACGGTTGCAGTACGTGACGAATTGCCTCAGTTCCACCCGTTGAAGCACCAATCGCAATCAGTTTTTCAGAACTCAACAACGGCCCCGCCTTCAGCGTTGTCGGTGCCGACAATGGCTTATGTGCTGCAAGGCTCGCCTTTGCTGCCGTACGCACCTTTTCAGCAATCATTTCGTTATACGCCAGCATACCTTCGCGAATACCCAGTTGCGGTTTGGTGACAAAATCTATCGCCCCCAGCTCCAGC > NC_000913/1967941‑1968214 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |