| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,211,187 | A→T | 5.3% | intergenic (+87/‑38) | yehQ → / → yehR | pseudogene/lipoprotein, DUF1307 family |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,211,187 | 0 | A | T | 5.3% | 272.9 / 4.3 | 75 | intergenic (+87/‑38) | yehQ/yehR | pseudogene/lipoprotein, DUF1307 family |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (34/37); new base T (2/2); total (36/39) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.76e-01 | |||||||||||
ATGAATAACGGTGTTTTGCTTTGCGAACAATTATTCCCCATGCTTCAGCAACAAGGATGAAATAGTGCTTTTTACTAAGAGTTCTACTCCAGTTCCGGACTGCTCACGCCACGGTATTAGGCATATCCTATATAGCCCCTGGTGAGAGTCACCAGTTCCTTGATTAAATAAAATGGAGTTTTACATGAAGGCTTTCAATAAGCTGTTTTCCCTCGTTGTTGCATCTGTTCTGGTTTTCTCTCTTGCTGGCTGCGGTGACAAAGA > NC_000913/2211041‑2211304 | aTGAATAACGGTGTTTTGCTTTGCGAACAATTATTCCCCATGCTTCAGCAACAAGGATGAAATAGTGCTTTTTACTAAGAGTTCTACTCCAGTTCCGGACTGCTCACGCCACGGTATTAGGCATATCCTATATAGCCCCTGGTGagag < 1:1119850/148‑1 (MQ=255) cGGTGTTTTGCTTTGCGAACAATTATTCCCCATGCTTCAGCAACAAGGATGAAATAGTGCTTTTTACTAAGAGTTCTACTCCAGTTCCGGACTGCTCACGCCACGGTATTAGGCATATCCTATATAGCCCCTGGTGAGAGTCACCAGt < 1:471844/148‑1 (MQ=255) cGGTGTTTTGCTTTGCGAACAATTATTCCCCATGCTTCAGCAACAAGGATGAAATAGTGCTTTTTACTAAGAGTTCTACTCCAGTTCCGGACTGCTCACGCCACGGTATTAGGCATATCCTATATAGCCCCTGGTGAGAGTCACCAGt < 3:791149/148‑1 (MQ=255) ggTGTTTTGCTTTGCGAACAATTATTCCCCATGCTTCAGCAACAAGGATGAAATAGTGCTTTTTACTAAGAGTTCTACTCCAGTTCCGGACTGCTCACGCCACGGTATTAGGCATATCCTATATAGCCCCTGGTGAGAGTCACCAGtt < 3:357951/148‑1 (MQ=255) aCAATTATTCCCCATGCTTCAGCAACAAGGATGAAATAGTGCTTTTTACTAAGAGTTCTACTCCAGTTCCGGACTGCTCACGCCACGGTATTAGGCATATCCTATATAGCCCCTGGTGAGAGTCACCAGTTCCt > 3:306580/1‑134 (MQ=255) aCAATTATTCCCCATGCTTCAGCAACAAGGATGAAATAGTGCTTTTTACTAAGAGTTCTACTCCAGTTCCGGACTGCTCACGCCACGGTATTAGGCATATCCTATATAGCCCCTGGTGAGAGTCACCAGTTCCt < 4:306580/134‑1 (MQ=255) aCAATTATTCCCCATGCTTCAGCAACAAGGATGAAATAGTGCTTTTTACTAAGAGTTCTACTCCAGTTCCGGACTGCTCACGCCACGGTATTAGGCATATCCTATATAGCCCCTGGTGAGAGTCACCAGTTCCTTGATTAAATAAAAt > 3:909826/1‑148 (MQ=255) aaTTATTCCCCATGCTTCAGCAACAAGGATGAAATAGTGCTTTTTACTAAGAGTTCTACTCCAGTTCCGGACTGCTCACGCCACGGTATTAGGCATATCCTATATAGCCCCTGGTGAGAGTCACCAGTTCCTTGATTAAATAAAATgg < 4:909826/148‑1 (MQ=255) tCCCCATGCTTCAGCAACAAGGATGAAATAGTGCTTTTTACTAAGAGTTCTACTCCAGTTCCGGACTGCTCACGCCACGGTATTAGGCATATCCTATATAGCCCCTGGTGACTCTCACCAg > 4:770543/1‑121 (MQ=255) tCCCCATGCTTCAGCAACAAGGATGAAATAGTGCTTTTTACTAAGAGTTCTACTCCAGTTCCGGACTGCTCACGCCACGGTATTAGGCATATCCTATATAGCCCCTGGTGACTCTCACCAg < 3:770543/121‑1 (MQ=255) ccATGCTTCAGCAACAAGGATGAAATAGTGCTTTTTACTAAGAGTTCTACTCCAGTTCCGGACTGCTCACGCCACGGTATTAGGCATATCCTATATAGCCCCTGGTGAGAGTCACCAGTTcc > 3:895036/1‑122 (MQ=255) ccATGCTTCAGCAACAAGGATGAAATAGTGCTTTTTACTAAGAGTTCTACTCCAGTTCCGGACTGCTCACGCCACGGTATTAGGCATATCCTATATAGCCCCTGGTGAGAGTCACCAGTTcc < 4:895036/122‑1 (MQ=255) ccATGCTTCAGCAACAAGGATGAAATAGTGCTTTTTACTAAGAGTTCTACTCCAGTTCCGGACTGCTCACGCCACGGTATTAGGCATATCCTATATAGCCCCTGGTGAGAGTCACCAGTTCCt > 1:339774/1‑123 (MQ=255) ccATGCTTCAGCAACAAGGATGAAATAGTGCTTTTTACTAAGAGTTCTACTCCAGTTCCGGACTGCTCACGCCACGGTATTAGGCATATCCTATATAGCCCCTGGTGAGAGTCACCAGTTCCt < 2:339774/123‑1 (MQ=255) ccATGCTTCAGCAACAAGGATGAAATAGTGCTTTTTACTAAGAGTTCTACTCCAGTTCCGGACTGCTCACGCCACGGTATTAGGCATATCCTATATAGCCCCTGGTGAGAGTCACCAGTTCCTTGATTAAATAAAATGGAGtt > 1:107124/1‑143 (MQ=255) ccATGCTTCAGCAACAAGGATGAAATAGTGCTTTTTACTAAGAGTTCTACTCCAGTTCCGGACTGCTCACGCCACGGTATTAGGCATATCCTATATAGCCCCTGGTGAGAGTCACCAGTTCCTTGATTAAATAAAATGGAGtt < 2:107124/143‑1 (MQ=255) aTGCTTCAGCAACAAGGATGAAATAGTGCTTTTTACTAAGAGTTCTACTCCAGTTCCGGACTGCTCACGCCACGGTATTAGGCATATCCTATATAGCCCCTGGTGAGAGTc > 2:65373/1‑111 (MQ=255) aTGCTTCAGCAACAAGGATGAAATAGTGCTTTTTACTAAGAGTTCTACTCCAGTTCCGGACTGCTCACGCCACGGTATTAGGCATATCCTATATAGCCCCTGGTGAGAGTc < 1:1034644/111‑1 (MQ=255) aTGCTTCAGCAACAAGGATGAAATAGTGCTTTTTACTAAGAGTTCTACTCCAGTTCCGGACTGCTCACGCCACGGTATTAGGCATATCCTATATAGCCCCTGGTGAGAGTc > 2:1034644/1‑111 (MQ=255) aTGCTTCAGCAACAAGGATGAAATAGTGCTTTTTACTAAGAGTTCTACTCCAGTTCCGGACTGCTCACGCCACGGTATTAGGCATATCCTATATAGCCCCTGGTGAGAGTc < 1:65373/111‑1 (MQ=255) caaGGATGAAATAGTGCTTTTTACTAAGAGTTCTACTCCAGTTCCGGACTGCTCACGCCACGGTATTAGGCATATCCTATATAGCCCCTGGTGAGAGTCACCAGTTCCTTGATTAAATAAAAt > 1:16794/1‑123 (MQ=255) caaGGATGAAATAGTGCTTTTTACTAAGAGTTCTACTCCAGTTCCGGACTGCTCACGCCACGGTATTAGGCATATCCTATATAGCCCCTGGTGAGAGTCACCAGTTCCTTGATTAAATAAAAt < 2:16794/123‑1 (MQ=255) aTAGTGCTTTTTACTAAGAGTTCTACTCCAGTTCCGGACTGCTCACGCCACGGTATTAGGCATATCCTATATAGCCCCTGGTGAGAGTCACCAGt > 2:462883/1‑95 (MQ=255) aTAGTGCTTTTTACTAAGAGTTCTACTCCAGTTCCGGACTGCTCACGCCACGGTATTAGGCATATCCTATATAGCCCCTGGTGAGAGTCACCAGt < 1:462883/95‑1 (MQ=255) aGTGCTTTTTACTAAGAGTTCTACTCCAGTTCCGGACTGCTCACGCCACGGTATTAGGCATATCCTATATAGCCCCTGGTGAGAGTCa < 1:120741/88‑1 (MQ=255) aGTGCTTTTTACTAAGAGTTCTACTCCAGTTCCGGACTGCTCACGCCACGGTATTAGGCATATCCTATATAGCCCCTGGTGAGAGTCa > 2:120741/1‑88 (MQ=255) gCTTTTTACTAAGAGTTCTACTCCAGTTCCGGACTGCTCACGCCACGGTATTAGGCATATCCTATATAGCCCCTGGTGAGAGTCACCAGTTCCTTGATTAAATAAAATGGAGTTTTACATGAAGGCTTTCAATAAGCTGtttt > 3:238516/1‑143 (MQ=255) gCTTTTTACTAAGAGTTCTACTCCAGTTCCGGACTGCTCACGCCACGGTATTAGGCATATCCTATATAGCCCCTGGTGAGAGTCACCAGTTCCTTGATTAAATAAAATGGAGTTTTACATGAAGGCTTTCAATAAGCTGtttt < 4:238516/143‑1 (MQ=255) ttttACTAAGAGTTCTACTCCAGTTCCGGACTGCTCACGCCACGGTATTAGGCATATCCTATATAGCCCCTGGTGAGAGTCACCAGTTCCTTGATTAAATAAAATGGAGtttt > 3:751821/1‑113 (MQ=255) ttttACTAAGAGTTCTACTCCAGTTCCGGACTGCTCACGCCACGGTATTAGGCATATCCTATATAGCCCCTGGTGAGAGTCACCAGTTCCTTGATTAAATAAAATGGAGtttt < 4:751821/113‑1 (MQ=255) aaGAGTTCTACTCCAGTTCCGGACTGCTCACGCCACGGTATTAGGCATATCCTATATAGCCCCTGGTGAGAGTCACCAGTTCCTTGATtaaataaa > 2:1092202/1‑96 (MQ=255) aaGAGTTCTACTCCAGTTCCGGACTGCTCACGCCACGGTATTAGGCATATCCTATATAGCCCCTGGTGAGAGTCACCAGTTCCTTGATtaaataaa < 1:1092202/96‑1 (MQ=255) aaGAGTTCTACTCCAGTTCCGGACTGCTCACGCCACGGTATTAGGCATATCCTATATAGCCCCTGGTGAGAGTCACCAGTTCCTTGATTAAATAAAATGGAGTTTTACATGAAGGCtt < 2:107456/118‑1 (MQ=255) aaGAGTTCTACTCCAGTTCCGGACTGCTCACGCCACGGTATTAGGCATATCCTATATAGCCCCTGGTGAGAGTCACCAGTTCCTTGATTAAATAAAATGGAGTTTTACATGAAGGCtt > 1:107456/1‑118 (MQ=255) aaGAGTTCTACTCCAGTTCCGGACTGCTCACGCCACGGTATTAGGCATATCCTATATAGCCCCTGGTGACTCTCACCAg > 4:488279/1‑79 (MQ=255) aaGAGTTCTACTCCAGTTCCGGACTGCTCACGCCACGGTATTAGGCATATCCTATATAGCCCCTGGTGACTCTCACCAg < 3:488279/79‑1 (MQ=255) gagTTCTACTCCAGTTCCGGACTGCTCACGCCACGGTATTAGGCATATCCTATATAGCCCCTGGTGAGAGTCa > 2:102635/1‑73 (MQ=255) gagTTCTACTCCAGTTCCGGACTGCTCACGCCACGGTATTAGGCATATCCTATATAGCCCCTGGTGAGAGTCa < 1:102635/73‑1 (MQ=255) gTTCTACTCCAGTTCCGGACTGCTCACGCCACGGTATTAGGCATATCCTATATAGCCCCTGGTGAGAGTCACCAGTTCCTTGATTAAATAAAATGGAGTTTTACATGAAGGCTTTCAATAAGCTGTTTTCCCTCGTTGTTGCATCTGt > 1:788283/1‑148 (MQ=255) ttCTACTCCAGTTCCGGACTGCTCACGCCACGGTATTAGGCATATCCTATATAGCCCCTGGTGAGAGTCACCAGTTCCTTGATTAAATAAAATGGAGTTTTACATGAAGGCTTTCAATAAGCTGTTTTCCCTCgt < 2:1116136/135‑1 (MQ=255) ttCTACTCCAGTTCCGGACTGCTCACGCCACGGTATTAGGCATATCCTATATAGCCCCTGGTGAGAGTCACCAGTTCCTTGATTAAATAAAATGGAGTTTTACATGAAGGCTTTCAATAAGCTGTTTTCCCTCgt > 1:1116136/1‑135 (MQ=255) tCTACTCCAGTTCCGGACTGCTCACGCCACGGTATTAGGCATATCCTATATAGCCCCTGGTGAGAGTCACCAGTTCCTTGATtaaataaa < 2:874089/90‑1 (MQ=255) tCTACTCCAGTTCCGGACTGCTCACGCCACGGTATTAGGCATATCCTATATAGCCCCTGGTGAGAGTCACCAGTTCCTTGATtaaataaa > 1:874089/1‑90 (MQ=255) tCTACTCCAGTTCCGGACTGCTCACGCCACGGTATTAGGCATATCCTATATAGCCCCTGGTGAGAGTCACCAGTTCCTTGATTAAATAAAATGGAGTTTTACATGAAGGCTTTCAATAAGCTg < 1:725403/123‑1 (MQ=255) tCTACTCCAGTTCCGGACTGCTCACGCCACGGTATTAGGCATATCCTATATAGCCCCTGGTGAGAGTCACCAGTTCCTTGATTAAATAAAATGGAGTTTTACATGAAGGCTTTCAATAAGCTg > 2:725403/1‑123 (MQ=255) tCCAGTTCCGGACTGCTCACGCCACGGTATTAGGCATATCCTATATAGCCCCTGGTGAGAGTCACCAGTTCCt < 4:322568/73‑1 (MQ=255) tCCAGTTCCGGACTGCTCACGCCACGGTATTAGGCATATCCTATATAGCCCCTGGTGAGAGTCACCAGTTCCt > 3:322568/1‑73 (MQ=255) aGTTCCGGACTGCTCACGCCACGGTATTAGGCATATCCTATATAGCCCCTGGTGAGAGTCACCAGTTCCTTGATTAAATAAAATGGAGTTTTACATGaa < 1:446819/99‑1 (MQ=255) aGTTCCGGACTGCTCACGCCACGGTATTAGGCATATCCTATATAGCCCCTGGTGAGAGTCACCAGTTCCTTGATTAAATAAAATGGAGTTTTACATGaa > 2:446819/1‑99 (MQ=255) gTTCCGGACTGCTCACGCCACGGTATTAGGCATATCCTATATAGCCCCTGGTGAGAGTCACCAGTTCCTTGATTAAATAAAATGGAGTTTTACATGAAGGCTTTCAATAAGCTGTTTTCCCTCGTTGTTGCATCTGTTCTGGtttt < 1:4434/146‑1 (MQ=255) gTTCCGGACTGCTCACGCCACGGTATTAGGCATATCCTATATAGCCCCTGGTGAGAGTCACCAGTTCCTTGATTAAATAAAATGGAGTTTTACATGAAGGCTTTCAATAAGCTGTTTTCCCTCGTTGTTGCATCTGTTCTGGtttt > 2:4434/1‑146 (MQ=255) tCCGGACTGCTCACGCCACGGTATTAGGCATATCCTATATAGCCCCTGGTGAGAGTCACCAGTTCCTTGATTAAATAAAATgg > 1:92641/1‑83 (MQ=255) tCCGGACTGCTCACGCCACGGTATTAGGCATATCCTATATAGCCCCTGGTGAGAGTCACCAGTTCCTTGATTAAATAAAATgg < 2:92641/83‑1 (MQ=255) gACTGCTCACGCCACGGTATTAGGCATATCCTATATAGCCCCTGGTGAGAGTCACCAGTTCCTTGATTAAATAAAATGGAGTTTTACATGAAGGCTTTCAATAAGCTGTTTTCCCTCGTTGTTGCATCTGTTCTGGTTTTCTCTCtt < 4:248633/147‑1 (MQ=255) gACTGCTCACGCCACGGTATTAGGCATATCCTATATAGCCCCTGGTGAGAGTCACCAGTTCCTTGATTAAATAAAATGGAGTTTTACATGAAGGCTTTCAATAAGCTGTTTTCCCTCGTTGTTGCATCTGTTCTGGTTTTCTCTCtt > 3:248633/1‑147 (MQ=255) tCACGCCACGGTATTAGGCATATCCTATATAGCCCCTGGTGAGAGTCACCAGTTCCTTGATtaaataaa < 1:84440/69‑1 (MQ=255) tCACGCCACGGTATTAGGCATATCCTATATAGCCCCTGGTGAGAGTCACCAGTTCCTTGATtaaataaa > 2:84440/1‑69 (MQ=255) aCGGTATTAGGCATATCCTATATAGCCCCTGGTGAGAGTCACCAGTTCCTTGATTAAATAAAATGGAGTTTTACATGAAGGCTTTCAATAAGCTGTTTTCCCTCGTTGTTGCATCTGTTCTGGTTTTCTCTCTTGCTGGCTGCGGTGa < 2:788283/148‑1 (MQ=255) tAGGCATATCCTATATAGCCCCTGGTGAGAGTCACCAGTTCCTTGATTAAATAAAATGGAGTTTTACATGAAGGCtt > 3:417702/1‑77 (MQ=255) tAGGCATATCCTATATAGCCCCTGGTGAGAGTCACCAGTTCCTTGATTAAATAAAATGGAGTTTTACATGAAGGCtt < 4:417702/77‑1 (MQ=255) ggCATATCCTATATAGCCCCTGGTGAGAGTCACCAGTTCCTTGATTAAATAAAATGGAGTTTTACATGAAGGCTTTCAATAAGCTGTTTTCCCTCGTTGTTGCATCTGt > 3:147625/1‑109 (MQ=255) ggCATATCCTATATAGCCCCTGGTGAGAGTCACCAGTTCCTTGATTAAATAAAATGGAGTTTTACATGAAGGCTTTCAATAAGCTGTTTTCCCTCGTTGTTGCATCTGt < 4:147625/109‑1 (MQ=255) gCATATCCTATATAGCCCCTGGTGAGAGTCACCAGTTCCTTGATTAAATAAAATGGAGTTTTACATGAAGGCTTTCAATAAGCTGTTTTCCCTCGTTGTTGCATCTGTTCTGGTTTTCTCTCTTgc < 1:218917/126‑1 (MQ=255) gCATATCCTATATAGCCCCTGGTGAGAGTCACCAGTTCCTTGATTAAATAAAATGGAGTTTTACATGAAGGCTTTCAATAAGCTGTTTTCCCTCGTTGTTGCATCTGTTCTGGTTTTCTCTCTTgc > 2:218917/1‑126 (MQ=255) cTATATAGCCCCTGGTGAGAGTCACCAGTTCCTTGATTAAATAAAATGGAGTTTTACATGAAGGCTTTCAATAAGCTGTTTTCCCTCGTTGTTGCATCTGTTCTGGTTTtctct > 1:153262/1‑114 (MQ=255) cTATATAGCCCCTGGTGAGAGTCACCAGTTCCTTGATTAAATAAAATGGAGTTTTACATGAAGGCTTTCAATAAGCTGTTTTCCCTCGTTGTTGCATCTGTTCTGGTTTtctct < 2:153262/114‑1 (MQ=255) tataGCCCCTGGTGAGAGTCACCAGTTCCTTGATTAAATAAAATGGAGTTTTACATGAAGGCTTTCAATAAGCTGTTTTCCCTCGTTGTTGCATCTGTTCTGGTTTtctct > 1:552745/1‑111 (MQ=255) tataGCCCCTGGTGAGAGTCACCAGTTCCTTGATTAAATAAAATGGAGTTTTACATGAAGGCTTTCAATAAGCTGTTTTCCCTCGTTGTTGCATCTGTTCTGGTTTtctct < 2:552745/111‑1 (MQ=255) ataGCCCCTGGTGAGAGTCACCAGTTCCTTGATTAAATAAAATGGAGTTTTACATGAAGGCTTTCAGTAAGCTGTTTTCCCTGGTTGTTGCATCTGTTCTGGTTTTCTCTCTTgctggct > 2:758617/1‑120 (MQ=255) ataGCCCCTGGTGAGAGTCACCAGTTCCTTGATTAAATAAAATGGAGTTTTACATGAAGGCTTTCAATAAGCTGTTTTCCCTCGTTGTTGCATCTGTTCTGGTTTTCTCTCTTgctggct < 1:758617/120‑1 (MQ=255) ccccTGGTGAGAGTCACCAGTTCCTTGATTAAATAAAATGGAGTTTTACATGAAGGCTTTCAATAAGCTGTTTTCCCTCGTTGTTGCATCTGTTCTGGTTTTCTCTCTTgctg < 3:611661/113‑1 (MQ=255) ccccTGGTGAGAGTCACCAGTTCCTTGATTAAATAAAATGGAGTTTTACATGAAGGCTTTCAATAAGCTGTTTTCCCTCGTTGTTGCATCTGTTCTGGTTTTCTCTCTTgctg > 4:611661/1‑113 (MQ=255) tGGTGAGAGTCACCAGTTCCTTGATTAAATAAAATGGAGTTTTACATGAAGGCTTTCAATAAGCTGTTTTCCCTCGttgttg < 4:354498/82‑1 (MQ=255) tGGTGAGAGTCACCAGTTCCTTGATTAAATAAAATGGAGTTTTACATGAAGGCTTTCAATAAGCTGTTTTCCCTCGttgttg > 3:354498/1‑82 (MQ=255) gTGAGAGTCACCAGTTCCTTGATTAAATAAAATGGAGTTTTACATGAAGGCTTTCAATAAGCTGTTTTCCCTCGTTGTTGCATCTGTTCTGGTTTTCTCTCTTGCTGGCTGCGGTGACAaaga < 2:26000/123‑1 (MQ=255) gTGAGAGTCACCAGTTCCTTGATTAAATAAAATGGAGTTTTACATGAAGGCTTTCAATAAGCTGTTTTCCCTCGTTGTTGCATCTGTTCTGGTTTTCTCTCTTGCTGGCTGCGGTGACAaaga > 1:26000/1‑123 (MQ=255) gagaGTCACCAGTTCCTTGATTAAATAAAATGGAGTTTTACATGAAGGCTTTCAATAAGCTGTTTTCCCTCGTTGTTGCATCTGTTCTGGTTTtctct < 1:184035/98‑1 (MQ=255) gagaGTCACCAGTTCCTTGATTAAATAAAATGGAGTTTTACATGAAGGCTTTCAATAAGCCGTTTTCCCTCGTTGTTGCATCTGTTCTGGTTTtctct > 2:184035/1‑98 (MQ=255) | ATGAATAACGGTGTTTTGCTTTGCGAACAATTATTCCCCATGCTTCAGCAACAAGGATGAAATAGTGCTTTTTACTAAGAGTTCTACTCCAGTTCCGGACTGCTCACGCCACGGTATTAGGCATATCCTATATAGCCCCTGGTGAGAGTCACCAGTTCCTTGATTAAATAAAATGGAGTTTTACATGAAGGCTTTCAATAAGCTGTTTTCCCTCGTTGTTGCATCTGTTCTGGTTTTCTCTCTTGCTGGCTGCGGTGACAAAGA > NC_000913/2211041‑2211304 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |