Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_000913 | 2,596,016 | T→C | 5.3% | D241G (GAC→GGC) | ypfJ ← | putative neutral zinc metallopeptidase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 2,596,016 | 0 | T | C | 5.3% | 382.0 / 7.4 | 112 | D241G (GAC→GGC) | ypfJ | putative neutral zinc metallopeptidase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (54/52); new base C (3/3); total (57/55) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.64e-01 |
Only 100 of 112 total aligned reads displayed.
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gTCATCGCCGATGGCCTGCGCCGCGTTCAGCGCCTCTTCCAGATCGCCGGTTTCCAGAACGCCTTGCTGCTGCATACTATGCCCCCAGACACCGGCAAAACAGTCGGCCTGGAGTTCCATACGCACAGATAAGCGGTTTACTTCCGcc > 4:819736/1‑148 (MQ=255) | TAAATGCTTTTACCAAAAGTATTGCATTGTGCCGGATCGCCGCTGTCGAAACCACGTTTAAACCAGCTGTAGCGTTGCTGAGAAGTGCCATGAGTGAAACTGTCTGGTACTACTCGCCCCTGACTTTGCTGTTGTAAACGGTCATCGCCGATGGCCTGCGCCGCGTTCAGCGCCTCTTCCAGATCGCCGGTTTCCAGAACGCCTTGCTGCTGCATACTATGCCCCCAGACACCGGCAAAACAGTCGGCCTGGAGTTCCATACGCACAGATAAGCGGTTTACTTCCGCC > NC_000913/2595875‑2596162 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |